BioLiP

>protein
LDQQTINIIKATVPVLKEHGVTITTTFYKNLFAKHPEVRPLFEQPKALAMTVLAAAQNIENLPAILPAVKKIAVKHCQAG
VAAAHYPIVGQELLGAIKEVLGDAATDDILDAWGKAYGVIADVFIQVEADLYAQAVE

The query sequence (length=137) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3tm9:A	146	145	0.9927	0.9315	0.9379	1.02e-92	3tld:A, 3tld:B, 3tm3:A, 1vhb:A, 1vhb:B, 2vhb:A, 2vhb:B, 3vhb:A, 3vhb:B, 4vhb:A, 4vhb:B
2	1cqx:A	403	145	0.5036	0.1712	0.4759	1.77e-38	1cqx:B, 3ozu:A, 3ozv:B, 3ozv:A, 3ozw:A, 3ozw:B
3	4g1b:A	398	144	0.5474	0.1884	0.5208	3.51e-36	4g1b:B, 4g1b:C, 4g1b:D, 4g1v:A
4	6wk3:D	146	137	0.4307	0.4041	0.4307	9.10e-36	6wk3:A, 6wk3:B, 6wk3:C
5	1gvh:A	396	142	0.4672	0.1616	0.4507	8.85e-34
6	7dih:A	139	139	0.4234	0.4173	0.4173	4.02e-32	7dih:B
7	2wy4:A	139	141	0.4891	0.4820	0.4752	1.79e-30
8	3s1i:A	131	129	0.3212	0.3359	0.3411	7.53e-22	3s1i:B, 3s1i:C, 3s1j:A, 3s1j:B, 3s1j:C, 3ubc:A, 3ubc:D, 3ubc:G, 3ubv:A, 3ubv:D, 3ubv:G
9	3wfw:A	138	105	0.2555	0.2536	0.3333	1.23e-17	3wfx:A, 3wfx:B
10	6o0a:A	383	145	0.3650	0.1305	0.3448	5.98e-17
11	7ohd:B	134	108	0.2263	0.2313	0.2870	3.89e-10
12	6h6c:A	151	123	0.2409	0.2185	0.2683	6.57e-07	5eet:A, 5eoh:A, 5eqm:A, 5eu2:A, 5ev5:A, 5eyj:A, 5eys:A, 6eye:A, 5f0b:A, 5f2a:A, 3gk9:A, 3gkt:A, 3gln:A, 8grz:A, 6h5z:A, 6h6i:A, 6h6j:A, 6i3t:A, 6i40:A, 5mjc:A, 5mjd:A, 4mpm:A, 4mpm:B, 4mu5:A, 5nvi:A, 5nw6:A, 4nzi:A, 4o1t:A, 5o17:A, 5o18:A, 5o1k:A, 4o2g:A, 5o27:A, 4o35:A, 4o4t:A, 4o4z:A, 7ohd:A, 1oj6:A, 1oj6:B, 1oj6:C, 1oj6:D, 1q1f:A, 6r1q:A, 6ra6:A, 7vqg:A, 2vry:A, 1w92:A
13	1gdi:A	153	62	0.1679	0.1503	0.3710	2.70e-06	1gdj:A, 1gdk:A, 1gdl:A, 2gdm:A, 1lh1:A, 1lh2:A, 1lh3:A, 1lh5:A, 1lh6:A, 1lh7:A, 2lh1:A, 2lh2:A, 2lh3:A, 2lh5:A, 2lh6:A, 2lh7:A
14	1hlb:A	157	135	0.2336	0.2038	0.2370	2.55e-05
15	2r50:C	147	131	0.2482	0.2313	0.2595	2.97e-05	2r50:A, 2r50:B, 2r50:D
16	1hlm:A	158	143	0.2409	0.2089	0.2308	3.15e-05
17	2oif:G	154	124	0.2409	0.2143	0.2661	2.86e-04	2oif:A, 2oif:B, 2oif:C, 2oif:D, 2oif:E, 2oif:F, 2oif:H
18	3qqq:A	150	98	0.1971	0.1800	0.2755	0.001	3qqq:B, 3qqr:A, 3qqr:B
19	1d8u:A	165	124	0.2482	0.2061	0.2742	0.003	1d8u:B, 2gnv:A, 2gnv:B, 2gnw:A, 2gnw:B
20	3zhw:A	154	49	0.1095	0.0974	0.3061	0.004	3zhw:B
21	1yhu:B	144	109	0.1898	0.1806	0.2385	0.012	1yhu:F, 1yhu:J, 1yhu:N, 1yhu:R, 1yhu:V
22	1bin:A	143	46	0.1168	0.1119	0.3478	0.036	1bin:B, 1fsl:A, 1fsl:B
23	7e96:C	147	131	0.2336	0.2177	0.2443	0.042	2d2m:C, 2d2n:C, 7e97:C, 7e98:C, 7e99:C, 2zfo:C, 2zs0:C, 2zs1:C
24	4hrr:A	149	107	0.1825	0.1678	0.2336	0.095	4hrr:C, 4hrr:E, 4hrr:G, 4hrt:A, 4hrt:C, 4hrt:E, 4hrt:G
25	4u8u:D	141	120	0.2336	0.2270	0.2667	0.11	4u8u:H, 4u8u:L, 4u8u:S, 4u8u:W, 4u8u:a, 4u8u:h, 4u8u:l, 4u8u:p, 4wch:D
26	7z1u:A	147	117	0.1898	0.1769	0.2222	0.19	7z1u:B, 7zos:A
27	7bvt:A	391	51	0.1387	0.0486	0.3725	0.58
28	2olp:A	151	95	0.1460	0.1325	0.2105	0.59	2olp:B, 6otw:A, 6otx:A, 6oty:A, 3pi1:A, 3pi1:B, 3pi2:A, 3pi2:B, 3pi3:A, 3pi3:B, 3pi4:A, 3pi4:B, 3pt7:A, 3pt8:A
29	2vyw:A	148	43	0.0949	0.0878	0.3023	1.3
30	4hrr:B	151	107	0.1606	0.1457	0.2056	1.6	4hrr:D, 4hrr:F, 4hrr:H, 4hrt:B, 4hrt:D, 4hrt:F, 4hrt:H
31	5kvu:A	738	124	0.2482	0.0461	0.2742	2.2	5kvu:B, 5kvu:C, 5kvu:D
32	1x46:A	150	27	0.0803	0.0733	0.4074	4.2
33	1dbp:A	271	29	0.0803	0.0406	0.3793	5.3	1drj:A, 1drk:A, 2dri:A, 2gx6:A
34	8yk5:A	664	18	0.0730	0.0151	0.5556	5.5	8yk5:B
35	3sxp:D	314	25	0.0803	0.0350	0.4400	6.6	3sxp:A, 3sxp:B, 3sxp:C, 3sxp:E
36	2b3j:C	152	20	0.0876	0.0789	0.6000	6.6	2b3j:A, 2b3j:B, 2b3j:D
37	5bk4:D	661	67	0.1460	0.0303	0.2985	7.5	5bk4:5
38	5fji:A	840	32	0.0949	0.0155	0.4062	9.2	5fji:B

[Back]