BioLiP

>protein
HLFTSESVSEGHPDKIADQISDAVLDAILEQDPKARVACETYVKTGMVLVGGEITTSAWVDIEEITRNTVREIGYVHSDM
GFDANSCAVLSAIGKQSPDINQGVDRADPLEQGAGDQGLMFGYATNETDVLMPAPITYAHRLVQRQAEVRKNGTLPWLRP
DAKSQVTFQYDDGKIVGIDAVVLSTQHSEEIDQKSLQEAVMEEIIKPILPAEWLTSATKFFINPTGRFVIGGPMGDCGLT
GRKIIVDTYGGMARHGGGAFSGKDPSKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADRCEIQVSYAIGVAEPTSIMVETFGTEKVPS
EQLTLLVREFFDLRPYGLIQMLDLLHPIYKETAAYGHFGREHFPWEKTDKAQLLRDAAGLK

The query sequence (length=381) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7loz:B	390	380	0.9974	0.9744	1.0000	0.0	7ll3:A, 7ll3:B, 7lnn:A, 7lnn:B, 7lo2:A, 7lo2:B, 7lo2:C, 7lo2:D, 7loo:A, 7loo:Q, 7loo:B, 7loo:R, 7low:A, 7low:B, 7loz:A, 1mxa:A, 1mxb:A, 1mxc:A, 1p7l:A, 1p7l:B, 1p7l:C, 1p7l:D, 7r2w:A, 1rg9:A, 1rg9:B, 1rg9:C, 1rg9:D, 1xra:A
2	5t8s:A	388	386	0.6982	0.6856	0.6891	0.0	5t8s:B, 5t8t:A, 5t8t:B
3	7r3b:C	371	381	0.6168	0.6334	0.6168	9.77e-162	7r3b:A, 7r3b:B, 7r3b:D, 7r3b:E, 7r3b:F, 7r3b:G, 7r3b:H
4	8jzg:B	390	389	0.5984	0.5846	0.5861	2.97e-152	8jzg:A, 8jzg:D, 8jzg:C
5	3s82:B	376	387	0.5774	0.5851	0.5685	4.85e-149	3rv2:A, 3s82:A
6	8p4h:A	388	371	0.5696	0.5593	0.5849	4.40e-145	5a19:A, 5a1g:A, 5a1i:A, 8axz:A, 7bhr:A, 7bhs:A, 7bht:A, 7bhu:A, 7bhv:A, 7bhw:A, 7bhx:A, 6fbn:A, 6fbo:A, 6fbp:A, 6fbp:B, 6fcb:A, 6fcd:A, 6g6r:A, 7kcc:A, 7kce:A, 7kcf:A, 7kda:A, 7kdb:A, 4ktt:B, 4ktt:D, 4ktv:A, 4ktv:B, 4ktv:D, 7l1a:A, 7lnh:A, 7lnh:B, 4ndn:A, 4ndn:B, 4ndn:D, 8oog:A, 2p02:A, 8p1t:AAA, 8p1v:AAA, 8p1w:AAA, 8p4h:B, 8p4h:C, 8p4h:D, 6p9v:A, 8qdy:A, 8qdz:A, 8qe0:A, 8qe1:A, 8qe2:A, 8qe3:A, 7rw5:A, 7rw5:B, 7rw5:C, 7rw7:A, 7rwg:A, 7rwh:A, 7rxv:A, 7rxw:A, 7rxx:A, 5ugh:A, 5ugh:C, 5ugh:D, 6wkb:A, 6wkb:B, 8xam:A, 8xam:B, 8xar:A, 8xb0:A
7	2obv:A	384	371	0.5696	0.5651	0.5849	5.69e-145	1o90:A, 1o90:B, 1o92:A, 1o92:B, 1o93:A, 1o93:B, 1o9t:A, 1o9t:B, 8swa:A
8	6vd1:A	395	389	0.5669	0.5468	0.5553	7.42e-136	6vcy:A, 6vd0:A, 6vd0:B, 6vd0:C, 6vd0:D, 6vd1:B, 6vd2:A, 6vd2:B
