Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KSPVIVDLKFIPEEVEAALAGAFPGREVIDLADPAHQERDLSGIDYAVVWKSAPDLFSRAPDLKVVFSGGAGVDHVLTLP
GLPDVPLVRFVDRTLTTRMSEWVMMQCLLHLRQHRAYEALAKKHEWRDLSQPEAADVTVGIMGMGVLGQDAARKLAAMGF
KVIGWSRSKRVIEGVETYDAAGLDAFLGRTDFLVGLLPLTPDTRGIFNAALFAKLSRNGPFGAPVFINAGRGGSQVEADI
LECLDSGVLGGASLDVFEREPLSPESRFWDMPNVYVTPHVAASSDVRALFVHVEHQIARFESGLPLEHVVDKVAGY

The query sequence (length=316) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4weq:A 316 316 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 4z0p:A
2 5bqf:A 317 316 0.6076 0.6057 0.6076 7.69e-144 5tsd:A, 5tsd:B, 4xcv:A
3 5vg6:B 315 308 0.3797 0.3810 0.3896 7.20e-56 5vg6:A, 5vg6:C, 5vg6:D, 5vg6:E, 5vg6:F, 5vg6:G, 5vg6:H, 5vg6:I, 5vg6:J
4 7jqh:A 313 284 0.3481 0.3514 0.3873 4.25e-52 7jqi:A, 7jqj:A, 6ovl:A, 6oxn:A, 6p35:A
5 3kbo:A 312 284 0.3576 0.3622 0.3979 1.45e-51 3kbo:B, 3kbo:C, 3kbo:D
6 4zqb:B 316 299 0.3386 0.3386 0.3579 1.16e-40 4zqb:A
7 5mh5:A 308 224 0.2342 0.2403 0.3304 6.34e-24 5mh5:B, 5mh6:A, 5mh6:B, 5mh6:C, 5mh6:D, 5mha:A, 5mha:B
8 3dc2:A 526 236 0.2342 0.1407 0.3136 5.54e-20 3dc2:B, 3ddn:B
9 7dkm:A 306 274 0.2563 0.2647 0.2956 4.73e-18 7cvp:B, 6cwa:A, 6cwa:B, 7dkm:B, 7ewh:A, 7ewh:B, 2g76:A, 2g76:B, 5n53:B, 5n53:A, 5n6c:A, 5n6c:B, 5nzo:B, 5nzo:A, 5nzp:B, 5nzp:A, 5nzq:B, 5nzq:A, 5ofm:B, 5ofm:A, 5ofv:B, 5ofv:A, 5ofw:B, 5ofw:A, 6plf:A, 6plf:B, 6plg:A, 6plg:B, 6plg:C, 6plg:D, 6plg:E, 6plg:F, 6plg:G, 6plg:H, 6rih:A, 6rih:B, 6rj2:A, 6rj2:B, 6rj3:A, 6rj3:B, 6rj5:A, 6rj5:B, 6rj6:A, 6rj6:B, 7va1:B, 7va1:A, 7va1:C, 7va1:D
10 5v6q:B 319 262 0.2722 0.2696 0.3282 5.48e-18 5j23:A, 5j23:B, 5j23:C, 5j23:D, 5v6q:A, 5v6q:C, 5v6q:D, 5v7g:A, 5v7g:B, 5v7g:C, 5v7g:D, 5v7n:A, 5v7n:B, 5v7n:C, 5v7n:D
11 3baz:A 311 233 0.2247 0.2283 0.3047 1.27e-17
12 7arz:A 361 245 0.2057 0.1801 0.2653 6.44e-16
13 7cvp:A 254 188 0.1962 0.2441 0.3298 3.62e-15
14 5aov:A 334 249 0.1962 0.1856 0.2490 6.86e-15
15 2gcg:A 324 231 0.2025 0.1975 0.2771 1.84e-14 2gcg:B, 2gcg:C, 2gcg:D
16 6ttb:A 331 269 0.2120 0.2024 0.2491 5.75e-13
17 4zgs:A 346 162 0.1582 0.1445 0.3086 7.48e-13 4zgs:B, 4zgs:C, 4zgs:D, 4zgs:E, 4zgs:F, 4zgs:G, 4zgs:H
