BioLiP

>protein
HHDGFQTVKATIDWEHPMFKLYEKAKRNGKWNPADIDFSQDQKDFASLTSEEKISALPLVAGFSAGEEAATLDILPMAHA
LARQGRLEDVLFLTTFMHDEAKHVEMFSRWQQAVGIGQMDLSVFHNDHYKRIFYEALPEAMNRLYADDSPEAVIRAATVY
NMIVEGTLAESGYYTFRQIYKKAGLFPGLLQGIDYLNMDEGRHIQFGIYTIQRIVNEDERYYELFIRYMDELWPHVIGYV
DYLTELGKIDYDLLRHYVIKQFNLRKKQISRT

The query sequence (length=272) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5dcs:A	287	284	0.9963	0.9443	0.9542	0.0	5dco:A, 5dcr:A, 5ekb:A, 6f65:A, 6f6b:A, 6f6c:A, 6f6c:B, 6f6e:A, 6f6e:B, 6f6f:A, 6f6g:A, 6f6g:B, 6f6h:A, 6f6h:B, 6f6k:A, 6f6k:B, 6f6l:A, 6f6l:B, 6f6m:A, 6f6m:B, 4hr0:A, 4hr4:A, 6i90:A, 6i92:A, 6i93:A, 6i94:A, 6i95:A, 5omj:A, 5omk:A, 6qjv:A, 6qk0:A, 6qk0:B, 6qk1:A, 6qk2:A, 6qk2:B, 4xb9:A, 4xbv:A, 4xbv:B, 4xbw:A
2	7qbp:A	291	275	0.3676	0.3436	0.3636	1.12e-55
3	6qrz:A	274	220	0.3382	0.3358	0.4182	2.01e-55
4	7qbk:A	284	268	0.3750	0.3592	0.3806	3.66e-55
5	4ac8:A	311	233	0.3456	0.3023	0.4034	2.20e-51	4ac8:B, 4ac8:C, 4ac8:D, 3ee4:A
6	8dq5:B	265	210	0.1618	0.1660	0.2095	3.57e-04
7	5v4t:A	212	84	0.0993	0.1274	0.3214	3.82e-04	5v4t:B
8	3hf1:B	286	223	0.1875	0.1783	0.2287	8.01e-04	3hf1:A, 2vux:A
9	6d9f:B	322	163	0.1507	0.1273	0.2515	0.002	6d9f:A
10	5olk:A	395	255	0.2022	0.1392	0.2157	0.005	5olk:B, 5olk:C, 5olk:D, 6sf5:A, 6sf5:B
11	2rcc:C	311	195	0.1581	0.1383	0.2205	0.010	2rcc:B
12	2vux:B	255	111	0.1066	0.1137	0.2613	0.012
13	6y2n:A	306	205	0.1544	0.1373	0.2049	0.014
14	7aik:A	321	201	0.1618	0.1371	0.2189	0.016	7ail:A, 7q39:AAA, 7q3c:AAA
15	8dq3:D	297	197	0.1471	0.1347	0.2030	0.019	8dq3:A, 8dq3:B, 8dq3:C
16	2o1z:A	288	203	0.1949	0.1840	0.2611	0.026	2o1z:B, 2p1i:A, 2p1i:B, 2p1i:C, 2p1i:D, 2p1i:E, 2p1i:F, 2p1i:G, 2p1i:H
17	6cwq:A	308	227	0.1618	0.1429	0.1938	0.038	6cwo:A, 6cwo:B, 6cwp:B, 6cwp:A, 6cwq:B, 8dq4:A, 8dq4:B, 8dq5:A
18	1h0n:A	288	212	0.1618	0.1528	0.2075	0.22	1h0o:A, 2uw2:A, 3vpm:A, 3vpm:B, 3vpn:A, 3vpn:B, 3vpo:A, 3vpo:B, 1w68:A, 1w69:A, 1xsm:A
19	6zjk:A	317	253	0.2169	0.1861	0.2332	0.53	6zjk:C, 6zjk:D, 6zjk:B
20	7rk5:B	501	128	0.1213	0.0659	0.2578	0.99	7rk5:A
21	8x5i:A	477	67	0.0588	0.0335	0.2388	2.2	8x5i:C, 8x5n:A, 8x5n:D, 8x5n:B, 8x5n:C
22	8wy4:A	451	67	0.0588	0.0355	0.2388	2.3	8wy4:B, 8wy4:D, 8wy4:C, 8wy5:A, 8wy5:B, 8wy5:C, 8wy5:D, 8x51:A, 8x51:B
23	8x5i:D	557	67	0.0588	0.0287	0.2388	2.4	8x5i:B
24	1t0b:G	242	104	0.1029	0.1157	0.2692	2.7	1t0b:A, 1t0b:B, 1t0b:C, 1t0b:D, 1t0b:E, 1t0b:F, 1t0b:H
25	7mdi:E	353	23	0.0404	0.0312	0.4783	5.3	7mdi:G, 7mdi:F, 7mdi:H
26	7y4i:A	822	81	0.0846	0.0280	0.2840	5.5	8dti:A, 8dti:B
27	6z5u:A	254	36	0.0478	0.0512	0.3611	6.5
28	3t2d:A	390	72	0.0551	0.0385	0.2083	9.3	3t2b:A, 3t2c:A, 3t2e:A, 3t2f:A, 3t2g:A
29	1jk0:A	334	45	0.0515	0.0419	0.3111	9.5

[Back]