BioLiP

>protein
HTARLVHTADLDSETRQDIRQMVTGAFAGDFTETDWEHTLGGMHALIWHHGAIIAHAAVIQRRLIYRGNALRCGYVEGVA
VRADWRGQRLVSALLDAVEQVMRGAYQLGALSSSARARRLYASRGWLPWHGPTSVLAPTGPVRTPDDDGTVFVLPIDISL
DTSAELMCDWRAGDVW

The query sequence (length=176) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1m4d:A	181	176	1.0000	0.9724	1.0000	1.29e-127	1m4d:B, 1m4g:A, 1m4g:B, 1m4i:A, 1m4i:B
2	7cs1:A	191	190	0.6818	0.6283	0.6316	9.21e-71	7cs0:A, 7cs0:B, 7cs1:B, 7csi:A, 7csi:B, 7csj:A, 7csj:B
3	5us1:A	189	173	0.3239	0.3016	0.3295	1.34e-33	7jzs:A, 5us1:B, 5us1:C, 5us1:D, 5us1:E, 5us1:F, 5us1:G, 5us1:H, 5us1:I, 5us1:K, 5us1:L, 6vou:A, 6vou:B, 6vr2:A, 6vr2:B, 6vr3:A, 6vr3:B, 6vta:A, 6vta:B
4	1i1d:D	161	70	0.1023	0.1118	0.2571	0.062	1i12:A, 1i12:B, 1i12:C, 1i12:D, 1i1d:A, 1i1d:B, 1i1d:C
5	7l1k:A	149	47	0.0966	0.1141	0.3617	0.11
6	7q3a:B	340	30	0.0739	0.0382	0.4333	0.21	7q3a:A
7	4xx6:B	321	65	0.1023	0.0561	0.2769	0.88	4xx6:A
8	3pvl:A	597	40	0.0682	0.0201	0.3000	1.5
9	5kf2:A	317	51	0.0852	0.0473	0.2941	3.5	5kf1:A, 5kf1:B, 5kf8:A, 5kf9:A, 5kga:A, 5kga:B, 5kgh:A, 5kgh:B, 5kgj:A, 5kgp:A, 5kgp:B
10	2bei:A	156	55	0.0966	0.1090	0.3091	9.5	2q4v:A
11	8gai:C	434	39	0.0511	0.0207	0.2308	9.6	5b56:A, 5b56:B, 4ba3:A, 3btr:C, 6bw0:E, 6bw1:E, 7cru:A, 7cru:C, 5ctt:A, 5d5k:C, 5e6q:B, 8ech:E, 1ejl:I, 1ejy:I, 5ekf:A, 5ekg:A, 8f2q:A, 5fc8:E, 8fk3:A, 8fua:A, 8fuc:B, 8fzk:C, 8g8q:A, 8g8r:A, 8g8s:A, 8gai:A, 5gxw:A, 5h43:A, 8he0:A, 8he3:A, 5hhg:E, 4htv:A, 5huw:C, 5huy:C, 1iq1:C, 6iu7:A, 6iua:A, 6iw8:C, 6iwa:C, 7jjm:B, 7jk7:B, 7jvo:A, 6k06:C, 5k9s:A, 5klr:B, 5klt:B, 3knd:A, 7l04:E, 3l3q:A, 7leq:E, 7let:E, 7leu:E, 7m60:A, 6mjl:B, 4mz5:E, 4mz6:E, 7n8j:A, 7n9h:C, 4oih:A, 3oqs:A, 6p6a:B, 6p6e:A, 1pjm:B, 1pjn:B, 1q1s:C, 1q1t:C, 3q5u:A, 8q8k:A, 8q8k:B, 8qxw:A, 8qxx:A, 7rfx:A, 7rfz:A, 7rg0:A, 7rg1:A, 7rg2:A, 7rg3:A, 7rg4:E, 7rg6:A, 3rz9:A, 3rzx:A, 8sg7:B, 8sud:A, 5svz:A, 8sv0:B, 7tmx:I, 7tmy:I, 3tpm:A, 8tuq:A, 8tur:A, 8tus:A, 8tut:A, 8tuu:A, 8tuv:A, 8u36:A, 4u54:A, 4u58:A, 4u5l:A, 4u5n:A, 4u5o:A, 4u5s:A, 4u5u:A, 4u5v:A, 5u5p:A, 5u5r:A, 3ukw:B, 3ukx:B, 3uky:B, 3ukz:B, 3ul0:B, 3ul1:B, 5umz:B, 7umi:E, 3uvu:A, 5v5o:C, 5v5p:C, 3ve6:A, 8vpr:A, 8vpu:A, 5w41:A, 5w4e:B, 5w4f:B, 5w4g:B, 6wba:A, 6wbb:I, 6wbc:A, 5wum:A, 5wun:A, 4wv6:A, 6wx7:A, 5x8n:A, 1y2a:C, 4yi0:C, 2ynr:A, 4zdu:A, 3zin:A, 3zio:A, 3zip:A, 3ziq:A, 3zir:A

[Back]