Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
KFEEGQDVLARWSDGLFYLGTIKKINILKQSCFIIFEDSSKSWVLWKDIQTCTICQEEYSEAPNEMVICDKCGQGYHQLC
HTPHIDCKWLCRQCVFATTTKRGGALKKGPNAKALQVMKQTLPYSVADLEWDAGHKTNVQQCYCYCGGPGDWYLKMLQCC
KCKQWFHEACVQCLQKPMLFGDRFYTFICSVCSSGPEYLKRLPLQWVDIAHLCLYNLSVIHKKKYFDSELELMTYINENW
DRLHPGELADTPKSERYEHVLEALNDYKTMFMSGKEIKKKKHLFGLRIRVPPVPPNVA

The query sequence (length=298) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5xfr:A 309 308 0.9966 0.9612 0.9643 0.0 5xfr:B
2 5xfo:A 315 305 0.5872 0.5556 0.5738 1.18e-125 8h43:A, 8h43:B, 8h43:C, 4hcz:A, 4hcz:B, 7lky:B, 7lky:H, 7lky:A, 7lky:C, 7lky:D, 7lky:E, 7lky:F, 7lky:G, 6wat:AA, 6wat:AC, 6wat:BA, 6wat:BC, 6wat:CA, 6wat:CC, 6wat:DA, 6wat:DC, 6wat:EC, 6wat:EA, 6wat:FA, 6wat:FC, 6wat:GA, 6wat:GC, 6wat:HA, 6wat:HC, 6wat:IA, 6wat:IC, 6wat:JA, 6wat:JC, 6wat:KA, 6wat:KC, 6wat:OC, 6wat:LA, 6wat:LC, 6wat:MA, 6wat:MC, 6wat:NA, 6wat:NC, 6wat:OA, 6wav:A, 6wav:C, 6wav:B, 6wav:D, 5xfn:A, 5xfp:B, 5xfp:A, 5xfp:E, 5xfq:A, 5xfq:B
3 5oqd:C 192 168 0.2181 0.3385 0.3869 5.37e-37 5oqd:B, 5oqd:A, 5oqd:D, 5oqd:E, 5oqd:F
4 2yt5:A 66 58 0.1678 0.7576 0.8621 1.30e-28
5 4bd3:A 58 57 0.1141 0.5862 0.5965 2.86e-17 6wau:A, 6wau:F, 6wau:B, 6wau:D, 6wau:C, 6wau:E
6 2m0o:A 79 46 0.1007 0.3797 0.6522 1.15e-15
7 8ge0:A 188 66 0.0872 0.1383 0.3939 7.32e-05 8gdx:A, 8ge0:B, 8ge0:C
8 2l43:A 80 53 0.0638 0.2375 0.3585 0.002 2ku3:A
9 3kv4:A 432 63 0.0671 0.0463 0.3175 0.006 4do0:A, 3k3n:A, 3k3o:A, 2wwu:A
10 1wev:A 88 70 0.0638 0.2159 0.2714 0.006
11 6j2p:A 98 53 0.0671 0.2041 0.3774 0.017 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
12 4tvr:A 222 44 0.0503 0.0676 0.3409 0.020
13 5z8l:A 204 58 0.0671 0.0980 0.3448 0.035 5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
14 3kv6:D 448 60 0.0638 0.0424 0.3167 0.050 3kv5:D, 3kv5:A, 3kv6:A, 3kv9:A, 3kva:A, 3u78:A
15 2miq:A 94 54 0.0604 0.1915 0.3333 0.057
