Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
KPFLGMPAPLGYVPGLGRGATGFTTRSDIGPARDEKDDEEADAIYAALDKRMDERRKERREQREKEEIEKYRMERPKIQQ
QFSDLKRKLAEVTEEEWLSIPEVGDARNKRQRNPRYEKLTPVPDSFFAKHLQTGENHTSVDPRQTQFGGGDINDIKKARL
LLKSVRETNPHHPPAWIASARLEEVTGKLQVARNLIMKGTEMCPKSEDVWLEAARLQPGDTAKAVVAQAVRHLPQSVRIY
IRAAELETDIRAKKRVLRKALEHVPNSVRLWKAAVELEEPEDARIMLSRAVECCPTSVELWLALARLETYENARKVLNKA
RENIPTDRHIWITAAKLEEANGNTQMVEKIIDRAITSLRANGVEINREQWIQDAEECDRAGSVATCQAVMRAVIGIGIEE
EDRKHTWMEDADSCVAHNALECARAIYAYALQVFPSKKSVWLRAAYFEKNHGTRESLEALLQRAVAHCPKAEVLWLMGAK
SKWLAGDVPAARSILALAFQANPNSEEIWLAAVKLESENDEYERARRLLAKARSSAPTARVFMKSVKLEWVQDNIRAAQD
LCEEALRHYEDFPKLWMMKGQIEEQKEMMEKAREAYNQGLKKCPHSTPLWLLLSRLEEKIGQLTRARAILEKSRLKNPKN
PGLWLESVRLEYRAGLKNIANTLMAKALQECPNSGILWSEAIFLEARPQRRTKSVDALKKCEHDPHVLLAVAKLFWSQRK
ITKAREWFHRTVKIDSDLGDAWAFFYKFELQHGTEEQQEEVRKRCESAEPRHGELWCAVSKDIANWQKKIGDILRLVAGR
I

The query sequence (length=801) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 8r09:N 834 830 0.9963 0.9568 0.9614 0.0 6ahd:N, 5o9z:G, 8q7n:N, 8qo9:N, 8qpe:N, 8qzs:N, 8r0b:N, 8rc0:E, 8rm5:N
2 6qw6:5J 803 807 0.9213 0.9191 0.9145 0.0 8h6e:4G, 8h6j:4G, 8h6k:4G, 8h6l:4G, 8qp8:N, 6qx9:5J, 8y6o:G
3 8qoz:N 457 366 0.3633 0.6368 0.7951 0.0 8qpa:N, 8qpb:N
4 8qoz:N 457 283 0.2185 0.3829 0.6184 1.36e-104 8qpa:N, 8qpb:N
5 8qoz:N 457 262 0.0799 0.1400 0.2443 1.16e-08 8qpa:N, 8qpb:N
6 8qoz:N 457 253 0.0774 0.1357 0.2451 2.24e-08 8qpa:N, 8qpb:N
7 8qoz:N 457 162 0.0499 0.0875 0.2469 2.00e-05 8qpa:N, 8qpb:N
8 5nrl:J 800 830 0.2959 0.2963 0.2855 2.98e-96 5gan:J, 5gap:J
9 3jcm:G 734 779 0.2747 0.2997 0.2824 6.05e-79 5zwm:N, 5zwo:N
10 8qpk:N 133 128 0.1323 0.7970 0.8281 2.41e-46
11 8c6j:S 635 542 0.1536 0.1937 0.2269 6.70e-17 7abi:O, 8ch6:X, 6ff4:O, 8i0r:J, 8i0s:J, 8i0t:J, 5mqf:O, 7qtt:X, 6zym:O
12 8c6j:S 635 480 0.1411 0.1780 0.2354 3.05e-10 7abi:O, 8ch6:X, 6ff4:O, 8i0r:J, 8i0s:J, 8i0t:J, 5mqf:O, 7qtt:X, 6zym:O
