Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GTNECLDNNGGCSHVCNDLKIGYECLCPDGFQLVAQRRCEDIDECQDPDTCSQLCVNLEGGYKCQCEEGFQLDPHTKACK

The query sequence (length=80) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1n7d:A 639 80 1.0000 0.1252 1.0000 8.91e-51 1ajj:A, 3bps:E, 1d2j:A, 1f8z:A, 2fcw:B, 3gcw:E, 3gcx:E, 1hj7:A, 1hz8:A, 1i0u:A, 2kri:B, 2lgp:A, 3m0c:C, 3p5b:L, 3p5c:L, 1xfe:A
2 1n7d:A 639 37 0.1625 0.0203 0.3514 6.1 1ajj:A, 3bps:E, 1d2j:A, 1f8z:A, 2fcw:B, 3gcw:E, 3gcx:E, 1hj7:A, 1hz8:A, 1i0u:A, 2kri:B, 2lgp:A, 3m0c:C, 3p5b:L, 3p5c:L, 1xfe:A
3 5b4x:B 479 79 0.6500 0.1086 0.6582 4.35e-32 3a7q:B, 5b4x:D, 5b4y:B
4 2w2m:E 49 41 0.5125 0.8367 1.0000 1.39e-24 2w2n:E, 2w2o:E, 2w2p:E, 2w2q:E
5 8em4:A 3818 79 0.4125 0.0086 0.4177 2.82e-15 8em4:B
6 8em4:A 3818 83 0.4250 0.0089 0.4096 1.86e-12 8em4:B
7 8em4:A 3818 64 0.3000 0.0063 0.3750 2.28e-06 8em4:B
8 8em4:A 3818 73 0.3000 0.0063 0.3288 1.30e-04 8em4:B
9 8em4:A 3818 38 0.2375 0.0050 0.5000 0.001 8em4:B
10 8em4:A 3818 80 0.2750 0.0058 0.2750 0.002 8em4:B
11 8em4:A 3818 41 0.2125 0.0045 0.4146 0.031 8em4:B
12 8em4:A 3818 27 0.1750 0.0037 0.5185 0.24 8em4:B
13 8em4:A 3818 69 0.2625 0.0055 0.3043 0.35 8em4:B
14 8em4:A 3818 35 0.1875 0.0039 0.4286 0.91 8em4:B
15 8em4:A 3818 17 0.1375 0.0029 0.6471 3.4 8em4:B
16 8em7:A 4378 79 0.4125 0.0075 0.4177 3.03e-15 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
17 8em7:A 4378 83 0.4250 0.0078 0.4096 1.97e-12 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
18 8em7:A 4378 64 0.3000 0.0055 0.3750 2.01e-06 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
19 8em7:A 4378 52 0.2500 0.0046 0.3846 3.92e-05 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
20 8em7:A 4378 38 0.2375 0.0043 0.5000 0.001 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
21 8em7:A 4378 80 0.2750 0.0050 0.2750 0.003 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
22 8em7:A 4378 41 0.2125 0.0039 0.4146 0.031 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
23 8em7:A 4378 27 0.1750 0.0032 0.5185 0.24 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
24 8em7:A 4378 69 0.2625 0.0048 0.3043 0.31 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
25 8em7:A 4378 35 0.1875 0.0034 0.4286 0.94 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
26 8em7:A 4378 38 0.1875 0.0034 0.3947 2.0 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
