BioLiP

>protein
HMRVQVSGLSDETTWHTLKDHLRQAGEVTFCKVFSGGRAVVEFVTPEDAARAITELQASELEGATLFLR

The query sequence (length=69) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8fnk:13	127	69	0.9710	0.5276	0.9710	6.28e-44	6e4p:C, 6e4p:I, 6e4p:B
2	2m8d:B	91	70	0.4348	0.3297	0.4286	1.57e-14	7abg:A6
3	2n7c:A	89	68	0.3043	0.2360	0.3088	0.003
4	6r5k:H	394	69	0.3188	0.0558	0.3188	0.023	6r5k:D, 6r5k:F
5	6r5k:H	394	32	0.1739	0.0305	0.3750	3.1	6r5k:D, 6r5k:F
6	5mqf:o	223	30	0.2319	0.0717	0.5333	0.075	6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
7	5x8p:v	190	71	0.3188	0.1158	0.3099	0.14	5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
8	7zew:A	117	30	0.2319	0.1368	0.5333	0.16	7zex:A
9	4ed5:B	169	68	0.3043	0.1243	0.3088	0.17	4ed5:A
10	9em0:A	376	36	0.1884	0.0346	0.3611	0.29	8aua:A, 8aua:B, 8aub:A, 8aub:B, 8aue:A, 8aue:B, 8auj:A, 8auj:B, 8aul:A, 8aul:B, 8aum:A, 8aum:B, 8aun:A, 8aun:B, 8auo:B, 8auo:A, 8auq:A, 8auq:B, 9em0:B, 9em2:B, 9em2:A, 9em3:A, 9em4:B, 9em4:A, 9em5:A, 9em6:B, 9em6:A, 3hgo:A, 3hgo:B, 3hgs:A, 3hgs:B, 2hs6:A, 2hs6:B, 2hs8:A, 2hs8:B, 2hsa:B, 2hsa:A, 8qmx:A, 8qmx:B, 8qn1:A, 8qn1:B, 8qn1:C, 8qn1:D, 8qn3:A, 8qn3:B, 8qn9:B, 8s8v:A, 8s8v:B, 8s8y:B, 8s8y:A
11	4a8x:A	88	30	0.1449	0.1136	0.3333	0.29
12	2i2y:A	150	28	0.2029	0.0933	0.5000	1.1	9asq:H, 5bmg:A, 5bmg:B, 5bmg:H, 5bmg:D, 5bmg:E, 5bmg:F, 5bmg:G, 5bmh:A, 3v3x:C, 3v3x:D
13	5dy2:A	378	36	0.1739	0.0317	0.3333	1.2	5dxx:A, 5dxy:A, 5dy3:A
14	9gpj:A	184	56	0.2754	0.1033	0.3393	1.3	6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
15	4qqb:A	169	60	0.2464	0.1006	0.2833	1.4	1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
16	5en1:A	184	28	0.1739	0.0652	0.4286	1.4	8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
17	2mgz:A	94	37	0.1884	0.1383	0.3514	1.5
18	4c2c:A	433	25	0.1594	0.0254	0.4400	1.8	4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
19	4c2d:D	343	25	0.1594	0.0321	0.4400	2.0
20	5h68:B	332	36	0.2029	0.0422	0.3889	2.2	5h68:A
21	8xxm:3G	84	59	0.2609	0.2143	0.3051	2.9	5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
22	7qun:A	694	35	0.2029	0.0202	0.4000	2.9	7qun:B, 7qun:C, 7qun:D
23	7abi:P	237	48	0.2319	0.0675	0.3333	3.3	7aav:P, 7abg:P
24	8ch6:U	295	48	0.2319	0.0542	0.3333	3.4	7a5p:P, 8c6j:M, 6ff4:P, 6ff7:P, 9fmd:O, 8i0p:O, 8i0r:O, 8i0s:O, 8i0t:O, 8i0u:O, 8i0v:O, 8i0w:O, 6icz:O, 6id0:O, 6id1:O, 5mqf:P, 6qdv:M, 7qtt:U, 8ro2:O, 7w59:O, 7w5a:O, 7w5b:O, 5xjc:O, 5yzg:O, 5z56:O, 5z57:O, 6zym:P
25	2rs2:A	84	28	0.1739	0.1429	0.4286	3.5
26	8i0v:4	161	70	0.2899	0.1242	0.2857	3.8
27	5hh3:C	393	31	0.1594	0.0280	0.3548	7.1	5hh3:A
28	4ayb:B	1103	22	0.1449	0.0091	0.4545	7.1	3hkz:B, 3hkz:J, 2pmz:B, 2pmz:R, 4v8s:AR, 4v8s:BB, 2waq:B, 2wb1:B, 2wb1:R, 2y0s:B, 2y0s:R
29	7ok0:B	1109	22	0.1449	0.0090	0.4545	7.4	7oq4:B, 7oqy:B
30	1dfx:A	125	34	0.1304	0.0720	0.2647	7.5

[Back]