9	5ugh:B	365	369	0.5407	0.5644	0.5583	3.33e-135	6fbn:B, 4ktt:A, 4ktt:C, 4ktv:C, 4ndn:C, 7rw5:D
10	4odj:A	386	378	0.5039	0.4974	0.5079	2.58e-114	6c07:A, 6c07:B, 6c07:C, 6ltv:A, 6ltv:B
11	6rk7:E	375	378	0.4409	0.4480	0.4444	2.14e-99	6rk7:A, 6rk7:B, 6rk7:F, 6rk7:H, 6rk7:G, 6rka:A, 6rka:B, 6rka:C, 6rka:D, 6rkc:A, 6rkc:B, 6rkc:D, 6rkc:C, 6rkc:E, 6rkc:F, 6rkc:G, 6rkc:H
12	3bv6:B	354	56	0.0472	0.0508	0.3214	1.3	3bv6:A, 3bv6:C, 3bv6:D, 3bv6:E, 3bv6:F
13	5k3i:A	661	203	0.1234	0.0711	0.2315	1.5	5k3i:B, 5k3i:C, 5k3i:D, 5k3i:E, 5k3i:F, 5k3i:G, 5k3i:H
14	6zcv:A	562	31	0.0315	0.0214	0.3871	4.6	6zcw:A
15	4uwq:A	548	125	0.0945	0.0657	0.2880	4.7	4uwq:D, 4uwq:G, 4uwq:J, 2wdc:A, 2wdd:A, 2wde:A, 2wdf:A
16	7wct:A	300	79	0.0551	0.0700	0.2658	6.0	7dtz:A, 7f3m:A, 6iup:A, 6jpe:A, 6jpj:A, 8kh6:A, 8kh7:A, 8kh8:A, 8kh9:A, 4qrc:A, 4uxq:A, 7v29:B, 7v29:A, 6v9c:A, 7wcw:A, 7wcx:A, 4xcu:A, 8xlq:A, 7ybo:A, 7ybp:A, 7ybx:A, 7yc1:A, 7yc3:A
17	3m0v:C	433	53	0.0367	0.0323	0.2642	6.1	4gji:A, 4gji:B, 4gji:C, 4gji:D, 4gjj:A, 4gjj:B, 4gjj:C, 4gjj:D, 2hcv:A, 2hcv:B, 2hcv:C, 2hcv:D, 2i56:A, 2i56:B, 2i56:C, 2i56:D, 2i57:A, 2i57:B, 2i57:C, 2i57:D, 3itl:A, 3itl:B, 3itl:C, 3itl:D, 3ito:A, 3ito:B, 3ito:C, 3ito:D, 3itt:A, 3itt:B, 3itt:C, 3itt:D, 3itv:A, 3itv:B, 3itv:C, 3itv:D, 3itx:A, 3itx:B, 3itx:C, 3itx:D, 3iud:A, 3iud:B, 3iud:C, 3iud:D, 3iuh:A, 3iuh:B, 3iuh:C, 3iuh:D, 3iui:A, 3iui:B, 3iui:C, 3iui:D, 3m0h:A, 3m0h:B, 3m0h:C, 3m0h:D, 3m0l:A, 3m0l:B, 3m0l:C, 3m0l:D, 3m0m:A, 3m0m:B, 3m0m:C, 3m0m:D, 3m0v:A, 3m0v:B, 3m0v:D, 3m0x:A, 3m0x:B, 3m0x:C, 3m0x:D, 3m0y:A, 3m0y:B, 3m0y:C, 3m0y:D
18	6gaq:A	146	53	0.0394	0.1027	0.2830	7.2	6gaq:B
19	4tyj:A	278	79	0.0604	0.0827	0.2911	9.9	6iuo:A, 5jkg:A, 5nud:A, 5nud:B, 6nvg:A, 6nvh:A, 6nvi:A, 6nvj:A, 6nvk:A, 5nwz:A, 5nwz:B, 4qq5:A, 4qqc:A, 4r6v:A, 4tyi:A, 7vjl:A, 7vjl:B, 8w5c:A, 8w5c:B, 5xff:A, 5xfj:A, 6yi8:A, 6yi8:B

[Back]