Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GSHMATKARVMYDFAAEPGNNELTVNEGEIITITNPDVGGGWLEGRNIKGERGLVPTDYVEILPSDG

The query sequence (length=67) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7oj9:A 67 67 1.0000 1.0000 1.0000 7.80e-45
2 1uj0:A 58 57 0.3582 0.4138 0.4211 2.93e-08
3 5ixf:A 68 57 0.3731 0.3676 0.4386 1.48e-07
4 2drk:A 59 55 0.3284 0.3729 0.4000 5.72e-07 2drm:A, 2drm:B, 2drm:C, 2drm:D
5 2kxc:A 67 66 0.3433 0.3433 0.3485 2.06e-06
6 2bz8:B 57 56 0.3881 0.4561 0.4643 4.76e-06 2bz8:A
7 6f55:A 67 56 0.2687 0.2687 0.3214 1.53e-05
8 2lcs:A 67 56 0.3433 0.3433 0.4107 1.82e-05
9 4lnp:A 61 57 0.2985 0.3279 0.3509 5.20e-05
10 4hvw:A 61 66 0.3433 0.3770 0.3485 1.16e-04 6xx2:A, 6xx3:A
11 2vkn:A 66 42 0.1940 0.1970 0.3095 1.37e-04
12 7pvx:A 60 61 0.2985 0.3333 0.3279 1.58e-04 7pvx:C
13 8hlo:A 67 66 0.3134 0.3134 0.3182 2.18e-04 2rqu:A
14 3rnj:A 67 60 0.2985 0.2985 0.3333 2.71e-04
15 4wci:C 63 52 0.3134 0.3333 0.4038 5.02e-04 2j6f:A, 2j6o:A, 2j7i:A, 2j7i:B, 4wci:A, 4wci:E
16 1n5z:A 71 60 0.2687 0.2535 0.3000 5.20e-04 1n5z:B, 2v1r:B, 2v1r:A
17 8ssn:B 386 50 0.2537 0.0440 0.3400 5.52e-04
18 5mo4:A 429 50 0.2537 0.0396 0.3400 6.56e-04 3cs9:B, 3cs9:C, 2hz0:B, 6npe:B, 6npu:B, 6npv:B, 3pyy:B, 8ssn:A
19 7a2w:A 61 50 0.2537 0.2787 0.3400 6.76e-04 7a2x:A, 7a2y:A, 7a2z:A
20 8bq3:A 60 52 0.2537 0.2833 0.3269 6.85e-04
21 2fo0:A 466 50 0.2537 0.0365 0.3400 8.51e-04 1abo:A, 1abo:B, 1bbz:A, 1bbz:E, 1bbz:C, 1bbz:G, 6bl8:A, 6bl8:B, 7cc2:A, 7cc2:B, 3cs9:A, 3cs9:D, 3dk3:A, 3dk3:B, 3dk6:A, 3dk6:B, 3dk7:A, 3dk7:B, 7dt2:A, 7dt2:B, 2e2b:A, 2e2b:B, 3eg1:A, 3eg1:B, 2f4j:A, 1fpu:A, 1fpu:B, 2g1t:A, 2g1t:B, 2g1t:C, 2g1t:D, 2g2f:A, 2g2f:B, 2g2h:A, 2g2h:B, 2g2i:A, 2g2i:B, 2gqg:A, 2gqg:B, 8h7f:A, 8h7f:B, 8h7h:A, 8h7h:B, 6hd4:A, 6hd4:B, 6hd6:A, 6hd6:B, 2hiw:A, 2hiw:B, 3hmi:A, 5hu9:A, 2hyy:A, 2hyy:B, 2hyy:C, 2hyy:D, 2hz0:A, 2hz4:A, 2hz4:C, 