BioLiP

>protein
GSHMGLVQRCVIIQKDDNGFGLTVSGDNPVFVQSVKEDGAAMRAGVQTGDRIIKVNGTLVTHSNHLEVVKLIKSGSYVAL
TVQGRPPGS

The query sequence (length=89) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2os6:A	89	89	1.0000	1.0000	1.0000	2.66e-61
2	6x23:A	89	79	0.3708	0.3708	0.4177	2.45e-12
3	5wou:A	95	89	0.3371	0.3158	0.3371	2.25e-10
4	6yx0:B	112	92	0.3483	0.2768	0.3370	7.62e-09	7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
5	8b82:A	108	84	0.2809	0.2315	0.2976	1.79e-08	8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
6	6xa7:B	96	83	0.3034	0.2812	0.3253	1.84e-08	7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
7	7qqn:C	414	97	0.4045	0.0870	0.3711	1.93e-08	7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
8	8bq8:C	93	86	0.3146	0.3011	0.3256	2.26e-08	8bq8:A, 8bq8:B
9	7pcb:A	415	96	0.4045	0.0867	0.3750	5.83e-08	7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
10	5n7d:A	423	86	0.3820	0.0804	0.3953	4.50e-07	2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
11	7p73:A	420	64	0.2921	0.0619	0.4062	1.10e-06	8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
12	2r4h:C	98	71	0.2472	0.2245	0.3099	2.00e-06
13	2m0v:A	128	73	0.2584	0.1797	0.3151	2.13e-06
14	2m0u:A	117	73	0.2360	0.1795	0.2877	3.62e-06
15	7qqm:A	413	95	0.3708	0.0799	0.3474	3.85e-06
16	2kqf:A	96	89	0.3596	0.3333	0.3596	6.31e-06	2kyl:A
17	3o5n:E	92	73	0.3371	0.3261	0.4110	9.79e-06
18	2kpl:A	129	67	0.3034	0.2093	0.4030	1.01e-05
19	2egn:A	83	68	0.2697	0.2892	0.3529	2.18e-05
20	5izu:A	124	84	0.3371	0.2419	0.3571	2.36e-05	6exj:A, 6exj:C, 5izu:C, 5ovc:A, 5ovp:A, 5ovv:A
21	3jxt:A	96	82	0.2697	0.2500	0.2927	4.04e-05	3jxt:B
22	8blu:B	195	82	0.3034	0.1385	0.3293	4.51e-05	5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
23	7pc3:A	405	61	0.2472	0.0543	0.3607	8.12e-05	2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
24	4wyu:A	201	72	0.3034	0.1343	0.3750	8.67e-05	8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
25	4gvc:A	94	61	0.2360	0.2234	0.3443	1.32e-04	4gvd:A, 4gvd:B, 3kze:A, 3kze:B, 3kze:C, 4nxq:A, 4nxq:B, 4nxq:C, 4nxr:A
26	5zys:A	90	81	0.2809	0.2778	0.3086	1.45e-04
27	6ezi:A	86	77	0.3034	0.3140	0.3506	1.69e-04	3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
28	1n7t:A	103	89	0.3034	0.2621	0.3034	1.96e-04	7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
29	4e34:A	87	73	0.2022	0.2069	0.2466	4.58e-04	4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
30	2l4t:A	124	68	0.2809	0.2016	0.3676	5.35e-04	3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
31	2qt5:A	194	72	0.2360	0.1082	0.2917	6.58e-04	2qt5:B
32	2qt5:A	194	82	0.3034	0.1392	0.3293	0.002	2qt5:B
33	7x2e:A	163	69	0.2135	0.1166	0.2754	0.001	2kbs:A
34	7w6x:A	447	57	0.2247	0.0447	0.3509	0.002
35	8sxg:A	366	74	0.3034	0.0738	0.3649	0.002	8sxe:A, 8sxe:B, 8sxf:A, 8sxh:A, 8sxh:E, 8sxh:I
36	2m0z:A	97	87	0.2921	0.2680	0.2989	0.003	1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
37	7d6f:A	87	79	0.2921	0.2989	0.3291	0.004
38	3tsz:A	341	56	0.2360	0.0616	0.3750	0.004	3shw:A
39	2ka9:A	189	64	0.2247	0.1058	0.3125	0.006	8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
40	1ihj:B	95	56	0.2022	0.1895	0.3214	0.007	1ihj:A
41	3ch8:A	190	48	0.1910	0.0895	0.3542	0.008	2qbw:A
