Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
IDALRTLIRLGSLHTPMVVRTAATLRLVDHILAGARTVKALAARTDTRPEALLRLIRHLVAIGLLEEDAPGEFVPTEVGE
LLADDHPAAQRAWHDLTQAVARADISFTRLPDAIRTGRPTYESIYGKPFYEDLAGRPDLRASFDSLMTTREDTAFAAPAA
AYDWTNVRHVLDVGGGKGGFAAAIARRAPHVSATVLEMAGTVDTARSYLKDEGLSDRVDVVEGDFFEPLPRKADAIILSF
VLLNWPDHDAVRILTRCAEALEPGGRILIHERADVEGDGADRFFSTLLDLRMLVFLGGALRTREKWDGLAASAGLVVEEV
RGPLVSPNVPLDSCLLVLAPA

The query sequence (length=341) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1tw2:B 350 341 0.9208 0.8971 0.9208 0.0 5eeg:A, 5eeg:B, 5eeh:A, 5eeh:B, 5eeh:C, 5jr3:A, 5jr3:B, 5jr3:C, 7owb:A, 7oy1:A, 7oy1:B, 7pga:A, 7pga:B, 7pga:C, 7pga:D, 7pgj:A, 7phd:A, 7phd:B, 7phe:A, 7phe:B, 7phf:A, 7phf:D, 7phf:C, 1tw2:A, 1tw3:A, 1tw3:B, 4wxh:A, 4wxh:B
2 7phf:B 270 341 0.7625 0.9630 0.7625 2.70e-156
3 1qzz:A 340 331 0.5572 0.5588 0.5740 1.27e-120 1r00:A, 1xds:A, 1xds:B, 1xdu:A
4 7pg7:D 329 334 0.5513 0.5714 0.5629 1.82e-109
5 3i58:A 328 308 0.4135 0.4299 0.4578 2.38e-69 3i53:A, 3i53:B, 3i58:B, 3i5u:A, 3i5u:B, 3i64:A, 3i64:B
6 6clx:B 342 320 0.3724 0.3713 0.3969 8.68e-60 6clx:A
7 6c5b:A 332 303 0.2727 0.2801 0.3069 3.53e-38 6c5b:B
8 3gwz:A 339 301 0.2786 0.2802 0.3156 1.50e-27 3gwz:D, 3gwz:C, 3gwz:B, 3gxo:A, 3gxo:D, 3gxo:C, 3gxo:B
9 8bir:A 321 318 0.2375 0.2523 0.2547 1.46e-26 8big:A, 8big:B, 8big:C, 8big:D, 8big:E, 8big:F, 8big:G, 8big:H, 8bii:A, 8bii:B, 8bii:C, 8bii:D, 8bii:E, 8bii:F, 8bii:G, 8bii:H, 8bir:B
10 8bif:A 318 207 0.1818 0.1950 0.2995 3.38e-26 8bif:B, 8bif:C, 8bif:D
11 3lst:A 333 294 0.2845 0.2913 0.3299 9.09e-26 3lst:B
12 8bgt:A 319 206 0.1818 0.1944 0.3010 1.17e-23 8bgt:B, 8bgx:A, 8bgx:B, 8bgx:C, 8bgx:D, 8bgy:A, 8bgy:B, 8bgy:C, 8bgy:D, 8bgz:A, 8bgz:B, 8bgz:C, 8bgz:D, 8bh0:A, 8bh0:B, 8bh0:C, 8bh0:D, 8bh0:E, 8bh0:F, 8bh0:G, 8bh0:H, 8bib:A, 8bib:B, 8bib:C, 8bib:D, 8bid:A, 8bid:B, 8bid:C, 8bid:D, 8bih:A, 8bih:B, 8bih:C, 8bih:D, 8bih:E, 8bih:F, 8bih:G, 8bih:H, 8bih:I, 8bih:J, 8bih:K, 8bih:L
13 8bie:A 318 319 0.2287 0.2453 0.2445 1.91e-23 8bie:B, 8bij:A, 8bij:B
14 8bic:B 323 324 0.2405 0.2539 0.2531 2.90e-22 8bic:A
15 8tjj:C 330 255 0.2287 0.2364 0.3059 7.41e-21 8tjj:A, 8tjj:B, 8tjj:D, 8tjk:A, 8tjk:B
16 5icc:A 352 323 0.2287 0.2216 0.2415 6.84e-20 5ice:A, 5icf:A
17 5xoh:A 348 321 0.2434 0.2385 0.2586 8.20e-20
