BioLiP

>protein
GLRIRRPMNAFMVWAKDERKRLAQQNPDLHNAVLSKMLGKAWKELNTAEKRPFVEEAERLRVQHLRDHPNYKYRPR

The query sequence (length=76) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4y60:C	76	76	1.0000	1.0000	1.0000	2.55e-52
2	6l6y:D	80	74	0.8684	0.8250	0.8919	2.33e-45	4a3n:A, 3f27:D, 6l6y:F
3	4s2q:D	76	73	0.6842	0.6842	0.7123	3.33e-34	4euw:A
4	6t78:A	77	73	0.6053	0.5974	0.6301	9.97e-32	6t78:B, 3u2b:C
5	1gt0:D	79	74	0.5658	0.5443	0.5811	1.34e-31	8bx1:E, 8bx2:E, 6ht5:D, 1o4x:B, 6t90:L, 6yov:L
6	2gzk:A	159	72	0.4868	0.2327	0.5139	1.89e-23	9bvd:C, 9bvd:F, 9bvd:I, 6cil:N, 6edb:B, 1hry:A, 1hrz:A, 1j46:A, 1j47:A, 6oem:N, 6oem:H, 6oen:N, 6oen:H, 6oeo:N, 6oer:H
7	2gzk:A	159	68	0.2237	0.1069	0.2500	0.007	9bvd:C, 9bvd:F, 9bvd:I, 6cil:N, 6edb:B, 1hry:A, 1hrz:A, 1j46:A, 1j47:A, 6oem:N, 6oem:H, 6oen:N, 6oen:H, 6oeo:N, 6oer:H
8	7m5w:A	138	70	0.3553	0.1957	0.3857	1.26e-12	6jrp:A, 6jrp:D, 6jrp:G, 6jrp:J
9	2lef:A	86	73	0.2632	0.2326	0.2740	1.36e-07
10	5jh0:D	157	60	0.2237	0.1083	0.2833	1.75e-06	5jgh:A, 5jgh:D, 5jgh:G, 5jgh:J, 5jh0:A
11	5jh0:D	157	55	0.1842	0.0892	0.2545	0.001	5jgh:A, 5jgh:D, 5jgh:G, 5jgh:J, 5jh0:A
12	1j5n:A	93	54	0.2368	0.1935	0.3333	3.27e-06
13	6cik:N	90	49	0.1974	0.1667	0.3061	0.001	6cg0:N, 6cim:N
14	6cij:N	133	49	0.2105	0.1203	0.3265	0.002	5zdz:N, 5ze1:N, 5ze2:N
15	1e7j:A	74	41	0.1447	0.1486	0.2683	0.010	3nm9:D, 3nm9:G, 3nm9:J, 3nm9:P, 3nm9:M, 3nm9:A, 1qrv:A, 1qrv:B, 8r1x:A
16	6hb4:A	197	49	0.1447	0.0558	0.2245	0.15	6erp:C, 6erp:G, 6erq:C, 6erq:G, 6hb4:D, 6hb4:G, 6hb4:J, 6hc3:A, 6hc3:D, 6hc3:G, 6hc3:J, 7lbw:A, 7lbw:B, 7lbx:A, 7lbx:B, 4nnu:A, 4nnu:B, 4nod:A, 4nod:B, 4nod:G, 4nod:H, 3tmm:A, 3tq6:A, 3tq6:B
17	1e6z:B	498	39	0.1842	0.0281	0.3590	0.33	7c34:A, 7c34:B, 7c92:A, 7c92:B, 7cb1:A, 7cb1:B, 1e6r:A, 1e6r:B, 1e6z:A, 1h0g:B, 1h0g:A, 1h0i:A, 1h0i:B, 6jk9:A, 6jk9:B, 6jkf:A, 6jkf:B, 1o6i:A, 1o6i:B, 1ogg:A, 1ogg:B, 1ur8:A, 1ur8:B, 1ur9:A, 1ur9:B, 1w1p:A, 1w1p:B, 1w1t:A, 1w1t:B, 1w1v:A, 1w1v:B, 1w1y:A, 1w1y:B, 3wd1:A, 3wd2:A, 3wd3:A, 3wd4:A, 4z2g:A, 4z2h:A, 4z2i:A, 4z2j:A, 4z2k:A, 4z2l:A
18	6zm7:CE	124	38	0.1711	0.1048	0.3421	1.7	8k2c:CE, 8xsy:CE, 6z6l:CE, 6zme:CE
19	7bzc:A	535	30	0.1711	0.0243	0.4333	2.6	7bzb:A
20	3en1:A	424	54	0.1842	0.0330	0.2593	2.7	3eqq:A
21	5vsu:A	387	59	0.2632	0.0517	0.3390	5.8	6aso:A, 2kh9:A, 4n0t:A, 5tf6:A, 5tf6:C
22	8h2w:B	984	47	0.1974	0.0152	0.3191	6.4	8h2w:A, 5nz8:B

[Back]