Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
LAFSPPFYPSPWANGQGEWAEAYQRAVAIVSQMTLDEKVNLTTGTGWELEKCVGQTGGVPRLNIGGMCLQDSPLGIRDSD
YNSAFPAGVNVAATWDKNLAYLRGQAMGQEFSDKGIDVQLGPAAGPLGRSPDGGRNWEGFSPDPALTGVLFAETIKGIQD
AGVVATAKHYILNEQEHFRQVAEAAGYGFNISDTISSNVDDKTIHEMYLWPFADAVRAGVGAIMCSYNQINNSYGCQNSY
TLNKLLKAELGFQGFVMSDWGAHHSGVGSALAGLDMSMPGDITFDSATSFWGTNLTIAVLNGTVPQWRVDDMAVRIMAAY
YKVGRDRLYQPPNFSSWTRDEYGFKYFYPQEGPYEKVNHFVNVQRNHSEVIRKLGADSTVLLKNNNALPLTGKERKVAIL
GEDAGSNSYGANGCSDRGCDNGTLAMAWGSGTAEFPYLVTPEQAIQAEVLKHKGSVYAITDNWALSQVETLAKQASVSLV
FVNSDAGEGYISVDGNEGDRNNLTLWKNGDNLIKAAANNCNNTIVVIHSVGPVLVDEWYDHPNVTAILWAGLPGQESGNS
LADVLYGRVNPGAKSPFTWGKTREAYGDYLVRELNNGNGAPQDDFSEGVFIDYRGFDKRNETPIYEFGHGLSYTTFNYSG
LHIQVLNATETGAAPTFGQVGNASDYVYPEGLTRISKFIYPWLNSTDLKASSGDPYYGVDTAEHVPEGATDGSPQPVLPA
GGGSGGNPRLYDELIRVSVTVKNTGRVAGDAVPQLYVSLGGPNEPKVVLRKFDRLTLKPSEETVWTTTLTRRDLSNWDVA
AQDWVITSYPKKVHVGSSSRQLPLHAALPKVQ

The query sequence (length=832) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4iib:A 834 834 1.0000 0.9976 0.9976 0.0 4iib:B, 4iic:A, 4iic:B, 4iid:A, 4iid:B, 4iie:A, 4iie:B, 4iif:A, 4iif:B, 4iig:A, 4iig:B, 4iih:A, 4iih:B
2 5fjj:A 839 839 0.8041 0.7974 0.7974 0.0 5fjj:B, 5fjj:C, 5fjj:D
3 5fji:A 840 838 0.7873 0.7798 0.7816 0.0 5fji:B
4 5ju6:A 835 835 0.6875 0.6850 0.6850 0.0 5ju6:B, 5ju6:C, 5ju6:D
5 5nbs:A 842 843 0.6130 0.6057 0.6050 0.0 5nbs:B
6 6sz6:A 836 841 0.6082 0.6053 0.6017 0.0
7 6jxg:A 713 629 0.3714 0.4334 0.4913 0.0
8 6jxg:A 713 107 0.0553 0.0645 0.4299 3.88e-15
9 4i8d:B 714 639 0.3510 0.4090 0.4570 0.0 4i8d:A, 3zyz:A
10 4i8d:B 714 106 0.0493 0.0574 0.3868 5.89e-14 4i8d:A, 3zyz:A
11 6jbs:A 762 657 0.3450 0.3766 0.4368 1.26e-155 7ey1:B, 7ey1:A, 7ey2:A, 7ey2:B, 7ey2:C, 7ey2:D, 7ey2:E, 7ey2:F, 7f95:A, 7f95:B, 8gyy:B, 8gyy:A, 8gyy:C, 8gyy:D, 6jbs:C, 6jbs:D, 6kj0:A, 6kj0:B, 7yo6:A, 7yo6:B, 7yo7:B, 7yo7:A
12 6jbs:A 762 101 0.0481 0.0525 0.3960 3.21e-13 7ey1:B, 7ey1:A, 7ey2:A, 7ey2:B, 7ey2:C, 7ey2:D, 7ey2:E, 7ey2:F, 7f95:A, 7f95:B, 8gyy:B, 8gyy:A, 8gyy:C, 8gyy:D, 6jbs:C, 6jbs:D, 6kj0:A, 6kj0:B, 7yo6:A, 7yo6:B, 7yo7:B, 7yo7:A
