Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KQLIEFVRWSPERAQHYRNKGYWIDQPLTRILTVGVQSHPHSLAIICGERQLSYIELDRLSTNLATRLAEKGLGKGDTAL
VQLPNVAEFYIVFFALLKAGVVVLNALYSHRQYELNAFIKQIQPKLLIGSRQHEVFSNNQFIDSLHDVNLSPEIILMLNH
QATDFGLLDWIETPAETFVDFSSTPADEVAFFQLSGGGTPKLIPRTHNDYDYSVRASAEICGLNSNTRLLCALPAPHNFM
LSSPGALGVLHAGGCVVMAPNPEPLNCFSIIQRHQVNMASLVPSAVIMWLEKAAQYKDQIQSLKLLQVGGASFPESLARQ
VPEVLNCKLQQVFGMAEGLVNYTRLDDSDEQIFTTQGRPISSDDEIKIVDEQYREVPEGEIGMLATRGPYTFCGYYQSPE
HNSQVFDEDNYYYSGDLVQRTPDGNLRVVGRIK

The query sequence (length=433) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3u16:B 437 435 1.0000 0.9908 0.9954 0.0 3o82:A, 3o82:B, 3o83:A, 3o83:B, 3o84:A, 3o84:B, 3u16:A, 3u17:A, 3u17:B
2 3rg2:C 613 434 0.5427 0.3834 0.5415 2.89e-158 6iyk:A, 6iyk:B, 6iyl:A, 6iyl:B, 4iz6:A, 4iz6:B, 8k5s:A, 8k5s:B, 8k5t:A, 8k5t:B, 3rg2:A, 3rg2:B, 3rg2:H, 3rg2:D, 3rg2:E, 3rg2:F, 3rg2:I, 3rg2:G, 3rg2:J
3 6e97:B 537 430 0.4711 0.3799 0.4744 7.91e-130 6e8o:A, 6e8o:B, 6e97:A
4 5wm3:A 537 432 0.4296 0.3464 0.4306 4.64e-115 5wm2:A, 5wm4:A, 5wm5:A, 5wm6:A, 5wm7:A
5 1md9:A 536 430 0.4203 0.3396 0.4233 6.59e-112 1mdb:A
6 7tz4:A 530 427 0.4065 0.3321 0.4122 3.47e-109 7tyb:A
7 5u89:A 1039 404 0.2286 0.0953 0.2450 5.46e-20
8 3a9v:A 528 398 0.2448 0.2008 0.2663 4.70e-19 3ni2:A
9 4gxq:A 506 399 0.2217 0.1897 0.2406 6.56e-19 4fut:A, 4gxq:B, 4gxq:C, 4gxr:A
10 8wev:A 486 398 0.2379 0.2119 0.2588 2.42e-18 8wev:B
11 5ie2:A 506 396 0.2032 0.1739 0.2222 4.44e-16 5ie2:B, 5ie3:A, 5ie3:B
12 6ea3:B 417 421 0.2171 0.2254 0.2233 4.49e-16
13 5bsm:A 530 398 0.2263 0.1849 0.2462 4.99e-15 5bsm:B, 5bsr:A, 5bst:A, 5bsu:A, 5bsv:A, 5bsw:A, 5bsw:B, 5u95:D, 5u95:B, 5u95:C
14 8jbr:A 1023 411 0.2240 0.0948 0.2360 5.35e-15
15 8www:A 501 420 0.2356 0.2036 0.2429 1.20e-14 8www:B
16 6sq8:B 494 241 0.1478 0.1296 0.2656 2.18e-14 6h1b:A, 6h1b:B, 6h1b:C, 6h1b:D, 6h1b:E, 6sq8:A, 6sq8:C, 6sq8:D, 6sq8:E
17 6qjz:A 504 416 0.2148 0.1845 0.2236 1.61e-13
