Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GVGSVAALLTVVFYIAAVMATNLYGATFPEWFGDLSKSLYTLFQVMTLESWSMGIVRPVMNVHPNAWVFFIPFIMLTTFT
VLNLFIGIIVDAM

The query sequence (length=93) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6sxc:A 271 93 0.9892 0.3395 0.9892 2.43e-62 5bzb:B, 5bzb:C, 5bzb:D, 4cbc:A, 4cbc:B, 4cbc:C, 4cbc:D, 4oxs:A, 4oxs:B, 4oxs:C, 4oxs:D, 4p2z:B, 4p30:A, 4p30:B, 4p30:C, 4p30:D, 4p9o:A, 4p9o:B, 4p9o:C, 4p9o:D, 4p9p:B, 4p9p:D, 4pa3:A, 4pa3:B, 4pa3:C, 4pa3:D, 4pa4:A, 4pa4:B, 4pa4:C, 4pa4:D, 4pa6:A, 4pa6:B, 4pa6:C, 4pa6:D, 4pa7:A, 4pa7:B, 4pa7:C, 4pa7:D, 4pa9:A, 4pa9:B, 4pa9:C, 4pa9:D, 8s6j:A, 6sx5:A, 6sx7:A, 6sxe:A, 6sxf:A, 6sxf:B, 6sxg:A, 4x88:A, 4x88:B, 4x88:C, 4x88:D, 4x89:B, 4x8a:B, 4x8a:C, 4x8a:D, 6yz0:A, 6yz2:A, 6z8c:A, 3zjz:A, 3zjz:B, 3zjz:C, 3zjz:D
2 5ek0:A 250 93 0.6882 0.2560 0.6882 6.63e-41 5ek0:B, 5ek0:C, 5ek0:D
3 7pgg:A 147 92 0.6452 0.4082 0.6522 9.39e-41 7pgg:B, 7pgi:E
4 6n4i:C 226 93 0.6774 0.2788 0.6774 2.32e-40 6n4i:A, 6n4i:D, 6n4i:B
5 5hk7:A 139 93 0.6129 0.4101 0.6129 1.85e-39 5hk7:B, 5hk7:C, 7pgb:c, 7pgb:Z, 7pgb:d, 7pgb:o, 7pgb:l, 7pgb:h, 7pgb:e
6 5klb:A 267 93 0.6559 0.2285 0.6559 1.93e-38 6c1e:A, 6c1e:B, 6c1k:A, 6c1k:B, 6c1m:A, 6c1m:B, 8h9w:A, 6juh:C, 6ke5:A, 6ke5:B, 6ke5:C, 6ke5:D, 6keb:C, 6keb:D, 5klb:B, 5klb:C, 5klb:D, 5klg:D, 5klg:C, 5kls:C, 5kmf:A, 5kmh:A
7 4dxw:A 210 89 0.4086 0.1810 0.4270 7.46e-16
8 8j7m:A 257 102 0.3226 0.1167 0.2941 1.64e-10 8j7m:C, 8j7m:D, 8j7m:B
9 8j7h:B 290 69 0.2581 0.0828 0.3478 1.86e-09 8j7f:A, 8j7f:B, 8j7f:C, 8j7f:D, 8j7h:C, 8j7h:D, 7x5v:A, 7x5v:B, 7x5v:C
10 7eeb:A 258 95 0.3226 0.1163 0.3158 3.87e-06
11 6kzo:A 967 70 0.2258 0.0217 0.3000 4.26e-05
12 6kzo:A 967 96 0.2473 0.0238 0.2396 0.002
13 6kzo:A 967 59 0.2043 0.0196 0.3220 0.90
14 6kzo:A 967 64 0.1505 0.0145 0.2188 3.2
15 6kzp:A 1014 70 0.2258 0.0207 0.3000 4.44e-05
16 6kzp:A 1014 97 0.2473 0.0227 0.2371 0.002
17 6kzp:A 1014 59 0.2043 0.0187 0.3220 0.90
18 6kzp:A 1014 64 0.1505 0.0138 0.2188 3.3
19 9ayh:A 1056 70 0.2258 0.0199 0.3000 7.46e-05 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
20 9ayh:A 1056 95 0.2366 0.0208 0.2316 0.001 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
21 9ayh:A 1056 59 0.2043 0.0180 0.3220 0.56 9ayg:A, 9ayj:A, 9ayk:A, 9ayl:A
22 7wli:A 1135 86 0.2581 0.0211 0.2791 2.32e-04 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
23 7wli:A 1135 104 0.2366 0.0194 0.2115 0.004 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
24 7wli:A 1135 59 0.2043 0.0167 0.3220 0.84 7wlj:A, 7wlk:A, 7wll:A
25 8e59:A 1230 113 0.3118 0.0236 0.2566 6.82e-04 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
