BioLiP

>protein
KDHTIPLTLISILADGEFHSGEQLGEQLGMSRAAINKHIQTLRDWGVDVFTVPGKGYSLPEPIHLLDEKKISQEIDHGRV
TVLPVIDSTNQYLLDRLDELTSGDACVAEYQQAGRGRRGRKWFSPFGANLYLSMYWRLEQGPAAAIGLSLVIGIVIAEVL
QQLGAEQVRVKWPNDIYLQDRKLSGILVELTGKTGDAAQIVSGAGINLVMRGWISLQEAGVVIDRNLLAARLIKELRLGL
ELFEQEGLAPYLPRWEKLDNFIHRPVKLIIGDKEIYGISRGIDAQGALLLEQDGVIKAWVGGEISLR

The query sequence (length=307) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8fi3:B	308	308	1.0000	0.9968	0.9968	0.0	8fi3:A
2	2ewn:A	318	315	0.8371	0.8082	0.8159	0.0	2ewn:B, 1hxd:A, 1hxd:B, 4wf2:A
3	1bib:A	294	307	0.7980	0.8333	0.7980	2.01e-173
4	9j8e:B	296	308	0.3779	0.3919	0.3766	5.52e-55	9j8e:A
5	6ndl:A	323	293	0.2541	0.2415	0.2662	7.02e-21	6apw:A, 6aqq:A, 4dq2:A, 8eni:A, 4ha8:A, 6oru:A, 3rir:A, 3rkw:A, 3rky:A, 3v7c:A, 3v7r:A, 3v7s:A, 3v8k:A, 3v8l:A
6	2ej9:A	237	240	0.2410	0.3122	0.3083	1.20e-14
7	2deq:A	235	237	0.2508	0.3277	0.3249	1.75e-14	2deq:B, 2djz:A, 2djz:B, 2dkg:A, 2dkg:B, 2dth:A, 2dth:B, 2dti:A, 2dti:B, 2dto:A, 2dto:B, 2dve:A, 2dve:B, 2dxt:A, 2dxt:B, 2dxu:A, 2dxu:B, 2dz9:A, 2dz9:B, 2e41:A, 2e41:B, 2ejf:A, 2ejf:B, 2ejg:A, 2ejg:B, 2fyk:A, 2fyk:B, 1wnl:A, 1wnl:B, 1wpy:A, 1wpy:B, 1wqw:A, 1wqw:B, 1x01:A, 1x01:B, 2zgw:A, 2zgw:B
8	4xtu:A	266	222	0.2443	0.2820	0.3378	9.02e-14	4op0:A, 4op0:B, 3rux:A, 3rux:B, 4xtu:B, 4xtv:A, 4xtv:B, 4xtw:A, 4xtw:B, 4xtx:A, 4xtx:B, 4xty:A, 4xty:B, 4xtz:A, 4xtz:B, 4xu0:A, 4xu0:B, 4xu1:A, 4xu1:B, 4xu2:A, 4xu2:B, 4xu3:A, 4xu3:B
9	3efr:A	233	237	0.2378	0.3133	0.3080	6.41e-13	3efr:B, 3efs:A, 3efs:B
10	6ck0:B	210	139	0.1564	0.2286	0.3453	6.18e-12	6ck0:A
11	7dbs:A	252	123	0.1303	0.1587	0.3252	6.27e-07	6jhu:A
12	6pag:A	277	48	0.0554	0.0614	0.3542	2.7	1im9:A, 1im9:E, 6pa1:A, 6pa1:E, 1qqd:A, 5vge:A
13	2ohh:A	403	64	0.0586	0.0447	0.2812	3.0	2ohh:B, 2ohh:D, 2ohh:E, 2ohi:A, 2ohi:B, 2ohi:D, 2ohi:E, 2ohi:G, 2ohi:H, 2ohi:I, 2ohi:J, 2ohj:A, 2ohj:B, 2ohj:D, 2ohj:E
14	7kmo:A	511	92	0.0814	0.0489	0.2717	3.4
15	1r3q:A	357	59	0.0651	0.0560	0.3390	4.1	2q71:A, 1r3s:A, 1r3t:A, 1r3v:A, 1r3w:A, 1r3y:A
16	6bf4:B	225	85	0.0879	0.1200	0.3176	4.9	6bf4:H, 6nfn:B, 6nfn:D, 6nfn:F, 6nfn:P
17	4jay:A	338	36	0.0521	0.0473	0.4444	8.0	4jay:B, 4jay:C, 4jay:D, 4jb1:A, 7or2:A, 7orz:A, 7osq:A

[Back]