16 4ptb:A 178 61 0.0570 0.0955 0.2787 0.071 5fb0:A, 5fb0:C, 5fb1:A, 6g5n:A, 6g5n:B, 6g5p:A, 6g5p:B, 4ptb:B, 5pwc:A, 5pwc:B, 5pwd:A, 5pwd:B, 5pwe:A, 5pwe:B, 5pwf:A, 5pwf:B, 5pwg:A, 5pwg:B, 5pwh:A, 5pwh:B, 5pwi:A, 5pwi:B, 5pwj:A, 5pwj:B, 5pwk:A, 5pwk:B, 5pwl:A, 5pwl:B, 5pwm:A, 5pwm:B, 5pwn:A, 5pwn:B, 5pwo:A, 5pwo:B, 5pwp:A, 5pwp:B, 5pwq:A, 5pwq:B, 5pwr:A, 5pwr:B, 5pws:A, 5pws:B, 5pwt:A, 5pwt:B, 5pwu:A, 5pwu:B, 5pwv:A, 5pwv:B, 5pww:A, 5pww:B, 5pwx:A, 5pwx:B, 5pwy:A, 5pwy:B, 5pwz:A, 5pwz:B, 5px0:A, 5px0:B, 5px1:A, 5px1:B, 5px2:A, 5px2:B, 5px3:A, 5px3:B, 5px4:A, 5px4:B, 5px5:A, 5px5:B, 5px6:A, 5px6:B, 5px7:A, 5px7:B, 5px8:A, 5px8:B, 5px9:A, 5px9:B, 5pxa:A, 5pxa:B, 5pxb:A, 5pxb:B, 5pxc:A, 5pxc:B, 5pxd:A, 5pxd:B, 5pxe:A, 5pxe:B, 5pxf:A, 5pxf:B, 5pxg:A, 5pxg:B, 5pxh:A, 5pxh:B, 5pxi:A, 5pxi:B, 5pxj:A, 5pxj:B, 5pxk:A, 5pxk:B, 5pxl:A, 5pxl:B, 5pxm:A, 5pxm:B, 5pxn:A, 5pxn:B, 5pxo:A, 5pxo:B, 5pxp:A, 5pxp:B, 5pxq:A, 5pxq:B, 5pxr:A, 5pxr:B, 5pxs:A, 5pxs:B, 5pxt:A, 5pxt:B, 5pxu:A, 5pxu:B, 5pxv:A, 5pxv:B, 5pxw:A, 5pxw:B, 5pxx:A, 5pxx:B, 5pxy:A, 5pxy:B, 5pxz:A, 5pxz:B, 5py0:A, 5py0:B, 5py1:A, 5py1:B, 5py2:A, 5py2:B, 5py3:A, 5py3:B, 5py4:A, 5py4:B, 5py5:A, 5py5:B, 5py6:A, 5py6:B, 5py7:A, 5py7:B, 5py8:A, 5py8:B, 5py9:A, 5py9:B, 5pya:A, 5pya:B, 5pyb:A, 5pyb:B, 5pyc:A, 5pyc:B, 5pyd:A, 5pyd:B, 5pye:A, 5pye:B, 5pyf:A, 5pyf:B, 5pyg:A, 5pyg:B, 5pyh:A, 5pyh:B, 5pyi:A, 5pyi:B, 5pyj:A, 5pyj:B, 5pyk:A, 5pyk:B, 5pyl:A, 5pyl:B, 5pym:A, 5pym:B, 5pyn:A, 5pyn:B, 5pyo:A, 5pyo:B, 5pyp:A, 5pyp:B, 5pyq:A, 5pyq:B, 5pyr:A, 5pyr:B, 5pys:A, 5pys:B, 5pyt:A, 5pyt:B, 5pyu:A, 5pyu:B, 5pyv:A, 5pyv:B, 5pyw:A, 5pyw:B, 5pyx:A, 5pyx:B, 5pyy:A, 5pyy:B, 5pyz:A, 5pyz:B, 5pz0:A, 5pz0:B, 5pz1:A, 5pz1:B, 5pz2:A, 5pz2:B, 5pz3:A, 5pz3:B, 5pz4:A, 5pz4:B, 5pz5:A, 5pz5:B, 5pz6:A, 5pz6:B, 5pz7:A, 5pz7:B, 5pz8:A, 5pz8:B, 5pz9:A, 5pz9:B, 5pza:A, 5pza:B, 5pzb:A, 5pzb:B, 5pzc:A, 5pzc:B, 5pzd:A, 5pzd:B, 5pze:A, 5pze:B, 5pzf:A, 5pzf:B, 5pzg:A, 5pzg:B, 5pzh:A, 5pzh:B, 5pzi:A, 5pzi:B, 5pzj:A, 5pzj:B