2hz4:B, 2hzi:A, 2hzi:B, 2hzn:A, 1iep:A, 1iep:B, 3ik3:A, 3ik3:B, 4j9c:A, 4j9d:A, 4j9d:C, 4j9d:E, 4j9e:A, 4j9e:C, 4j9e:E, 4j9f:A, 4j9f:C, 4j9f:E, 4j9g:A, 4j9g:C, 4j9g:E, 4j9h:A, 4j9h:B, 4j9h:F, 4j9h:E, 4j9h:D, 4j9h:C, 4j9i:A, 4j9i:C, 4j9i:E, 3k5v:A, 3k5v:B, 3kf4:A, 3kf4:B, 3kfa:A, 3kfa:B, 1m52:A, 1m52:B, 3ms9:A, 3ms9:B, 3mss:A, 3mss:B, 3mss:C, 3mss:D, 7n9g:A, 7n9g:B, 6npe:A, 6npu:A, 6npv:A, 2o88:A, 2o88:B, 1opj:A, 1opj:B, 1opk:A, 1opl:A, 1opl:B, 3oxz:A, 3oy3:A, 3oy3:B, 3pyy:A, 2qoh:A, 2qoh:B, 3qri:A, 3qri:B, 3qrj:A, 3qrj:B, 3qrk:A, 4twp:A, 4twp:B, 3ue4:A, 3ue4:B, 2v7a:A, 2v7a:B, 7w7x:A, 7w7x:B, 7w7y:A, 7w7y:B, 4wa9:B, 4xey:A, 4xli:A, 4xli:B, 2xyn:A, 2xyn:B, 2xyn:C, 4yc8:A, 4yc8:B, 2z60:A, 4zog:A, 4zog:B
22 2ak5:B 64 58 0.3134 0.3281 0.3621 8.91e-04 2df6:A, 2df6:B
23 2sem:B 59 53 0.2537 0.2881 0.3208 0.002 1sem:A, 1sem:B, 2sem:A, 3sem:A, 3sem:B
24 1y57:A 452 63 0.2985 0.0442 0.3175 0.002 1a07:A, 1a07:B, 1a08:A, 1a08:B, 1a09:A, 1a09:B, 1a1a:A, 1a1a:B, 1a1b:A, 1a1b:B, 1a1c:A, 1a1c:B, 1a1e:A, 1a1e:B, 4agw:A, 4agw:B, 7ah3:A, 2bdf:A, 2bdf:B, 2bdj:A, 1bkm:A, 5bmm:A, 5bmm:B, 5d12:A, 7d57:A, 7d5o:A, 3d7t:B, 4dgg:A, 4dgg:B, 3dqw:A, 3dqw:B, 3dqw:C, 3dqw:D, 3dqx:A, 3dqx:B, 6e6e:A, 6e6e:B, 6e6e:C, 6e6e:D, 6e6e:E, 6e6e:F, 6e6e:G, 6e6e:H, 3el8:A, 3en4:A, 3en4:B, 3en5:B, 1f1w:A, 3f3t:A, 3f3u:A, 3f3u:B, 3f3v:A, 3f3v:B, 3f3w:A, 3f3w:B, 6f3f:A, 4f5a:A, 4f5b:A, 3f6x:A, 3f6x:B, 3f6x:C, 3f6x:D, 3g5d:A, 3g5d:B, 3g6g:A, 3g6g:B, 3g6h:B, 3geq:A, 3geq:B, 2h8h:A, 1hcs:B, 1hct:B, 4hvu:A, 4hvv:A, 6hve:A, 4hxj:A, 1is0:A, 1is0:B, 5j5s:A, 5j5s:B, 8jn8:A, 8jn9:A, 4k11:A, 8k79:A, 8k79:B, 5k9i:A, 5k9i:B, 1kc2:A, 1ksw:A, 6l8l:A, 6l8l:B, 6l8l:C, 6l8l:D, 4mcv:A, 4mcv:B, 4mxo:A, 4mxo:B, 4mxx:A, 4mxx:B, 4mxy:A, 4mxy:B, 4mxz:A, 4mxz:B, 7nes:A, 7ng7:A, 1nlo:C, 1nlp:C, 1nzl:B, 1nzv:B, 4o2p:A, 4o2p:B, 1o41:A, 1o42:A, 1o43:A, 1o44:A, 1o45:A, 1o46:A, 1o47:A, 1o48:A, 