18 6nej:B 346 313 0.2405 0.2370 0.2620 2.62e-19 6neg:A, 6neg:B, 6neh:A, 6neh:B, 6nej:A
19 6i6m:B 357 200 0.1672 0.1597 0.2850 1.64e-17 6i5z:A, 6i5z:B, 6i5z:D, 6i6k:A, 6i6k:B, 6i6l:A, 6i6l:B, 6i6m:A, 6i6n:A, 6i6n:B
20 6cig:A 349 238 0.1701 0.1662 0.2437 7.26e-17 1fp2:A
21 4a6d:A 345 211 0.1877 0.1855 0.3033 2.56e-16 4a6e:A
22 4evi:A 360 303 0.2141 0.2028 0.2409 3.43e-16 4e70:A, 4e70:B, 4evi:B
23 2qyo:A 353 302 0.2053 0.1983 0.2318 1.31e-15 2qyo:B
24 4u1q:A 341 142 0.1378 0.1378 0.3310 7.72e-15 4u1q:B, 4u1q:C, 4u1q:D, 4x3q:A, 4x3q:B, 4x3q:C, 4x3q:D
25 7v6l:B 347 315 0.2082 0.2046 0.2254 8.60e-15 7v6j:A, 7v6j:B, 7v6l:A
26 1kyw:C 361 216 0.1613 0.1524 0.2546 2.24e-14 1kyw:F, 1kyz:A, 1kyz:C, 1kyz:E
27 7wdq:A 336 110 0.1085 0.1101 0.3364 6.14e-14 7wdq:B, 7wdq:C, 7wdw:A, 7wdw:B, 7wdw:C, 7wdw:D
28 7clf:A 335 278 0.2199 0.2239 0.2698 9.64e-14 7clf:B
29 1x1a:A 337 258 0.1877 0.1899 0.2481 5.18e-13 1x1b:A, 1x1c:A, 1x1d:A
30 5cvj:D 361 212 0.1496 0.1413 0.2406 4.27e-12 5cvj:A, 5cvj:B, 5cvj:C, 5cvu:A, 5cvu:B, 5cvu:C, 5cvu:D, 5cvv:A, 5cvv:B, 3reo:A, 3reo:B, 3reo:C, 3reo:D, 3tky:A, 3tky:B, 3tky:C, 3tky:D
31 7waq:D 365 238 0.1848 0.1726 0.2647 7.13e-12 7vb8:B, 7vb8:A, 7waq:B, 7waq:A, 7waq:C, 7war:B, 7war:A, 7was:A, 7was:B
32 1fp1:D 340 155 0.1202 0.1206 0.2645 1.19e-11 1fpq:A
33 6i71:A 353 216 0.1437 0.1388 0.2269 1.46e-11 6i71:B, 6i72:A, 6i72:B, 6i73:A, 6i73:B, 6yjw:A, 6yjw:B
34 6inw:B 390 349 0.2317 0.2026 0.2264 2.85e-11 6inw:A, 6iv7:A, 6iv7:B, 6ix3:A, 6ix3:B, 6ix5:A, 6ix5:B, 6ix7:A, 6ix7:B, 6ix8:A, 6ix8:B, 6ix9:A, 6ix9:B, 6j1o:A, 6j1o:B, 6j24:B, 6j24:A, 6j46:A, 6j46:B, 5zzd:A, 5zzd:B
35 7wh9:A 476 368 0.2757 0.1975 0.2554 3.27e-11 7wh9:B, 7wh9:C
36 8pha:A 450 108 0.0997 0.0756 0.3148 1.37e-10 8pha:B
37 8har:A 357 270 0.2111 0.2017 0.2667 3.02e-10 8har:B
38 1zg3:A 358 134 0.1202 0.1145 0.3060 1.02e-09 1zga:A, 1zgj:A, 1zhf:A
39 5i2h:A 335 105 0.0968 0.0985 0.3143 2.55e-09 5i2h:B
40 4pgh:D 358 281 0.2053 0.1955 0.2491 3.64e-09 4pgh:A, 4pgh:B, 4pgh:C
41 3p9i:A 357 286 0.1994 0.1905 0.2378 4.72e-09 3p9c:A, 3p9i:B, 3p9i:C, 3p9i:D, 3p9k:A, 3p9k:B, 3p9k:C, 3p9k:D
42 8xte:A 395 329 0.2639 0.2278 0.2736 8.78e-08 8xte:B, 8xte:C, 8xte:D, 8xte:E, 8xte:F, 8xtf:A, 8xtg:A, 8xtg:B, 8xtg:C, 8xtg:D, 8xtg:E, 8xtg:F