18 6k4d:A 539 412 0.2356 0.1892 0.2476 8.05e-13 6k4c:A
19 6p4u:A 843 413 0.2263 0.1163 0.2373 1.24e-12 6ozv:A, 6p3i:A
20 3r44:A 502 396 0.1963 0.1693 0.2146 1.59e-12 5zrn:A, 5zrn:B
21 7ywk:A 401 410 0.2148 0.2319 0.2268 5.59e-12 5n81:A, 5n81:B, 5n82:A, 7ywk:B
22 4wv3:B 518 411 0.2055 0.1718 0.2165 1.11e-11 4wv3:A
23 7thq:B 505 405 0.2148 0.1842 0.2296 1.45e-11 6o6e:B, 7thq:A
24 4r0m:A 637 271 0.1663 0.1130 0.2657 2.09e-11 4r0m:B
25 6mfz:A 1789 406 0.2217 0.0537 0.2365 2.27e-11 5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
26 6mfz:A 1789 137 0.0808 0.0196 0.2555 0.029 5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
27 6mfz:A 1789 77 0.0439 0.0106 0.2468 0.11 5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
28 8ppp:A 500 413 0.2240 0.1940 0.2349 6.15e-11 8ppp:B, 8pyx:A, 8pyx:B
29 5x8f:B 485 404 0.2379 0.2124 0.2550 7.54e-11 5buq:B, 5bur:A, 5bur:B, 5bus:A, 5bus:B, 5gtd:A, 5gtd:B, 5x8f:A, 5x8f:C, 5x8f:D, 5x8g:A, 5x8g:B, 5x8g:D, 5x8g:C
30 6q2m:A 544 404 0.2171 0.1728 0.2327 8.43e-11 1ba3:A, 5dwv:A, 4e5d:A, 4g36:A, 4g36:B, 4g37:A, 4g37:B, 5gyz:A, 5gz2:A, 6hps:A, 6hps:B, 3ies:A, 5kyt:A, 5kyt:B, 5kyv:A, 5kyv:B, 6q2m:B, 6q2m:C, 3rix:A, 5wys:A
31 5n9x:A 489 418 0.2194 0.1943 0.2273 1.34e-10 5n9x:B
32 6ulw:A 1193 466 0.2564 0.0930 0.2382 1.65e-10 6ulw:D, 6ulx:A, 6uly:A, 6uly:B
33 3nyq:A 460 142 0.0855 0.0804 0.2606 3.69e-10 3nyr:A
34 3e7w:A 508 205 0.1247 0.1063 0.2634 6.59e-10 3e7x:A
35 6n8e:A 1332 430 0.2263 0.0736 0.2279 7.36e-10
36 4oxi:A 526 420 0.2055 0.1692 0.2119 7.72e-10
37 7ly7:A 908 414 0.2148 0.1024 0.2246 9.80e-10
38 4ir7:A 508 402 0.2009 0.1713 0.2164 1.10e-09
39 3wv5:A 387 395 0.1848 0.2067 0.2025 1.81e-09 3wvn:A
40 6ijb:B 538 251 0.1409 0.1134 0.2430 3.75e-09 6ihk:B
41 6mg0:B 1687 408 0.2079 0.0533 0.2206 4.76e-09
42 6mg0:B 1687 137 0.0808 0.0207 0.2555 0.033
43 6mg0:B 1687 77 0.0439 0.0113 0.2468 0.12
44 2vsq:A 1273 435 0.2379 0.0809 0.2368 7.98e-09
