Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GKKNPPQIYPWMKRVQRTSYTRYQTLELEKEFHFNRYLTRRRRIEIAHALSLTERQIKIWFQNRRMKWKKEHK

The query sequence (length=73) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2r5z:A 75 75 0.9863 0.9600 0.9600 4.87e-46 9ant:A, 9ant:B, 5jlw:A, 5jlw:D, 5jlx:A, 5jlx:D, 2r5y:A, 4xic:A, 4xic:D, 4xid:A, 4xid:D
2 1ahd:P 68 62 0.7534 0.8088 0.8871 4.09e-34
3 4cyc:A 66 64 0.7123 0.7879 0.8125 2.36e-30 1b8i:A
4 4uus:A 67 55 0.6712 0.7313 0.8909 2.75e-29 4uus:E
5 2h1k:B 60 56 0.5616 0.6833 0.7321 1.05e-23 2h1k:A
6 1b72:A 68 65 0.5616 0.6029 0.6308 1.35e-22
7 1puf:A 77 60 0.5753 0.5455 0.7000 1.55e-22 2lp0:A
8 2me6:A 71 57 0.4795 0.4930 0.6140 3.14e-19
9 5zjr:A 64 57 0.4932 0.5625 0.6316 4.21e-19 5zjq:A, 5zjs:A, 5zjt:A, 5zjt:E
10 8eml:A 58 55 0.4932 0.6207 0.6545 6.36e-19 8eml:B
11 6es3:K 72 57 0.4795 0.4861 0.6140 9.44e-19 6es2:K, 6es2:L, 6es3:M, 5lty:K, 5lty:M, 5lux:K, 5lux:L, 7q3o:K, 7q3o:C, 7q3o:E, 7q3o:G, 7q4n:K, 7q4n:C
12 3a01:A 78 62 0.3973 0.3718 0.4677 4.92e-15 3a01:E
13 1jgg:A 57 55 0.4110 0.5263 0.5455 6.74e-14 1jgg:B
14 5eea:G 63 57 0.3973 0.4603 0.5088 1.26e-13 8byx:B, 8byx:J, 8byx:A, 8byx:K, 8byx:G, 8byx:L, 5edn:A, 5edn:B, 5edn:G, 5edn:J, 5eea:B, 5eea:A, 5eea:J, 5ef6:A, 5ef6:J, 5ef6:B, 5ef6:G, 5eg0:B, 5ego:B, 5no6:A, 5no6:B, 7psx:A, 7psx:B, 7psx:G, 7psx:J
15 8pna:A 67 58 0.3425 0.3731 0.4310 4.14e-13 8pm5:A, 8pm5:D, 8pm5:G, 8pm5:M, 8pm5:J, 8pm7:A, 8pm7:C, 8pm7:E, 8pm7:G, 8pmc:A, 8pmc:C, 8pmc:E, 8pmc:G, 8pmf:A, 8pmn:A, 8pmv:A, 8pmv:D, 8pmv:G, 8pmv:J, 8pn4:A, 8pn4:D, 8pn4:G, 8pn4:M, 8pn4:J, 8pnc:A, 8pnc:K, 8pnc:E, 8pnc:H
16 6m3d:C 108 70 0.4384 0.2963 0.4571 9.61e-13 1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
17 6m3d:C 108 48 0.3288 0.2222 0.5000 2.28e-10 1du0:A, 1du0:B, 1hdd:C, 1hdd:D, 2hdd:A, 2hdd:B, 3hdd:A, 3hdd:B, 2hos:A, 2hos:B, 2hot:A, 2hot:B
18 2ld5:A 67 57 0.3699 0.4030 0.4737 1.52e-12
19 1ig7:A 58 54 0.3836 0.4828 0.5185 2.98e-12
