Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
HMMKKTALITGFTGQVGSQMADFLLENTDYDVIGMMRWQEPMDNIYHLSDRINKKDRISIFYADLNDYSSLQKLFESQRP
DVIFHLAAQSYPKTSFDIPIETLQTNIIGTANILENIRILKAKEGYDPVVHICSSSEVYGKAKVGVKLNEETAFHGASPY
SISKIGTDYLGKFYGEAYNIRTFVTRMGTHSGPRRSDVFFESTVAKQIALIEAGYQEPVIKVGNLSSVRTFQDCRDAIRA
YYLLSLESEKGNIPCGEAFNIAGEEAFKLPEVIDILLNFSDMGRGIEVRQVEDRMRPIDADYQMFDNSKIKSFIDWKAEI
PVRQMLKDLLNHWRNEIKRGRIPLNR

The query sequence (length=346) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7us5:A 346 346 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 7us5:B, 7us5:C, 7us5:D
2 2pk3:A 309 329 0.3035 0.3398 0.3191 2.90e-43 2pk3:B
3 1n7g:B 336 343 0.2890 0.2976 0.2915 8.17e-37 1n7g:A, 1n7g:C, 1n7g:D, 1n7h:A, 1n7h:B
4 6x3b:A 300 339 0.2717 0.3133 0.2773 6.78e-35 6x3b:B, 6x3b:C, 6x3b:D
5 5uzh:A 345 350 0.2919 0.2928 0.2886 9.61e-33
6 7kf3:A 362 350 0.2832 0.2707 0.2800 4.65e-32 7kf3:B, 7kf3:C, 7kf3:D
7 5in4:A 355 352 0.2775 0.2704 0.2727 1.27e-31 6gpj:A, 6gpj:B, 6gpj:D, 6gpj:C, 6gpk:A, 6gpk:B, 6gpk:C, 6gpk:D, 6gpl:B, 6gpl:E, 6gpl:C, 6gpl:D, 5in4:B, 5in4:C, 5in4:D, 5in5:A, 5in5:B, 5in5:C, 5in5:D, 6q94:B, 6q94:A, 6q94:C, 6q94:E, 6q94:D, 6q94:F, 6q94:G, 6q94:H, 1t2a:A, 1t2a:D, 1t2a:B, 1t2a:C
8 2z1m:A 338 348 0.2746 0.2811 0.2730 7.67e-28 2z1m:D, 2z95:A, 2z95:D
9 1keu:A 361 363 0.2890 0.2770 0.2755 5.09e-26 1g1a:A, 1g1a:B, 1g1a:C, 1g1a:D, 1keu:B, 1kew:A, 1kew:B
10 2hun:A 329 320 0.2890 0.3040 0.3125 1.39e-23 2hun:B
11 1bxk:B 344 277 0.2225 0.2238 0.2780 2.26e-22 1bxk:A
12 4zrn:A 309 333 0.2659 0.2977 0.2763 1.60e-21 4zrm:A, 4zrm:B, 4zrn:B
13 1rpn:D 322 248 0.1908 0.2050 0.2661 2.79e-20 1rpn:A, 1rpn:B, 1rpn:C
14 8du1:A 361 347 0.2659 0.2548 0.2651 1.75e-19 8du1:B, 8du1:C, 8du1:D
15 6zll:A 321 277 0.2283 0.2461 0.2852 2.45e-18 6zl6:A, 6zl6:B, 6zla:A, 6zla:B, 6zla:C, 6zla:D, 6zld:A, 6zld:B, 6zlj:A, 6zlj:B, 6zlk:A, 6zlk:B, 6zlk:C, 6zlk:D, 6zll:B, 6zll:C, 6zll:D
16 1orr:A 338 364 0.2630 0.2692 0.2500 2.21e-16 1orr:B, 1orr:C, 1orr:D
17 1ker:B 347 328 0.2399 0.2392 0.2530 3.31e-15 1kep:A, 1kep:B, 1ker:A, 1ket:A, 1ket:B, 1oc2:A, 1oc2:B
18 6bi4:C 311 342 0.2428 0.2701 0.2456 6.90e-14 6bi4:B, 6bi4:D, 6bi4:A
19 1rkx:C 351 289 0.2052 0.2023 0.2457 1.53e-13 1rkx:A, 1rkx:B, 1rkx:D
