BioLiP

>protein
KKLNLKDKYQYLTRDMAWEPTYQDKKDIFPEEDFEGIKITDWSQWEDPFRLTMDAYWKYQAEKEKKLYAIFDAFAQNNGH
QNISDARYVNALKLFISGISPLEHAAFQGYSKVGRQFSGAGARVACQMQAIDELRHSQTQQHAMSHYNKHFNGLHDGPHM
HDRVWYLSVPKSFFDDARSAGPFEFLTAISFSFEYVLTNLLFVPFMSGAAYNGDMATVTFGFSAQSDEARHMTLGLEVIK
FILEQHEDNVPIVQRWIDKWFWRGFRLLSLVSMMMDYMLPNKVMSWSEAWEVYYEQNGGALFKDLERYGIRPPKYQDVAN
DAKHHLSHQLWTTFYQYCQATNFHTWIPEKEEMDWMSEKYPDTFDKYYRPRYEYLAKEAAAGRRFYNNTLPQLCQVCQIP
TIFTEKDAPTMLSHRQIEHEGERYHFCSDGCCDIFKHEPEKYIQAWLPVHQIYQGNCEGGDLETVVQKYYHINIGEDNFD
YVGSPDQKHWLSI

The query sequence (length=493) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2inn:A	496	493	1.0000	0.9940	1.0000	0.0	2inn:B, 2inp:A, 2inp:B, 3u52:A, 3u52:B
2	2inc:A	491	492	0.2698	0.2709	0.2703	2.95e-38	2ind:A, 3n1x:A, 3n1y:A, 3n1z:A, 3n20:A, 2rdb:A, 3rn9:A, 3rna:A, 3rnb:A, 3rnc:A, 3rne:A, 3rnf:A, 3rng:A, 1t0q:A, 1t0r:A, 1t0s:A
3	3dhi:A	498	477	0.2657	0.2631	0.2746	5.14e-38	3dhg:A, 3dhg:D, 3dhh:A, 3ge3:A, 3ge8:A, 3ge8:D, 3i5j:A, 3i63:A, 4p1b:A, 4p1b:D, 4p1c:A, 4p1c:D, 3q14:A, 3q2a:A, 3q3m:A, 3q3m:D, 3q3n:A, 3q3o:A, 3ri7:A, 3rmk:A, 3rmk:D, 5tds:A, 5tds:D, 5tdt:A, 5tdt:D, 5tdu:A, 5tdv:A, 5tdv:D
4	1fzi:A	512	427	0.2211	0.2129	0.2553	3.75e-20	1fyz:A, 1fyz:B, 1fz0:A, 1fz0:B, 1fz1:A, 1fz1:B, 1fz2:A, 1fz2:B, 1fz3:A, 1fz3:B, 1fz4:A, 1fz4:B, 1fz5:A, 1fz5:B, 1fz6:A, 1fz6:B, 1fz7:A, 1fz7:B, 1fz8:A, 1fz8:B, 1fz9:A, 1fz9:B, 1fzh:A, 1fzh:B, 1fzi:B, 4gam:A, 4gam:F, 4gam:K, 4gam:P, 1mmo:D, 1mmo:E, 1mty:D, 1mty:E, 7tc7:D, 7tc7:E, 7tc8:D, 7tc8:E, 1xmf:A, 1xmf:B, 1xmh:A, 1xmh:B, 1xu3:A, 1xu3:B, 1xu5:A, 1xu5:B, 1xvb:A, 1xvb:B, 1xvc:A, 1xvc:B, 1xvd:A, 1xvd:B, 1xve:A, 1xve:B, 1xvf:A, 1xvf:B, 1xvg:A, 1xvg:B
5	7m8q:A	515	451	0.1927	0.1845	0.2106	1.00e-14	6d7k:A, 6d7k:E, 7m8q:E, 7m8r:A, 7m8r:E, 1mhy:D, 1mhz:D, 7s6q:A, 7s6q:E, 7s6r:A, 7s6r:E, 7s6s:A, 7s6s:E, 7s6t:A, 7s6t:E, 7s7h:A, 7s7h:E, 6vk4:A, 6vk4:E, 6vk5:A, 6vk5:E, 6vk6:A, 6vk7:A, 6vk8:A, 6vk8:E, 6yd0:D, 6ydi:D, 6ydu:D, 6yy3:D
6	1t0s:B	323	231	0.1116	0.1703	0.2381	4.01e-05
7	3rmk:E	306	233	0.0974	0.1569	0.2060	3.33e-04	3dhg:B, 3dhg:E, 3dhh:B, 3q2a:B, 3q3m:B, 3q3m:F, 3q3o:B, 3rmk:B, 5tds:B
8	6cwq:A	308	141	0.0811	0.1299	0.2837	0.080	6cwo:A, 6cwo:B, 6cwp:B, 6cwp:A, 6cwq:B, 8dq4:A, 8dq4:B, 8dq5:A
9	3mq2:A	215	57	0.0365	0.0837	0.3158	0.42	3mq2:B
10	6bzc:A	548	115	0.0548	0.0493	0.2348	1.1	6bzc:B
11	7apd:C	287	69	0.0467	0.0801	0.3333	3.6	5a9k:A, 5a9k:B, 5a9k:C, 7apd:D, 7apd:E, 7apd:F, 7apd:A, 2gxa:B, 2gxa:C, 2gxa:D, 2gxa:E, 2gxa:F, 2gxa:G, 2gxa:H, 2gxa:I, 2gxa:J, 2gxa:K, 2gxa:L, 2gxa:A, 2v9p:A, 2v9p:B, 2v9p:C, 2v9p:H, 2v9p:I
12	8dq5:B	265	154	0.0872	0.1623	0.2792	3.7

[Back]