Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
IEEEELTLTILGLGISIAGGKGSTPYKGDDEGIFISRVSEEGPAARAGVRVGDKLLEVNGVALQGAEHHEAVEALRGATA
VQMRVWRE

The query sequence (length=88) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8b82:A 108 93 1.0000 0.8148 0.9462 7.12e-54 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
2 5wou:A 95 89 0.5455 0.5053 0.5393 6.65e-29
3 6xa7:B 96 69 0.4432 0.4062 0.5652 2.06e-19 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
4 1n7t:A 103 79 0.3636 0.3107 0.4051 9.66e-14 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
5 3ch8:A 190 79 0.3636 0.1684 0.4051 4.00e-13 2qbw:A
6 4wyu:A 201 90 0.4545 0.1990 0.4444 5.19e-13 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
7 4wyu:A 201 68 0.4205 0.1841 0.5441 4.00e-11 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
8 8cn1:H 101 90 0.4659 0.4059 0.4556 8.25e-13 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
9 6q0m:B 94 79 0.3409 0.3191 0.3797 4.58e-12
10 7p73:A 420 89 0.4432 0.0929 0.4382 8.59e-12 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
11 2ka9:A 189 91 0.4659 0.2169 0.4505 1.05e-11 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
12 2ka9:A 189 71 0.3409 0.1587 0.4225 1.53e-09 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
13 2l4t:A 124 86 0.3864 0.2742 0.3953 1.52e-11 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
14 7pc3:A 405 69 0.3523 0.0765 0.4493 1.01e-10 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
15 3jxt:A 96 73 0.3636 0.3333 0.4384 1.71e-10 3jxt:B
16 7qqm:A 413 80 0.3636 0.0775 0.4000 2.56e-10
17 5heb:A 119 68 0.3636 0.2689 0.4706 1.41e-09 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
18 8bq8:C 93 66 0.3182 0.3011 0.4242 1.97e-09 8bq8:A, 8bq8:B
19 7x2e:A 163 74 0.3068 0.1656 0.3649 3.30e-09 2kbs:A
20 2r4h:C 98 78 0.3068 0.2755 0.3462 4.38e-09
21 2os6:A 89 74 0.2614 0.2584 0.3108 7.86e-09
22 2m0z:A 97 77 0.3523 0.3196 0.4026 7.05e-08 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
23 2koh:A 111 72 0.2955 0.2342 0.3611 8.67e-08 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
24 8bv7:A 95 68 0.3068 0.2842 0.3971 1.73e-07 8buw:A, 8buw:B
25 2m0v:A 128 45 0.2159 0.1484 0.4222 1.92e-07
26 4e34:A 87 66 0.3523 0.3563 0.4697 4.35e-07 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
27 8c1t:A 90 78 0.3182 0.3111 0.3590 5.86e-07 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
28 6x23:A 89 91 0.3182 0.3146 0.3077 1.63e-06
29 2egn:A 83 45 0.1932 0.2048 0.3778 5.78e-06
30 7pcb:A 415 43 0.2386 0.0506 0.4884 6.01e-06 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
31 4xhv:A 94 86 0.3068 0.2872 0.3140 9.96e-06
32 7p70:A 407 68 0.3295 0.0713 0.4265 2.04e-05 7pc4:A, 7qql:A
33 8blu:B 195 59 0.2386 0.1077 0.3559 2.21e-05 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
34 4xh7:A 110 66 0.2955 0.2364 0.3939 2.35e-05
35 3tsz:A 341 48 0.2386 0.0616 0.4375 2.78e-05 3shw:A
36 6ew9:A 305 59 0.2273 0.0656 0.3390 2.85e-05 6ew9:B, 6ew9:C, 3gcn:A, 3gco:A, 3gds:A, 3gdu:A, 3gdu:C, 3gdv:A, 3gdv:C, 2r3y:B, 2r3y:C, 1soz:A, 1soz:B
37 7qqn:C 414 72 0.2727 0.0580 0.3333 2.96e-05 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
38 8sxg:A 366 59 0.2273 0.0546 0.3390 3.42e-05 8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
39 6gbe:A 119 78 0.2841 0.2101 0.3205 3.46e-05
40 2pdz:A 86 67 0.3182 0.3256 0.4179 3.75e-05
41 2m0u:A 117 75 0.2955 0.2222 0.3467 8.14e-05
42 2i0i:A 81 68 0.3409 0.3704 0.4412 8.58e-05 2i0i:B, 2i0i:C