20 2p5u:A 311 340 0.2283 0.2540 0.2324 3.25e-13 2p5u:B, 2p5u:C, 2p5u:D, 2p5y:A
21 5u4q:A 321 191 0.1705 0.1838 0.3089 8.41e-13
22 5u4q:B 304 191 0.1676 0.1908 0.3037 1.17e-12
23 1r66:A 322 338 0.2457 0.2640 0.2515 1.40e-12 1r6d:A
24 3aw9:A 304 327 0.2399 0.2730 0.2538 1.67e-12 3aw9:B, 3aw9:C, 3icp:A, 3ko8:A
25 2b69:A 312 341 0.2370 0.2628 0.2405 6.39e-12 4gll:A, 4gll:B
26 6pnl:A 336 327 0.2110 0.2173 0.2232 9.42e-12 6pmh:A
27 7yst:A 312 169 0.1503 0.1667 0.3077 9.69e-12 7ys8:A, 7ys8:B, 7ys9:A, 7ys9:B, 7ysa:A, 7ysa:B, 7ysm:A, 7ysm:B, 7yst:B, 7ysy:A, 7ysy:B, 7yt0:A, 7yt0:B
28 1wvg:A 352 346 0.2254 0.2216 0.2254 2.07e-11 1wvg:B
29 6vlo:A 319 323 0.2225 0.2414 0.2384 2.91e-11 6vlo:B, 6vlo:C, 6vlo:D
30 8wov:B 341 352 0.2457 0.2493 0.2415 3.10e-11 8wop:A, 8wop:B, 8wov:A, 8wow:A, 8wow:B
31 8sk0:B 330 299 0.1965 0.2061 0.2274 7.97e-11 8shh:A, 8shh:B, 8sk0:A
32 6dnt:A 310 315 0.2341 0.2613 0.2571 3.07e-10
33 6bwl:A 313 186 0.1561 0.1725 0.2903 1.48e-09
34 4lk3:B 274 337 0.2341 0.2956 0.2404 3.81e-08 4lk3:A, 4lk3:C, 4lk3:D, 4lk3:E, 4lk3:F, 4m55:A, 4m55:B, 4m55:C, 4m55:D
35 2c20:A 329 289 0.1792 0.1884 0.2145 6.01e-08 2c20:B, 2c20:C, 2c20:D, 2c20:E, 2c20:F
36 6wj9:B 308 254 0.1676 0.1883 0.2283 7.37e-08 6wj9:A, 6wja:A, 6wja:B, 6wjb:A, 6wjb:B
37 7xpo:A 344 351 0.2341 0.2355 0.2308 3.01e-07 7xpo:B, 7xpp:B, 7xpp:A, 7xpq:A, 7xpq:B
38 1z45:A 674 163 0.1272 0.0653 0.2699 3.59e-07
39 3lu1:A 336 331 0.2399 0.2470 0.2508 3.74e-07 3lu1:B, 3lu1:C, 3lu1:D, 3ru7:A, 3ru7:B, 3ru7:C, 3ru7:D, 3ru9:A, 3ru9:B, 3ru9:C, 3ru9:D, 3rua:A, 3rua:B, 3rua:C, 3rua:D, 3ruc:A, 3ruc:B, 3ruc:C, 3ruc:D, 3rud:A, 3rud:B, 3rud:C, 3rud:D, 3rue:A, 3rue:B, 3rue:S, 3rue:b, 3ruf:A, 3ruf:B, 3ruf:S, 3ruf:b, 3ruh:A, 3ruh:B, 3ruh:C, 3ruh:D
40 3ehe:A 290 273 0.1965 0.2345 0.2491 3.94e-07 3ehe:B
41 4j2o:C 316 116 0.1098 0.1203 0.3276 1.38e-06 4j2o:A, 4j2o:B, 4j2o:D, 4j2o:E, 4j2o:F
42 8vr2:B 321 289 0.2168 0.2336 0.2595 1.46e-06 8vr2:A, 8vr2:C, 8vr2:D
43 7k3p:A 329 333 0.2081 0.2188 0.2162 3.10e-06 7k3p:B
44 3a1n:A 315 174 0.1358 0.1492 0.2701 9.04e-06 3a1n:B, 3a4v:A, 3a4v:B, 3a9w:A, 3a9w:B, 3ajr:A, 3ajr:B
45 2q1w:A 300 113 0.1098 0.1267 0.3363 1.37e-05 2q1w:B, 2q1w:C
46 8gjh:A 639 250 0.1792 0.0970 0.2480 1.64e-05 8gjh:B, 8gjh:C, 8gjh:D, 8gjh:E, 8gjh:F
