Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GSPVDSNDLGPLPPGWEERTHTDGRVFFINHNIKKTQWEDPRMQNVAITG

The query sequence (length=50) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1i5h:W 50 50 1.0000 1.0000 1.0000 3.55e-33
2 5dws:C 40 36 0.5200 0.6500 0.7222 5.77e-16
3 5cq2:A 76 35 0.5000 0.3289 0.7143 6.37e-15 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
4 5cq2:A 76 38 0.3400 0.2237 0.4474 8.71e-06 5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
5 2kxq:A 90 42 0.4400 0.2444 0.5238 8.46e-12 2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
6 2kxq:A 90 43 0.3400 0.1889 0.3953 3.11e-04 2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
7 2lb1:A 35 35 0.4000 0.5714 0.5714 8.91e-12 2ltx:A
8 2djy:A 42 35 0.4000 0.4762 0.5714 7.71e-11
9 2laj:A 40 33 0.4000 0.5000 0.6061 6.82e-10
10 4lcd:A 419 37 0.4000 0.0477 0.5405 7.46e-10 4lcd:B
11 2m3o:W 43 39 0.4400 0.5116 0.5641 9.20e-10 2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
12 2jmf:A 43 33 0.3800 0.4419 0.5758 2.19e-09
13 2ltv:A 36 34 0.3600 0.5000 0.5294 3.80e-09 2law:A
14 2n8t:A 39 34 0.3400 0.4359 0.5000 6.50e-09
15 7lp3:A 37 35 0.3400 0.4595 0.4857 6.63e-09 7lp3:C
16 2ez5:W 46 40 0.3600 0.3913 0.4500 8.33e-08
17 6jjz:B 96 43 0.3800 0.1979 0.4419 2.42e-07 6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
18 6jjz:B 96 44 0.2200 0.1146 0.2500 1.7 6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
19 6jjy:A 128 32 0.3400 0.1328 0.5312 5.46e-07 6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
20 6jjy:A 128 33 0.3600 0.1406 0.5455 7.46e-05 6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
21 7lp2:E 37 30 0.3000 0.4054 0.5000 1.37e-06 2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
22 8sg2:A 163 31 0.3200 0.0982 0.5161 3.65e-06 6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
23 2nc3:A 33 30 0.2800 0.4242 0.4667 5.79e-06 2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
24 1jmq:A 46 32 0.3000 0.3261 0.4688 1.90e-05 1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
25 8pxx:A 99 26 0.2000 0.1010 0.3846 0.054 2dyf:A
26 8pxx:A 99 42 0.2000 0.1010 0.2381 1.2 2dyf:A
27 6euo:C 354 14 0.1800 0.0254 0.6429 0.11 6euo:A, 6euo:B, 6euo:D, 6eur:A, 6eur:C, 6eur:D, 6exf:A, 6exf:C, 6exf:D, 6exh:A, 6exh:B, 6exh:C, 6exh:D, 6f9p:A, 6f9p:C, 6f9p:D
28 6eur:B 328 14 0.1800 0.0274 0.6429 0.12 6exf:B
29 1eg4:A 260 28 0.1800 0.0346 0.3214 0.19
30 7y5f:B 341 30 0.2600 0.0381 0.4333 0.31 7vgn:A, 7y5f:A, 7y5i:A, 7y5i:B, 7y5p:A, 7y5p:B, 7yhe:A, 7yhe:B, 7yw9:A
31 2jup:W 37 27 0.1600 0.2162 0.2963 0.42 2rly:W, 2rm0:W
32 3b69:A 626 28 0.2400 0.0192 0.4286 0.59 2ah2:A, 1ms0:A, 1ms0:B, 1ms1:A, 1ms1:B, 1ms8:A, 1ms8:B, 1ms9:A, 1ms9:B, 3pjq:A, 1s0i:A, 1s0j:A
33 6daw:A 342 18 0.2000 0.0292 0.5556 2.8 6daw:B
34 5go9:A 3423 20 0.1600 0.0023 0.4000 7.3 5go9:B, 5go9:C, 5go9:D, 5goa:A, 5goa:B, 5goa:C, 5goa:D
