Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GLVPRGSHMKMIIAIVQDQDSQELADQLVKNNFRATKLATTGGFLRAGNTTFLCGVNDDRVDEILSVINQTCGNEVGGAT
VFVMPVDAFHQF

The query sequence (length=92) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4wk1:A 92 92 1.0000 1.0000 1.0000 9.57e-65
2 4d3h:B 104 104 1.0000 0.8846 0.8846 2.36e-61 4d3h:A, 4d3h:C
3 4rww:A 113 109 0.5978 0.4867 0.5046 8.98e-32 4rww:B, 4rww:C
4 4rle:A 116 109 0.6087 0.4828 0.5138 6.24e-30
5 1v3s:A 97 92 0.2717 0.2577 0.2717 0.011 1v3s:B, 1v3s:C, 1v9o:A, 1v9o:B, 1v9o:C
6 3im9:A 313 45 0.2065 0.0607 0.4222 0.020
7 4nex:A 157 50 0.2174 0.1274 0.4000 0.024 4nex:B, 4nf1:A, 4nf1:B, 4nf1:C, 4nf1:D, 4nf1:E, 4nf1:F, 4nf1:G, 4nf1:H
8 4zmr:A 207 19 0.1413 0.0628 0.6842 0.056 4e7o:A, 4e7o:B, 4e7p:A, 4e7p:B, 4zmr:B, 4zms:A, 4zms:B
9 3lf0:B 112 99 0.2609 0.2143 0.2424 0.17 3lf0:C
10 4gcy:A 163 17 0.1304 0.0736 0.7059 0.17 8cga:A, 5ect:A, 5edd:A, 3h6d:A, 3hza:A, 3i93:A, 3loj:A, 2py4:A, 1six:A, 1sjn:A, 1sjn:C, 1sjn:B, 1sm8:A, 1sm8:B, 1sm8:C, 1smc:A, 1smc:B, 1smc:C, 1snf:A, 1snf:C, 1snf:B
11 3esw:A 333 70 0.2391 0.0661 0.3143 0.24 1x3w:A, 1x3z:A
12 6ypa:B 269 87 0.3043 0.1041 0.3218 0.29 7ovg:A, 7ovg:B, 6ypa:A, 6ypa:C, 6ypa:D
13 1cbf:A 239 13 0.1196 0.0460 0.8462 0.40 2cbf:A
14 7ag4:D 425 42 0.1630 0.0353 0.3571 0.40 7ag4:A, 7ag4:B, 7ag4:F, 7ag4:C, 7ag4:E, 2zbl:A, 2zbl:B, 2zbl:C, 2zbl:D, 2zbl:E, 2zbl:F
15 2l6e:A 94 17 0.1304 0.1277 0.7059 0.40
16 6j3h:A 264 87 0.2609 0.0909 0.2759 0.47 6j3h:B, 6j3h:C, 6j3h:D
17 2c4w:A 168 13 0.1087 0.0595 0.7692 0.48 4b6r:A, 4b6r:C, 4b6r:B, 4b6s:A, 4b6s:C, 4b6s:B, 2c57:A, 2c57:B, 2c57:C, 2c57:D, 2c57:E, 2c57:F, 2c57:G, 2c57:H, 2c57:I, 2c57:J, 2c57:K, 2c57:L, 1j2y:A, 2wks:A, 2wks:B, 2wks:C, 2wks:F, 2wks:D, 2wks:E, 2xb9:A, 2xb9:B, 2xd9:A, 2xd9:B, 2xd9:C, 2xda:A
18 2qry:C 318 15 0.1087 0.0314 0.6667 0.50 2qry:A, 2qry:B, 2qry:D
19 4irx:A 296 14 0.0978 0.0304 0.6429 0.66 4irx:B