47 3vvb:A 270 113 0.0925 0.1185 0.2832 2.83e-05
48 3w1v:A 347 113 0.0925 0.0922 0.2832 3.04e-05 4g5h:A, 3vvc:A, 3w1v:B
49 6h0n:A 377 287 0.1994 0.1830 0.2404 3.66e-05 6h0n:B, 6h0p:A, 6h0p:B
50 4r1s:A 319 110 0.1012 0.1097 0.3182 3.87e-05 4r1s:B
51 4twr:A 325 186 0.1358 0.1446 0.2527 4.46e-05 4wok:A
52 6kv9:A 299 335 0.2370 0.2742 0.2448 4.48e-05 6kvc:A
53 6k0g:A 335 348 0.2283 0.2358 0.2270 5.23e-05 6k0h:A, 6k0i:A
54 3rfv:A 265 224 0.1647 0.2151 0.2545 1.40e-04 3rfv:B, 3rfv:C, 3rfx:A, 3rfx:B, 3rfx:C
55 1z7e:D 644 272 0.1792 0.0963 0.2279 1.79e-04 2bln:A, 2bln:B, 5j63:A, 5j63:B, 5j63:C, 5j63:D, 1z7e:A, 1z7e:B, 1z7e:C, 1z7e:E, 1z7e:F
56 1i3k:A 347 355 0.2312 0.2305 0.2254 2.55e-04 1ek5:A, 1ek6:A, 1ek6:B, 1hzj:A, 1hzj:B, 1i3k:B, 1i3l:A, 1i3l:B, 1i3m:A, 1i3m:B, 1i3n:A, 1i3n:B
57 8v4h:B 342 256 0.1618 0.1637 0.2188 3.02e-04 8v4g:A, 8v4g:B, 8v4h:A
58 6jyg:D 307 173 0.1185 0.1336 0.2370 3.90e-04 6jyg:A, 6jyg:B, 6jyg:C, 6jyg:E, 6jyg:F
59 3sxp:D 314 279 0.2139 0.2357 0.2652 5.24e-04 3sxp:A, 3sxp:B, 3sxp:C, 3sxp:E
60 5bju:A 340 107 0.0723 0.0735 0.2336 8.43e-04 5bju:B, 5bjv:A, 5bjv:B, 5bjw:A, 5bjw:B, 5bjx:A, 5bjx:B, 5bjy:A, 5bjy:B
61 1i24:A 392 233 0.1503 0.1327 0.2232 0.001 1i2b:A, 1i2c:A, 1qrr:A
62 4lis:A 364 145 0.1243 0.1181 0.2966 0.001 4lis:B, 4lis:C
63 8fet:A 334 113 0.0954 0.0988 0.2920 0.001 8fet:B, 8feu:A, 8feu:B, 8fev:A, 8fev:B, 8few:A, 8few:B
64 5z75:A 306 343 0.2254 0.2549 0.2274 0.001 5z75:B, 5z75:D
65 1sb8:A 341 197 0.1445 0.1466 0.2538 0.002 1sb9:A
66 1a9y:A 338 349 0.2023 0.2071 0.2006 0.003 1a9z:A, 5gy7:A, 5gy7:B, 1kvq:A, 1kvr:A, 1kvs:A, 1kvt:A, 1kvu:A, 1lrj:A, 1lrk:A, 1lrl:A, 1nah:A, 1nai:A, 1uda:A, 1udb:A, 1udc:A, 2udp:A, 2udp:B, 1xel:A
67 3enk:A 340 356 0.2399 0.2441 0.2331 0.006 3enk:B
68 7cgv:A 310 345 0.2081 0.2323 0.2087 0.007 7cgv:B, 7cgv:C, 7cgv:D
69 2q1s:A 336 195 0.1272 0.1310 0.2256 0.011 2pzj:A, 2q1t:A, 2q1u:A, 2q1u:B
70 8gjb:A 320 175 0.1185 0.1281 0.2343 0.016 8gjb:B
71 2gn4:A 329 110 0.0867 0.0912 0.2727 0.016 2gn4:B, 2gn6:A, 2gn6:B, 2gn8:A, 2gn8:B, 2gn9:A, 2gn9:B, 2gna:A, 2gna:B
72 6bwc:C 327 146 0.1127 0.1193 0.2671 0.019 6bwc:A, 6bwc:B, 6bwc:D, 6bwc:E, 6bwc:F
73 5u9c:A 288 138 0.1069 0.1285 0.2681 0.034 5u9c:C
74 5tqm:A 315 110 0.0867 0.0952 0.2727 0.049 5tqm:B
