BioLiP

>protein
GLPSGWEERKDAKGRTYYVNHNNRTTTWTRPIMQL

The query sequence (length=35) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7lp2:E	37	32	0.9143	0.8649	1.0000	7.52e-19	2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
2	2n8t:A	39	34	0.6286	0.5641	0.6471	2.58e-14
3	7lp3:A	37	32	0.6571	0.6216	0.7188	7.23e-12	7lp3:C
4	5dws:C	40	33	0.5429	0.4750	0.5758	3.11e-09
5	5cq2:A	76	33	0.5429	0.2500	0.5758	8.38e-09	5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
6	5cq2:A	76	30	0.4571	0.2105	0.5333	3.29e-05	5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
7	2djy:A	42	30	0.5429	0.4524	0.6333	1.00e-08
8	2lb1:A	35	30	0.5143	0.5143	0.6000	1.67e-08	2ltx:A
9	6jjy:A	128	30	0.4857	0.1328	0.5667	2.74e-08	6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
10	6jjy:A	128	33	0.4000	0.1094	0.4242	0.003	6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
11	2kxq:A	90	30	0.5429	0.2111	0.6333	3.13e-08	2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
12	2kxq:A	90	30	0.2857	0.1111	0.3333	0.082	2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
13	1i5h:W	50	33	0.4857	0.3400	0.5152	3.17e-08
14	2m3o:W	43	34	0.4286	0.3488	0.4412	1.44e-07	2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
15	2ltv:A	36	30	0.4286	0.4167	0.5000	3.38e-07	2law:A
16	4lcd:A	419	30	0.4857	0.0406	0.5667	8.40e-07	4lcd:B
17	2laj:A	40	34	0.4286	0.3750	0.4412	1.35e-06
18	1jmq:A	46	30	0.4286	0.3261	0.5000	2.94e-06	1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
19	2jmf:A	43	30	0.4286	0.3488	0.5000	2.72e-05
20	2nc3:A	33	30	0.4000	0.4242	0.4667	9.32e-05	2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
21	6jjz:B	96	30	0.3714	0.1354	0.4333	9.85e-05	6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
22	6jjz:B	96	33	0.4286	0.1562	0.4545	1.50e-04	6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
23	8sg2:A	163	31	0.4286	0.0920	0.4839	2.72e-04	6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
24	2ez5:W	46	30	0.3429	0.2609	0.4000	0.001
25	8pxx:A	99	31	0.4000	0.1414	0.4516	0.001	2dyf:A
26	8pxx:A	99	26	0.2571	0.0909	0.3462	0.36	2dyf:A
27	2jup:W	37	28	0.3714	0.3514	0.4643	0.005	2rly:W, 2rm0:W
28	1eg4:A	260	28	0.3143	0.0423	0.3929	0.020
29	2oei:A	37	30	0.3714	0.3514	0.4333	1.0	2ho2:A
30	3oa8:B	180	35	0.3714	0.0722	0.3714	2.2	3oa8:D, 3oa8:F, 3ocd:B, 3ocd:D
31	4oge:A	977	21	0.2857	0.0102	0.4762	2.9	4ogc:A
32	1rm6:A	761	34	0.3714	0.0171	0.3824	3.5	1rm6:D, 1sb3:A, 1sb3:D
33	3sy9:B	372	16	0.2000	0.0188	0.4375	4.6	3sy9:A, 3sy9:C, 3sy9:D
34	6m1y:A	938	26	0.2286	0.0085	0.3077	6.2	6m1y:B, 6m22:A, 6m22:B
35	4qbb:A	159	25	0.2286	0.0503	0.3200	8.2	4qbb:B, 4qbb:C

[Back]