35 6jgz:B 3485 20 0.1600 0.0023 0.4000 7.3 6jg3:A, 6jg3:B, 6jg3:C, 6jg3:D, 6jgz:D, 6jgz:F, 6jgz:H, 6jh6:B, 6jh6:D, 6jh6:F, 6jh6:H, 6jhn:A, 6jhn:C, 6jhn:E, 6jhn:G, 6ji0:A, 6ji0:C, 6ji0:E, 6ji0:G, 6jrr:A, 6jrr:C, 6jrr:E, 6jrr:G
36 6jrs:A 3488 20 0.1600 0.0023 0.4000 7.3 6jrs:D, 6jrs:G, 6jrs:J
37 6jiy:A 3521 20 0.1600 0.0023 0.4000 7.3 6ji8:A, 6ji8:D, 6ji8:G, 6ji8:J, 6jii:B, 6jii:E, 6jii:H, 6jii:K, 6jiu:A, 6jiu:D, 6jiu:G, 6jiu:J, 6jiy:D, 6jiy:G, 6jiy:J, 6jv2:A, 6jv2:C, 6jv2:E, 6jv2:G
38 8dvv:A 3886 20 0.1600 0.0021 0.4000 7.3 8dvv:B, 8dvv:C, 8dvv:D
39 6wou:A 3921 20 0.1600 0.0020 0.4000 7.3 6wou:B, 6wou:C, 6wou:D, 6wov:A, 6wov:B, 6wov:C, 6wov:D
40 8uxh:A 4004 20 0.1600 0.0020 0.4000 7.3 8uxh:B, 8uxh:C, 8uxh:D, 8uxi:A, 8uxi:B, 8uxi:C, 8uxi:D
41 8dty:A 4004 20 0.1600 0.0020 0.4000 7.3 8dty:B, 8dty:C, 8dty:D
42 7vml:A 4044 20 0.1600 0.0020 0.4000 7.3 7aih:UA, 7am2:UA, 7ane:UA, 5dat:l1, 5gak:r, 6hd7:r, 6j3z:19, 6j40:19, 6j40:39, 5mc6:AZ, 6n8k:s, 6n8l:s, 6n8m:S, 6n8n:S, 6n8o:S, 7nrc:Lt, 6o1o:F, 6o1o:G, 6o1o:H, 6qik:p, 6qtz:p, 6ri5:p, 7rr5:L1, 6rzz:p, 6s05:p, 5t62:S, 5t6r:S, 6tnu:BT, 7vml:B, 7vml:C, 7vml:D, 7vmm:A, 7vmm:B, 7vmm:C, 7vmm:D, 7vmn:A, 7vmn:B, 7vmn:C, 7vmn:D, 7vmo:A, 7vmo:B, 7vmo:C, 7vmo:D, 7vmp:A, 7vmp:B, 7vmp:C, 7vmp:D, 7vmq:A, 7vmq:B, 7vmq:C, 7vmq:D, 7vmr:A, 7vmr:B, 7vmr:C, 7vmr:D, 7vms:A, 7vms:B, 7vms:C, 7vms:D
43 8dtz:A 4061 20 0.1600 0.0020 0.4000 7.3 8dtz:B, 8dtz:C, 8dtz:D
44 8uxl:A 4232 20 0.1600 0.0019 0.4000 7.3 7u9q:A, 7u9q:D, 7u9q:B, 7u9q:C, 7u9r:A, 7u9r:D, 7u9r:B, 7u9r:C, 7u9t:A, 7u9t:D, 7u9t:B, 7u9t:C, 7u9x:A, 7u9x:B, 7u9x:C, 7u9x:D, 7u9z:A, 7u9z:B, 7u9z:C, 7u9z:D, 7ua1:A, 7ua1:B, 7ua1:C, 7ua1:D, 7ua5:A, 7ua5:B, 7ua5:C, 7ua5:D, 7ua9:A, 7ua9:B, 7ua9:C, 7ua9:D, 8uq2:A, 8uq2:B, 8uq2:C, 8uq2:D, 8uq3:A, 8uq3:B, 8uq3:C, 8uq3:D, 8uq4:A, 8uq4:B, 8uq4:C, 8uq4:D, 8uq5:A, 8uq5:B, 8uq5:C, 8uq5:D, 8uxc:A, 8uxc:B, 8uxc:C, 8uxc:D, 8uxe:A, 8uxe:B, 8uxe:C, 8uxe:D, 8uxf:A, 8uxf:B, 8uxf:C, 8uxf:D, 8uxg:A, 8uxg:B, 8uxg:C, 8uxg:D, 8uxl:B, 8uxl:C, 8uxl:D, 8uxm:A, 8uxm:B, 8uxm:C, 8uxm:D
45 7ua3:A 4443 20 0.1600 0.0018 0.4000 7.3 7ua3:B, 7ua3:C, 7ua3:D, 7ua4:A, 7ua4:B, 7ua4:C, 7ua4:D
46 5u8t:6 661 13 0.1800 0.0136 0.6923 8.3 6wgi:6
47 5v8f:6 692 13 0.1800 0.0130 0.6923 8.3 8b9a:6, 8b9b:6, 8b9c:6, 6eyc:6, 3ja8:6, 8kg6:6, 8kg8:6, 8kg9:6, 7p30:6, 7p30:E, 7p5z:6, 7p5z:E, 8p5e:6, 8p62:6, 8p63:6, 7pmk:6, 7pmn:6, 6ptn:m, 6ptn:6, 6pto:l, 6pto:6, 7pt6:6, 7pt6:F, 7pt7:6, 7pt7:F, 6rqc:6, 6skl:6, 6sko:6, 6u0m:6, 5u8s:6, 8w7m:6, 8xgc:6
48 1cev:A 299 20 0.2000 0.0334 0.5000 8.5 1cev:B, 1cev:C, 1cev:D, 1cev:E, 1cev:F, 2cev:A, 2cev:C, 2cev:B, 2cev:D, 2cev:E, 2cev:F, 3cev:A, 3cev:B, 3cev:C, 3cev:D, 3cev:E, 3cev:F, 4cev:A, 4cev:B, 4cev:C, 4cev:D, 4cev:E, 4cev:F, 5cev:A, 5cev:B, 5cev:C, 5cev:D, 5cev:F, 5cev:E

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218