45 8gic:A 392 417 0.2333 0.2577 0.2422 1.10e-08 8gic:B, 8gkm:A, 8gkm:B
46 3vnq:A 497 406 0.2009 0.1751 0.2143 1.87e-08 3vnr:A, 3vns:A
47 2d1r:A 539 406 0.2148 0.1725 0.2291 1.96e-08 2d1q:A, 2d1s:A, 2d1t:A
48 1v26:B 510 250 0.1316 0.1118 0.2280 2.06e-08 1v25:A, 1v25:B, 1v26:A
49 7en2:B 1410 248 0.1478 0.0454 0.2581 3.74e-08 7emy:A, 7emy:B, 7en1:A, 7en1:B, 7en2:A
50 4d56:A 482 446 0.2356 0.2116 0.2287 3.87e-08 4d4g:A, 4d4i:A, 4d57:A
51 5wmm:A 870 412 0.1940 0.0966 0.2039 3.92e-08
52 8g96:A 406 421 0.1963 0.2094 0.2019 3.97e-08 8g96:B, 8g97:A, 8g97:B, 8g98:A
53 6ltb:A 928 406 0.2194 0.1024 0.2340 6.61e-08 6ltc:A, 6ltd:A, 6ltd:B
54 3dlp:X 504 409 0.2194 0.1885 0.2323 9.59e-08 3cw8:X, 3cw9:A, 3cw9:B, 2qvx:X, 2qvy:X, 2qvz:X, 2qw0:X, 1t5d:X, 1t5h:X
55 7wew:A 481 424 0.2333 0.2100 0.2382 1.29e-07
56 5ja2:A 1238 412 0.2055 0.0719 0.2160 1.38e-07 5ja1:A, 5t3d:A
57 8yyr:A 496 259 0.1617 0.1411 0.2703 1.51e-07 7dq5:A, 7dq5:B, 7dq6:A, 7dq6:B, 6m01:A, 8yyq:A
58 3fcc:A 500 192 0.1085 0.0940 0.2448 1.78e-07 3dhv:A, 3fce:A
59 7r27:B 398 207 0.1155 0.1256 0.2415 2.22e-07 7r27:A
60 4gr5:C 457 411 0.2125 0.2013 0.2238 4.93e-07 4gr5:A, 4gr5:B, 4gr5:D
61 3b7w:A 537 406 0.1894 0.1527 0.2020 7.32e-07 3c5e:A, 3day:A, 3eq6:A, 3eq6:B, 3gpc:A, 3gpc:B, 2vze:A, 2vze:B, 2vze:C, 2wd9:A, 2wd9:B, 2wd9:C
62 3lgx:A 508 396 0.1963 0.1673 0.2146 7.82e-07 3lgx:B, 3lgx:C, 3lgx:D
63 7kvy:A 633 424 0.1894 0.1295 0.1934 1.14e-06 7kcp:A, 7kq6:A, 7kq6:B, 7kq6:C, 7kqz:A, 7l3p:A, 7l3q:A, 7l3q:B, 7l3q:C
64 2p20:A 641 423 0.2102 0.1420 0.2151 4.45e-06 5jrh:A, 5jrh:B, 2p20:B, 2p2b:A, 2p2b:B, 2p2f:A, 2p2f:B, 2p2j:A, 2p2j:B, 2p2m:A, 2p2m:B, 2p2q:A, 2p2q:B, 1pg3:A, 1pg3:B, 1pg4:A, 1pg4:B
65 1amu:A 509 76 0.0554 0.0472 0.3158 5.69e-06 1amu:B
66 1amu:A 509 143 0.0947 0.0806 0.2867 2.13e-04 1amu:B
67 7a9j:A 503 409 0.2148 0.1849 0.2274 7.04e-06 7a9i:A
68 3wv5:B 359 373 0.1686 0.2033 0.1957 7.67e-06 3wvn:B