18 4e5p:A 332 266 0.2373 0.2259 0.2820 2.12e-12 4e5k:A, 4e5k:B, 4e5k:C, 4e5k:D, 4e5m:A, 4e5m:B, 4e5n:A, 4e5n:B, 4e5n:C, 4e5n:D, 4e5n:E, 4e5n:F, 4e5n:G, 4e5n:H, 4e5p:B, 4e5p:C, 4e5p:D, 4e5p:E, 4e5p:F, 4ebf:A, 4ebf:B, 4ebf:C, 4ebf:D, 4nu5:A, 4nu5:B, 4nu6:A, 4nu6:B
19 6bii:A 332 148 0.1424 0.1355 0.3041 2.73e-12 6bii:B
20 3jtm:A 351 151 0.1392 0.1254 0.2914 3.18e-12 3n7u:A, 3n7u:B, 3n7u:C, 3n7u:D, 3n7u:E, 3n7u:F, 3n7u:G, 3n7u:H, 3n7u:I, 3n7u:J, 3n7u:K, 3n7u:L
21 5z20:F 336 261 0.2405 0.2262 0.2912 4.44e-12 5z20:A, 5z20:B, 5z20:C, 5z20:D, 5z20:E
22 6t9w:B 383 246 0.1962 0.1619 0.2520 6.26e-11 8bxx:AA, 8bxx:BB, 8bxx:CC, 8bxx:DD, 6t9w:A, 6t9w:C, 6t9x:B, 6t9x:A, 6t9x:C, 6t9x:D, 6tb6:B
23 6ih6:A 330 171 0.1551 0.1485 0.2865 1.66e-10 6ih3:A, 6ih5:B, 6ih6:B
24 2dbq:A 333 137 0.1234 0.1171 0.2847 1.70e-10 2dbr:A, 2dbr:B, 2dbr:C, 2dbr:D, 2dbr:E, 2dbr:F, 2dbz:A, 2dbz:B
25 1j49:A 332 198 0.1677 0.1596 0.2677 2.02e-10 1j49:B
26 2gsd:A 399 237 0.1899 0.1504 0.2532 3.50e-10
27 4prl:A 330 261 0.1994 0.1909 0.2414 4.25e-10 4prl:B
28 8ati:A 330 266 0.2152 0.2061 0.2556 5.06e-10 8ati:B, 8ati:C, 8ati:D, 4lcj:A, 4lcj:B, 4lcj:C, 4lcj:D, 4lcj:E, 4lcj:F, 4lcj:G, 4lcj:H, 2ome:A, 2ome:B, 2ome:C, 2ome:D, 2ome:E, 2ome:F, 2ome:G, 2ome:H, 6wkw:D, 6wkw:C, 6wkw:B, 6wkw:A
29 3kb6:B 334 271 0.2057 0.1946 0.2399 5.65e-10 3kb6:A, 3kb6:C, 3kb6:D
30 6cdf:A 333 151 0.1487 0.1411 0.3113 7.97e-10 8ari:A, 8ari:G, 8ari:D, 8ari:F, 8ari:E, 8ari:J, 8ari:H, 8ari:K, 8ari:I, 8ari:P, 8ari:L, 8ari:M, 8ari:N, 8ari:T, 8ari:O, 8ari:Q, 8ari:R, 8ari:U, 8ari:S, 8ari:X, 8ari:B, 8ari:C, 8ari:V, 8ari:W, 6cdr:A, 1hku:A, 1hl3:A, 2hu2:A, 7kwm:A, 4lce:A, 1mx3:A, 4u6q:A, 4u6s:A, 6v89:A, 6v8a:A
31 1qp8:A 301 244 0.1994 0.2093 0.2582 4.03e-09 1qp8:B
32 2dld:A 337 199 0.1804 0.1691 0.2864 4.99e-09 2dld:B
33 3wr5:A 401 242 0.1899 0.1496 0.2479 1.40e-08 6juj:A, 6juj:B, 6juk:A, 6juk:B, 2nad:A, 2nad:B, 8oq2:A, 8oq2:B, 8oq2:C, 8oq2:D, 8oq2:E, 8oq2:F, 3wr5:B, 3wr5:C
34 1dxy:A 330 229 0.1835 0.1758 0.2533 4.25e-08
35 1wwk:A 304 102 0.0949 0.0987 0.2941 5.72e-08 1wwk:B
36 6d4b:A 361 250 0.1741 0.1524 0.2200 1.24e-07 6d4b:B, 6d4c:A, 6d4c:B, 5dn9:A, 5dn9:B
37 2yq5:C 331 201 0.1614 0.1541 0.2537 1.24e-07 2yq5:A, 2yq5:B, 2yq5:D
38 4xyb:A 384 200 0.1741 0.1432 0.2750 1.27e-07 4xyb:B, 4xye:A, 4xye:B
39 2ekl:A 312 245 0.1677 0.1699 0.2163 1.88e-07
40 5z21:B 331 186 0.1551 0.1480 0.2634 5.10e-07 5z21:A, 5z21:C, 5z21:D