17 2f6j:A 168 71 0.0738 0.1310 0.3099 0.079 8ag2:A, 6aze:A, 7dmy:A, 7dn4:A, 7dn4:B, 7dn4:C, 7dn4:D, 7dn4:E, 7dn4:F, 7f5c:A, 7f5d:A, 7f5e:A, 2f6j:B, 2f6j:C, 2f6n:A, 2f6n:B, 8f6g:A, 2fsa:A, 2fsa:B, 2fsa:C, 2fuu:A, 5h6y:A, 7k6r:A, 7k6s:A, 7kdw:A, 7kdw:B, 7kdz:A, 7lp0:A, 7lp0:B, 7lpk:A, 7lpk:B, 7lrk:A, 7lrk:B, 7lro:A, 7lro:B, 6lu5:A, 6lu6:A, 7m2e:A, 8ou2:A, 8ou2:B, 3qzs:A, 3qzs:B, 3qzt:A, 3qzv:A, 5r4g:A, 5r4h:A, 5r4i:A, 5r4j:A, 5r4k:A, 5r4l:A, 5r4m:A, 5r4n:A, 2ri7:A, 7rwn:A, 7rwo:A, 7rwp:A, 7rwq:A, 7vd4:A
18 3rsn:A 165 107 0.0906 0.1636 0.2523 0.080 3s32:A
19 1wep:A 79 29 0.0403 0.1519 0.4138 0.081
20 8f8y:B 433 29 0.0470 0.0323 0.4828 0.082 8f8y:A, 8f8z:A, 8f8z:B, 3kqi:A, 7m10:A, 3pu3:A, 3pu3:B, 3pu8:B, 3pu8:A, 3pua:A, 3pus:A, 3pus:B
21 5vab:A 54 39 0.0436 0.2407 0.3333 0.086
22 6u04:A 168 78 0.0772 0.1369 0.2949 0.100 5erc:A
23 6fhq:A 58 48 0.0570 0.2931 0.3542 0.10 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
24 5b79:A 118 52 0.0570 0.1441 0.3269 0.19 5vdc:A
25 5hh7:A 192 63 0.0638 0.0990 0.3016 0.20
26 5znp:B 186 47 0.0537 0.0860 0.3404 0.27 5znp:A, 5znr:A, 5znr:B
27 8hxx:N 375 69 0.0671 0.0533 0.2899 0.28 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
28 1f62:A 51 51 0.0470 0.2745 0.2745 0.29
29 2ysm:A 111 58 0.0570 0.1532 0.2931 0.30
30 6g8r:B 164 77 0.0537 0.0976 0.2078 0.35 2md7:B, 2md8:C
31 7klo:A 59 56 0.0537 0.2712 0.2857 0.37 7klr:A
32 6ra9:B 458 58 0.0671 0.0437 0.3448 0.46 8b6z:A, 4c0s:A, 4c0s:B, 8g5z:EF, 8g60:EF, 8g6j:EF, 5lzs:jj, 6ra9:A, 6zmo:CD
33 4lk9:A 126 38 0.0436 0.1032 0.3421 0.51 5b75:A, 5b76:A, 5b77:A, 5b78:A, 4ljn:A, 4lka:A, 4llb:A, 4llb:B, 2ln0:A, 6lsb:A, 3v43:A
34 1wem:A 76 57 0.0638 0.2500 0.3333 0.64 4l7x:A, 2m3h:A
35 2l5u:A 61 47 0.0503 0.2459 0.3191 0.66
36 2ke1:A 66 59 0.0503 0.2273 0.2542 0.68 2kft:A, 1xwh:A
37 7xga:A 126 67 0.0570 0.1349 0.2537 0.83 6vfo:A
38 6oie:B 111 51 0.0537 0.1441 0.3137 0.83 6oie:A, 5u2j:B, 5u2j:A
39 5szb:A 115 51 0.0503 0.1304 0.2941 1.1 5i3l:A, 5i3l:B, 2kwj:A, 2kwk:A, 2kwn:A, 2kwo:A, 5szc:A