20 4rdu:D 62 57 0.3562 0.4194 0.4561 4.10e-11 4rdu:A, 4xrs:I, 4xrs:G
21 3a01:F 61 57 0.3699 0.4426 0.4737 4.23e-11 3a01:B, 3lnq:A
22 2lkx:A 68 58 0.3836 0.4118 0.4828 3.05e-10
23 1nk2:P 77 61 0.3836 0.3636 0.4590 8.05e-10 1nk3:P
24 4qtr:C 57 54 0.3562 0.4561 0.4815 9.60e-10 4qtr:A, 4qtr:B, 4qtr:D
25 3rkq:A 58 53 0.3425 0.4310 0.4717 1.06e-09 3rkq:B
26 8osb:E 62 54 0.3425 0.4032 0.4630 1.96e-09
27 1zq3:P 68 53 0.3288 0.3529 0.4528 3.67e-09
28 5flv:M 229 52 0.3288 0.1048 0.4615 1.55e-08 5flv:A, 5flv:E, 5flv:I, 4s0h:A, 4s0h:B, 4s0h:E, 4s0h:F, 6wc2:N, 6wc2:M, 6wc2:O, 6wc5:I, 6wc5:N, 2x6u:A, 2x6v:A, 2x6v:B
29 1fjl:A 65 60 0.3288 0.3692 0.4000 5.47e-08 1fjl:B, 1fjl:C
30 3cmy:A 60 59 0.3151 0.3833 0.3898 2.60e-07
31 6e8c:A 135 67 0.3425 0.1852 0.3731 9.12e-07 6a8r:A, 6a8r:B, 6dfy:C, 6dfy:D, 7dw5:A, 7dw5:B, 6u81:A, 6u82:A, 6u82:D, 5z2t:C, 5z2t:D, 5z6z:A, 5zfw:A, 5zfy:A, 5zfz:A
32 6e8c:A 135 54 0.2329 0.1259 0.3148 0.003 6a8r:A, 6a8r:B, 6dfy:C, 6dfy:D, 7dw5:A, 7dw5:B, 6u81:A, 6u82:A, 6u82:D, 5z2t:C, 5z2t:D, 5z6z:A, 5zfw:A, 5zfy:A, 5zfz:A
33 4rbo:A 55 53 0.2603 0.3455 0.3585 2.43e-06 4rbo:D
34 9b8u:B 66 51 0.2603 0.2879 0.3725 1.40e-04 9b8u:A, 9b8u:C, 9b8u:D
35 8ejo:A 56 54 0.2466 0.3214 0.3333 0.003 8ejo:B, 8ejp:A, 8ejp:B
36 1le8:A 53 42 0.1918 0.2642 0.3333 0.005 1akh:A, 1yrn:A
37 8ik5:C 67 54 0.2466 0.2687 0.3333 0.006 8ike:C, 8ilw:C
38 1gt0:C 137 58 0.2877 0.1533 0.3621 0.007 1cqt:A, 1cqt:B, 1e3o:C, 1hf0:A, 1hf0:B, 1o4x:A, 1oct:C
39 4egc:A 539 40 0.2055 0.0278 0.3750 0.009
40 3d1n:I 150 60 0.2740 0.1333 0.3333 0.012 3d1n:K, 3d1n:J, 3d1n:L, 3d1n:M, 3d1n:N, 3d1n:O, 3d1n:P
41 5hod:A 61 54 0.2329 0.2787 0.3148 0.041 5hod:D
42 1lfu:P 82 63 0.2466 0.2195 0.2857 0.065 1b72:B, 1b8i:B, 4cyc:B, 1puf:B, 2r5y:B, 2r5z:B, 4uus:B, 4uus:F, 5zjq:B, 5zjr:B, 5zjs:B, 5zjt:B
43 3l1p:A 147 25 0.1507 0.0748 0.4400 0.61 8bx2:A, 6ht5:E, 3l1p:B, 8sps:L, 8spu:L, 6t90:K, 7u0g:M, 7u0g:L, 7u0i:L, 7u0i:M