43 7wuy:A 393 168 0.1408 0.1221 0.2857 6.43e-07 7wuy:B, 7wvs:A, 7wvs:B, 7ww0:A, 7ww0:B
44 7bqk:A 459 185 0.1496 0.1111 0.2757 1.11e-06 7bqk:B, 7bql:A, 7bql:B
45 7bqo:A 451 182 0.1437 0.1086 0.2692 2.68e-05
46 6wlf:B 434 114 0.0821 0.0645 0.2456 4.43e-05 6wlf:A
47 7y3h:A 396 321 0.2375 0.2045 0.2523 4.93e-04 8gx4:A, 8gzi:A
48 1l3i:A 186 99 0.0880 0.1613 0.3030 0.002 1l3i:B, 1l3i:C, 1l3i:D, 1l3i:E, 1l3i:F
49 6dtn:B 233 111 0.0968 0.1416 0.2973 0.003 5cvd:A, 5cvd:B, 5cve:A, 5cve:B, 5e1b:A, 5e1b:B, 5e1d:A, 5e1d:B, 5e1m:A, 5e1m:B, 5e1o:A, 5e1o:B, 5e2a:A, 5e2a:B, 5e2b:A, 5e2b:B, 2ex4:A, 2ex4:B, 7k3d:B, 7k3d:A, 6kdq:A, 6kdq:B, 6pva:B, 6pvb:B, 7ss1:A, 7ss1:B, 7u1m:A, 7u1m:B, 6wh8:B, 6wh8:A, 6wj7:B
50 1wzn:A 244 102 0.0880 0.1230 0.2941 0.004 1wzn:B, 1wzn:C
51 1sg9:A 274 81 0.0674 0.0839 0.2840 0.005 1nv8:A, 1nv8:B, 1nv9:A, 1sg9:B, 1sg9:C, 1vq1:A, 1vq1:B
52 4gek:G 231 111 0.0704 0.1039 0.2162 0.005 4gek:A, 4iwn:A, 4iwn:B
53 6dub:A 222 152 0.1290 0.1982 0.2895 0.007 6dub:B, 6kdr:A, 6kdr:B, 6kds:A, 5ubb:A
54 9fce:B 209 97 0.0997 0.1627 0.3505 0.007 9fce:A
55 7ux7:A 378 272 0.1994 0.1799 0.2500 0.008 7ux6:A, 7ux6:B, 7ux7:B, 7ux8:A, 7ux8:B
56 8rpr:A 338 148 0.1114 0.1124 0.2568 0.014 8ftr:A, 8fts:A, 8ftv:A, 8rww:A, 8rxf:A, 8rxg:A
57 1im8:A 225 112 0.0850 0.1289 0.2589 0.017 1im8:B
58 7d8f:A 234 119 0.0821 0.1197 0.2353 0.017 7d8d:A
59 9fcx:A 214 133 0.1056 0.1682 0.2707 0.040 9fcd:A, 9fcl:A, 9fcq:A, 9fcs:A, 9fcs:B, 9fcu:A, 9fcu:B, 9fcu:C, 9fcu:D, 9fcx:B, 9fcy:A, 9fcy:B, 9fcy:C, 9fcy:D, 9fd3:A, 9g0k:A, 9g0k:B
60 3dtn:A 220 175 0.1085 0.1682 0.2114 0.044 3dtn:B
61 8r4z:A 341 112 0.1026 0.1026 0.3125 0.066 8r4z:B, 8rvc:A, 8rvc:B, 8rvs:A, 8rvs:B, 8rwm:A, 8rwm:B
62 4kif:B 339 305 0.2053 0.2065 0.2295 0.068 4kib:A, 4kib:B, 4kic:A, 4kic:B, 4kif:A, 4kig:A, 4kig:B, 4m6x:A, 4m6x:B, 4m6y:A, 4m6y:B, 4m71:A, 4m71:B, 4m72:A, 4m72:B, 4m73:A, 4m73:B, 4m74:A, 4m74:B
63 8joz:A 257 99 0.0909 0.1206 0.3131 0.14 4htf:A, 4htf:B
64 4cej:B 1156 173 0.1261 0.0372 0.2486 0.17 4ceh:B, 4cei:B, 3u44:B, 3u4q:B
65 5fad:A 160 103 0.0762 0.1625 0.2524 0.27 5fa8:A
66 5wmm:A 870 123 0.1056 0.0414 0.2927 0.34
67 1jq3:A 295 112 0.0880 0.1017 0.2679 0.34 1jq3:C, 1jq3:D
68 3dlc:A 219 103 0.0850 0.1324 0.2816 0.45