1o49:A, 1o4a:A, 1o4b:A, 1o4c:A, 1o4d:A, 1o4e:A, 1o4f:A, 1o4g:A, 1o4h:A, 1o4i:A, 1o4j:A, 1o4k:A, 1o4n:A, 1o4o:A, 1o4p:A, 1o4q:A, 1o4r:A, 5oav:A, 5oav:C, 5ob0:A, 5ob1:A, 5ob2:A, 5ob2:C, 3oez:A, 3oez:B, 2oiq:A, 7ote:A, 7ote:B, 1p13:B, 1p13:A, 1prl:C, 1prm:C, 3qlf:B, 3qlg:A, 3qlg:B, 4qt7:A, 1qwe:A, 1qwf:A, 1rlp:C, 1rlq:C, 4rtv:A, 4rtw:A, 4rtw:C, 4rty:A, 4rtz:A, 1sha:A, 1shb:A, 1shd:A, 1skj:A, 1sps:A, 1sps:B, 1sps:C, 2src:A, 3svv:A, 3svv:B, 5swh:A, 5swh:B, 5sys:A, 5sys:B, 5t0p:A, 5t0p:B, 5teh:A, 5teh:B, 3tz7:A, 3tz7:B, 3tz8:A, 3tz8:B, 3tz9:A, 3tz9:B, 3u4w:A, 3u51:A, 3u51:B, 4u5j:A, 4u5j:B, 3uqf:A, 3uqg:A, 3uqg:B, 7wf5:A, 7wf5:B, 6wiw:B, 8xn8:A, 5xp5:A, 5xp5:B, 5xp7:A, 5xp7:B, 4ybj:A, 4ybk:A, 1yom:A, 1yom:B
25 2d1x:C 66 61 0.2985 0.3030 0.3279 0.003 2d1x:A, 2d1x:B, 2d1x:D, 5nv1:A, 7pll:A, 3ulr:B
26 6ipz:Z 63 52 0.2687 0.2857 0.3462 0.003 1a0n:B, 1azg:B, 4eik:A, 1fyn:A, 8kdx:A, 3ua7:A, 3ua7:D, 3ua7:C, 4znx:A, 4znx:D, 4znx:B, 4znx:C
27 6a9c:B 66 58 0.3134 0.3182 0.3621 0.004
28 1zsg:A 65 53 0.2537 0.2615 0.3208 0.006 2p4r:A, 5sxp:B, 5sxp:D, 5sxp:A, 5sxp:C
29 7ud6:A 265 50 0.2388 0.0604 0.3200 0.006 3a7d:A, 2cl5:A, 2cl5:B, 5fhq:A, 5fhr:A, 5fhr:B, 6gy1:A, 1h1d:A, 3hvh:A, 3hvi:A, 3hvj:A, 3hvj:B, 3hvk:A, 1jr4:A, 5k01:A, 5k03:A, 5k05:A, 5k05:B, 5k09:A, 5k09:B, 5k09:C, 5k09:D, 5k09:E, 5k09:F, 5k09:G, 5k09:H, 5k09:I, 5k09:J, 5k09:K, 5k09:L, 5k09:M, 5k09:N, 5k09:O, 5k09:P, 5k09:Q, 5k09:R, 5k09:S, 5k09:T, 5k09:U, 5k09:V, 5k09:W, 5k09:X, 5k0b:A, 5k0b:B, 5k0b:C, 5k0b:D, 5k0b:E, 5k0b:F, 5k0b:G, 5k0b:H, 5k0c:A, 5k0c:B, 5k0e:A, 5k0f:A, 5k0f:B, 5k0g:A, 5k0l:A, 5k0l:B, 5k0l:C, 5k0l:D, 5k0n:A, 5k0n:B, 5k0n:C, 5k0n:D, 6lfe:A, 5lqa:A, 5lqc:A, 5lqj:B, 5lqj:C, 5lqj:D, 5lqk:A, 5lqn:A, 5lqr:A, 5lqu:A, 5lqu:B, 5lr6:A, 5lr6:B, 5lr6:C, 5lr6:D, 3nw9:A, 3nwb:A, 3nwe:A, 3oe4:A, 3oe5:A, 3ozr:A, 3ozs:A, 3ozt:A, 4p58:A, 5p8w:A, 5p8w:B, 5p8w:C, 5p8x:A, 5p8y:A, 