20 8kbc:B 132 35 0.1413 0.0985 0.3714 0.80 8kbc:G, 8kbc:J, 8kbc:A, 8kbc:H, 8kbc:I, 8kbc:L, 8kbc:C, 8kbc:E, 8kbc:K, 8kbc:D, 8kbc:F, 8kbd:A, 8kbd:H, 8kbd:I, 8kbd:B, 8kbd:G, 8kbd:J, 8kbd:L, 8kbd:C, 8kbd:E, 8kbd:K, 8kbd:D, 8kbd:F
21 6d2v:A 315 35 0.1522 0.0444 0.4000 1.2 6d2v:B, 6nd7:A, 6nd7:B
22 2owq:B 224 36 0.1522 0.0625 0.3889 1.4 8j86:B, 8j8f:B, 8j8g:B, 4lzb:A, 4lzb:B, 4lzb:C, 4lzb:D, 4lzb:E, 4lzb:F, 4lzb:G, 4lzb:H, 4lzb:I, 4lzb:J, 4lzb:K, 4lzb:L, 2owq:A, 4qcb:B, 4qcb:A, 8wpe:C, 8wpf:C, 8wpk:C, 8wpp:C, 4ygm:B, 4ygm:A, 4yig:A, 4yig:E, 4yig:I
23 4f2p:B 239 27 0.1304 0.0502 0.4444 1.5 3df9:A, 3df9:B, 4f1w:A, 4f1w:B, 4f2p:A, 4f2w:A, 4f2w:B, 4f3c:A, 4f3c:B, 4f3k:A, 4f3k:B, 1jys:A, 1jys:B, 1nc1:A, 1nc1:B, 1nc3:A, 1nc3:B, 3o4v:A, 3o4v:B, 4wkc:A, 1y6q:A, 1y6q:B, 1y6r:A, 1y6r:B, 4yml:A, 1z5n:A, 1z5n:B, 1z5o:A, 1z5o:B
24 4qqq:A 483 55 0.1957 0.0373 0.3273 1.5
25 7dwa:B 327 11 0.1087 0.0306 0.9091 1.6 7dvj:B, 7dvj:A, 7dw8:A, 7dw8:B, 7dwa:A
26 5vyz:C 1083 13 0.1087 0.0092 0.7692 1.7 5vyw:A, 5vyw:B, 5vyw:C, 5vz0:C
27 6gcn:B 438 11 0.1087 0.0228 0.9091 1.7 6gcn:C, 6gcn:D, 6gco:A, 4ww0:B, 4z8x:A, 4z8x:B, 4z8x:C
28 3hlf:A 425 13 0.1196 0.0259 0.8462 1.8 3hld:A, 3hle:A, 3hlg:A
29 2pyu:A 208 13 0.0978 0.0433 0.6923 1.9 2q16:A, 2q16:B
30 8aq2:A 520 12 0.1087 0.0192 0.8333 2.0
31 4izt:A 263 17 0.1304 0.0456 0.7059 2.2 4izs:A, 4izu:A, 4izv:A, 4izw:A, 5ny7:A, 5nyb:A, 5nyc:A, 5nye:A
32 5ejw:A 80 11 0.0978 0.1125 0.8182 2.5 5epj:A, 2kvm:A, 2l12:A, 2l1b:A, 4mn3:A, 8sii:A, 8sii:B, 6v2r:A, 4x3k:A, 4x3k:B, 4x3s:B, 4x3s:A, 4x3t:A, 4x3t:B, 4x3t:C, 4x3t:D, 4x3t:E, 4x3t:F, 4x3u:A, 4x3u:B
33 5gv2:C 307 13 0.1087 0.0326 0.7692 2.8 5gs9:B, 5gs9:C, 5gs9:D, 5gt7:B, 5gv2:A, 5i2c:B, 5i2c:C, 5i2c:D
34 2liw:A 99 9 0.0978 0.0909 1.0000 3.0
35 2imc:B 405 12 0.0978 0.0222 0.7500 3.1 3dse:A, 4hev:A, 4hev:B, 2ima:A, 2ima:B, 2imb:A, 2imb:B, 2imc:A, 7ky2:A, 7ky2:B, 7kyh:A, 7kyh:B, 7kyh:C, 7kyh:D, 7n18:A, 7n18:B, 3nf3:A, 3qix:A, 3qix:B, 3qiy:A, 3qiz:A, 3qj0:A, 5v8p:A, 5v8p:B, 5v8r:A, 5v8r:B, 5v8u:A, 5v8u:B