27 8em7:A 4378 17 0.1375 0.0025 0.6471 4.1 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
28 1z6c:A 87 71 0.3750 0.3448 0.4225 5.08e-12
29 1lmj:A 86 61 0.3375 0.3140 0.4426 7.76e-09
30 2w86:A 147 56 0.3000 0.1633 0.4286 7.90e-08
31 2w86:A 147 39 0.1750 0.0952 0.3590 0.12
32 3v64:C 338 39 0.2250 0.0533 0.4615 1.40e-07 3v64:D
33 3v64:C 338 30 0.1625 0.0385 0.4333 0.005 3v64:D
34 3v64:C 338 44 0.1750 0.0414 0.3182 4.0 3v64:D
35 6l6r:A 610 48 0.2500 0.0328 0.4167 2.46e-07 6l6r:B, 7nam:A, 3sob:B, 3soq:A, 3sov:A
36 6l6r:A 610 44 0.2375 0.0311 0.4318 5.43e-06 6l6r:B, 7nam:A, 3sob:B, 3soq:A, 3sov:A
37 6l6r:A 610 29 0.1500 0.0197 0.4138 0.073 6l6r:B, 7nam:A, 3sob:B, 3soq:A, 3sov:A
38 6l6r:A 610 48 0.2000 0.0262 0.3333 0.78 6l6r:B, 7nam:A, 3sob:B, 3soq:A, 3sov:A
39 8jxc:A 1337 64 0.3125 0.0187 0.3906 2.85e-07 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
40 8jxc:A 1337 39 0.2125 0.0127 0.4359 0.050 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
41 8jxc:A 1337 29 0.1750 0.0105 0.4828 1.5 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
42 7pfp:A 563 62 0.3000 0.0426 0.3871 5.11e-07 7pfp:C, 7q3n:U
43 7pfp:A 563 54 0.2625 0.0373 0.3889 0.001 7pfp:C, 7q3n:U
44 1emn:A 82 53 0.2875 0.2805 0.4340 1.11e-06 1emo:A
45 1emn:A 82 33 0.1875 0.1829 0.4545 5.91e-04 1emo:A
46 1emn:A 82 39 0.1625 0.1585 0.3333 5.1 1emo:A
47 8jxj:A 570 52 0.2500 0.0351 0.3846 5.06e-05 8jxj:B
48 8jxj:A 570 38 0.1875 0.0263 0.3947 1.6 8jxj:B
49 8jxj:A 570 69 0.2500 0.0351 0.2899 1.6 8jxj:B
50 8dvm:A 612 51 0.2500 0.0327 0.3922 5.55e-05 4a0p:A, 8dvl:A, 8dvn:A
51 8dvm:A 612 25 0.1500 0.0196 0.4800 0.40 4a0p:A, 8dvl:A, 8dvn:A
52 8dvm:A 612 39 0.1500 0.0196 0.3077 1.0 4a0p:A, 8dvl:A, 8dvn:A
53 1uzj:A 162 40 0.2375 0.1173 0.4750 2.12e-04 1uzj:B, 1uzj:C, 1uzk:A
54 1uzj:A 162 62 0.3000 0.1481 0.3871 0.001 1uzj:B, 1uzj:C, 1uzk:A
55 6pog:B 236 61 0.2875 0.0975 0.3770 2.14e-04
56 6pog:B 236 61 0.2625 0.0890 0.3443 0.002
57 6pog:B 236 64 0.2875 0.0975 0.3594 0.030
58 6pog:B 236 60 0.2125 0.0720 0.2833 0.14
59 5to3:B 367 43 0.2375 0.0518 0.4419 3.55e-04 1dx5:I, 1dx5:J, 1dx5:K, 1dx5:L, 3gis:X, 3gis:Y, 3gis:Z
60 2bo2:A 140 68 0.2375 0.1357 0.2794 0.002 2bo2:B, 2bou:A, 7do4:A
61 2bo2:A 140 57 0.2000 0.1143 0.2807 0.61 2bo2:B, 2bou:A, 7do4:A
62 6f1c:A 291 57 0.2500 0.0687 0.3509 0.004 6f1c:C, 6f1d:A, 6f1h:A, 6f1h:C, 6f39:A, 6f39:B
63 1szb:A 167 55 0.2625 0.1257 0.3818 0.009 1szb:B
64 6pol:B 129 60 0.2625 0.1628 0.3500 0.017 6pol:D, 6pol:F
