BioLiP

>protein
GSSGSSGRAMKCPYCDFYFMKNGSDLQRHIWAHEGVK

The query sequence (length=37) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2elp:A	37	37	1.0000	1.0000	1.0000	1.81e-23	2rv1:A
2	2elq:A	36	37	0.4324	0.4444	0.4324	0.002	2rv2:A
3	2rsi:A	92	37	0.4595	0.1848	0.4595	0.006	2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
4	2rsj:A	92	37	0.4595	0.1848	0.4595	0.007	2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
5	2eln:A	38	38	0.4595	0.4474	0.4474	0.012	2ruz:A
6	2rsh:A	37	38	0.4595	0.4595	0.4474	0.014	2ruv:A
7	8gn3:B	60	28	0.3243	0.2000	0.4286	0.015	8gn3:A, 8gn4:A
8	2elv:A	36	33	0.4324	0.4444	0.4848	0.033	2rux:A
9	6j6h:v	722	33	0.3243	0.0166	0.3636	0.11	6j6n:v, 6j6q:v
10	2ena:A	46	40	0.5135	0.4130	0.4750	0.24
11	2epr:A	48	39	0.4324	0.3333	0.4103	0.27
12	1mey:F	84	30	0.3514	0.1548	0.4333	0.34	1mey:C
13	1fzi:A	512	19	0.2432	0.0176	0.4737	0.42	1fyz:A, 1fyz:B, 1fz0:A, 1fz0:B, 1fz1:A, 1fz1:B, 1fz2:A, 1fz2:B, 1fz3:A, 1fz3:B, 1fz4:A, 1fz4:B, 1fz5:A, 1fz5:B, 1fz6:A, 1fz6:B, 1fz7:A, 1fz7:B, 1fz8:A, 1fz8:B, 1fz9:A, 1fz9:B, 1fzh:A, 1fzh:B, 1fzi:B, 4gam:A, 4gam:F, 4gam:K, 4gam:P, 1mmo:D, 1mmo:E, 1mty:D, 1mty:E, 7tc7:D, 7tc7:E, 7tc8:D, 7tc8:E, 1xmf:A, 1xmf:B, 1xmh:A, 1xmh:B, 1xu3:A, 1xu3:B, 1xu5:A, 1xu5:B, 1xvb:A, 1xvb:B, 1xvc:A, 1xvc:B, 1xvd:A, 1xvd:B, 1xve:A, 1xve:B, 1xvf:A, 1xvf:B, 1xvg:A, 1xvg:B
14	2elr:A	36	33	0.3784	0.3889	0.4242	0.81	2rv3:A
15	8ffz:A	314	30	0.3243	0.0382	0.4000	1.1
16	6ed2:A	591	27	0.2703	0.0169	0.3704	1.4
17	6g90:T	462	30	0.2703	0.0216	0.3333	1.8	7dco:u, 4dgw:A, 5nrl:T, 5zwm:u
18	2kmk:A	82	33	0.3243	0.1463	0.3636	2.2
19	2cs8:A	108	30	0.4054	0.1389	0.5000	2.6
20	7yls:B	436	26	0.2703	0.0229	0.3846	2.7	8h2t:B, 8h2t:D, 8h2t:G
21	6f5p:A	708	14	0.2162	0.0113	0.5714	2.8	5d98:A, 5d98:D, 6f5p:D, 6xzd:AP1, 6xzg:AP1, 6xzp:AP1, 6xzq:A, 6xzr:AP1, 6y0c:A
22	4h8v:A	557	21	0.2973	0.0197	0.5238	3.0	4gi6:A, 4gi6:B, 4gi8:A, 4gi8:B, 4gi9:A, 4gi9:B, 4gia:A, 4gia:B, 4gin:A, 4go8:A, 4go8:B, 4go9:A, 4go9:B, 4h2c:A, 4h7v:A, 4h7v:B, 4h8h:A, 4h8h:B, 4h8u:A, 4h8u:B, 4h8v:B, 4ha1:A, 4ha1:B, 2pwd:A, 2pwd:B, 2pwe:A, 2pwe:B, 2pwf:A, 2pwf:B, 2pwf:C, 2pwf:D, 2pwg:A, 2pwg:B, 2pwh:A, 2pwh:B, 1zja:A, 1zja:B, 1zjb:A, 1zjb:B
23	2emb:A	44	37	0.3784	0.3182	0.3784	3.3
24	2pyb:A	151	13	0.1622	0.0397	0.4615	3.5	2pyb:B, 2pyb:C, 2pyb:D
25	7w1m:H	322	36	0.2703	0.0311	0.2778	3.5	5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
26	3i26:D	369	31	0.3514	0.0352	0.4194	3.7	3i27:D
27	7wsf:A	693	16	0.2162	0.0115	0.5000	3.9	8hfx:E, 8hfy:A, 8hfz:E, 8hg0:A, 8ify:F, 8wlo:E, 8wlr:A, 7wse:A
28	8yhd:G	234	24	0.2703	0.0427	0.4167	5.5	8yhe:G, 8z4j:G, 8z4l:G, 8z99:G, 8z9c:G
29	3wqy:A	905	20	0.2162	0.0088	0.4000	5.6	3wqy:B, 3wqz:A, 3wqz:B, 2ztg:A
30	4how:A	559	13	0.1892	0.0125	0.5385	5.7	4hox:A, 4hoz:A, 4hp5:A, 4hph:A
31	2elm:A	37	30	0.3243	0.3243	0.4000	6.7	2ruy:A
32	4z4k:A	282	25	0.2432	0.0319	0.3600	7.6	5aas:A, 4bmj:A, 4bmj:B, 4bmj:D, 4bmj:E, 4bmj:F, 4bmj:G, 4bmj:I, 4bmj:K, 3vht:B, 5yt6:D, 4z4k:B, 4z4m:A, 4z4m:B
33	4pf8:A	300	12	0.1892	0.0233	0.5833	7.7	4pf8:B
34	8eaz:A	254	28	0.2973	0.0433	0.3929	8.4	8bvl:A, 8bvl:B, 8eaz:B, 7yuj:A, 7yuj:B

[Back]