Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVRGEGEGDATNGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLVQCFSRYPDHMKRHDFFK
SAMPEGYVQERTISFKDDGTYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNLRVSTPRWERIARVLVCLLGI
LLSLYAFHVEREHARDPSYKALCDVSSSISCSKVFGSRWGRGFGLLGSIFGNDSALNQPNSVYGIVFYAFQLLLGMTVSA
MAALILMTTSIMSVVGSLYLGYILYFVLKDLCVICVTTYALNFILFVLNYKRLVYLNEAWKQKLQAKQDNSHNVYITADK
QKNGIKANFKIRHNVEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSVLSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITHELYKS
NSLEVLFQ

The query sequence (length=408) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6wvb:A 408 408 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 6wv8:A
2 6wv7:B 388 394 0.7377 0.7758 0.7640 0.0 6wv3:A, 6wv4:A, 6wv5:A, 6wv6:A, 6wv7:A, 6wvh:A, 6wvh:B
3 6wvf:A 386 412 0.6250 0.6606 0.6189 2.49e-161 3e9j:C, 3e9j:F, 2hi7:B, 2leg:B, 2ltq:A, 2zup:B, 2zuq:A, 2zuq:D
4 7vcm:A 371 399 0.4730 0.5202 0.4837 1.09e-106 7pvc:A, 7vcm:B
5 7bwn:J 280 143 0.3407 0.4964 0.9720 1.18e-96 7bwn:O, 7bwn:C, 7bwn:M, 4gf6:B, 4w74:A, 4w74:B, 4w74:H, 4w74:C, 4w74:D, 4w74:E, 4w76:A, 4w76:B, 4w77:A, 4w77:B, 4w7a:A, 4w7a:B, 4w7c:B, 4w7d:A, 4w7f:A, 4w7r:A, 4w7r:B, 4w7r:C, 4w7r:D
6 7bwn:J 280 93 0.2206 0.3214 0.9677 7.80e-56 7bwn:O, 7bwn:C, 7bwn:M, 4gf6:B, 4w74:A, 4w74:B, 4w74:H, 4w74:C, 4w74:D, 4w74:E, 4w76:A, 4w76:B, 4w77:A, 4w77:B, 4w7a:A, 4w7a:B, 4w7c:B, 4w7d:A, 4w7f:A, 4w7r:A, 4w7r:B, 4w7r:C, 4w7r:D
7 8ovo:A 503 140 0.3382 0.2744 0.9857 1.76e-96 8ovo:B, 8ovp:A, 8ovp:B, 2vha:A, 2vha:B
8 8ovo:A 503 93 0.2108 0.1710 0.9247 8.04e-52 8ovo:B, 8ovp:A, 8ovp:B, 2vha:A, 2vha:B
9 6m63:A 359 139 0.3309 0.3760 0.9712 6.20e-96 6m63:B
10 6m63:A 359 89 0.1936 0.2201 0.8876 2.13e-46 6m63:B
11 7s7t:A 509 140 0.3358 0.2692 0.9786 3.03e-94 8i4o:A, 8i4o:C, 8i4o:E, 8i4o:G, 8i4o:I, 8i4o:K
12 7s7t:A 509 95 0.2059 0.1650 0.8842 1.09e-48 8i4o:A, 8i4o:C, 8i4o:E, 8i4o:G, 8i4o:I, 8i4o:K
13 4z4k:A 282 139 0.3235 0.4681 0.9496 1.93e-92 5aas:A, 4bmj:A, 4bmj:B, 4bmj:D, 4bmj:E, 4bmj:F, 4bmj:G, 4bmj:I, 4bmj:K, 3vht:B, 5yt6:D, 4z4k:B, 4z4m:A, 4z4m:B