65 6pol:B 129 59 0.2375 0.1473 0.3220 0.73 6pol:D, 6pol:F
66 8eph:A 91 81 0.3625 0.3187 0.3580 0.020 1edm:B, 1edm:C, 8eph:C
67 9etn:A 551 43 0.2000 0.0290 0.3721 0.037
68 5ckn:A 278 54 0.2500 0.0719 0.3704 0.039 5cis:A, 5ckm:A, 5ckn:D, 1nt0:A, 1nt0:G
69 4aqb:A 345 50 0.2000 0.0464 0.3200 0.040 5ckq:A, 3dem:A, 3dem:B
70 4d90:A 127 55 0.2375 0.1496 0.3455 0.043 4d90:B
71 5ms9:A 177 44 0.2000 0.0904 0.3636 0.092
72 7alj:A 115 31 0.1750 0.1217 0.4516 0.15
73 7alj:A 115 50 0.2500 0.1739 0.4000 2.5
74 5mwb:A 118 70 0.3000 0.2034 0.3429 0.15
75 3h5c:B 312 68 0.2375 0.0609 0.2794 0.22
76 6f1c:D 276 82 0.3000 0.0870 0.2927 0.25 6f1c:B, 6f1h:D, 6f1h:B, 4lmf:A, 4lmf:B, 4lmf:C, 4lmf:D, 4lor:A, 1nzi:A, 1nzi:B
77 6f1c:D 276 49 0.2250 0.0652 0.3673 0.30 6f1c:B, 6f1h:D, 6f1h:B, 4lmf:A, 4lmf:B, 4lmf:C, 4lmf:D, 4lor:A, 1nzi:A, 1nzi:B
78 4xbm:B 401 68 0.2875 0.0574 0.3382 0.32
79 5uk5:A 194 49 0.2125 0.0876 0.3469 0.58 2rqz:A, 2rr2:A
80 7weg:B 96 34 0.1625 0.1354 0.3824 0.65 7weg:A
81 5l0t:B 40 32 0.1875 0.3750 0.4688 0.76 5ky7:B, 5l0u:B, 5l0v:B
82 6ska:D 347 48 0.1875 0.0432 0.3125 2.1 2jxa:A
83 2rhp:A 622 45 0.2375 0.0305 0.4222 2.7 1yo8:A
84 6pif:H 198 62 0.2250 0.0909 0.2903 3.1 8fuk:H, 6lnb:A, 6lnc:A, 6pig:H, 6pij:H, 6uvn:A
85 6r2w:L 143 32 0.1500 0.0839 0.3750 3.2 2a2q:L, 2aei:L, 2aer:L, 2b8o:L, 2c4f:L, 8cn9:D, 8cn9:I, 8cn9:S, 1dan:L, 1dva:L, 1dva:M, 2ec9:L, 3ela:L, 1fak:L, 1ff7:A, 1ffm:A, 2fir:L, 4ibl:L, 1j9c:L, 5l0s:B, 5par:A, 2puq:L, 1qfk:L, 3th2:L, 3th3:L, 3th4:L, 1w0y:L, 1w2k:L, 1wqv:L, 1wss:L, 1wtg:L, 1wun:L, 1wv7:L, 4ylq:L, 1z6j:L, 4z6a:L, 4zma:L, 2zp0:L, 2zwl:L, 2zzu:L
86 6rwl:B 252 29 0.1375 0.0437 0.3793 3.9 6rwl:C, 6rwl:J, 6rwl:K, 6rwm:B, 6rwm:C, 6rwm:J, 6rwm:K, 6rwn:K, 6rwn:J, 6rwn:C, 6rwn:B, 6rwo:K, 6rwo:J, 6rwo:C, 6rwo:B
87 6kz1:A 97 25 0.1250 0.1031 0.4000 4.6 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
88 1xkb:A 91 69 0.2500 0.2198 0.2899 5.3 3k9x:A
89 6k2k:A 57 25 0.1375 0.1930 0.4400 7.3 6m2c:E, 6m2c:F, 6m2c:G, 6m2c:H, 6m2d:A, 6m2d:B, 6m2d:C, 6m2d:D, 6m2d:E, 6m2d:F
90 4xlw:C 118 72 0.2875 0.1949 0.3194 7.6 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
91 4d0f:A 125 34 0.1500 0.0960 0.3529 8.5 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
92 7ckl:A 1415 15 0.1000 0.0057 0.5333 8.8
93 7ela:A 1402 15 0.1000 0.0057 0.5333 8.9
94 7she:A 541 33 0.1625 0.0240 0.3939 9.3 7she:B, 7shf:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218