41 8j3p:A 374 274 0.2152 0.1818 0.2482 1.91e-06 8j3o:A, 8j3o:B, 8j3o:C, 8j3o:D, 8j3p:B, 8j3p:C
42 4cuk:A 330 160 0.1361 0.1303 0.2687 2.73e-06 4cuk:D
43 2p9e:A 406 175 0.1551 0.1207 0.2800 5.61e-06 2p9c:A, 2p9c:B, 2p9e:B, 2p9e:C, 2p9e:D, 2p9g:A, 2p9g:B, 2pa3:A, 1psd:A, 1psd:B, 1sc6:A, 1sc6:B, 1yba:A, 1yba:B, 1yba:C, 1yba:D
44 5dt9:A 379 254 0.2152 0.1794 0.2677 2.33e-05
45 6t8y:BBB 375 108 0.0949 0.0800 0.2778 3.77e-05 6t8y:AAA, 6t8y:CCC, 6t8y:DDD, 6t8z:AAA, 6t8z:BBB, 6t8z:CCC, 6t8z:DDD, 6t92:AAA, 6t92:BBB, 6t92:CCC, 6t92:DDD, 6t94:AAA, 6t94:BBB, 6t94:CCC, 6t94:DDD
46 7ya3:B 384 222 0.1614 0.1328 0.2297 4.23e-05 7ya3:A, 7ya4:A, 7ya4:B
47 4xkj:A 332 235 0.1835 0.1747 0.2468 5.90e-04 4xkj:B
48 6p2i:A 307 173 0.1456 0.1498 0.2659 6.80e-04 6p2i:B
49 8grv:A 336 191 0.1519 0.1429 0.2513 7.30e-04
50 2w2l:A 346 148 0.1203 0.1098 0.2568 0.001 2w2l:B, 2w2l:C, 2w2l:D
51 3oet:H 378 130 0.1361 0.1138 0.3308 0.003 3oet:A, 3oet:B, 3oet:C, 3oet:D, 3oet:E, 3oet:F, 3oet:G
52 1sc6:D 384 161 0.1392 0.1146 0.2733 0.050 1sc6:C
53 3tsa:B 372 77 0.0759 0.0645 0.3117 0.84 3uyk:B, 3uyl:A, 3uyl:B
54 6qhe:A 261 49 0.0696 0.0843 0.4490 1.4 6qhe:B, 6qhe:C, 6qhe:D, 6qhe:F
55 8c79:A 478 30 0.0411 0.0272 0.4333 1.5 8c79:B
56 5mzy:B 244 123 0.1139 0.1475 0.2927 1.7 5mzx:D, 5mzx:B, 5mzy:D, 5mzz:D, 5mzz:B
57 6qph:4 211 64 0.0696 0.1043 0.3438 2.3 6rhz:4, 6sl5:4, 6yxr:4
58 8wbx:B 467 89 0.0791 0.0535 0.2809 2.3
59 2f1k:A 279 63 0.0601 0.0681 0.3016 2.7 2f1k:B, 2f1k:C, 2f1k:D
60 7a3w:B 293 31 0.0380 0.0410 0.3871 2.8 7a3w:A
61 6fqy:A 468 30 0.0285 0.0192 0.3000 3.0 6fqy:B, 6fqz:A, 6fqz:B
62 4ar2:A 455 82 0.0759 0.0527 0.2927 3.4
63 1k23:D 231 115 0.0981 0.1342 0.2696 3.5
64 5tx1:N 473 82 0.0759 0.0507 0.2927 3.8 7tau:N
65 3fwn:A 467 37 0.0380 0.0257 0.3243 3.9 3fwn:B, 2zya:A, 2zya:B, 2zyd:A, 2zyd:B
66 2uyy:A 292 55 0.0570 0.0616 0.3273 3.9 2uyy:D
67 4j8g:B 302 90 0.0728 0.0762 0.2556 4.1 4j8b:A, 4j8g:A