13 2x41:A 715 666 0.2380 0.2769 0.2973 2.36e-73 2x42:A
14 2x41:A 715 99 0.0361 0.0420 0.3030 1.65e-04 2x42:A
15 8j9f:D 749 639 0.2392 0.2657 0.3114 4.13e-72 8j9f:A, 8j9f:B
16 8j9f:D 749 94 0.0385 0.0427 0.3404 2.33e-08 8j9f:A, 8j9f:B
17 5wab:A 674 656 0.2356 0.2908 0.2988 2.52e-56
18 5wab:A 674 89 0.0349 0.0430 0.3258 5.95e-04
19 4i3g:B 780 393 0.1671 0.1782 0.3537 3.92e-49 4i3g:A
20 4i3g:B 780 170 0.0721 0.0769 0.3529 2.68e-17 4i3g:A
21 4i3g:B 780 155 0.0565 0.0603 0.3032 9.10e-06 4i3g:A
22 3ac0:A 841 397 0.1406 0.1391 0.2947 9.64e-38 3ac0:B, 3ac0:C, 3ac0:D
23 3ac0:A 841 186 0.0673 0.0666 0.3011 3.77e-13 3ac0:B, 3ac0:C, 3ac0:D
24 3ac0:A 841 98 0.0361 0.0357 0.3061 0.007 3ac0:B, 3ac0:C, 3ac0:D
25 3u48:B 742 715 0.2127 0.2385 0.2476 1.94e-37 3u48:A, 3u4a:B, 3u4a:A
26 7zgz:X 753 582 0.1719 0.1899 0.2457 2.25e-37 8c7f:B
27 7zgz:X 753 131 0.0445 0.0491 0.2824 0.039 8c7f:B
28 8c7f:A 772 590 0.1755 0.1891 0.2475 6.75e-37 7zb3:A, 7zb3:B, 7zdy:W, 7zdy:Y, 7zgz:Y
29 8c7f:A 772 131 0.0445 0.0479 0.2824 0.037 7zb3:A, 7zb3:B, 7zdy:W, 7zdy:Y, 7zgz:Y
30 5tf0:A 733 701 0.2103 0.2387 0.2496 8.96e-31 5tf0:B
31 5tf0:A 733 62 0.0264 0.0300 0.3548 0.20 5tf0:B
32 6r5i:A 733 586 0.1767 0.2005 0.2509 2.06e-29 6r5i:B, 6r5n:B, 6r5n:A, 6r5o:B, 6r5o:A, 6r5p:B, 6r5p:A, 6r5r:B, 6r5r:A, 6r5t:B, 6r5t:A, 6r5u:B, 6r5u:A, 6r5v:B, 6r5v:A
33 6r5i:A 733 91 0.0349 0.0396 0.3187 0.30 6r5i:B, 6r5n:B, 6r5n:A, 6r5o:B, 6r5o:A, 6r5p:B, 6r5p:A, 6r5r:B, 6r5r:A, 6r5t:B, 6r5t:A, 6r5u:B, 6r5u:A, 6r5v:B, 6r5v:A
34 5jp0:A 745 596 0.1743 0.1946 0.2433 2.62e-29 5jp0:B
35 5jp0:A 745 66 0.0276 0.0309 0.3485 0.26 5jp0:B
36 5xxm:A 749 686 0.1875 0.2083 0.2274 2.97e-29 5xxl:A, 5xxl:B, 5xxm:B, 5xxn:A, 5xxn:B, 5xxo:B, 5xxo:A
37 6q7i:A 770 660 0.1995 0.2156 0.2515 4.41e-28 6q7j:A, 6q7j:B
38 6q7i:A 770 68 0.0276 0.0299 0.3382 7.3 6q7j:A, 6q7j:B
39 5z87:A 756 607 0.1731 0.1905 0.2372 1.28e-27 5z87:B