5p8z:A, 5p90:A, 5p91:A, 5p92:A, 5p93:A, 5p94:A, 5p95:A, 5p96:A, 5p97:A, 5p98:A, 5p99:A, 5p9a:A, 5p9b:A, 5p9c:A, 5p9d:A, 5p9e:A, 5p9n:A, 5p9o:A, 5p9p:A, 5p9q:A, 5p9r:A, 5p9r:B, 5p9s:A, 5p9t:A, 5p9u:A, 5p9v:A, 5p9w:A, 5p9x:A, 5p9y:A, 5p9z:A, 5pa0:A, 5pa1:A, 5pa2:A, 5pa3:A, 5pa4:A, 5pa5:A, 5pa6:A, 5pa7:A, 5pa7:B, 4pyl:A, 4pyn:A, 4pyo:A, 4pyo:B, 4pyq:A, 4pyq:B, 3r6t:A, 3s68:A, 3u81:A, 1vid:A, 7xgi:A, 7xjb:A, 7xjb:B, 7xjb:C, 7xjb:D, 2zth:A, 2zvj:A
30 7uy0:A 448 51 0.2687 0.0402 0.3529 0.008 7uy0:B, 7uy3:A
31 1b07:A 59 59 0.2836 0.3220 0.3220 0.011 6atv:A, 1cka:A, 1ckb:A, 5ih2:A, 5ih2:B, 5l23:A, 5ul6:A
32 4iio:B 57 58 0.2687 0.3158 0.3103 0.019
33 1jeg:A 60 56 0.2090 0.2333 0.2500 0.026
34 7pvt:C 56 50 0.2239 0.2679 0.3000 0.034 7pvt:A
35 5qu2:A 56 50 0.2239 0.2679 0.3000 0.068 5qu2:B
36 2rpn:A 59 58 0.2836 0.3220 0.3276 0.25
37 2kym:A 120 58 0.3134 0.1750 0.3621 0.41
38 8gmb:A 438 55 0.2388 0.0365 0.2909 1.2 6aua:A, 6aub:A, 6bik:A, 6bke:A, 6bkh:A, 6bkw:A, 6bln:A, 5bpy:A, 5bpy:B, 5bq0:A, 6di0:A, 6di1:A, 6di3:A, 6di5:A, 6di9:A, 8dso:B, 8e2m:A, 6e4f:A, 8ejb:A, 6ep9:A, 5fbn:C, 5fbn:D, 5fbo:A, 8fd9:A, 8ff0:A, 8flg:A, 8flh:A, 8fll:A, 8fln:A, 8flv:A, 8gc7:A, 8gc8:A, 3gen:A, 6hrp:A, 6hrt:A, 6j6m:A, 5j87:A, 5j87:B, 5j87:C, 5j87:D, 5jrs:A, 5kup:A, 7kxl:A, 7kxm:A, 7kxn:A, 7kxo:A, 7kxp:A, 7kxq:A, 7l5o:A, 7l5p:A, 7l5p:B, 7lty:A, 7ltz:A, 6mny:A, 7n4q:A, 7n4r:A, 7n4s:A, 7n5o:A, 7n5r:A, 7n5x:A, 7n5y:A, 6n9p:A, 6nfh:A, 4nwm:A, 4nwm:B, 6nzm:A, 6nzm:D, 6o8i:A, 3ocs:A, 3oct:A, 6omu:A, 4ot5:A, 4ot6:A, 4otf:A, 4otq:A, 4otr:A, 5p9f:A, 5p9g:A, 5p9h:A, 5p9i:A, 5p9j:A, 5p9k:A, 5p9l:A, 5p9m:A, 3pix:A, 3piy:A, 7r60:A, 7r61:A, 4rfy:A, 4rfz:A, 4rg0:A, 4rx5:A, 6s90:A, 6s90:B, 8s9f:B, 8s9f:A, 5t18:A, 6tfp:A, 6tfp:B, 6tfp:C, 6tfp:D, 6tfp:E, 8tu3:A, 8tu4:A, 8tu5:A, 8u2d:A, 8u2e:A, 5u9d:A, 5vfi:A, 5vgo:A, 6vxq:A, 6w06:A, 6w07:A, 6w7o:A, 6w7o:B, 6w8i:C, 6w8i:A, 6w8i:B, 6x3n:A, 6x3o:A, 6x3o:B, 6x3p:A, 6xe4:A, 4y95:A, 4y95:B, 4y95:C, 4y95:D, 7yc9:A, 4yhf:A, 4yhf:B, 4z3v:A, 4zly:A, 4zlz:A, 5zz4:A, 5zz4:B, 5zz4:C, 5zz4:D, 5zz4:E, 5zz4:F