36 2pzm:A 316 12 0.0978 0.0285 0.7500 3.4 2pzk:A, 2pzk:B, 2pzl:A, 2pzl:B, 2pzm:B
37 3w6z:A 296 11 0.0978 0.0304 0.8182 3.9 3w6u:A, 3ws7:A, 5xvh:A
38 5utm:A 345 15 0.1087 0.0290 0.6667 4.1 5jy6:A, 5jy6:B, 5jy6:C, 5jy6:D, 5jya:A, 5jya:B, 5jya:C, 5jya:D, 5jye:A, 5jye:C, 4qx6:A, 4qx6:B, 4qx6:C, 4qx6:D, 5utl:A, 5utl:B, 5utl:C, 5utl:D, 5utm:B, 5utm:C, 5utm:D, 5v8x:A, 5v8x:B, 5v8x:C, 5v8x:D, 5y37:A, 5y37:B
39 4c3k:D 101 86 0.2609 0.2376 0.2791 4.3 4c3k:A, 4c3k:E, 8wm7:F, 2xzw:E
40 4pqh:A 214 49 0.1630 0.0701 0.3061 4.4 4pqh:B
41 3a15:B 362 14 0.1087 0.0276 0.7143 4.5 3a15:A, 3a15:C, 3a15:D, 3a16:A, 3a16:B, 3a16:C, 3a16:D, 3a17:A, 3a17:B, 3a17:C, 3a17:D, 3a17:E, 3a17:F, 3a17:G, 3a17:H, 3a18:A, 3a18:B, 3a18:C, 3a18:D
42 7y5f:B 341 15 0.1196 0.0323 0.7333 4.7 7vgn:A, 7y5f:A, 7y5i:A, 7y5i:B, 7y5p:A, 7y5p:B, 7yhe:A, 7yhe:B, 7yw9:A
43 4bkq:A 415 14 0.1304 0.0289 0.8571 4.8 4bkr:A, 5g2o:A, 5jai:A, 5jam:A, 5jaq:A, 3zu2:A, 3zu3:A, 3zu4:A, 3zu5:A
44 4c20:B 605 12 0.1087 0.0165 0.8333 5.4 4c20:A, 4c21:A, 4c21:B, 4c22:A, 4c22:B
45 2x7m:A 180 12 0.0978 0.0500 0.7500 5.5
46 6ihr:A 257 10 0.0978 0.0350 0.9000 5.7 5f1m:A, 6ihl:A, 6ihs:A, 6iht:A, 6ihw:A
47 3ll3:A 492 33 0.1196 0.0224 0.3333 5.8 3ll3:B
48 4zgn:A 279 12 0.0978 0.0323 0.7500 5.8 4zgp:A
49 2yck:X 272 13 0.1087 0.0368 0.7692 5.8 2yci:X, 2ycj:A
50 8of1:A 505 15 0.0978 0.0178 0.6000 6.0 8of1:B, 8ofm:A, 8ofm:B
51 4d8f:B 334 10 0.0978 0.0269 0.9000 6.1 2ani:A, 4d8f:A, 4d8f:C, 4d8f:D, 4d8g:A, 4d8g:B, 4d8g:C, 4d8g:D, 4m1i:A, 4m1i:B, 4m1i:C, 4m1i:D, 1syy:A
52 5zcm:A 329 12 0.1087 0.0304 0.8333 6.2
53 7yx0:A 166 9 0.0978 0.0542 1.0000 6.5 7yx0:C
54 3w2z:A 178 9 0.0978 0.0506 1.0000 6.5 5zoh:A
55 2czr:A 226 9 0.0978 0.0398 1.0000 6.9
56 8k56:B 281 10 0.0978 0.0320 0.9000 7.0 8k56:A