40 5z87:A 756 66 0.0300 0.0331 0.3788 0.002 5z87:B
41 7xtj:B 743 656 0.1971 0.2207 0.2500 2.99e-24 7xtj:A
42 7vc7:A 743 658 0.1935 0.2167 0.2447 3.78e-24
43 5wvp:A 924 197 0.0877 0.0790 0.3706 9.19e-24
44 5wvp:A 924 171 0.0529 0.0476 0.2573 1.05e-05
45 7eap:A 755 643 0.1911 0.2106 0.2473 1.91e-23 5yot:A, 5yot:B, 5yqs:A, 5yqs:B
46 5m6g:A 579 572 0.1707 0.2453 0.2483 6.87e-23
47 3ut0:A 804 576 0.1659 0.1716 0.2396 3.36e-22 3rrx:A, 3usz:A, 3ut0:B, 3ut0:C, 3ut0:D
48 5k6o:A 795 207 0.0793 0.0830 0.3188 8.53e-21 5k6m:A, 5k6n:A
49 5k6o:A 795 321 0.0901 0.0943 0.2336 1.61e-05 5k6m:A, 5k6n:A
50 5k6o:A 795 64 0.0312 0.0327 0.4062 0.032 5k6m:A, 5k6n:A
51 6jg1:A 606 527 0.1562 0.2145 0.2467 4.87e-20 1ex1:A, 1ieq:A, 1iev:A, 1iew:A, 1iex:A, 1j8v:A, 6jg2:A, 6jg6:A, 6jg7:A, 6jga:A, 6jgb:A, 6jgc:A, 6jgd:A, 6jge:A, 6jgg:A, 6jgk:A, 6jgl:A, 6jgn:A, 6jgo:A, 6jgp:A, 6jgq:A, 6jgr:A, 6jgs:A, 6jgt:A, 6k6v:A, 6kuf:A, 6l1j:A, 6lbb:A, 6lbv:A, 6lc5:A, 1lq2:A, 6md6:A, 6mi1:A, 3wlh:A, 3wlj:A, 3wlk:X, 3wll:A, 3wlo:A, 3wlp:A, 1x38:A, 1x39:A
52 5ae6:B 767 652 0.1875 0.2034 0.2393 3.85e-18 5a7m:A, 5a7m:B, 5ae6:A
53 4zo6:B 724 662 0.1743 0.2003 0.2190 3.08e-17 4zo6:A, 4zo7:B, 4zo7:A, 4zo8:A, 4zo8:B, 4zo9:A, 4zo9:B, 4zoa:A, 4zoa:B, 4zob:A, 4zob:B, 4zoc:A, 4zoc:B, 4zod:A, 4zod:B, 4zoe:A, 4zoe:B
54 4zo6:B 724 92 0.0325 0.0373 0.2935 0.069 4zo6:A, 4zo7:B, 4zo7:A, 4zo8:A, 4zo8:B, 4zo9:A, 4zo9:B, 4zoa:A, 4zoa:B, 4zob:A, 4zob:B, 4zoc:A, 4zoc:B, 4zod:A, 4zod:B, 4zoe:A, 4zoe:B
55 5z9s:A 765 347 0.0974 0.1059 0.2334 8.88e-17 5z9s:B
56 5z9s:A 765 93 0.0337 0.0366 0.3011 4.65e-05 5z9s:B
57 8xrx:E 611 184 0.0589 0.0802 0.2663 2.03e-12
58 8xrx:E 611 92 0.0252 0.0344 0.2283 0.40
59 4gyj:A 618 279 0.0793 0.1068 0.2366 4.42e-10 3bmx:A, 3bmx:B, 4gyj:B, 4gyk:A, 3nvd:A, 3nvd:B
60 6k5j:A 526 258 0.0757 0.1198 0.2442 8.90e-08
61 5g3r:A 335 199 0.0625 0.1552 0.2613 0.001 5g3r:B, 5g5k:A, 5g5k:B, 5g6t:A, 5g6t:B, 5ly7:A, 5ly7:B
62 2oxn:A 333 110 0.0349 0.0871 0.2636 0.008 3gs6:A, 3gsm:A