43 6yx0:B 112 81 0.2955 0.2321 0.3210 1.11e-04 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
44 4ynn:A 400 67 0.1932 0.0425 0.2537 5.77e-04 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
45 1n7f:A 86 78 0.2727 0.2791 0.3077 6.76e-04 1n7f:B
46 2qt5:A 194 45 0.2159 0.0979 0.4222 6.91e-04 2qt5:B
47 2qt5:A 194 67 0.2386 0.1082 0.3134 0.93 2qt5:B
48 3pv3:A 392 64 0.2045 0.0459 0.2812 8.77e-04 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
49 2exg:A 101 92 0.3409 0.2970 0.3261 0.001 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
50 4c2c:A 433 61 0.2045 0.0416 0.2951 0.001 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
51 2kqf:A 96 54 0.2273 0.2083 0.3704 0.001 2kyl:A
52 2kaw:A 90 65 0.2841 0.2778 0.3846 0.002 6lcb:A, 2mx6:A
53 5f67:A 98 50 0.2386 0.2143 0.4200 0.004 5f67:B
54 1ihj:B 95 67 0.2045 0.1895 0.2687 0.004 1ihj:A
55 1l6o:A 95 65 0.2727 0.2526 0.3692 0.005 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
56 7xft:A 86 57 0.1818 0.1860 0.2807 0.005
57 7d6f:A 87 56 0.2045 0.2069 0.3214 0.005
58 5oak:A 90 71 0.2500 0.2444 0.3099 0.005 5oak:C
59 7xs0:A 376 56 0.2045 0.0479 0.3214 0.009
60 7xs0:A 376 61 0.1932 0.0452 0.2787 0.20
61 6kz1:A 97 76 0.2955 0.2680 0.3421 0.015 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
62 1u38:A 89 59 0.1591 0.1573 0.2373 0.021
63 5t63:A 283 44 0.2045 0.0636 0.4091 0.029 5b6l:A, 5gnd:A
64 4gvc:A 94 30 0.1250 0.1170 0.3667 0.042 4gvd:A, 4gvd:B, 3kze:A, 3kze:B, 3kze:C, 4nxq:A, 4nxq:B, 4nxq:C, 4nxr:A
65 8j9c:A 605 45 0.1932 0.0281 0.3778 0.044 8j9c:B, 8j9c:C, 8j9c:D, 8j9d:A, 8j9d:B, 8j9d:C, 8j9d:D
66 6ezi:A 86 47 0.1818 0.1860 0.3404 0.044 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
67 6zbq:A 89 65 0.2500 0.2472 0.3385 0.048 6zc4:A
68 4wsi:A 372 46 0.1705 0.0403 0.3261 0.056 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
69 3gdv:B 284 28 0.1364 0.0423 0.4286 0.067 3gdu:B, 2r3y:A, 4rqz:A, 4rqz:B, 4rqz:C
70 5izu:A 124 81 0.3182 0.2258 0.3457 0.091 6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
71 3o5n:E 92 53 0.2500 0.2391 0.4151 0.22
72 3cs0:A 392 38 0.1477 0.0332 0.3421 0.22 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
73 3cs0:A 392 29 0.1364 0.0306 0.4138 0.55 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
74 7co7:D 329 32 0.1477 0.0395 0.4062 0.28 7co2:A, 7co3:A, 7co5:H, 7co5:B, 7co5:D, 7co5:F, 7co5:J, 7co5:L
75 1rzx:A 98 45 0.1818 0.1633 0.3556 0.32 5i7z:A, 1x8s:A
76 8kic:A 300 58 0.2045 0.0600 0.3103 0.36 8kic:C, 8kic:B, 3stj:A, 3stj:B, 3stj:C, 3stj:D, 3stj:E, 3stj:F, 3stj:G, 3stj:H, 3stj:I, 3stj:J, 3stj:K, 3stj:L, 8w69:A, 8w69:C, 8w69:B
77 4ydp:A 83 45 0.1477 0.1566 0.2889 0.69 4ydp:B
78 5zys:A 90 68 0.2386 0.2333 0.3088 0.76
79 7w6z:A 414 23 0.1136 0.0242 0.4348 0.86 7w6y:A
80 8tun:C 258 49 0.1932 0.0659 0.3469 1.5 8tt3:C, 8tt3:D, 8tun:D
81 5dds:A 514 25 0.1364 0.0233 0.4800 2.1 5dds:B, 5dds:C, 5dds:D, 5ddu:A, 5ddu:B, 5ddu:C, 5ddu:D, 5ddw:A, 5ddw:B, 5ddw:C, 5ddw:D, 6jc7:A, 6jc7:B, 6jc7:C, 6jc7:D, 6jc8:A, 6jc8:B, 6jc8:C, 6jc8:D, 6jc9:A, 6jc9:B, 6jc9:C, 6jc9:D, 8jt3:A, 8jt3:B, 8jt3:C, 8jt3:D
82 7nrd:Sh 120 30 0.1364 0.1000 0.4000 2.3 6zvi:T
83 3dpm:A 522 16 0.1136 0.0192 0.6250 2.5 3dpm:B
84 1b8q:A 127 46 0.1818 0.1260 0.3478 5.6
85 4fgm:A 587 59 0.1932 0.0290 0.2881 5.8
86 2v0n:A 459 39 0.1705 0.0327 0.3846 6.8 2v0n:B, 1w25:A, 1w25:B, 2wb4:A, 2wb4:B
87 3bpu:A 86 28 0.1136 0.1163 0.3571 8.1

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417