14 4z4k:A 282 83 0.1936 0.2801 0.9518 1.96e-49 5aas:A, 4bmj:A, 4bmj:B, 4bmj:D, 4bmj:E, 4bmj:F, 4bmj:G, 4bmj:I, 4bmj:K, 3vht:B, 5yt6:D, 4z4k:B, 4z4m:A, 4z4m:B
15 6xu4:A 389 140 0.3235 0.3393 0.9429 2.66e-92 6xu4:B, 6xu4:E
16 6xu4:A 389 79 0.1789 0.1877 0.9241 1.82e-43 6xu4:B, 6xu4:E
17 6quh:B 228 139 0.2990 0.5351 0.8777 6.58e-92 6quh:E, 6qui:B, 6qui:E, 6quj:B, 6quj:E
18 6quh:B 228 85 0.1814 0.3246 0.8706 9.60e-49 6quh:E, 6qui:B, 6qui:E, 6quj:B, 6quj:E
19 3osr:A 603 154 0.3333 0.2255 0.8831 1.99e-90 3osr:B
20 3osr:A 603 84 0.1912 0.1294 0.9286 6.07e-46 3osr:B
21 3osq:A 607 140 0.3260 0.2191 0.9500 2.72e-90
22 3osq:A 607 95 0.2059 0.1384 0.8842 4.31e-47
23 3o78:A 402 141 0.3186 0.3234 0.9220 4.91e-90 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
24 3o78:A 402 83 0.1961 0.1990 0.9639 1.80e-48 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
25 7e9y:A 563 140 0.3235 0.2345 0.9429 6.04e-90
26 7e9y:A 563 95 0.1936 0.1403 0.8316 4.81e-46
27 6gez:B 532 139 0.3235 0.2481 0.9496 9.04e-90 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
28 6gez:B 532 138 0.3235 0.2481 0.9565 4.18e-89 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
29 6gez:B 532 79 0.1789 0.1372 0.9241 1.57e-41 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
30 6gez:B 532 109 0.1593 0.1222 0.5963 1.31e-28 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
31 6gez:B 532 27 0.0613 0.0470 0.9259 2.65e-08 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
32 8b6s:A 517 138 0.3260 0.2573 0.9638 1.89e-89 8b6r:A, 8b6s:B, 8b6t:A, 8b6t:B, 1cqw:A, 4fwb:A, 4hzg:A, 8j1o:A, 4kac:A, 4kac:B, 4kaj:A, 4kyv:A, 4kyv:B, 7o3o:A, 7o8b:A, 7ond:A, 7ond:B, 7oo4:A, 7pcw:A, 7pcw:B, 7pcw:C, 7pcw:D, 7pcx:A, 7pcx:B, 7pcx:F, 7pcx:C, 7pcx:D, 7pcx:E, 3rk4:A, 8sw8:AAA, 6u32:A, 5uxz:A, 5uxz:B, 5vnp:A, 5vnp:B, 7wam:A, 7wan:A, 5y2y:A, 5y2y:B, 6y7a:A, 6y7b:A, 6y7b:B, 6y7b:E, 6y7b:C, 6y7b:D, 7zba:A, 7zba:B, 7zbb:A, 7zbb:B, 7zbd:A, 7zbd:B, 6zcc:A, 7ziv:A, 7ziw:A, 7ziw:B, 7zix:A, 7zix:B, 7ziy:A, 7ziy:B, 7ziz:A, 7zj0:A, 7zj0:B, 6zvu:A, 6zvv:A, 6zvv:B, 6zvv:C, 6zvv:D, 6zvw:A, 6zvw:B, 6zvx:A, 6zvy:A, 6zvy:B