42	3cyy:B	81	66	0.2247	0.2469	0.3030	0.012	3cyy:A
43	5heb:A	119	83	0.2360	0.1765	0.2530	0.026	1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
44	4ynn:A	400	53	0.1573	0.0350	0.2642	0.031	4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
45	4ynn:A	400	33	0.1573	0.0350	0.4242	4.8	4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
46	2pdz:A	86	82	0.2584	0.2674	0.2805	0.032
47	4ydp:A	83	56	0.1798	0.1928	0.2857	0.040	4ydp:B
48	8tua:A	1329	56	0.2247	0.0150	0.3571	0.043	5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
49	8tua:A	1329	47	0.1910	0.0128	0.3617	0.045	5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
50	5f67:A	98	44	0.1573	0.1429	0.3182	0.045	5f67:B
51	5m0t:A	287	55	0.1798	0.0557	0.2909	0.059	5m0t:B
52	8j9c:A	605	39	0.1910	0.0281	0.4359	0.061	8j9c:B, 8j9c:C, 8j9c:D, 8j9d:A, 8j9d:B, 8j9d:C, 8j9d:D
53	6sno:A	573	74	0.2697	0.0419	0.3243	0.087	1c47:A, 1c4g:A, 5epc:A, 5epc:B, 5f9c:A, 5jn5:A, 5jn5:B, 3pmg:A, 3pmg:B, 7s0w:A, 6snp:A, 6snq:A, 5tr2:A, 5tr2:B, 6uiq:B, 6uiq:A, 6uo6:A, 6uo6:B, 5vbi:A, 5vbi:B, 5vec:A, 5vec:B, 5vg7:A, 5vg7:B, 5vin:A, 5vin:B
54	7p70:A	407	84	0.2472	0.0541	0.2619	0.088	7pc4:A, 7qql:A
55	3pv3:A	392	54	0.1798	0.0408	0.2963	0.13	3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
56	3pv3:A	392	53	0.2022	0.0459	0.3396	0.33	3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
57	6ew9:A	305	54	0.2022	0.0590	0.3333	0.15	6ew9:B, 6ew9:C, 3gcn:A, 3gco:A, 3gds:A, 3gdu:A, 3gdu:C, 3gdv:A, 3gdv:C, 2r3y:B, 2r3y:C, 1soz:A, 1soz:B
58	7xs0:A	376	35	0.1685	0.0399	0.4286	0.18
59	4xhv:A	94	29	0.1461	0.1383	0.4483	0.18
60	4xh7:A	110	77	0.2584	0.2091	0.2987	0.19
61	6q0m:B	94	48	0.1685	0.1596	0.3125	0.45
62	6ar4:B	87	70	0.2584	0.2644	0.3286	0.49	6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
63	5ez0:D	95	69	0.2360	0.2211	0.3043	0.95	5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
64	6hks:B	94	70	0.2022	0.1915	0.2571	1.1	8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
65	3gdv:B	284	62	0.2135	0.0669	0.3065	1.1	3gdu:B, 2r3y:A, 4rqz:A, 4rqz:B, 4rqz:C
66	4wsi:A	372	75	0.2360	0.0565	0.2800	1.1	7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
67	5oak:A	90	58	0.2022	0.2000	0.3103	1.2	5oak:C
68	6jlz:I	430	55	0.2472	0.0512	0.4000	1.3
69	3bpu:A	86	77	0.3034	0.3140	0.3506	1.6
70	4c2c:A	433	62	0.2135	0.0439	0.3065	1.6	4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
71	6r2v:A	62	49	0.1348	0.1935	0.2449	1.9
72	5t63:A	283	38	0.1461	0.0459	0.3421	2.5	5b6l:A, 5gnd:A
73	3aib:G	844	38	0.1461	0.0154	0.3421	3.1	3aib:A, 3aib:B, 3aib:C, 3aib:D, 3aib:E, 3aib:F, 3aib:H, 3aic:A, 3aic:B, 3aic:C, 3aic:D, 3aic:E, 3aic:F, 3aic:G, 3aic:H, 3aie:A, 3aie:B, 3aie:C, 3aie:D, 3aie:E, 3aie:F, 3aie:G, 3aie:H, 8fg8:A, 8fg8:B, 8fj9:A, 8fj9:B, 8fjc:A, 8fjc:B, 8fk4:A, 8fk4:B, 8fk4:C, 8fk4:D, 8fk4:E, 8fk4:F, 8fk4:G, 8fk4:H, 8uf5:A, 8uf5:B
74	8bp4:A	93	81	0.1798	0.1720	0.1975	3.4	8bp4:C, 8bp4:B
75	2i0i:A	81	52	0.1798	0.1975	0.3077	3.8	2i0i:B, 2i0i:C
76	3cs0:A	392	32	0.1236	0.0281	0.3438	4.7	8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
77	7w6z:A	414	27	0.1011	0.0217	0.3333	5.3	7w6y:A
78	3ven:A	571	46	0.2022	0.0315	0.3913	6.2	3veo:A, 3ver:A, 3ves:A, 3vet:A, 3vew:A, 3vex:A, 3vez:A, 3vf2:A, 3vf4:A

[Back]