BioLiP

>protein
HSQSIFDIHPVLSAEEIHLIEASVEQFGAPLLLLDCDVIRQQYRALKNALPNVTLHYALKPLPHPVVVRTLLAEGASFDL
ATTGEVELVASEGVPADLTIHTHPIKRDADIRDALAYGCNVFVVDNLNELEKFKAYRDDVELLVRLSFSKKFGCSPEQAL
VIIETAKEWNIRIKGLSFHVGSQTTNPNKYVEAIHTCRHVMEQVVERGLPALSTLDIGGGFPVNYTQQVMPIDQFCAPIN
EALSLLPETVHVLAEPGRFICAPAVTSVASVMGQAEREGQIWYYLDDGIYGSFSGLMFDDARYPLTTIKQGGELIPSVLS
GPTCDSVDVIAENILLPKLNNGDLVIGRTMGAYTSATATDFNFFKRAQTIALNEFV

The query sequence (length=376) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2plj:A	376	376	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	2plj:B, 2plk:A, 2plk:B
2	5gjo:A	385	374	0.3404	0.3325	0.3422	9.52e-69	5gjn:A, 5gjo:B, 5gjp:A
3	2oo0:A	419	346	0.3324	0.2983	0.3613	3.39e-57	5bwa:A, 7odc:A, 2on3:A, 2on3:B, 2oo0:B, 7s3f:A, 7s3f:B, 7s3g:A, 7s3g:B, 7u6p:A, 7u6p:B, 7u6u:A, 7u6u:B, 4zgy:A
4	1f3t:B	381	350	0.3245	0.3202	0.3486	2.35e-56	1f3t:A, 1f3t:C, 1f3t:D, 1njj:A, 1njj:B, 1njj:C, 1njj:D, 1qu4:A, 1qu4:B, 1qu4:C, 1qu4:D, 1szr:C, 1szr:D, 1szr:A, 1szr:B, 2tod:A, 2tod:B, 2tod:C, 2tod:D
5	2nv9:B	372	329	0.2819	0.2849	0.3222	3.11e-48	2nv9:A, 2nv9:C, 2nv9:D, 2nv9:E, 2nv9:F, 2nv9:G, 2nv9:H, 2nva:A, 2nva:B, 2nva:C, 2nva:D, 2nva:E, 2nva:F, 2nva:G, 2nva:H
6	2yxx:A	385	374	0.2420	0.2364	0.2433	1.70e-26
7	1hkv:A	446	395	0.2500	0.2108	0.2380	1.60e-22	1hkv:B
8	7ru7:A	412	366	0.2128	0.1942	0.2186	4.68e-20	2j66:A
9	4xg1:B	418	388	0.2553	0.2297	0.2474	3.12e-19	4xg1:C, 4xg1:D
10	4xg1:A	393	365	0.2473	0.2366	0.2548	3.89e-18
11	3c5q:A	394	368	0.2261	0.2157	0.2310	1.17e-17	2qgh:A
12	5x7m:A	443	392	0.2527	0.2144	0.2423	1.83e-16	5x7m:B, 5x7n:A, 5x7n:B
13	6knh:C	384	352	0.2340	0.2292	0.2500	4.92e-16	6knh:A, 6knh:B, 6kni:A, 6kni:B, 6kni:C, 6knk:A, 6knk:B, 6knk:C
14	1knw:A	421	405	0.2633	0.2352	0.2444	2.78e-15	1ko0:A
15	7kh2:D	415	390	0.2021	0.1831	0.1949	3.51e-15	7kh2:A, 7kh2:B, 7kh2:C
16	1tuf:A	434	383	0.2394	0.2074	0.2350	1.02e-14	1tuf:B, 1twi:A, 1twi:B, 1twi:C, 1twi:D
17	8d4i:A	462	394	0.2394	0.1948	0.2284	5.38e-10	8d2y:A, 8d4i:C, 8d5d:A, 8d5d:B, 8d5r:A, 8d5r:B, 8d88:A, 8d88:B
18	6n2a:A	422	375	0.2234	0.1991	0.2240	2.77e-07	6n2a:B, 6n2f:B, 6n2f:A
19	3nzp:B	591	246	0.1543	0.0981	0.2358	3.57e-06	3nzp:A
20	6hiv:CR	314	147	0.1011	0.1210	0.2585	0.010	6hiw:CR, 6hiy:CR, 6hiz:CR, 7pub:CR
21	3n29:A	371	290	0.1729	0.1752	0.2241	0.032	3n29:B
22	3nzq:A	628	79	0.0585	0.0350	0.2785	0.042	3nzq:B
23	7r50:A	473	47	0.0479	0.0381	0.3830	2.7	7r50:D, 7r50:E, 7r50:H, 7r50:I, 7r50:L, 7r50:M, 7r50:N, 7r50:P
24	7aat:A	401	159	0.1011	0.0948	0.2390	3.0	7aat:B, 8aat:A, 8aat:B, 9aat:A, 9aat:B, 1aka:A, 1aka:B, 1akb:A, 1akc:A, 1ama:A, 1ivr:A, 1map:A, 1maq:A, 1oxo:A, 1oxo:B, 1oxp:A, 1tar:A, 1tar:B, 1tas:A, 1tas:B, 1tat:A, 1tat:B
25	4etp:A	379	46	0.0372	0.0369	0.3043	4.7	1f9t:A, 1f9u:A, 1f9v:A, 3kar:A
26	2yaj:C	871	61	0.0452	0.0195	0.2787	4.8	2y8n:A, 2yaj:A
27	5fsx:A	233	81	0.0638	0.1030	0.2963	5.4	5fsx:B, 5fsy:A
28	3vyr:B	371	40	0.0399	0.0404	0.3750	7.8	3vys:B, 3vyt:B, 3vyu:B, 2z1d:A, 2z1d:B
29	1fsg:A	233	52	0.0426	0.0687	0.3077	9.9	1dbr:A, 1dbr:B, 1dbr:D, 1fsg:C, 1qk3:A, 1qk3:B, 1qk3:C, 1qk3:D, 1qk4:A, 1qk4:B, 1qk4:C, 1qk4:D, 1qk5:A, 1qk5:B

[Back]