26 8e59:A 1230 67 0.2043 0.0154 0.2836 0.015 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
27 8e59:A 1230 68 0.1935 0.0146 0.2647 0.25 8e5a:A, 8e5b:A, 7uhf:A, 7uhg:A
28 6jp5:A 1274 113 0.3011 0.0220 0.2478 0.002 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
29 6jp5:A 1274 60 0.1935 0.0141 0.3000 0.009 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
30 6jp5:A 1274 68 0.1828 0.0133 0.2500 0.37 6jp8:A, 6jpa:A, 6jpb:A
31 7jpx:A 1116 113 0.3011 0.0251 0.2478 0.002 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
32 7jpx:A 1116 60 0.1935 0.0161 0.3000 0.009 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
33 7jpx:A 1116 68 0.1828 0.0152 0.2500 0.35 8e56:A, 8e57:A, 8e58:A, 7jpk:A, 7jpl:A, 7jpv:A, 7jpw:A
34 7mix:A 1326 60 0.2043 0.0143 0.3167 0.002 7miy:A
35 7mix:A 1326 108 0.2796 0.0196 0.2407 0.018 7miy:A
36 7mix:A 1326 71 0.2151 0.0151 0.2817 6.3 7miy:A
37 7vfs:A 1266 60 0.2043 0.0150 0.3167 0.002 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
38 7vfs:A 1266 108 0.2796 0.0205 0.2407 0.017 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
39 7vfs:A 1266 71 0.2151 0.0158 0.2817 6.6 7vfu:A, 7vfv:A, 7vfw:A
40 8wea:A 1206 107 0.3011 0.0232 0.2617 0.003
41 8wea:A 1206 59 0.1828 0.0141 0.2881 0.098
42 8wea:A 1206 68 0.1935 0.0149 0.2647 0.16
43 8x90:A 1377 51 0.1828 0.0123 0.3333 0.007 8x91:A, 8x93:A
44 8x90:A 1377 89 0.2903 0.0196 0.3034 0.017 8x91:A, 8x93:A
45 8x90:A 1377 26 0.1290 0.0087 0.4615 0.089 8x91:A, 8x93:A
46 7xm9:A 1230 70 0.2151 0.0163 0.2857 0.007 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
47 7xm9:A 1230 84 0.2366 0.0179 0.2619 0.10 6j8g:A, 6j8h:A, 6j8i:A, 6j8j:A, 7xmf:A, 7xmg:A, 8xmm:A
48 7w9l:A 1420 61 0.2043 0.0134 0.3115 0.008 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
49 7w9l:A 1420 84 0.2366 0.0155 0.2619 0.089 8g1a:A, 7w9k:A, 7w9m:A, 7w9p:A, 7w9t:A, 8xmo:A
50 8epm:A 991 59 0.1935 0.0182 0.3051 0.009
51 8epm:A 991 119 0.3118 0.0293 0.2437 0.025
52 8epm:A 991 89 0.2473 0.0232 0.2584 0.027
53 8fhs:A 1282 111 0.3011 0.0218 0.2523 0.010 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
54 8fhs:A 1282 59 0.1828 0.0133 0.2881 0.100 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
55 8fhs:A 1282 68 0.1935 0.0140 0.2647 0.16 8eog:K, 8fd7:K, 8hlp:A, 8hma:E, 8hmb:D, 8we6:A, 8we7:A, 8we8:A, 8we9:A
56 7xlq:A 1319 50 0.1828 0.0129 0.3400 0.011 8epl:A, 7yg5:A
57 7xlq:A 1319 119 0.3118 0.0220 0.2437 0.023 8epl:A, 7yg5:A
58 7xlq:A 1319 91 0.2688 0.0190 0.2747 0.030 8epl:A, 7yg5:A
59 8fhd:A 1294 70 0.2151 0.0155 0.2857 0.013
60 8fhd:A 1294 83 0.2258 0.0162 0.2530 0.23
61 8gz2:B 1174 70 0.2151 0.0170 0.2857 0.013 8gz1:B
62 8gz2:B 1174 81 0.2043 0.0162 0.2346 0.28 8gz1:B