69 3pbk:A 555 432 0.2079 0.1622 0.2083 8.56e-06 3pbk:B
70 6oz1:A 643 73 0.0554 0.0373 0.3288 1.88e-05
71 5ups:A 520 106 0.0670 0.0558 0.2736 2.67e-05 5upq:A, 5upq:B, 5ups:B, 5upt:A
72 5ups:A 520 65 0.0485 0.0404 0.3231 5.42e-05 5upq:A, 5upq:B, 5ups:B, 5upt:A
73 4zxh:A 1314 399 0.1963 0.0647 0.2130 9.29e-05 4zxi:A
74 7mmz:A 559 419 0.1940 0.1503 0.2005 1.04e-04
75 5mss:A 717 79 0.0554 0.0335 0.3038 1.72e-04 5mst:A, 5mst:B, 5msw:A
76 6vhy:C 540 68 0.0531 0.0426 0.3382 2.08e-04 6vhv:A, 6vhw:A, 6vhw:B, 6vhx:A, 6vhx:B, 6vhy:D, 6vhy:A, 6vhy:B, 6vhz:A, 6vhz:B
77 7r7e:A 567 433 0.2309 0.1764 0.2309 2.18e-04 7r7e:B, 7r7f:A, 7r7f:B, 7r7g:A, 7r7g:B
78 5msd:A 636 92 0.0647 0.0440 0.3043 3.47e-04 5msc:A, 5msq:A
79 8i22:A 530 423 0.1917 0.1566 0.1962 3.97e-04 8i22:F, 8i22:B, 8i22:C, 8i22:D, 8i22:E, 8i3i:A, 8i3i:D, 8i3i:B, 8i3i:C, 8i49:A, 8i49:D, 8i49:E, 8i49:F, 8i49:C, 8i49:B, 8i51:A, 8i51:B, 8i51:C, 8i51:D, 8i51:E, 8i51:F, 8i6m:A, 8i6m:F, 8i6m:D, 8i6m:C, 8i6m:B, 8i6m:E, 8i8d:A, 8i8d:B, 8i8d:C, 8i8d:D, 8i8d:E, 8i8d:F, 8i8e:F, 8i8e:D, 8i8e:A, 8i8e:B, 8i8e:C, 8i8e:E, 8jyl:A, 8jyl:B, 8jyl:C, 8jyl:D, 8jyl:E, 8jyl:F, 8jyu:A, 8jyu:D, 8jyu:B, 8jyu:C, 8jyu:E, 8jyu:F
80 8rpl:B 630 430 0.1986 0.1365 0.2000 5.33e-04 8rpk:A, 8rpk:B, 8rpk:C, 8rpk:D, 8rpl:A, 8rpl:C, 8rpl:D
81 8biq:A 562 404 0.2032 0.1566 0.2178 0.002 8biq:B, 8biq:C, 8biq:D, 8bit:A, 8bit:B
82 5oe3:A 394 68 0.0531 0.0584 0.3382 0.002 5oe3:B, 5oe3:C, 5oe3:D, 5oe4:A, 5oe4:B, 5oe5:A, 5oe6:A, 5oe6:B, 5oe6:C, 5oe6:D
83 7l4g:B 668 416 0.1894 0.1228 0.1971 0.019 9c8s:A, 9c8s:B, 9c8s:C, 8eps:A, 8eps:B, 8eps:C, 8g0r:A, 8g0r:B, 8g0r:C, 8g0s:A, 8g0s:B, 8g0s:C, 8g0t:A, 8g0t:B, 8g0t:C, 8g0u:A, 8g0u:B, 8g0v:A, 8g0v:B, 8g0v:C, 5ifi:A, 5ifi:B, 5ifi:C, 5k85:A, 5k85:B, 5k85:C, 5k8f:A, 5k8f:B, 5k8f:C, 7kno:A, 7kno:B, 7kno:C, 7knp:A, 7knp:B, 7knp:C, 7l4g:A, 7l4g:C, 5u29:A, 5u29:B, 5u29:C, 8v5g:A, 8v5g:B
84 5gxd:A 627 90 0.0531 0.0367 0.2556 0.026
