Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GPLPNALYCICRQPHNNRFMICCDRCEEWFHGDCVGISEARGRLLERNGEDYICPNCT

The query sequence (length=58) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1wem:A 76 55 0.9483 0.7237 1.0000 2.87e-37 4l7x:A, 2m3h:A
2 5wlf:A 60 58 0.6724 0.6500 0.6724 9.22e-27 5wle:A
3 3kv6:D 448 52 0.4655 0.0603 0.5192 9.26e-15 3kv5:D, 3kv5:A, 3kv6:A, 3kv9:A, 3kva:A, 3u78:A
4 3kv4:A 432 52 0.4310 0.0579 0.4808 3.34e-13 4do0:A, 3k3n:A, 3k3o:A, 2wwu:A
5 8f8y:B 433 52 0.4310 0.0577 0.4808 4.75e-13 8f8y:A, 8f8z:A, 8f8z:B, 3kqi:A, 7m10:A, 3pu3:A, 3pu3:B, 3pu8:B, 3pu8:A, 3pua:A, 3pus:A, 3pus:B
6 2f6j:A 168 54 0.4138 0.1429 0.4444 2.02e-12 8ag2:A, 6aze:A, 7dmy:A, 7dn4:A, 7dn4:B, 7dn4:C, 7dn4:D, 7dn4:E, 7dn4:F, 7f5c:A, 7f5d:A, 7f5e:A, 2f6j:B, 2f6j:C, 2f6n:A, 2f6n:B, 8f6g:A, 2fsa:A, 2fsa:B, 2fsa:C, 2fuu:A, 5h6y:A, 7k6r:A, 7k6s:A, 7kdw:A, 7kdw:B, 7kdz:A, 7lp0:A, 7lp0:B, 7lpk:A, 7lpk:B, 7lrk:A, 7lrk:B, 7lro:A, 7lro:B, 6lu5:A, 6lu6:A, 7m2e:A, 8ou2:A, 8ou2:B, 3qzs:A, 3qzs:B, 3qzt:A, 3qzv:A, 5r4g:A, 5r4h:A, 5r4i:A, 5r4j:A, 5r4k:A, 5r4l:A, 5r4m:A, 5r4n:A, 2ri7:A, 7rwn:A, 7rwo:A, 7rwp:A, 7rwq:A, 7vd4:A
7 9c0o:A 63 55 0.4310 0.3968 0.4545 3.45e-12
8 1wep:A 79 52 0.4483 0.3291 0.5000 2.63e-11
9 5yc3:A 60 42 0.3448 0.3333 0.4762 1.95e-08 5yc4:A
10 1we9:A 64 42 0.3448 0.3125 0.4762 3.72e-08
11 5y20:A 52 42 0.3276 0.3654 0.4524 4.79e-08
12 6j2p:A 98 51 0.3276 0.1939 0.3725 1.92e-06 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
13 2lv9:A 80 35 0.2759 0.2000 0.4571 3.47e-06 4l58:A
14 5z8l:A 204 54 0.2931 0.0833 0.3148 3.77e-06 5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
15 5tab:A 53 58 0.3966 0.4340 0.3966 7.28e-06
16 5znp:B 186 53 0.3103 0.0968 0.3396 2.48e-05 5znp:A, 5znr:A, 5znr:B
17 2k16:A 75 48 0.2931 0.2267 0.3542 2.94e-05 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
18 5tbn:A 57 53 0.3448 0.3509 0.3774 6.51e-04
19 1x4i:A 70 62 0.3966 0.3286 0.3710 0.001 7zmx:A, 7zmx:B
20 5c11:A 52 50 0.3276 0.3654 0.3800 0.001 3gl6:A, 2kgg:A, 2kgi:A
21 2ma5:A 61 50 0.3276 0.3115 0.3800 0.001
22 3n9m:A 503 37 0.2241 0.0258 0.3514 0.002 3n9l:A, 3n9m:C, 3n9n:A, 3n9o:A, 3n9p:A, 3n9q:A, 3puq:A, 3puq:C, 3pur:A, 3pur:C
23 5tdr:A 70 51 0.2931 0.2429 0.3333 0.002 5tdw:A
24 7y0i:A 56 53 0.2931 0.3036 0.3208 0.002
25 3lqi:C 181 41 0.2414 0.0773 0.3415 0.007 2kyu:A, 3lqh:A, 3lqi:A, 3lqi:B, 3lqj:A, 3lqj:B, 7zey:B, 7zez:B
26 6wxk:B 51 36 0.2241 0.2549 0.3611 0.008 6wxk:A, 6wxk:C, 6wxk:D, 6wxk:E
27 5dx9:A 307 54 0.3276 0.0619 0.3519 0.024
28 3o70:A 55 34 0.2069 0.2182 0.3529 0.024 3o7a:A
29 6ryr:W 708 48 0.2414 0.0198 0.2917 0.044 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
30 2xb1:C 97 50 0.2759 0.1649 0.3200 0.069 4up0:A, 4up5:A, 2xb1:A