13 8c6j:S 635 103 0.0287 0.0362 0.2233 0.001 7abi:O, 8ch6:X, 6ff4:O, 8i0r:J, 8i0s:J, 8i0t:J, 5mqf:O, 7qtt:X, 6zym:O
14 8ro0:J 574 496 0.1348 0.1882 0.2177 2.61e-16 8ro1:J
15 8ro0:J 574 245 0.0687 0.0958 0.2245 5.00e-07 8ro1:J
16 8ro0:J 574 103 0.0325 0.0453 0.2524 2.10e-06 8ro1:J
17 8ro0:J 574 495 0.1199 0.1672 0.1939 3.13e-04 8ro1:J
18 8ro0:J 574 215 0.0549 0.0767 0.2047 0.026 8ro1:J
19 8i0w:J 571 249 0.0687 0.0963 0.2209 2.46e-09 7dvq:J, 8i0u:J, 8i0v:J, 6icz:J, 6id0:J, 6id1:J, 6qdv:S, 7w59:J, 7w5a:J, 7w5b:J, 5xjc:J, 5yzg:J, 5z56:J, 5z57:J, 5z58:J
20 8i0w:J 571 260 0.0762 0.1068 0.2346 8.00e-07 7dvq:J, 8i0u:J, 8i0v:J, 6icz:J, 6id0:J, 6id1:J, 6qdv:S, 7w59:J, 7w5a:J, 7w5b:J, 5xjc:J, 5yzg:J, 5z56:J, 5z57:J, 5z58:J
21 8i0w:J 571 525 0.1398 0.1961 0.2133 3.02e-04 7dvq:J, 8i0u:J, 8i0v:J, 6icz:J, 6id0:J, 6id1:J, 6qdv:S, 7w59:J, 7w5a:J, 7w5b:J, 5xjc:J, 5yzg:J, 5z56:J, 5z57:J, 5z58:J
22 8i0w:J 571 103 0.0287 0.0403 0.2233 0.001 7dvq:J, 8i0u:J, 8i0v:J, 6icz:J, 6id0:J, 6id1:J, 6qdv:S, 7w59:J, 7w5a:J, 7w5b:J, 5xjc:J, 5yzg:J, 5z56:J, 5z57:J, 5z58:J
23 6rxy:Cz 275 265 0.0774 0.2255 0.2340 9.51e-07 6rxz:Cz
24 6rxy:Cz 275 208 0.0587 0.1709 0.2260 0.71 6rxz:Cz
25 8chy:A 272 251 0.0662 0.1949 0.2112 5.14e-05 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
26 8chy:A 272 222 0.0587 0.1728 0.2117 6.44e-05 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
27 8chy:A 272 254 0.0724 0.2132 0.2283 1.17e-04 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
28 8chy:A 272 221 0.0637 0.1875 0.2308 2.21e-04 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
29 8chy:A 272 272 0.0699 0.2059 0.2059 3.33e-04 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
30 8chy:A 272 244 0.0687 0.2022 0.2254 3.74e-04 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
31 8chy:A 272 229 0.0587 0.1728 0.2052 0.003 8bu0:A, 8cig:A, 8ckr:A, 8cqp:C, 8cqq:A
32 3jb9:R 575 227 0.0649 0.0904 0.2291 1.26e-04
33 3jb9:R 575 143 0.0375 0.0522 0.2098 1.31e-04