63 6agf:A 1138 62 0.2258 0.0185 0.3387 0.014
64 6agf:A 1138 84 0.2258 0.0185 0.2500 2.7
65 8eoi:K 1116 115 0.3118 0.0260 0.2522 0.036
66 8eoi:K 1116 59 0.1828 0.0152 0.2881 0.085
67 8eoi:K 1116 68 0.1935 0.0161 0.2647 0.15
68 6xiw:A 1256 69 0.1720 0.0127 0.2319 0.050
69 6xiw:A 1256 62 0.1613 0.0119 0.2419 1.0
70 6xiw:A 1256 61 0.1828 0.0135 0.2787 3.8
71 6xiw:A 1256 110 0.2903 0.0215 0.2455 6.9
72 8f6p:A 1091 71 0.2258 0.0192 0.2958 0.051
73 8f6p:A 1091 81 0.2151 0.0183 0.2469 0.67
74 6uz3:A 1126 71 0.2258 0.0187 0.2958 0.052 7fbs:A
75 6uz3:A 1126 81 0.2151 0.0178 0.2469 0.68 7fbs:A
76 7xsu:A 1085 71 0.2258 0.0194 0.2958 0.053
77 7xsu:A 1085 81 0.2151 0.0184 0.2469 0.72
78 7cu3:A 1277 69 0.1720 0.0125 0.2319 0.056
79 7cu3:A 1277 62 0.1613 0.0117 0.2419 1.2
80 7cu3:A 1277 61 0.1828 0.0133 0.2787 4.2
81 7cu3:A 1277 110 0.2903 0.0211 0.2455 7.2
82 7sx3:A 1386 69 0.1720 0.0115 0.2319 0.058 7sx4:A
83 7sx3:A 1386 62 0.1613 0.0108 0.2419 1.1 7sx4:A
84 7sx3:A 1386 61 0.1828 0.0123 0.2787 4.6 7sx4:A
85 7sx3:A 1386 110 0.2903 0.0195 0.2455 7.2 7sx4:A
86 8t6l:A 1237 70 0.2258 0.0170 0.3000 0.059 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
87 8t6l:A 1237 81 0.2151 0.0162 0.2469 0.74 7k18:A, 6lqa:B, 6uz0:A
88 6j8e:A 1139 71 0.2258 0.0184 0.2958 0.066 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
89 6j8e:A 1139 84 0.2366 0.0193 0.2619 0.29 7dtd:A, 7w77:D, 7w7f:D
90 8xmn:A 1277 70 0.2043 0.0149 0.2714 0.075 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
91 8xmn:A 1277 84 0.2366 0.0172 0.2619 0.092 8i5b:A, 8i5g:A, 8i5x:A, 8i5y:A, 8j4f:A, 8s9b:A, 8s9c:A, 8thg:A, 8thh:A, 7xve:A, 7xvf:A
92 7we4:A 1122 72 0.2473 0.0205 0.3194 0.14 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
93 7we4:A 1122 49 0.1398 0.0116 0.2653 5.6 7wel:A, 7wfr:A, 7wfw:A
94 7roq:A 1831 41 0.1935 0.0098 0.4390 0.41
95 8f0p:A 1116 73 0.2043 0.0170 0.2603 0.43 8f0q:A, 8f0r:A, 8f0s:A
96 6a91:A 1323 73 0.2043 0.0144 0.2603 0.45 6a95:A, 6nt3:A, 6nt4:A
97 6c9a:B 723 61 0.1613 0.0207 0.2459 0.76 6c9a:A
98 3gyy:D 311 23 0.1290 0.0386 0.5217 1.5 3gyy:A, 3gyy:B, 3gyy:C, 2vpn:A, 2vpn:B, 2vpo:A, 2vpo:B
99 8ee6:A 1808 38 0.1505 0.0077 0.3684 1.7 8edw:A
100 8eop:A 1687 38 0.1505 0.0083 0.3684 1.7
101 8ouo:A 648 103 0.2366 0.0340 0.2136 1.8
102 8ouo:B 625 103 0.2366 0.0352 0.2136 1.9 6nq0:A, 6nq0:B, 6nq2:A, 6nq2:B
103 7tj9:A 1111 70 0.1935 0.0162 0.2571 2.5
104 1cf3:A 581 31 0.1398 0.0224 0.4194 4.4 1gal:A, 8jpz:A, 8jpz:B, 5nit:A, 5niw:A, 3qvp:A, 3qvr:A
105 7tbw:A 1928 38 0.1720 0.0083 0.4211 5.8
106 7tby:A 1788 38 0.1720 0.0089 0.4211 6.3 7tc0:A
107 4xzw:A 305 37 0.1290 0.0393 0.3243 6.3

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417