40 4q6f:A 56 49 0.0470 0.2500 0.2857 1.6 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
41 7d87:A 202 33 0.0403 0.0594 0.3636 1.7 7d86:A, 7d8a:A
42 7yi0:F 120 63 0.0604 0.1500 0.2857 1.9
43 7yi2:D 321 66 0.0638 0.0592 0.2879 2.1 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
44 6zq4:F 512 56 0.0503 0.0293 0.2679 2.7 6zq4:A, 6zq4:B, 6zq4:C, 6zq4:D, 6zq4:E, 6zq4:G, 6zq4:H, 6zq6:A, 6zq6:B, 6zq6:C, 6zq6:D, 6zq7:A
45 8w9c:F 156 64 0.0671 0.1282 0.3125 2.7 8hxx:P, 8hy0:P, 8jho:P, 8w9d:F, 8w9e:F, 8w9f:F
46 2mny:A 55 52 0.0470 0.2545 0.2692 2.9 2mnz:A
47 2r6h:C 289 41 0.0470 0.0484 0.3415 3.6 2r6h:A, 2r6h:B, 2r6h:D
48 7ebk:A 183 35 0.0403 0.0656 0.3429 4.3 7ebj:A
49 1wee:A 72 28 0.0369 0.1528 0.3929 4.4
50 4nhb:B 311 24 0.0436 0.0418 0.5417 4.9 4nhb:A
51 3o36:A 184 47 0.0470 0.0761 0.2979 5.0 7b9x:A, 5h1t:A, 5h1t:B, 5h1t:C, 5h1t:D, 5h1u:B, 5h1u:A, 5h1u:C, 5h1u:D, 5h1v:A, 5h1v:B, 3o33:A, 3o33:B, 3o33:C, 3o33:D, 3o34:A, 3o35:B, 3o35:A, 3o36:B, 3o37:A, 3o37:B, 3o37:C, 3o37:D, 4yab:A, 4yab:B, 4yad:A, 4yad:B, 4yat:A, 4yat:B, 4yax:A, 4yax:B, 4ybm:A, 4ybm:B, 4ybs:A, 4ybt:A, 4yc9:A, 4zql:A, 4zql:B
52 2e6s:A 77 36 0.0403 0.1558 0.3333 5.1
53 6ieu:A 170 34 0.0369 0.0647 0.3235 5.4 6iet:A
54 8ihn:M 357 51 0.0537 0.0448 0.3137 6.5 8kd4:E
55 6guu:B 204 51 0.0470 0.0686 0.2745 6.6 6guu:A
56 8kd6:E 301 51 0.0537 0.0532 0.3137 6.6 8kd2:E
57 2ro1:A 189 61 0.0570 0.0899 0.2787 6.6
58 6ryr:W 708 51 0.0470 0.0198 0.2745 8.2 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
59 6bhd:A 217 91 0.0872 0.1198 0.2857 8.6 6au2:A, 6au3:A, 6bhe:A, 6bhg:A, 6bhh:A, 6bhi:A, 6bpi:A, 7c9n:B, 7c9n:A, 7caj:D, 7caj:A, 7cd9:A, 7cd9:B, 7cjt:D, 7cjt:A, 7cjt:B, 7cjt:C, 8g5e:A, 5kch:A, 5kco:A, 5ke2:A, 5ke3:A, 5kh6:A, 5qt1:A, 5qt2:A, 8uwp:A, 8uwp:B
60 9atn:A 98 39 0.0336 0.1020 0.2564 9.0
61 2e6r:A 92 54 0.0470 0.1522 0.2593 9.8

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218