39 3cc2:T 119 65 0.2239 0.1261 0.2308 1.9 3cc4:T, 3cc7:T, 3cce:T, 3ccj:T, 3ccl:T, 3ccm:T, 3ccq:T, 3ccr:T, 3ccs:T, 3ccu:T, 3ccv:T, 3cd6:T, 3cma:T, 3cme:T, 3cpw:S, 3cxc:S, 3g4s:T, 3g6e:T, 3g71:T, 3i55:T, 3i56:T, 1jj2:S, 1k73:U, 1k8a:U, 1k9m:U, 1kc8:U, 1kd1:U, 1kqs:S, 1m1k:U, 1m90:U, 1n8r:U, 1nji:U, 2otj:T, 2otl:T, 3ow2:S, 1q7y:U, 1q81:U, 1q82:U, 1q86:U, 2qa4:T, 2qex:T, 1qvf:S, 1qvg:S, 1s72:T, 4v4p:AU, 4v4r:BY, 4v4s:BY, 4v4t:BY, 4v9f:T, 1vq4:T, 1vq5:T, 1vq6:T, 1vq7:T, 1vq8:T, 1vq9:T, 1vqk:T, 1vql:T, 1vqm:T, 1vqn:T, 1vqo:T, 1vqp:T, 1w2b:S, 1yhq:T, 1yi2:T, 1yij:T, 1yit:T, 1yj9:T, 1yjn:T, 1yjw:T
40 7jz6:B 662 48 0.2388 0.0242 0.3333 2.4 7jz6:A, 7jz6:C, 7jz6:D
41 7o0g:A 733 22 0.1642 0.0150 0.5000 4.1 7o0h:A, 7o24:A
42 9eqg:D 353 28 0.1343 0.0255 0.3214 4.2 6d6t:B, 6d6t:D, 6d6u:B, 6d6u:D, 8dd2:D, 8dd2:B, 8dd3:D, 8dd3:B, 6dw0:A, 6dw0:C, 6dw1:C, 6dw1:A, 9eqg:A, 8foi:A, 8foi:C, 8g4n:A, 8g4n:C, 8g4o:C, 8g4x:A, 8g5f:C, 8g5g:A, 8g5h:C, 6hug:A, 6hug:D, 6huj:A, 6huj:D, 6huk:A, 6huk:D, 6huo:A, 6huo:D, 6hup:A, 6hup:D, 6i53:A, 6i53:D, 7pbd:A, 7qne:A, 7qne:D, 8sgo:B, 8sgo:D, 8si9:B, 8si9:D, 8sid:B, 8sid:D, 7t0w:D, 7t0z:D, 7t0z:B, 8vqy:B, 8vqy:D, 8vrn:D, 8vrn:B, 6x3s:D, 6x3s:B, 6x3t:D, 6x3t:B, 6x3u:D, 6x3v:D, 6x3w:D, 6x3w:B, 6x3x:D, 6x3x:B, 6x3z:D, 6x3z:B, 6x40:D, 6x40:B
43 2ehz:A 299 38 0.1940 0.0435 0.3421 6.0 2ei0:A, 2ei1:A, 2ei2:A, 2ei3:A
44 8olx:B 836 23 0.1194 0.0096 0.3478 6.8 8om5:B, 8om9:B
45 3thw:B 860 23 0.1194 0.0093 0.3478 6.8 8oma:B, 8omo:B, 8omq:B, 3thx:B, 3thy:B, 3thz:B
46 3red:A 521 17 0.1493 0.0192 0.5882 9.0 3red:B, 3red:C, 3red:D, 3red:E, 3red:F, 3red:G, 3red:H, 3red:I, 3red:J, 3red:K, 3red:L

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417