63 6dte:B 340 195 0.0553 0.1353 0.2359 0.030 6dte:A, 4mss:A, 4mss:B, 5utp:A, 5utp:B, 5utq:A, 5utq:B, 5utr:A, 5utr:B
64 7qg4:A 746 121 0.0409 0.0456 0.2810 0.056 7qe1:A, 7qe1:B, 7qe2:A, 7qe2:B, 7qea:A, 7qea:B, 7qee:A, 7qee:B, 7qef:A, 7qef:B, 7qg4:B
65 7qg4:A 746 301 0.0781 0.0871 0.2159 0.17 7qe1:A, 7qe1:B, 7qe2:A, 7qe2:B, 7qea:A, 7qea:B, 7qee:A, 7qee:B, 7qef:A, 7qef:B, 7qg4:B
66 8xrt:F 751 92 0.0252 0.0280 0.2283 0.41 8xrt:E, 8xrt:A, 8xrt:B, 8xrt:C, 8xrt:D, 8xru:A, 8xru:B, 8xrv:A, 8xrv:B, 8xrv:C, 8xrv:F, 8xrv:D, 8xrv:E, 8xrx:A, 8xrx:D, 8xrx:F, 8xrx:B, 8xrx:C
67 4gvh:A 341 170 0.0505 0.1232 0.2471 1.6 4gvh:B, 4gvi:B, 4hzm:A, 4hzm:B
68 3mdj:C 819 64 0.0240 0.0244 0.3125 2.0 3mdj:A
69 1aor:A 605 92 0.0337 0.0463 0.3043 2.6 1aor:B
70 1e19:A 313 36 0.0180 0.0479 0.4167 3.0 1e19:B
71 2f2h:A 773 73 0.0276 0.0298 0.3151 4.8 2f2h:B, 2f2h:C, 2f2h:D, 2f2h:E, 2f2h:F, 1xsk:A, 1xsk:B, 1xsk:C, 1xsk:E
72 6z1p:BD 107 96 0.0288 0.2243 0.2500 7.6
73 7obb:B 1130 111 0.0409 0.0301 0.3063 7.8 7ob9:B, 7oba:B, 7vba:B, 7vbb:B, 7vbc:B
74 2a21:A 263 32 0.0168 0.0532 0.4375 9.6 2a21:B, 2a2i:A, 2a2i:B, 3e0i:A, 3e0i:B, 3e12:A, 3e12:B, 2ef9:A, 2ef9:B, 1fwn:A, 1fwn:B, 1fws:A, 1fws:B, 1fwt:A, 1fwt:B, 1fww:A, 1fww:B, 1fx6:A, 1fx6:B, 1fxp:A, 1fxp:B, 1fxq:A, 1fxq:B, 1fy6:A, 1fy6:B, 1jcx:A, 1jcx:B, 1jcy:A, 1jcy:B, 1lrn:A, 1lrn:B, 1lro:A, 1lro:B, 1lrq:A, 1lrq:B, 2nwr:A, 2nwr:B, 2nws:A, 2nws:B, 2nx1:A, 2nx1:B, 2nx3:A, 2nx3:B, 2nx3:C, 2nx3:D, 2nx3:E, 2nx3:F, 2nx3:G, 2nx3:H, 2nx3:I, 2nx3:J, 2nx3:K, 2nx3:L, 2nxg:A, 2nxg:B, 2nxh:A, 2nxh:B, 2nxh:C, 2nxh:D, 2nxh:E, 2nxh:F, 2nxh:G, 2nxh:H, 2nxh:I, 2nxh:J, 2nxh:K, 2nxh:L, 2nxi:A, 2nxi:B, 2nxi:C, 2nxi:D, 2nxi:E, 2nxi:F, 2nxi:G, 2nxi:H, 2nxi:I, 2nxi:J, 2nxi:K, 2nxi:L, 1pck:A, 1pck:B, 1pcw:A, 1pcw:B, 1pe1:A, 1pe1:B, 1t8x:A, 1t8x:B, 1t96:A, 1t96:B, 1zha:A, 1zha:B, 1zji:A, 1zji:B
75 4r43:A 601 190 0.0553 0.0765 0.2421 9.8 5i67:A, 4rcg:A, 4wie:A, 4wiu:A, 4wl8:A, 4wou:A, 4wpt:A, 4wpu:A, 4wpv:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218