34 3jb9:R 575 203 0.0587 0.0817 0.2315 0.008
35 3jb9:R 575 230 0.0587 0.0817 0.2043 0.43
36 5gmk:d 549 179 0.0537 0.0783 0.2402 2.26e-04 5gm6:d, 5wsg:d
37 5gmk:d 549 143 0.0387 0.0565 0.2168 0.25 5gm6:d, 5wsg:d
38 5gmk:d 549 91 0.0262 0.0383 0.2308 1.0 5gm6:d, 5wsg:d
39 5gmk:d 549 91 0.0262 0.0383 0.2308 2.4 5gm6:d, 5wsg:d
40 5gmk:d 549 87 0.0237 0.0346 0.2184 6.7 5gm6:d, 5wsg:d
41 5gmk:d 549 160 0.0375 0.0546 0.1875 6.8 5gm6:d, 5wsg:d
42 7dco:J 554 104 0.0337 0.0487 0.2596 3.28e-04 5y88:I
43 7dco:J 554 143 0.0387 0.0560 0.2168 0.20 5y88:I
44 7dco:J 554 91 0.0262 0.0379 0.2308 1.0 5y88:I
45 7dco:J 554 255 0.0649 0.0939 0.2039 2.0 5y88:I
46 7dco:J 554 91 0.0262 0.0379 0.2308 4.5 5y88:I
47 7dco:J 554 121 0.0312 0.0451 0.2066 4.9 5y88:I
48 7dco:J 554 147 0.0337 0.0487 0.1837 6.6 5y88:I
49 5ylz:I 517 104 0.0337 0.0522 0.2596 3.97e-04
50 5ylz:I 517 143 0.0387 0.0600 0.2168 0.22
51 5ylz:I 517 91 0.0262 0.0406 0.2308 1.1
52 5ylz:I 517 415 0.1049 0.1625 0.2024 2.6
53 5ylz:I 517 91 0.0262 0.0406 0.2308 5.3
54 5ylz:I 517 121 0.0312 0.0484 0.2066 5.9
55 5ylz:I 517 147 0.0337 0.0522 0.1837 6.3
56 6j6g:d 566 104 0.0337 0.0477 0.2596 3.99e-04 7b9v:S, 6j6h:d, 6j6n:d, 6j6q:d, 5lqw:R
57 6j6g:d 566 143 0.0387 0.0548 0.2168 0.18 7b9v:S, 6j6h:d, 6j6n:d, 6j6q:d, 5lqw:R
58 6j6g:d 566 420 0.0949 0.1343 0.1810 1.3 7b9v:S, 6j6h:d, 6j6n:d, 6j6q:d, 5lqw:R
59 6j6g:d 566 91 0.0262 0.0371 0.2308 1.3 7b9v:S, 6j6h:d, 6j6n:d, 6j6q:d, 5lqw:R
60 6j6g:d 566 121 0.0312 0.0442 0.2066 5.8 7b9v:S, 6j6h:d, 6j6n:d, 6j6q:d, 5lqw:R
61 6j6g:d 566 91 0.0262 0.0371 0.2308 5.9 7b9v:S, 6j6h:d, 6j6n:d, 6j6q:d, 5lqw:R
62 6bk8:T 483 112 0.0375 0.0621 0.2679 4.19e-04 6exn:S, 5lj3:S, 5lj5:S, 5mps:S, 5mq0:S
63 6bk8:T 483 143 0.0387 0.0642 0.2168 0.26 6exn:S, 5lj3:S, 5lj5:S, 5mps:S, 5mq0:S
64 6bk8:T 483 91 0.0262 0.0435 0.2308 1.6 6exn:S, 5lj3:S, 5lj5:S, 5mps:S, 5mq0:S
65 6bk8:T 483 87 0.0237 0.0393 0.2184 4.8 6exn:S, 5lj3:S, 5lj5:S, 5mps:S, 5mq0:S
