Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
IMEIKLIKGPKGLGFSIAGGVGNQHIPGDNSIYVTKIIEGGAAHKDGKLQIGDKLLAVNSVGLEEVTHEEAVTALKNTSD
FVYLKVAKPT

The query sequence (length=90) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7pc3:A 405 90 0.9778 0.2173 0.9778 4.03e-57 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
2 2ka9:A 189 90 0.8889 0.4233 0.8889 1.73e-53 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
3 2ka9:A 189 86 0.5222 0.2487 0.5465 6.92e-24 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
4 8bq8:C 93 89 0.6444 0.6237 0.6517 4.10e-35 8bq8:A, 8bq8:B
5 8cn1:H 101 89 0.5333 0.4752 0.5393 8.87e-26 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
6 8c1t:A 90 87 0.4556 0.4556 0.4713 1.14e-23 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
7 7p73:A 420 84 0.4444 0.0952 0.4762 3.57e-20 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
8 6xa7:B 96 80 0.4111 0.3854 0.4625 3.60e-19 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
9 2m0z:A 97 88 0.4222 0.3918 0.4318 2.01e-16 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
10 4xhv:A 94 89 0.3667 0.3511 0.3708 1.57e-13
11 8b82:A 108 88 0.3667 0.3056 0.3750 4.98e-13 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
12 3jxt:A 96 87 0.3778 0.3542 0.3908 1.04e-12 3jxt:B
13 4wyu:A 201 92 0.3889 0.1741 0.3804 4.62e-12 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
14 4wyu:A 201 78 0.3111 0.1393 0.3590 5.40e-09 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
15 5heb:A 119 77 0.3333 0.2521 0.3896 6.08e-11 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
16 8bv7:A 95 62 0.3000 0.2842 0.4355 9.37e-11 8buw:A, 8buw:B
17 2exg:A 101 84 0.3667 0.3267 0.3929 1.36e-10 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
18 2pdz:A 86 75 0.3778 0.3953 0.4533 3.48e-10
19 2r4h:C 98 85 0.3000 0.2755 0.3176 4.55e-10
20 1n7t:A 103 90 0.3667 0.3204 0.3667 4.96e-10 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
21 2kaw:A 90 64 0.3000 0.3000 0.4219 5.05e-10 6lcb:A, 2mx6:A
22 5wou:A 95 87 0.3444 0.3263 0.3563 9.48e-10
23 2l4t:A 124 86 0.3778 0.2742 0.3953 1.14e-09 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
24 7p70:A 407 75 0.3667 0.0811 0.4400 1.35e-09 7pc4:A, 7qql:A
25 1l6o:A 95 65 0.2889 0.2737 0.4000 1.44e-09 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
26 7qqm:A 413 85 0.4000 0.0872 0.4235 1.45e-09
27 2koh:A 111 70 0.3111 0.2523 0.4000 1.58e-09 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
28 7weg:B 96 74 0.3333 0.3125 0.4054 1.83e-09 7weg:A
29 7pc5:A 405 73 0.3222 0.0716 0.3973 7.38e-09
30 6gbe:A 119 90 0.3222 0.2437 0.3222 7.66e-09
31 3ch8:A 190 79 0.3444 0.1632 0.3924 7.90e-09 2qbw:A
32 6x23:A 89 87 0.3000 0.3034 0.3103 8.95e-09
33 6q0m:B 94 90 0.3333 0.3191 0.3333 5.18e-08
34 6zbq:A 89 51 0.2222 0.2247 0.3922 8.63e-08 6zc4:A
35 4e34:A 87 77 0.3333 0.3448 0.3896 1.33e-07 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
36 8bp4:A 93 66 0.3111 0.3011 0.4242 2.55e-07 8bp4:C, 8bp4:B
37 2i0i:A 81 82 0.3444 0.3827 0.3780 4.14e-07 2i0i:B, 2i0i:C
38 2qt5:A 194 74 0.2667 0.1237 0.3243 4.41e-07 2qt5:B