57 8vhe:B 421 14 0.1087 0.0238 0.7143 7.0 6adg:A, 6adg:B, 6b0z:A, 6b0z:C, 6b0z:B, 6b0z:D, 8bay:A, 8bay:B, 8bay:C, 6bkx:C, 6bkx:B, 6bkx:A, 6bky:D, 6bky:C, 6bky:E, 6bky:A, 6bky:B, 6bky:F, 6bkz:A, 6bkz:B, 6bl0:A, 6bl0:B, 6bl0:C, 6bl1:B, 6bl1:A, 6bl1:C, 6bl2:C, 6bl2:A, 6bl2:B, 5de1:A, 5de1:B, 8hb9:AAA, 8hb9:BBB, 8hb9:CCC, 8hb9:DDD, 3inm:A, 3inm:B, 3inm:C, 6io0:A, 6io0:B, 5k10:A, 5k10:B, 5k11:A, 5k11:B, 8kib:A, 8kib:B, 8kib:C, 8kib:D, 4kzo:A, 4kzo:B, 4kzo:C, 4l03:A, 4l03:B, 4l03:C, 4l04:A, 4l04:B, 4l04:C, 4l04:D, 4l04:E, 4l04:F, 4l06:A, 4l06:B, 4l06:C, 4l06:D, 4l06:E, 4l06:F, 5l57:A, 5lge:A, 5lge:B, 5lge:C, 5lge:D, 3map:A, 3map:B, 3mar:B, 3mas:A, 3mas:B, 6o2y:A, 6o2y:B, 6o2y:C, 6o2z:A, 6o2z:B, 6pay:A, 6pay:D, 6pay:C, 7pjm:A, 7pjm:B, 7pjm:C, 7pjn:A, 7pjn:B, 7pjn:C, 7pjn:D, 6q6f:A, 6q6f:B, 5svf:A, 5svf:C, 5svf:B, 5svf:D, 1t09:A, 1t09:B, 1t0l:A, 1t0l:B, 1t0l:C, 1t0l:D, 8t7d:A, 8t7n:A, 8t7n:B, 8t7o:A, 8t7o:B, 5tqh:A, 5tqh:B, 5tqh:C, 5tqh:D, 6u4j:A, 6u4j:B, 4umx:A, 4umx:B, 6vei:A, 6vei:B, 6vg0:A, 6vg0:B, 6vg0:C, 8vh9:A, 8vh9:B, 8vha:A, 8vha:B, 8vha:C, 8vha:D, 8vhb:A, 8vhb:B, 8vhb:C, 8vhb:D, 8vhc:A, 8vhc:B, 8vhd:A, 8vhd:B, 8vhd:C, 8vhd:D, 8vhe:A, 8vhe:C, 8vhe:D, 8w49:A, 8w49:B, 8w49:C, 8w49:D, 5yfm:A, 5yfm:B, 5yfm:C, 5yfn:A, 5yzh:A, 5yzh:B, 5yzi:A, 5yzi:B
58 1wwr:C 160 9 0.0978 0.0563 1.0000 7.0 1wwr:A, 1wwr:B, 1wwr:D
59 5ejl:A 235 41 0.1630 0.0638 0.3659 7.1 5kgo:D, 5kgo:A
60 2xjp:A 258 10 0.0978 0.0349 0.9000 7.4 4lhn:A, 2xjr:A, 2xjs:A, 2xjt:A, 2xju:A, 2xjv:A
61 5m8i:A 114 10 0.0978 0.0789 0.9000 7.5
62 5lbp:A 196 9 0.0978 0.0459 1.0000 7.7 5l9k:A, 5l9k:B, 5l9q:A, 5l9q:B, 5lau:A
63 7rm7:A 222 9 0.0978 0.0405 1.0000 7.8 7rzk:A, 7snb:A, 7uq1:A
64 7e3w:B 239 38 0.1304 0.0502 0.3158 7.9 7e3v:A, 7e3v:B, 7e3v:C, 7e3v:D, 7e3v:E, 7e3v:F, 7e3w:A, 7e3w:C, 7e3w:D, 7e3w:E, 7e3w:F
65 7cu1:A 535 16 0.1196 0.0206 0.6875 8.3 8ad7:A, 8ad8:A, 7aqu:A, 7aqu:B, 7cu0:A, 7cu0:B, 7cu1:B, 7cu2:A, 7cu2:B, 6h44:A, 6h44:B, 6sls:A, 6sls:B, 6slt:A, 6slt:B
