BioLiP

>protein
GSHMNPISRLAQIQQAKKEKEPEYTLLTERGLPRRREFVMQVKVGNHTAEGTGTNKKVAKRNAAENMLEILGFK

The query sequence (length=74) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6sdw:A	177	74	0.9595	0.4011	0.9595	2.05e-46	6htu:A, 6htu:B, 6htu:C, 6sdy:A
2	6sdw:A	177	73	0.3919	0.1638	0.3973	1.87e-06	6htu:A, 6htu:B, 6htu:C, 6sdy:A
3	1di2:A	69	63	0.3514	0.3768	0.4127	1.75e-11
4	7zpk:C	233	67	0.3784	0.1202	0.4179	2.12e-10	3adl:A, 5n8l:A, 5n8m:A
5	7zpk:C	233	67	0.3514	0.1116	0.3881	1.7	3adl:A, 5n8l:A, 5n8m:A
6	8dfv:K	253	65	0.3243	0.0949	0.3692	7.57e-08	8dg5:K
7	1ekz:A	76	68	0.3243	0.3158	0.3529	4.41e-06
8	1yyk:A	221	62	0.2568	0.0860	0.3065	1.07e-05	2ez6:A, 2ez6:B, 1jfz:A, 1jfz:B, 1jfz:C, 1jfz:D, 4m2z:A, 4m2z:B, 4m30:A, 4m30:B, 2nue:A, 2nuf:A, 2nuf:B, 2nug:A, 2nug:B, 1rc5:A, 1rc5:B, 1rc5:C, 1rc5:D, 1rc7:A, 1yyo:A, 1yyw:A, 1yyw:C, 1yz9:A
9	1di2:B	60	63	0.2838	0.3500	0.3333	2.46e-05
10	2l3j:A	236	67	0.3378	0.1059	0.3731	4.28e-05	2l3c:A
11	2l3j:A	236	63	0.3243	0.1017	0.3810	0.001	2l3c:A
12	8e0f:B	454	56	0.2838	0.0463	0.3750	0.001	6d06:A, 6d06:D, 8e0f:A, 8e4x:A, 8e4x:B, 5ed1:A, 5ed1:D, 5ed2:A, 5ed2:D, 5hp2:A, 5hp2:D, 5hp3:A, 5hp3:D, 7kfn:A, 7kfn:D, 2l2k:B, 6vff:A, 6vff:B, 1zy7:A, 1zy7:B
13	5dv7:C	137	70	0.2838	0.1533	0.3000	0.004
14	5dv7:C	137	51	0.2162	0.1168	0.3137	0.18
15	3vyy:A	86	70	0.2838	0.2442	0.3000	0.007	3vyy:B
16	5ztm:A	168	58	0.2703	0.1190	0.3448	0.012	5ztm:B
17	7zlq:B	82	68	0.2703	0.2439	0.2941	0.055	7zlq:A
18	9asp:B	250	41	0.2027	0.0600	0.3659	0.087	9asm:B, 9asn:B, 9asq:B
19	9asp:B	250	21	0.1622	0.0480	0.5714	3.9	9asm:B, 9asn:B, 9asq:B
20	6v5b:C	217	38	0.1892	0.0645	0.3684	0.10	6v5b:B, 6v5c:C, 6v5c:B
21	6v5b:C	217	21	0.1622	0.0553	0.5714	3.8	6v5b:B, 6v5c:C, 6v5c:B
22	6j7k:A	385	43	0.2162	0.0416	0.3721	0.62	6j7l:A, 6j7m:A, 6j7m:C
23	5t16:A	276	32	0.1892	0.0507	0.4375	2.4	2lbs:B, 2lup:B, 4oog:C, 5t16:B, 5t16:I, 5t16:J, 1t4l:B
24	9asp:C	92	21	0.1622	0.1304	0.5714	2.7
25	3chx:A	362	16	0.1351	0.0276	0.6250	4.0	3chx:E, 3chx:I
26	7nkl:A	61	37	0.1757	0.2131	0.3514	4.7
27	6dbb:A	504	26	0.1757	0.0258	0.5000	5.8	6dbb:B, 6dbb:C
28	7v6c:B	260	50	0.2027	0.0577	0.3000	6.1
29	2p17:A	249	70	0.2162	0.0643	0.2286	8.5
30	4oes:A	498	33	0.1892	0.0281	0.4242	9.1
31	6vr7:A	485	38	0.1757	0.0268	0.3421	9.8
32	4y2h:B	352	25	0.1486	0.0312	0.4400	9.9	4c03:A, 4c03:B, 4c04:A, 4c05:A, 4c07:A, 4c08:A, 5e8r:A, 5e8r:B, 5egs:A, 5egs:B, 5egs:C, 5egs:D, 5fqn:A, 5fqo:A, 4hc4:A, 5hzm:A, 5lv4:A, 5lv5:A, 7nr4:A, 7nr4:B, 7nr4:C, 7nr4:D, 7nud:A, 7nud:B, 7nue:A, 7nue:B, 7p2r:A, 7p2r:B, 6p7i:A, 6p7i:B, 6p7i:C, 6p7i:D, 4qpp:B, 4qpp:C, 4qpp:A, 4qqk:A, 6sq3:A, 6sq3:B, 6sq4:A, 6sq4:B, 6sqi:A, 6sqk:B, 6sqk:A, 6w6d:A, 6wad:A, 5wcf:A, 4y2h:A, 4y30:A, 4y30:B

[Back]