85 8hlk:A 910 79 0.0485 0.0231 0.2658 0.042
86 8hlk:A 910 81 0.0554 0.0264 0.2963 0.070
87 6akd:A 488 58 0.0439 0.0389 0.3276 0.046
88 5u8o:B 360 55 0.0416 0.0500 0.3273 0.079 5i0p:C, 5i0p:D, 5u8o:A, 5u8o:C, 5u8o:D
89 8u2r:A 664 401 0.1824 0.1190 0.1970 0.082 8sf3:A, 8u2s:A, 8u2s:B, 8u2t:A, 8u2u:A
90 5i0p:B 323 55 0.0416 0.0557 0.3273 0.13 5i0p:A
91 7wua:A 603 459 0.2286 0.1642 0.2157 0.21 7wua:B, 7wua:C, 7wua:D
92 5c5h:B 448 240 0.1316 0.1272 0.2375 0.37 5c5h:A, 6nj0:A
93 6ao1:A 354 55 0.0393 0.0480 0.3091 0.41 6ao1:B, 6ao1:C, 6ao1:D
94 8w0b:A 667 71 0.0508 0.0330 0.3099 0.63 7kds:A, 8v4o:A, 8v4o:B, 8v4o:C, 8v4p:A, 8v4p:B, 8v4p:C, 8v4r:A, 8v4r:B, 8v4r:C, 8w0b:B, 8w0b:C, 8w0c:A, 8w0c:B, 8w0c:C, 8w0d:A, 8w0d:B, 8w0d:C, 8w0h:A, 8w0h:B, 8w0h:C, 8w0j:A, 8w0j:B, 8w0j:C, 8w0l:A, 8w0l:B, 8w0l:C, 8w0m:A, 8w0m:B, 8w0m:C
95 1pjq:B 455 147 0.0855 0.0813 0.2517 0.91 6p5x:A, 6p5x:B, 6p5z:A, 6p5z:B, 6p7c:A, 6p7c:B, 6p7d:A, 6p7d:B, 1pjs:A, 1pjs:B, 1pjt:A, 1pjt:B, 6pqz:A, 6pqz:B, 6pr0:A, 6pr0:B, 6pr1:A, 6pr1:B, 6pr2:A, 6pr2:B, 6pr3:A, 6pr3:B, 6pr4:A, 6pr4:B, 6ulu:A, 6ulu:B, 6veb:A, 6veb:B
96 8k4r:A 506 59 0.0393 0.0336 0.2881 1.0 8k4r:C
97 5d6j:A 630 84 0.0531 0.0365 0.2738 1.2 5ey8:A, 5ey8:B, 5ey8:C, 5ey8:D, 5ey8:E, 5ey8:F, 5ey8:G, 5ey8:H, 5icr:A, 5icr:B, 5icr:C, 5icr:D
98 8g0u:C 455 99 0.0554 0.0527 0.2424 1.2
99 3kxw:A 572 265 0.1201 0.0909 0.1962 1.9 3lnv:A
100 7ajt:UR 482 95 0.0531 0.0477 0.2421 2.2 7aju:UR, 7d4i:B8, 7d5s:B8, 7d5t:B8, 7d63:B8, 6ke6:B8, 6lqp:B8, 6lqq:B8, 6lqr:B8, 6lqs:B8, 6lqt:B8, 6lqu:B8, 6lqv:B8, 6nd4:S, 7suk:LS, 5wlc:LS, 6zqa:UR, 6zqb:UR, 6zqc:UR, 6zqd:UR
101 5gud:E 460 55 0.0416 0.0391 0.3273 3.3 5gud:A, 5gud:B, 5gud:C, 5gud:D, 5gud:F, 5ijz:A, 5ijz:B, 5ijz:C, 5ijz:D, 5ijz:E, 5ijz:F, 5ijz:G, 5ijz:H, 5ijz:J
102 6gtd:A 1269 125 0.0739 0.0252 0.2560 9.6 6i1l:D, 5nfv:A, 5ng6:A, 5ng6:C, 5ng6:E, 5ng6:G

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218