44 8bx1:A 127 24 0.1507 0.0866 0.4583 0.79
45 8g8e:X 140 25 0.1507 0.0786 0.4400 0.98 8g87:X, 8g88:X, 8g8b:X, 8g8g:X, 8sps:M, 7u0g:K
46 7alp:U 1935 41 0.1918 0.0072 0.3415 1.1
47 8r6y:A 1991 41 0.1918 0.0070 0.3415 1.1 8as7:A, 8r6w:A, 6xya:B
48 3rrw:A 255 20 0.1233 0.0353 0.4500 1.6 3rrw:B
49 5wc9:A 136 69 0.1781 0.0956 0.1884 2.1 1au7:A, 1au7:B, 5wc9:B, 5wc9:E, 5wc9:F
50 6m4k:A 496 29 0.1644 0.0242 0.4138 2.2 6m4l:A, 6m4m:A
51 7xrc:C 134 25 0.1370 0.0746 0.4000 2.4 2xsd:C
52 3j1o:J 159 41 0.2192 0.1006 0.3902 2.9 3rj1:J, 3rj1:Q, 7ui9:h, 7uif:h, 7uig:h, 7uio:Ah, 7uio:Bh
53 8asd:A 1826 49 0.2603 0.0104 0.3878 3.2
54 8asb:A 1715 49 0.2603 0.0111 0.3878 3.2 8as6:A, 8asg:A, 8r6u:A
55 3db1:A 267 36 0.1918 0.0524 0.3889 4.6 3d6a:A, 3db1:C, 3db1:D
56 8a1l:A 354 13 0.0822 0.0169 0.4615 4.7 7a0z:A, 7a0z:B, 7a10:A, 7a10:B, 7a11:A, 7a1e:A, 8a1j:A, 8a1j:B, 8a1k:A, 8a1k:B, 8a1l:B, 8a1m:A, 8a1m:B, 8a1n:A, 8a1o:A, 8bk3:A, 6boi:A, 6boi:B, 5dc2:A, 5dc2:B, 5dcc:A, 5dcc:B, 5duj:A, 5duj:B, 5dvp:A, 5dvp:B, 5dzj:A, 5dzj:B, 5dzp:A, 5e1g:A, 5e1i:A, 7f71:A, 7f71:B, 7f8p:A, 4gsq:A, 4gsr:A, 4gsu:A, 4gsu:B, 6iyv:B, 6iyv:A, 6iyw:A, 6iyw:B, 6iyw:C, 6iyw:D, 6iyw:E, 6iyw:F, 5k69:A, 5k69:B, 7kem:A, 7kem:B, 5lb1:A, 5lb1:B, 5lbg:B, 6lqb:A, 6lqb:B, 8pxy:A, 8pxz:A, 4qr7:A, 4qrb:A, 4qtf:A, 6rrm:A, 6rrm:B, 3tur:A, 3tur:B, 3vyp:A, 3vyp:B
57 4rzq:A 422 71 0.2740 0.0474 0.2817 5.7 4mv6:A, 4mv7:A, 4mv9:A
58 3f98:A 377 34 0.1781 0.0345 0.3824 6.8 3f97:A, 3f97:B, 3f98:B, 3f98:C, 3f9c:A, 3f9c:B, 5i8p:A, 5i8p:B, 5i9i:A, 5i9i:B, 5jad:A, 5jah:A, 5jal:A, 5jan:A, 5jao:A, 5jap:A, 5jar:A, 5jas:A, 5jat:A, 5jau:A, 5lp1:A, 5lyy:A, 5lz2:A, 5lz4:A, 5lz5:A, 5lz7:A, 5lz8:A, 5lz9:A, 6m06:A, 6m06:B, 6m07:A, 6m07:B, 6m08:B, 5ye7:B, 5ye7:A, 5ye8:B, 5ye8:A, 5ye9:A, 5ye9:B, 5yea:A, 5yea:B
59 6ajf:A 901 27 0.1096 0.0089 0.2963 7.6 6ajg:A, 6ajh:A, 6ajj:A, 7c2m:A, 7c2n:A, 6or2:A, 7wnx:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417