75 4m55:E 164 109 0.1040 0.2195 0.3303 0.051
76 5y1f:A 311 179 0.1156 0.1286 0.2235 0.059 5y1e:A, 5y1g:A
77 4tqg:A 297 148 0.1127 0.1313 0.2635 0.082
78 7kn1:A 336 163 0.1098 0.1131 0.2331 0.100 7kn1:B
79 6d2v:A 315 191 0.1098 0.1206 0.1990 0.13 6d2v:B, 6nd7:A, 6nd7:B
80 4yrb:C 249 228 0.1329 0.1847 0.2018 0.14 4yrb:A, 4yrb:D, 4yrb:E
81 3c1t:B 326 117 0.0867 0.0920 0.2564 0.15 3bxx:A, 3bxx:B, 3bxx:C, 3bxx:D, 3bxx:E, 3bxx:F, 3c1t:A, 3c1t:C, 3c1t:D, 2c29:D, 2c29:F, 2iod:A, 2iod:B, 2iod:C, 2iod:D, 2nnl:D, 2nnl:F
82 4pvd:A 342 156 0.1156 0.1170 0.2564 0.21 4pvd:B
83 4qec:A 248 121 0.1040 0.1452 0.2975 0.24 4qec:B, 4qed:A, 4qed:B
84 3sc6:D 283 156 0.1127 0.1378 0.2500 0.27 3sc6:A, 3sc6:B, 3sc6:C, 3sc6:E, 3sc6:F
85 2ggs:A 273 84 0.0723 0.0916 0.2976 0.32 2ggs:B
86 7epr:B 310 351 0.2110 0.2355 0.2080 0.37 7epr:A, 7epr:C, 7epr:D
87 8fip:A 338 67 0.0607 0.0621 0.3134 0.43 8fio:A, 8fio:B, 8fip:B
88 6uh2:B 255 245 0.1590 0.2157 0.2245 0.49 6uh2:A
89 2hma:A 364 90 0.0751 0.0714 0.2889 0.57
90 6nbr:A 316 130 0.1012 0.1108 0.2692 0.64 6nbr:B, 6nbr:C, 6nbr:D
91 4yr9:A 308 119 0.0723 0.0812 0.2101 1.5 4yr9:B, 4yr9:C, 4yr9:D, 4yr9:E, 4yr9:F
92 4imp:A 520 85 0.0636 0.0423 0.2588 1.9 4imp:B, 4imp:C, 4imp:D
93 8q4h:A 503 58 0.0549 0.0378 0.3276 3.2 8q4h:B
94 8hi5:A 647 206 0.1416 0.0757 0.2379 3.5
95 6aqz:A 334 120 0.0809 0.0838 0.2333 4.2 6aqz:B, 6aqz:C, 6aqz:E, 6aqz:F
96 5koh:A 483 47 0.0376 0.0269 0.2766 4.6 5koh:C, 5koj:A, 5koj:C
97 4yrb:B 215 94 0.0665 0.1070 0.2447 6.1 4yrb:F
98 1x9r:A 105 50 0.0434 0.1429 0.3000 7.2 1x9r:B, 1x9u:A, 1x9u:B
99 8ibd:AB 418 55 0.0520 0.0431 0.3273 7.3 8iao:Ab, 8iar:Ab, 8ibd:Ab, 8ibg:AB, 8ibg:Ab
100 5bnt:C 371 94 0.0780 0.0728 0.2872 7.4 5bnt:B, 5bnt:A, 5bnt:D
101 1nw1:A 365 71 0.0665 0.0630 0.3239 7.4 1nw1:B
102 2a7r:A 338 40 0.0462 0.0473 0.4000 7.7 2a7r:B, 2a7r:C, 2bzn:A, 2bzn:B, 2bzn:C, 2bzn:D, 2bzn:E, 2bzn:F, 2bzn:G, 2bzn:H, 2c6q:A, 2c6q:B, 2c6q:D, 2c6q:C, 2c6q:E, 2c6q:F, 2c6q:H, 2c6q:G
103 4v37:A 495 25 0.0347 0.0242 0.4800 8.2 4a0m:A, 4a0m:B, 4a0m:C, 4a0m:D, 4v37:B, 4v37:C, 4v37:D
104 4e5y:C 290 26 0.0347 0.0414 0.4615 9.1
105 3a06:B 373 87 0.0549 0.0509 0.2184 9.6 3a06:A, 3a14:A, 3a14:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218