33 8b6s:A 517 85 0.1985 0.1567 0.9529 9.77e-49 8b6r:A, 8b6s:B, 8b6t:A, 8b6t:B, 1cqw:A, 4fwb:A, 4hzg:A, 8j1o:A, 4kac:A, 4kac:B, 4kaj:A, 4kyv:A, 4kyv:B, 7o3o:A, 7o8b:A, 7ond:A, 7ond:B, 7oo4:A, 7pcw:A, 7pcw:B, 7pcw:C, 7pcw:D, 7pcx:A, 7pcx:B, 7pcx:F, 7pcx:C, 7pcx:D, 7pcx:E, 3rk4:A, 8sw8:AAA, 6u32:A, 5uxz:A, 5uxz:B, 5vnp:A, 5vnp:B, 7wam:A, 7wan:A, 5y2y:A, 5y2y:B, 6y7a:A, 6y7b:A, 6y7b:B, 6y7b:E, 6y7b:C, 6y7b:D, 7zba:A, 7zba:B, 7zbb:A, 7zbb:B, 7zbd:A, 7zbd:B, 6zcc:A, 7ziv:A, 7ziw:A, 7ziw:B, 7zix:A, 7zix:B, 7ziy:A, 7ziy:B, 7ziz:A, 7zj0:A, 7zj0:B, 6zvu:A, 6zvv:A, 6zvv:B, 6zvv:C, 6zvv:D, 6zvw:A, 6zvw:B, 6zvx:A, 6zvy:A, 6zvy:B
34 7ydq:A 598 142 0.3284 0.2241 0.9437 4.81e-89 4as8:A, 2b3q:A, 2b3q:D, 8dhy:A, 8dpd:A, 4eul:A, 6gqg:A, 6ir7:A, 4jfg:A, 4jfg:B, 4jfg:C, 4jfg:D, 4jfg:E, 4jfg:F, 4jfg:G, 4jfg:H, 6jgj:A, 4ka9:A, 4kw9:A, 1kyr:A, 1kys:A, 4l1i:A, 5nhn:B, 5nhn:A, 5ni3:A, 5ni3:D, 5ni3:B, 5ni3:C, 2o24:A, 7pca:A, 6sm0:A, 5t3i:A, 4w7c:D, 4w7e:A
35 7ydq:A 598 97 0.2059 0.1405 0.8660 8.24e-50 4as8:A, 2b3q:A, 2b3q:D, 8dhy:A, 8dpd:A, 4eul:A, 6gqg:A, 6ir7:A, 4jfg:A, 4jfg:B, 4jfg:C, 4jfg:D, 4jfg:E, 4jfg:F, 4jfg:G, 4jfg:H, 6jgj:A, 4ka9:A, 4kw9:A, 1kyr:A, 1kys:A, 4l1i:A, 5nhn:B, 5nhn:A, 5ni3:A, 5ni3:D, 5ni3:B, 5ni3:C, 2o24:A, 7pca:A, 6sm0:A, 5t3i:A, 4w7c:D, 4w7e:A
36 6hr1:A 406 135 0.3113 0.3128 0.9407 1.29e-88 6hr1:B
37 6hr1:A 406 87 0.1961 0.1970 0.9195 5.27e-49 6hr1:B
38 4pa0:A 974 138 0.3235 0.1355 0.9565 1.29e-86 4db1:A, 4db1:B, 8efe:A, 8efh:A, 9f6c:A, 6fsa:A, 6fsa:B, 5n69:A, 5n69:B, 5n6a:A, 8qyu:A
39 4pa0:A 974 82 0.1716 0.0719 0.8537 5.20e-36 4db1:A, 4db1:B, 8efe:A, 8efh:A, 9f6c:A, 6fsa:A, 6fsa:B, 5n69:A, 5n69:B, 5n6a:A, 8qyu:A
40 4anj:A 995 139 0.3211 0.1317 0.9424 3.52e-86 1jbz:A
41 4anj:A 995 83 0.1912 0.0784 0.9398 1.52e-45 1jbz:A
42 4w75:B 187 130 0.2819 0.6150 0.8846 1.24e-73
43 4w75:B 187 82 0.1373 0.2995 0.6829 1.13e-26
44 3u8p:A 336 102 0.2426 0.2946 0.9706 2.10e-67 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
45 3u8p:A 336 85 0.1985 0.2411 0.9529 4.15e-51 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
46 3u8p:A 336 38 0.0882 0.1071 0.9474 4.15e-15 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
47 8smu:D 394 102 0.2426 0.2513 0.9706 1.03e-66 8smu:A, 8smu:C, 8smu:B
48 8smu:D 394 85 0.1961 0.2030 0.9412 1.03e-49 8smu:A, 8smu:C, 8smu:B