66 4gmg:A 358 61 0.2065 0.0531 0.3115 8.4 4gmg:B, 4gmg:C, 4gmg:D, 5kvq:A, 5kvq:B, 5kvs:A, 5kvs:B
67 2jg1:A 318 15 0.0978 0.0283 0.6000 8.4 2jg1:B, 2jg1:C, 2jg1:D, 2jgv:B, 2jgv:D
68 8h0m:A 392 16 0.1087 0.0255 0.6250 8.9 8gqr:A, 8gqr:B
69 3tmb:B 318 12 0.0978 0.0283 0.7500 9.2 3tm8:A, 3tm8:B, 3tmb:A, 3tmc:A, 3tmc:B, 3tmd:A
70 5lou:B 301 9 0.0978 0.0299 1.0000 9.2 5lor:A, 5lou:A, 5r50:A, 5r51:A, 5r52:A, 5r53:A, 5r54:A, 5r55:A, 5r56:A, 5r57:A, 5r58:A, 5r59:A, 5r5a:A, 5r5b:A, 5r5c:A, 5r5d:A, 5r5e:A, 5r5f:A, 5r5g:A, 5r5h:A, 5r5i:A, 5r5j:A, 5r5k:A, 5r5l:A, 5r5m:A, 5r5n:A, 5r5o:A, 5r5p:A, 5r5q:A, 5r5r:A, 5r5s:A
71 3r4c:A 268 13 0.0978 0.0336 0.6923 9.3
72 3wnb:A 361 21 0.1304 0.0332 0.5714 9.4 3wnc:A
73 8irk:A 379 11 0.0978 0.0237 0.8182 9.5 8irk:B, 8irk:C, 8irk:D, 8iry:A, 8iry:B, 8iry:C, 8iry:D, 8irz:A, 8irz:B, 8is0:A, 8is0:B
74 8a0n:B 212 24 0.1304 0.0566 0.5000 9.5 8a0z:B, 8a0z:A, 8crh:B, 8crh:A
75 3vtf:A 432 9 0.0978 0.0208 1.0000 9.6
76 4ie6:A 447 9 0.0978 0.0201 1.0000 9.6 6aej:A, 6ak4:A, 6akw:A, 7ckk:A, 4cxw:A, 4cxx:A, 4cxy:A, 5dab:A, 7e8z:A, 5f8p:A, 4ie0:A, 4ie4:A, 4ie5:A, 4ie7:A, 8it9:A, 3lfm:A, 4qho:A, 4qkn:A, 7wcv:A, 4zs2:A, 4zs3:A
77 3sur:A 504 9 0.0978 0.0179 1.0000 9.7 3sus:A, 3sut:A, 3suu:A, 3suv:A, 3suw:A
78 5m1i:A 539 9 0.0978 0.0167 1.0000 9.8 6gta:A, 6gvd:A, 6gwf:A, 6gwg:A, 6gx8:A, 5m0x:A, 5m12:A, 5m16:A
79 4trb:B 209 21 0.1196 0.0526 0.5238 9.8 4trc:A, 4trc:B, 4ts5:A, 4ts5:B, 4ts7:A, 4ts7:B
80 5bxp:A 636 9 0.0978 0.0142 1.0000 9.9 5bxp:B, 5bxr:A, 5bxr:B, 5bxs:A, 5bxs:B, 5bxt:A, 5bxt:B, 4h04:A, 4h04:B, 4jaw:A, 4jaw:B
81 5cio:A 770 9 0.0978 0.0117 1.0000 10.0 5cio:B
82 5faw:B 806 9 0.0978 0.0112 1.0000 10.0 5fau:A, 5fau:B, 5fau:C, 5fau:D, 5faw:A, 5fay:A, 5fay:B, 6nd3:A, 6nd3:B, 6nd3:C, 6nd3:D, 6nd3:E, 6nd3:F, 6nd3:G, 6nd3:H, 6vue:A, 6vue:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417