69 6dcb:A 225 125 0.0938 0.1422 0.2560 0.52 6dcc:A, 5una:C, 5una:A, 5una:B, 5una:D, 5una:E, 5una:F
70 3hm2:G 171 72 0.0616 0.1228 0.2917 0.62
71 6dnz:A 317 73 0.0792 0.0852 0.3699 0.70 6dnz:C
72 4ine:A 431 35 0.0352 0.0278 0.3429 0.72 4ine:B
73 7nzi:A 207 158 0.1261 0.2077 0.2722 1.1 2fca:A, 2fca:B, 7nyb:A, 7nyb:B, 7nzi:B
74 5gm2:B 282 109 0.0762 0.0922 0.2385 1.7 5gm1:A, 5gm1:B, 5gm1:C, 5gm1:D, 5gm1:E, 5gm1:F, 5gm1:G, 5gm1:H, 5gm1:I, 5gm1:J, 5gm1:K, 5gm1:L, 5gm1:M, 5gm1:N, 5gm1:O, 5gm1:P, 5gm1:Q, 5gm1:R, 5gm2:A, 5gm2:C, 5gm2:D, 5gm2:E, 5gm2:F, 5gm2:G, 5gm2:H, 5gm2:I, 5gm2:J, 5gm2:L, 5gm2:M, 5gm2:N, 5gm2:O, 5gm2:P, 5gm2:Q, 5gm2:R
75 6o65:B 294 63 0.0645 0.0748 0.3492 1.8 6o65:A, 6o65:C, 6o65:D, 6o65:E, 6o65:F, 6o65:G, 6o65:H
76 1jg1:A 215 125 0.0997 0.1581 0.2720 1.8 1jg2:A, 1jg3:A, 1jg3:B, 1jg4:A
77 5bxy:A 155 134 0.1056 0.2323 0.2687 2.5 5bxy:B
78 6ecx:A 283 177 0.1114 0.1343 0.2147 2.6 6ect:A
79 7joz:R 446 77 0.0587 0.0448 0.2597 3.1 7ckw:R, 7ckx:R, 7cky:R, 7ckz:R, 7crh:R, 7f0t:F, 7f1o:F, 7f1z:F, 7f23:F, 7f24:F, 8irr:R, 7jv5:R, 7jvp:R, 7jvq:R, 8jxr:A, 8jxs:A, 7ljc:R, 7ljd:R, 7x2c:F, 7x2d:F, 7x2f:F
80 7v6h:A 267 170 0.1261 0.1610 0.2529 3.1 7v6h:B
81 7a7b:A 323 71 0.0499 0.0526 0.2394 3.4 7a7b:B, 7a7b:C, 7a7b:D, 7a7b:E, 7a7b:F, 7a7b:H, 7apr:A, 7apr:B, 7apr:C, 7apr:D, 7apr:E, 7apr:F, 7apr:H
82 7a7b:G 265 71 0.0499 0.0642 0.2394 3.8
83 5epe:A 248 103 0.0821 0.1129 0.2718 4.2
84 7apr:G 293 71 0.0499 0.0580 0.2394 4.6
85 1axn:A 323 55 0.0499 0.0526 0.3091 4.9 1aii:A
86 8tua:A 1329 52 0.0528 0.0135 0.3462 5.1 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
87 4hgp:A 179 62 0.0674 0.1285 0.3710 5.7 1k1e:A, 1k1e:B, 1k1e:C, 1k1e:D, 1k1e:E, 1k1e:F, 1k1e:G, 1k1e:H, 1k1e:I, 1k1e:J, 1k1e:K, 1k1e:L
88 1gws:A 503 42 0.0411 0.0278 0.3333 5.7 2cvc:A, 1h29:A, 1h29:B, 1h29:C, 1h29:D
89 5gm2:K 267 110 0.0821 0.1049 0.2545 5.8
90 7slp:A 239 112 0.0997 0.1423 0.3036 6.9 7slq:A
91 8sfj:A 1001 78 0.0616 0.0210 0.2692 7.1
92 4dzr:A 163 31 0.0381 0.0798 0.4194 7.9
93 6qxl:J 404 53 0.0528 0.0446 0.3396 8.7
94 2b3t:A 276 71 0.0528 0.0652 0.2535 9.6 1t43:A
95 6qxl:A 483 53 0.0528 0.0373 0.3396 9.8 6qxl:B, 6qxl:C, 6qxl:D, 6qxl:E, 6qxl:F, 6qxl:G, 6qxl:H, 6qxl:I, 6qxl:K, 6qxl:L

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218