66 6bk8:T 483 81 0.0250 0.0414 0.2469 6.2 6exn:S, 5lj3:S, 5lj5:S, 5mps:S, 5mq0:S
67 6bk8:T 483 122 0.0337 0.0559 0.2213 8.4 6exn:S, 5lj3:S, 5lj5:S, 5mps:S, 5mq0:S
68 6bk8:T 483 147 0.0337 0.0559 0.1837 9.7 6exn:S, 5lj3:S, 5lj5:S, 5mps:S, 5mq0:S
69 8ro2:I 753 332 0.0974 0.1036 0.2349 0.003
70 8ro2:I 753 415 0.1161 0.1235 0.2241 0.13
71 8ro2:I 753 240 0.0749 0.0797 0.2500 0.35
72 8ro2:I 753 194 0.0549 0.0584 0.2268 1.8
73 5oql:E 331 91 0.0300 0.0725 0.2637 0.030 6rxt:UF, 6rxu:UF, 6rxv:UF, 6rxy:UF, 6rxz:UF
74 5oql:E 331 64 0.0237 0.0574 0.2969 0.40 6rxt:UF, 6rxu:UF, 6rxv:UF, 6rxy:UF, 6rxz:UF
75 5oql:E 331 85 0.0250 0.0604 0.2353 3.9 6rxt:UF, 6rxu:UF, 6rxv:UF, 6rxy:UF, 6rxz:UF
76 5oql:E 331 80 0.0262 0.0634 0.2625 6.0 6rxt:UF, 6rxu:UF, 6rxv:UF, 6rxy:UF, 6rxz:UF
77 7suk:LP 359 63 0.0237 0.0529 0.3016 0.053 5wlc:LP
78 7suk:LP 359 90 0.0250 0.0557 0.2222 0.087 5wlc:LP
79 7suk:LP 359 95 0.0250 0.0557 0.2105 3.1 5wlc:LP
80 7d4i:B6 377 63 0.0237 0.0504 0.3016 0.057 7ajt:UF, 7d5s:B6, 7d5t:B6, 7d63:B6, 6ke6:B6, 6lqp:B6, 6lqq:B6, 6lqr:B6, 6lqs:B6, 6lqt:B6, 6lqu:B6, 6lqv:B6, 6zqa:UF, 6zqb:UF, 6zqc:UF
81 7d4i:B6 377 90 0.0250 0.0531 0.2222 0.14 7ajt:UF, 7d5s:B6, 7d5t:B6, 7d63:B6, 6ke6:B6, 6lqp:B6, 6lqq:B6, 6lqr:B6, 6lqs:B6, 6lqt:B6, 6lqu:B6, 6lqv:B6, 6zqa:UF, 6zqb:UF, 6zqc:UF
82 7d4i:B6 377 95 0.0250 0.0531 0.2105 5.1 7ajt:UF, 7d5s:B6, 7d5t:B6, 7d63:B6, 6ke6:B6, 6lqp:B6, 6lqq:B6, 6lqr:B6, 6lqs:B6, 6lqt:B6, 6lqu:B6, 6lqv:B6, 6zqa:UF, 6zqb:UF, 6zqc:UF
83 7yeh:A 1020 199 0.0562 0.0441 0.2261 0.064 4ay5:A, 4ay5:B, 4ay5:C, 4ay5:D, 4ay6:A, 4ay6:B, 4ay6:C, 4ay6:D, 5c1d:A, 4cdr:A, 4cdr:B, 4cdr:C, 4cdr:D, 8cm9:A, 8cm9:B, 8cm9:D, 8cm9:C, 8fe7:A, 8fe7:C, 8fe7:E, 8fe7:G, 8fuf:A, 8fuf:C, 8fuf:E, 8fuf:G, 4gyw:C, 4gz3:C, 4gz5:A, 4gz5:B, 4gz5:C, 4gz5:D, 4gz6:A, 4gz6:B, 4gz6:C, 4gz6:D, 5hgv:C, 6ibo:A, 5lvv:A, 6ma1:A, 6ma2:A, 6ma3:A, 6ma4:A, 6ma5:A, 4n39:A, 4n3a:A, 4n3b:A, 4n3c:A, 5npr:A, 3pe3:A, 3pe3:B, 3pe3:C, 3pe3:D, 3pe4:A, 3pe4:C, 6q4m:A, 3tax:A, 3tax:C, 1w3b:A, 4xi9:A, 4xi9:B, 4xi9:C, 4xi9:D, 4xif:A, 4xif:B, 4xif:C, 4xif:D
