BioLiP

>protein
GSHMIEVVCNDRLGKKVRVKCNTDDTIGDLKKLIAAQTGTRWNKIVLKKWYTIFKDHVSLGDYEIHDGMNLELYYQ

The query sequence (length=76) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4pyu:A	76	76	1.0000	1.0000	1.0000	1.47e-52	4pyu:B, 4pyu:G, 4pyu:K, 4pyu:O, 4pyu:S, 8q7n:s
2	3plv:A	80	75	0.6579	0.6250	0.6667	3.50e-33	3plu:A, 3plu:B
3	5w4l:G	357	45	0.2237	0.0476	0.3778	0.009	6bf4:G, 8dcq:A, 4dko:A, 4dko:C, 4dkp:A, 4dkp:C, 4dkq:A, 4dkr:A, 4dkr:C, 4dku:A, 4dku:B, 4dkv:A, 4dkv:B, 4dvs:A, 4dvs:B, 4dvt:A, 4dvt:B, 4dvv:A, 4dvv:B, 4dvw:A, 4dvw:B, 4dvx:A, 4dvx:B, 8f9z:A, 8fa0:A, 8gcz:A, 8gd0:A, 8gd1:A, 8gd3:A, 8gd5:A, 8gdj:A, 8gdk:A, 8gjt:A, 4i54:A, 4i54:B, 5kjr:G, 4lsq:G, 6mfp:G, 6mfp:A, 6mg7:G, 7n8q:G, 3ngb:G, 3ngb:A, 3ngb:D, 3ngb:I, 6one:A, 6onf:A, 6onh:A, 6onv:A, 6ooo:A, 6p9n:A, 4rfn:G, 4rfn:A, 4rfo:G, 4rz8:A, 4rz8:B, 4rz8:C, 4rz8:D, 3se9:G, 5u6e:A, 5u6e:B, 5uem:G, 6usw:A, 6ut1:A, 5w4l:A, 6w4m:G
4	7mxd:A	472	35	0.1842	0.0297	0.4000	0.37	7mxd:F, 7mxd:G, 7n28:A
5	6vpv:B	737	27	0.1711	0.0176	0.4815	0.57	8am5:b, 8asl:b, 8asp:b, 6hqb:B, 4kt0:B, 4l6v:B, 4l6v:b, 4l6v:2, 6nwa:B, 6nwa:b, 6nwa:G, 7o1v:B, 5oy0:B, 5oy0:b, 5oy0:2, 7umh:B, 7umh:G, 7umh:b, 6uzv:B, 6uzv:b, 6uzv:2, 6vpv:b, 6vpv:2
6	7qco:B	734	27	0.1711	0.0177	0.4815	0.64	7qco:G, 7qco:g, 7qco:b
7	7f4v:aB	725	27	0.1711	0.0179	0.4815	0.73	7f4v:bB, 7f4v:cB
8	6lu1:B	713	27	0.1711	0.0182	0.4815	0.75
9	7fix:B1	740	27	0.1711	0.0176	0.4815	0.80	7bw2:B, 4fe1:B, 7fix:B2, 7fix:B3, 1jb0:B, 6k33:aB, 6k33:bB, 6k33:cB, 7m75:B, 7m76:B, 7m78:B, 3pcq:B, 6pfy:H, 6pfy:B, 6pfy:Z, 6pgk:H, 6pgk:B, 6pgk:Z, 6tra:B, 6trc:B, 6trc:b, 6trc:2, 6trd:B, 6trd:b, 6trd:2, 5zf0:B1, 5zf0:B2, 5zf0:B3, 5zf0:B4, 5zf0:B6, 5zf0:B5
10	8d53:G	446	51	0.2368	0.0404	0.3529	0.81
11	7dwq:B	659	27	0.1711	0.0197	0.4815	0.97	7coy:aB, 7coy:bB, 7coy:cB
12	7blz:B	731	27	0.1711	0.0178	0.4815	1.0	6fos:B, 8wey:B, 5zgb:B, 5zgh:B
13	6kif:B	733	27	0.1711	0.0177	0.4815	1.0	6kif:H, 6kif:f, 6kig:B, 6kig:H, 6kig:f
14	6kmw:aB	740	27	0.1711	0.0176	0.4815	1.1	6kmw:cB, 6kmw:bB
15	7yca:B	732	27	0.1579	0.0164	0.4444	1.4
16	7y5e:BN	732	27	0.1579	0.0164	0.4444	2.1	7y5e:B2, 7y7a:B7, 7y7a:Bo, 7y7b:B, 7y8a:B
17	6ly5:b	732	27	0.1711	0.0178	0.4815	2.8	6l4u:B
18	6pwu:A	615	51	0.2105	0.0260	0.3137	2.8	6j5e:I, 6ulc:C, 6ulc:A, 3vtp:C, 5yb2:E, 5yb2:F, 5yb2:D, 5yb2:A, 5yb2:B, 5yb2:C, 5yb2:M, 5yb3:E, 5yb3:F, 5yb3:D, 5yc0:A, 5yc0:D, 5yc0:E, 5z0w:E, 5zcx:A, 5zpw:A, 5zpw:E, 5zpw:C
19	7d0j:B	734	27	0.1579	0.0163	0.4444	3.0	7a4p:B, 7bgi:B, 7blx:B, 8cmo:B, 7dz7:B, 7dz8:B, 8h2u:B, 6ijj:B, 6ijo:B, 6jo5:B, 6jo6:B, 6qph:B, 7r3k:B, 6rhz:B, 6sl5:B, 7wyi:B, 7wzn:B, 6yxr:B, 7zq9:B, 7zqc:B, 7zqd:B, 7zqd:B2, 6zzx:B, 6zzy:B
20	7abr:F	536	35	0.1447	0.0205	0.3143	3.3
21	8czz:A	440	35	0.1711	0.0295	0.3714	3.3	8czz:E, 8czz:I
22	3ieu:A	293	52	0.2368	0.0614	0.3462	4.9	3ieu:B
23	6lpi:B	539	30	0.1184	0.0167	0.3000	5.1	6lpi:A, 6lpi:C, 6lpi:D
24	7s3d:B	742	24	0.1447	0.0148	0.4583	5.4	7s3d:H, 7s3d:b
25	4v3g:A	330	58	0.1974	0.0455	0.2586	5.5	4d5b:A, 4d5b:B, 4d5d:A, 4d5d:B, 4v3g:B, 4v3h:A, 4v3h:B
26	3h8o:A	206	43	0.1447	0.0534	0.2558	6.2	3btx:A, 3bty:A, 3btz:A, 3bu0:A, 3buc:A, 3h8r:A, 3h8x:A, 4mg2:A, 4mgt:A, 3rzg:A, 3rzh:A, 3rzj:A, 3rzk:A, 3rzl:A, 3rzl:D, 3rzm:A, 3s57:A, 3s5a:A
27	8tgw:A	387	37	0.1579	0.0310	0.3243	7.1
28	4zm6:A	844	15	0.0921	0.0083	0.4667	8.4	4zm6:B
29	8wm6:B	732	27	0.1579	0.0164	0.4444	9.4	8wmj:B, 8wmv:B, 8wmw:B

[Back]