39 2qt5:A 194 77 0.2778 0.1289 0.3247 6.14e-06 2qt5:B
40 7qqn:C 414 76 0.3111 0.0676 0.3684 1.13e-06 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
41 1n7f:A 86 87 0.3333 0.3488 0.3448 1.21e-06 1n7f:B
42 7qct:A 90 58 0.2111 0.2111 0.3276 4.69e-06 7qct:B
43 7d6f:A 87 76 0.2444 0.2529 0.2895 9.47e-06
44 2m0u:A 117 86 0.3000 0.2308 0.3140 1.22e-05
45 5zys:A 90 77 0.2778 0.2778 0.3247 1.52e-05
46 2ejy:A 85 56 0.2000 0.2118 0.3214 1.99e-05
47 7pcb:A 415 80 0.2778 0.0602 0.3125 2.04e-05 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
48 3tsz:A 341 74 0.3111 0.0821 0.3784 4.03e-05 3shw:A
49 1u38:A 89 52 0.2111 0.2135 0.3654 5.62e-05
50 7x2e:A 163 79 0.3000 0.1656 0.3418 8.26e-05 2kbs:A
51 1b8q:A 127 65 0.2333 0.1654 0.3231 1.29e-04
52 2os6:A 89 61 0.2444 0.2472 0.3607 1.76e-04
53 2kpl:A 129 77 0.2333 0.1628 0.2727 3.51e-04
54 5n7d:A 423 76 0.2333 0.0496 0.2763 4.80e-04 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
55 6kz1:A 97 69 0.2556 0.2371 0.3333 6.80e-04 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
56 6nid:B 88 58 0.1667 0.1705 0.2586 8.59e-04 6nid:A, 6nid:C
57 4wsi:A 372 58 0.1889 0.0457 0.2931 0.001 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
58 1ihj:B 95 74 0.2556 0.2421 0.3108 0.001 1ihj:A
59 3bpu:A 86 75 0.2333 0.2442 0.2800 0.003
60 3vqg:A 85 57 0.1667 0.1765 0.2632 0.005
61 4xh7:A 110 80 0.2556 0.2091 0.2875 0.006
62 6hks:B 94 69 0.2333 0.2234 0.3043 0.11 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
63 3d8f:A 127 73 0.2000 0.1417 0.2466 0.32 3d8f:C
64 6ar4:B 87 47 0.1667 0.1724 0.3191 0.54 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
65 3cyy:B 81 47 0.1556 0.1728 0.2979 0.54 3cyy:A
66 5k4w:C 321 42 0.1556 0.0436 0.3333 0.54 5k4q:A, 5k4q:B, 5k4q:C, 5k4q:D, 5k4q:E, 5k4q:F, 5k4u:A, 5k4u:C, 5k4v:A, 5k4v:C, 5k4w:A, 5k4y:A, 5k4y:B, 5k4y:C, 5k4y:D, 5k4y:E, 5k4y:F, 5k50:A, 5k50:C, 5k50:E, 5k50:G, 5k50:I, 5k50:J, 5lc1:A, 5lc1:B, 5lc1:C, 5lc1:D, 5lc1:E, 5lc1:F
67 5ez0:D 95 69 0.2000 0.1895 0.2609 0.60 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
68 3r0h:D 199 82 0.2333 0.1055 0.2561 0.80 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
69 8xud:D 651 43 0.1333 0.0184 0.2791 1.6 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C
70 5f67:A 98 54 0.1889 0.1735 0.3148 2.1 5f67:B
71 3la4:A 837 65 0.2333 0.0251 0.3231 2.2
72 6z2w:E 2325 50 0.1889 0.0073 0.3400 2.5 6z2w:F, 6z2x:E, 6z2x:F, 6z3a:F, 6z3a:E
73 4bs9:A 691 54 0.1889 0.0246 0.3148 2.6
74 1zub:A 109 58 0.2111 0.1743 0.3276 2.7
75 2egn:A 83 53 0.1667 0.1807 0.2830 2.8
76 7pog:A 2382 38 0.1111 0.0042 0.2632 3.1 4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
77 7t2r:C 152 59 0.1889 0.1118 0.2881 4.3 7t2r:H
78 1ons:A 278 22 0.1222 0.0396 0.5000 5.8
79 4g7e:B 833 69 0.2222 0.0240 0.2899 8.1
80 3jqo:B 130 38 0.1333 0.0923 0.3158 8.5 3jqo:E, 3jqo:H, 3jqo:K, 3jqo:N, 3jqo:Q, 3jqo:T, 3jqo:W, 3jqo:Z, 3jqo:c, 3jqo:f, 3jqo:i, 3jqo:l, 3jqo:o, 2ofq:A, 3zbi:B, 3zbi:E, 3zbi:H, 3zbi:K, 3zbi:N, 3zbi:Q, 3zbi:T, 3zbi:W, 3zbi:Z, 3zbi:c, 3zbi:f, 3zbi:i, 3zbi:l, 3zbi:o

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417