31 1weu:A 91 55 0.3448 0.2198 0.3636 0.071 3c6w:A, 3c6w:C, 2k1j:A, 2m1r:A, 2pnx:A, 2pnx:C, 2vnf:A, 2vnf:C, 1wen:A
32 8hxx:N 375 23 0.1724 0.0267 0.4348 0.082 8hxy:N, 8hy0:N, 8i3f:B, 8jho:N, 8tof:G, 8w9c:E, 8w9d:E, 8w9e:E, 8w9f:E
33 8ihn:M 357 23 0.1724 0.0280 0.4348 0.095 8kd4:E
34 7yi2:D 321 23 0.1724 0.0312 0.4348 0.16 7yi0:D, 7yi3:D, 7yi4:D, 7yi5:D
35 8kd6:E 301 23 0.1724 0.0332 0.4348 0.17 8kd2:E
36 2rsd:A 68 42 0.2759 0.2353 0.3810 0.20
37 2mum:A 50 37 0.2759 0.3200 0.4324 0.29
38 5xfr:A 309 29 0.2069 0.0388 0.4138 0.31 5xfr:B
39 2jmi:A 60 37 0.2586 0.2500 0.4054 0.31 2jmj:A
40 5b73:A 313 54 0.2759 0.0511 0.2963 0.33 4cos:A, 7cwh:B, 5y1z:C, 5y1z:D
41 2qic:A 51 54 0.3448 0.3922 0.3704 0.42
42 3zpv:1 62 32 0.1897 0.1774 0.3438 0.46 3zpv:3, 3zpv:5, 3zpv:7, 3zpv:9, 3zpv:A, 3zpv:C, 3zpv:E, 3zpv:G, 3zpv:I, 3zpv:K, 3zpv:M, 3zpv:O, 3zpv:Q, 3zpv:S, 3zpv:U, 3zpv:W, 3zpv:Y
43 6fhq:A 58 52 0.2759 0.2759 0.3077 0.65 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
44 1f62:A 51 48 0.2586 0.2941 0.3125 0.66
45 1wee:A 72 21 0.1724 0.1389 0.4762 1.0
46 8k2m:A 559 26 0.1897 0.0197 0.4231 1.1
47 1mm3:A 61 49 0.2586 0.2459 0.3061 1.2
48 1wes:A 71 55 0.3103 0.2535 0.3273 1.6 2g6q:A
49 9atn:A 98 26 0.1552 0.0918 0.3462 1.9
50 6bn5:B 448 41 0.2069 0.0268 0.2927 3.4
51 3u5o:C 195 54 0.2931 0.0872 0.3148 3.4 8bd8:A, 8bd9:A, 8bdy:A, 5mr8:A, 3u5m:A, 3u5m:B, 3u5m:C, 3u5m:D, 3u5m:F, 3u5m:G, 3u5m:H, 3u5m:I, 3u5m:K, 3u5m:J, 3u5m:L, 3u5n:A, 3u5n:B, 3u5o:A, 3u5o:B, 3u5o:D, 3u5o:E, 3u5o:F, 3u5o:G, 3u5o:H, 3u5p:A, 3u5p:B, 3u5p:C, 3u5p:D, 3u5p:E, 3u5p:F, 3u5p:G, 3u5p:H, 7zdd:A
52 6lqf:A 175 52 0.2931 0.0971 0.3269 4.5 6lqe:A
53 5oqd:C 192 33 0.2241 0.0677 0.3939 4.6 5oqd:B, 5oqd:A, 5oqd:D, 5oqd:E, 5oqd:F
54 2ro1:A 189 25 0.1552 0.0476 0.3600 5.8
55 4g7f:A 419 23 0.1724 0.0239 0.4348 6.5
56 2vp7:A 66 39 0.2069 0.1818 0.3077 6.9 2dx8:A, 2dx8:B, 2vpb:A, 2vpd:A, 2vpd:C, 2vpe:C, 2vpe:A, 2vpg:A, 2vpg:C, 2yyr:A, 2yyr:B
57 3o36:A 184 31 0.1897 0.0598 0.3548 7.4 7b9x:A, 5h1t:A, 5h1t:B, 5h1t:C, 5h1t:D, 5h1u:B, 5h1u:A, 5h1u:C, 5h1u:D, 5h1v:A, 5h1v:B, 3o33:A, 3o33:B, 3o33:C, 3o33:D, 3o34:A, 3o35:B, 3o35:A, 3o36:B, 3o37:A, 3o37:B, 3o37:C, 3o37:D, 4yab:A, 4yab:B, 4yad:A, 4yad:B, 4yat:A, 4yat:B, 4yax:A, 4yax:B, 4ybm:A, 4ybm:B, 4ybs:A, 4ybt:A, 4yc9:A, 4zql:A, 4zql:B
58 6b3x:A 327 28 0.1897 0.0336 0.3929 7.4
59 8i02:G 284 37 0.2069 0.0423 0.3243 8.1 8ifg:P
60 2a7r:A 338 21 0.1724 0.0296 0.4762 8.3 2a7r:B, 2a7r:C, 2bzn:A, 2bzn:B, 2bzn:C, 2bzn:D, 2bzn:E, 2bzn:F, 2bzn:G, 2bzn:H, 2c6q:A, 2c6q:B, 2c6q:D, 2c6q:C, 2c6q:E, 2c6q:F, 2c6q:H, 2c6q:G
61 3nvj:A 351 36 0.2241 0.0370 0.3611 9.2
62 4fk9:A 314 27 0.1552 0.0287 0.3333 9.8
63 5l9c:A 304 31 0.1897 0.0362 0.3548 9.9 5l9c:B, 5l9c:C, 5l9c:D

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417