68 4bdt:A 563 57 0.0570 0.0320 0.3158 4.2 8aen:B, 8aen:A, 8aev:A, 8aev:B, 6cqt:A, 6cqt:B, 6cqu:A, 6cqu:B, 6cqv:A, 6cqv:B, 6cqw:A, 6cqw:B, 6cqx:A, 6cqx:B, 6cqy:A, 6cqy:B, 6cqz:A, 6cqz:B, 7d9o:A, 7d9o:B, 7d9p:A, 7d9p:B, 7d9q:A, 7d9q:B, 8dt4:A, 8dt4:B, 8dt5:A, 8dt5:B, 8dt7:A, 8dt7:B, 7e3h:A, 7e3h:B, 4ey5:A, 4ey5:B, 4ey6:A, 4ey6:B, 4ey7:A, 4ey7:B, 6f25:A, 6f25:B, 5hf6:B, 5hf6:A, 5hf8:A, 5hf8:B, 5hf9:A, 5hf9:B, 5hfa:A, 5hfa:B, 5hq3:A, 5hq3:B, 4m0e:A, 4m0e:B, 4m0f:A, 4m0f:B, 6nea:A, 6nea:B, 6ntg:A, 6ntg:B, 6nth:A, 6nth:B, 6ntk:A, 6ntk:B, 6ntl:A, 6ntl:B, 6ntm:A, 6ntm:B, 6ntn:A, 6ntn:B, 6nto:A, 6nto:B, 6o4w:A, 6o4w:B, 6o4x:A, 6o4x:B, 6o50:A, 6o50:B, 6o52:A, 6o52:B, 6o5r:A, 6o5r:B, 6o5s:A, 6o5s:B, 6o5v:A, 6o5v:B, 6o66:A, 6o66:B, 7p1n:aa, 7p1n:A, 7p1n:bb, 7p1p:aa, 7p1p:A, 7p1p:bb, 7rb5:A, 7rb6:A, 7rb6:B, 7rb7:A, 7rb7:B, 6u34:A, 6u34:B, 6u37:A, 6u37:B, 6u3p:A, 6wuv:A, 6wuv:B, 6wuy:A, 6wuy:B, 6wuz:A, 6wuz:B, 6wv1:A, 6wv1:B, 6wvc:A, 6wvc:B, 6wvo:A, 6wvo:B, 6wvp:A, 6wvp:B, 6wvq:A, 6wvq:B, 7xn1:A, 7xn1:B, 6zwe:A
69 8a3n:B 352 53 0.0601 0.0540 0.3585 4.2 8a3n:A
70 2haw:B 308 115 0.0981 0.1006 0.2696 4.2 2haw:A, 2iw4:A, 2iw4:B, 1k23:A, 1k23:B, 1k23:C, 1wpm:A, 1wpm:B, 1wpn:A, 1wpn:B
71 2xdq:A 425 40 0.0538 0.0400 0.4250 4.8
72 3vol:A 138 44 0.0475 0.1087 0.3409 5.2 4hi4:A, 4hi4:B, 4hi4:D, 4hi4:G
73 6a2j:A 309 41 0.0475 0.0485 0.3659 5.9 6ied:A
74 2p4q:A 476 60 0.0538 0.0357 0.2833 7.5
75 8a3x:A 295 36 0.0316 0.0339 0.2778 8.0 8a3x:B, 8a3x:C, 8a3x:D, 8a5z:A, 8a5z:B
76 2vq3:A 181 32 0.0411 0.0718 0.4062 8.3 2vq3:B
77 6smt:B 289 32 0.0380 0.0415 0.3750 8.9 6smt:A, 6smt:C, 6smt:D, 6smt:E
78 3pdu:A 287 32 0.0380 0.0418 0.3750 9.1 3pdu:B, 3pdu:C, 3pdu:D, 3pdu:F, 3pdu:E, 3pdu:G, 3pdu:H
79 6hg8:B 482 93 0.0918 0.0602 0.3118 9.4 2f5z:A, 2f5z:B, 2f5z:C, 2f5z:D, 2f5z:E, 2f5z:F, 2f5z:G, 2f5z:H, 2f5z:I, 2f5z:J, 6hg8:A, 6i4p:A, 6i4p:B, 6i4q:A, 6i4q:B, 6i4r:A, 6i4r:B, 6i4s:A, 6i4s:B, 6i4t:A, 6i4t:B, 6i4u:A, 6i4u:B, 6i4z:A, 6i4z:B, 6i4z:C, 6i4z:D, 6i4z:E, 6i4z:F, 6i4z:G, 6i4z:H, 5j5z:A, 5j5z:B, 5nhg:A, 5nhg:B, 5nhg:C, 5nhg:D, 5nhg:E, 5nhg:F, 5nhg:G, 5nhg:H, 7psc:A, 7psc:B, 3rnm:A, 3rnm:B, 3rnm:C, 3rnm:D, 1zmc:A, 1zmc:B, 1zmc:C, 1zmc:D, 1zmc:E, 1zmc:F, 1zmc:G, 1zmc:H, 1zmd:A, 1zmd:B, 1zmd:C, 1zmd:D, 1zmd:E, 1zmd:F, 1zmd:G, 1zmd:H, 1zy8:A, 1zy8:B, 1zy8:C, 1zy8:D, 1zy8:E, 1zy8:F, 1zy8:G, 1zy8:H, 1zy8:I, 1zy8:J, 7zyt:A, 7zyt:B
80 4d3f:B 289 94 0.0854 0.0934 0.2872 9.5
81 3ddv:B 139 20 0.0316 0.0719 0.5000 9.7 3ddv:D
82 4njm:A 303 107 0.0791 0.0825 0.2336 9.9 4njm:B, 4njo:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218