84 7ane:ar 252 50 0.0262 0.0833 0.4200 0.52
85 7d5s:RD 265 220 0.0649 0.1962 0.2364 0.61 6lqu:RD, 7suk:NJ, 5wlc:NJ
86 7zc6:D 304 72 0.0287 0.0757 0.3194 0.90
87 3kd7:A 102 97 0.0300 0.2353 0.2474 1.9 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
88 3kd7:A 102 104 0.0325 0.2549 0.2500 4.0 3kd7:B, 3kd7:C, 3kd7:D, 3kd7:E
89 6j6h:v 722 133 0.0487 0.0540 0.2932 1.9 6j6n:v, 6j6q:v
90 7zy4:B 306 46 0.0212 0.0556 0.3696 2.5 7zy4:A
91 7m0d:B 340 60 0.0225 0.0529 0.3000 3.5 2bcq:A, 2bcr:A, 2bcs:A, 2bcu:A, 2bcv:A, 3c5f:A, 3c5f:B, 3c5g:A, 3c5g:B, 5ca7:B, 5ca7:A, 5chg:A, 5chg:B, 5cj7:A, 5cj7:B, 5cp2:B, 5cr0:A, 5cr0:B, 5cwr:A, 5cwr:B, 5ddm:B, 5ddy:A, 5ddy:C, 5ddy:E, 5ddy:G, 5dkw:A, 5dkw:B, 4fo6:A, 2gws:A, 2gws:E, 2gws:I, 2gws:M, 3hw8:A, 3hwt:A, 3hx0:A, 3hx0:F, 3hx0:K, 3hx0:P, 5iii:A, 5iij:A, 5iik:A, 5iil:A, 5iim:A, 5iin:A, 5iio:A, 5iio:M, 5iio:E, 5iio:I, 4k4g:A, 4k4g:M, 4k4g:E, 4k4g:I, 4k4h:A, 4k4h:E, 4k4h:I, 4k4h:M, 4k4i:A, 4k4i:E, 4k4i:I, 4k4i:M, 7m07:A, 7m08:A, 7m09:A, 7m0a:A, 7m0b:A, 7m0c:A, 7m0d:A, 7m0e:A, 7m0e:B, 7m0e:C, 7m0e:D, 7m43:A, 7m44:A, 7m45:A, 7m46:A, 7m47:A, 7m48:A, 7m49:A, 7m4a:A, 7m4b:A, 7m4c:A, 7m4d:A, 7m4e:A, 7m4f:A, 7m4g:A, 7m4h:A, 7m4i:A, 7m4j:A, 7m4k:A, 7m4l:A, 3mda:A, 3mdc:A, 3mgh:A, 3mgh:C, 3mgi:A, 2pfn:A, 2pfo:A, 2pfp:A, 2pfq:A, 3pml:A, 3pml:B, 3pmn:A, 3pnc:A, 1rzt:A, 1rzt:M, 1rzt:E, 1rzt:I, 8u0o:A, 8u0p:A, 7un7:A, 3upq:A, 3uq0:A, 3uq2:A, 4x5v:A, 4xa5:A, 4xq8:B, 4xq8:A, 4xrh:B, 4xrh:A, 1xsl:A, 1xsl:E, 1xsl:I, 1xsl:M, 1xsn:A, 1xsp:A, 4xus:A
92 3fp2:A 483 185 0.0537 0.0890 0.2324 4.4 3fp4:A, 3lca:A
93 8w9z:G 218 127 0.0400 0.1468 0.2520 4.5 8wa0:G, 8wa1:G
94 2xpi:A 520 50 0.0200 0.0308 0.3200 5.2 2xpi:D
95 1na0:B 119 100 0.0300 0.2017 0.2400 8.3 1na3:A, 1na3:B
96 7tra:A 572 76 0.0262 0.0367 0.2763 8.5

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218