49 8smu:D 394 38 0.0882 0.0914 0.9474 8.12e-15 8smu:A, 8smu:C, 8smu:B
50 4pa0:B 920 116 0.2426 0.1076 0.8534 8.00e-58 8qyu:B
51 4pa0:B 920 84 0.1593 0.0707 0.7738 8.90e-30 8qyu:B
52 8xld:A 213 157 0.1324 0.2535 0.3439 3.93e-24 8ill:B
53 4q9x:A 213 151 0.1176 0.2254 0.3179 9.07e-21 4r6d:A
54 4ljb:C 223 152 0.1176 0.2152 0.3158 9.10e-21 4ljb:A, 4ljc:C, 4ljd:A, 4ljd:B, 4ljd:C, 4ljd:D, 3p8u:A, 3p8u:B, 3p8u:D, 3tmr:A, 3tmr:B, 3tmr:C, 3tmr:D, 2vvh:A, 2vvh:B, 2vvh:C, 2vvh:D, 2vvi:A, 2vvi:B, 2vvi:C, 2vvi:D, 2vvj:A, 2vvj:B, 2vvj:C, 2vvj:D
55 4dxp:A 216 153 0.1225 0.2315 0.3268 1.31e-20
56 8hgi:A 220 151 0.1152 0.2136 0.3113 1.63e-18 8hgi:B, 8tjh:A, 8tjh:B
57 2vad:A 217 160 0.1127 0.2120 0.2875 1.85e-18
58 7qgk:A 217 133 0.1054 0.1982 0.3233 5.11e-18
59 2gx2:F 217 151 0.1054 0.1982 0.2848 1.39e-17 2gx2:A, 2gx2:D, 2gx2:H, 2gx2:K, 5hzs:A, 5hzs:B, 5hzs:C, 5hzs:D, 5hzs:E, 5hzs:F, 5hzs:G, 5hzs:H, 5hzs:I, 5hzs:J, 5hzs:K, 5hzs:L, 5hzt:B, 5hzt:C, 5hzt:D, 5hzt:E, 5hzt:F, 5hzt:G, 5hzt:H, 5hzt:I, 5hzt:J, 5hzt:L
60 1xmz:B 231 154 0.1103 0.1948 0.2922 5.79e-17 1xmz:A
61 3u0k:A 397 123 0.1005 0.1033 0.3333 7.11e-16
62 2arl:A 218 150 0.1054 0.1972 0.2867 7.85e-16
63 7x2b:A 217 123 0.0907 0.1705 0.3008 5.39e-15
64 1uis:A 224 144 0.0980 0.1786 0.2778 2.92e-14 1uis:B
65 5ukg:A 393 133 0.0907 0.0941 0.2782 8.08e-14 5ukg:B
66 6u1a:A 220 136 0.0907 0.1682 0.2721 1.44e-13
67 5hzt:A 192 151 0.0931 0.1979 0.2517 4.39e-11 5hzt:K
68 5exc:gg 165 99 0.0711 0.1758 0.2929 1.31e-10 5exc:ee, 5exc:ff, 5exc:hh
69 8c0t:A 281 134 0.1005 0.1459 0.3060 1.14e-08
70 5mwc:D 275 122 0.0907 0.1345 0.3033 4.05e-08
71 7dna:I 207 56 0.0490 0.0966 0.3571 5.33e-08 7dna:F
72 7dna:I 207 58 0.0490 0.0966 0.3448 0.001 7dna:F
73 8osi:A 400 122 0.0907 0.0925 0.3033 9.70e-08
74 6xw2:A 387 122 0.0882 0.0930 0.2951 2.05e-07
75 4i2y:A 381 91 0.0564 0.0604 0.2527 6.70e-07 4i2y:B
76 4q7r:A 223 123 0.0907 0.1659 0.3008 9.55e-06 8bgl:A, 8bgl:B, 4q7r:B
77 5exc:E 59 52 0.0490 0.3390 0.3846 1.07e-04 5exc:F, 5exc:G, 5exc:H
78 2p0j:A 203 28 0.0368 0.0739 0.5357 1.7 2p0j:B, 1vrr:A, 1vrr:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218