Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GRVRLVQFQKNTDEPMGITLKMNELNHCIVARIMHGGMIHRQGTLHVGDEIREINGISVANQTVEQLQKMLREMRGSITF
KIVPSY

The query sequence (length=86) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6nid:B 88 86 1.0000 0.9773 1.0000 5.56e-60 6nid:A, 6nid:C
2 2ejy:A 85 83 0.6163 0.6235 0.6386 7.34e-37
3 4wsi:A 372 83 0.3837 0.0887 0.3976 7.37e-17 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
4 1rzx:A 98 95 0.2907 0.2551 0.2632 1.07e-07 5i7z:A, 1x8s:A
5 1n7f:A 86 70 0.2442 0.2442 0.3000 9.89e-07 1n7f:B
6 1u38:A 89 51 0.1977 0.1910 0.3333 5.73e-06
7 4e34:A 87 85 0.2907 0.2874 0.2941 9.54e-06 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
8 6xa7:B 96 31 0.1977 0.1771 0.5484 2.98e-05 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
9 7d6f:A 87 55 0.2093 0.2069 0.3273 5.18e-05
10 8bq8:C 93 58 0.2209 0.2043 0.3276 6.29e-05 8bq8:A, 8bq8:B
11 6ar4:B 87 77 0.2442 0.2414 0.2727 1.36e-04 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
12 4xh7:A 110 73 0.2209 0.1727 0.2603 0.003
13 8bv7:A 95 44 0.1860 0.1684 0.3636 0.003 8buw:A, 8buw:B
14 7pc3:A 405 57 0.1744 0.0370 0.2632 0.004 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
15 2ka9:A 189 61 0.1977 0.0899 0.2787 0.006 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
16 3jxt:A 96 58 0.2442 0.2188 0.3621 0.014 3jxt:B
17 3cyy:B 81 77 0.2326 0.2469 0.2597 0.018 3cyy:A
18 6zbq:A 89 59 0.1977 0.1910 0.2881 0.024 6zc4:A
19 2qt5:A 194 72 0.2093 0.0928 0.2500 0.032 2qt5:B
20 2qt5:A 194 51 0.1395 0.0619 0.2353 1.2 2qt5:B
21 2r4h:C 98 32 0.1628 0.1429 0.4375 0.040
22 7qqn:C 414 84 0.2558 0.0531 0.2619 0.060 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
23 4xhv:A 94 54 0.1977 0.1809 0.3148 0.087
24 5heb:A 119 51 0.1744 0.1261 0.2941 0.094 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
25 2koh:A 111 73 0.2209 0.1712 0.2603 0.12 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
26 2kaw:A 90 45 0.1395 0.1333 0.2667 0.14 6lcb:A, 2mx6:A
27 3r0h:D 199 77 0.1860 0.0804 0.2078 0.20 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
28 3r0h:D 199 50 0.1512 0.0653 0.2600 2.7 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
29 1l6o:A 95 45 0.1395 0.1263 0.2667 0.27 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
30 2pdz:A 86 77 0.2442 0.2442 0.2727 0.43
31 1ihj:B 95 43 0.1744 0.1579 0.3488 0.45 1ihj:A
32 5oak:A 90 69 0.2442 0.2333 0.3043 0.46 5oak:C
33 5z5d:A 504 61 0.2209 0.0377 0.3115 0.51 5z5f:A, 5z5h:A, 5z5i:A
34 8blu:B 195 74 0.2093 0.0923 0.2432 0.64 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
35 7x2e:A 163 49 0.1744 0.0920 0.3061 1.8 2kbs:A
36 7p70:A 407 69 0.1744 0.0369 0.2174 2.0 7pc4:A, 7qql:A
37 2bis:A 440 19 0.1047 0.0205 0.4737 2.1 2bis:C, 3fro:B, 3l01:A, 3l01:B
38 6tpk:A 461 19 0.1047 0.0195 0.4737 2.1 7qvm:R
39 6w25:A 468 19 0.1047 0.0192 0.4737 2.1 8wky:A, 8wkz:A
40 7br3:A 470 19 0.1047 0.0191 0.4737 2.1
41 6lfl:A 471 19 0.1047 0.0191 0.4737 2.1
42 6kuw:A 474 19 0.1047 0.0190 0.4737 2.1 6kuw:B
43 7w41:A 484 19 0.1047 0.0186 0.4737 2.1
44 6hlp:A 485 19 0.1047 0.0186 0.4737 2.1 6e59:A, 6hll:A, 6hlo:A
45 6me2:A 486 19 0.1047 0.0185 0.4737 2.1 6me3:A, 6me4:A, 6me5:A, 6ps8:A
46 7fee:A 486 19 0.1047 0.0185 0.4737 2.1 6kqi:A, 5u09:A
47 6v9s:A 503 19 0.1047 0.0179 0.4737 2.1 4zj8:A, 4zjc:A
48 6tpn:A 510 19 0.1047 0.0176 0.4737 2.1 4s0v:A, 6tpg:A, 6tpj:A, 6tpj:B, 5wqc:A, 5ws3:A
49 7pcb:A 415 43 0.1628 0.0337 0.3256 2.1 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
50 8cxo:A 551 19 0.1047 0.0163 0.4737 2.1
51 6fj3:A 562 19 0.1047 0.0160 0.4737 2.1 8d51:A, 8d52:A, 7uzo:A, 7uzp:A, 7uzp:C, 7uzp:E
52 2m0z:A 97 43 0.1512 0.1340 0.3023 2.2 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
53 6kz1:A 97 44 0.1512 0.1340 0.2955 2.3 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
54 4wyu:A 201 95 0.2326 0.0995 0.2105 2.8 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
55 4wyu:A 201 45 0.1744 0.0746 0.3333 7.1 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
56 8cn1:H 101 67 0.2209 0.1881 0.2836 2.9 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
57 3zuk:A 657 26 0.1163 0.0152 0.3846 3.0 3zuk:B
58 1v7v:A 779 40 0.1395 0.0154 0.3000 3.6 1v7w:A, 1v7x:A
59 2l4t:A 124 42 0.1744 0.1210 0.3571 4.6 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
60 8dh0:F 796 53 0.1744 0.0188 0.2830 4.9
61 6yx0:B 112 49 0.1860 0.1429 0.3265 5.3 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
62 2exg:A 101 54 0.1279 0.1089 0.2037 5.4 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
63 2m0u:A 117 52 0.1512 0.1111 0.2500 6.4
64 7p73:A 420 53 0.1512 0.0310 0.2453 6.5 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
65 7lcc:A 1369 18 0.1047 0.0066 0.5000 7.5
66 5yjg:A 594 31 0.1395 0.0202 0.3871 8.7 5yjh:A
67 2bb3:A 194 47 0.1860 0.0825 0.3404 9.5 2bb3:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417