Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GKKFDSSRDRNKPFKFMLGKQEVIRGWEEGVAQMSVGQRAKLTISPDYAYGATGHPGIIPPHATLVFDVELLKLE

The query sequence (length=75) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8xi9:A 201 75 1.0000 0.3731 1.0000 7.03e-51 1a7x:A, 1a7x:B, 1bkf:A, 1bl4:A, 1bl4:B, 8chi:A, 8chi:B, 8chj:A, 8chj:B, 8chj:C, 8chj:D, 8chk:A, 8chk:B, 8chk:C, 8chl:A, 8chl:B, 8chm:A, 1d7i:A, 1d7i:B, 1d7j:A, 1d7j:B, 2dg3:A, 2dg4:A, 2dg9:A, 4dh0:A, 8er6:A, 8er6:C, 8er6:E, 8er7:A, 8er7:C, 8er7:E, 8era:B, 1f40:A, 1fap:A, 2fap:A, 3fap:A, 4fap:A, 1fkb:A, 1fkd:A, 1fkf:A, 1fkg:A, 1fkh:A, 1fki:A, 1fki:B, 1fkj:A, 1fkl:A, 2fke:A, 1j4h:A, 1j4i:A, 1j4r:A, 1j4r:B, 1j4r:D, 6m4u:A, 6m4u:E, 6m4v:B, 6m4v:D, 6m4w:D, 6m4w:E, 6m4w:F, 1nsg:A, 6oqa:A, 6oqa:B, 6oqa:E, 6oqa:F, 8pdf:A, 8ppz:A, 1qpf:A, 1qpf:D, 1qpl:A, 1qpl:C, 1tco:C, 7u0t:B, 7u8d:A, 7u8d:B, 6vcu:A, 6vcu:C, 6vcu:D, 6vcu:B, 6yf0:A, 6yf1:A, 6yf2:A, 6yf3:A
2 1c9h:A 107 75 0.8267 0.5794 0.8267 8.23e-44 5hkg:A
3 6tz8:C 111 75 0.6000 0.4054 0.6000 4.64e-30 6tz8:F
4 7u0s:A 124 75 0.6000 0.3629 0.6000 5.56e-30 5hwc:A, 6tz7:C, 7u0s:B, 7u0u:B, 6vcv:A, 6vcv:B
5 6vrx:A 108 75 0.5867 0.4074 0.5867 9.68e-30 6vct:A, 6vrx:B, 6vrx:C, 6vrx:D
6 5hua:A 113 75 0.5733 0.3805 0.5733 4.55e-28 1yat:A
7 8p3c:B 126 74 0.6000 0.3571 0.6081 2.37e-27
8 5b8i:C 119 71 0.5867 0.3697 0.6197 3.66e-26
9 4giv:A 192 74 0.5867 0.2292 0.5946 3.35e-25 4dz2:A, 4dz2:B, 4dz3:A, 4dz3:B, 4fn2:A, 4fn2:B, 4g50:A, 4g50:B, 4ggq:C, 4ggq:A, 4ggq:B, 4ggq:D, 4giv:B, 5klx:A, 5klx:B, 5klx:D, 5klx:C, 2ko7:A, 2l2s:A, 6o49:A, 6o49:B, 6o4a:A, 6o4a:B, 6o4a:C, 6o4a:D, 3uf8:A, 3uqa:A, 3uqb:A, 5v8t:A, 5v8t:B, 3vaw:A
10 6mke:A 117 72 0.5467 0.3504 0.5694 7.89e-25 6mke:B, 6mke:C, 6mke:D
11 4lax:A 237 74 0.5333 0.1688 0.5405 1.64e-22 4drj:A, 4lay:A, 6rcy:A, 4tw8:A, 4tw8:B
12 4lax:A 237 69 0.2533 0.0802 0.2754 0.001 4drj:A, 4lay:A, 6rcy:A, 4tw8:A, 4tw8:B
13 8z38:B 113 71 0.5067 0.3363 0.5352 2.73e-21 8z38:A
14 5njx:A 413 72 0.5333 0.0969 0.5556 2.74e-21 7a6w:AAA, 7a6w:BBB, 7a6x:AAA, 7aot:A, 7aou:A, 7apq:A, 7aps:A, 7aps:B, 7apt:A, 7apw:A, 7awf:A, 7awx:A, 7awx:B, 7b9y:A, 7b9z:A, 7ba0:A, 8ba6:A, 8baj:A, 5bxj:A, 8cca:A, 8ccb:A, 8ccc:A, 8ccd:A, 8cce:A, 8ccf:A, 8ccg:A, 8cch:A, 8chn:A, 8chp:A, 8chq:A, 8chr:A, 5dit:A, 5diu:A, 5div:A, 4drh:A, 4drh:D, 4dri:A, 4drk:A, 4drk:B, 4drm:A, 4drn:A, 4dro:A, 4drp:A, 4drq:A, 7ett:A, 7etu:A, 7etv:A, 9eu6:A, 9eu7:A, 9eu7:B, 9eu8:A, 9eu8:B, 9eu9:A, 9eu9:B, 9eua:A, 9eua:B, 9eub:A, 9eub:B, 9euc:A, 9euc:B, 9eud:A, 9eud:B, 9eue:A, 9eue:B, 9ey3:A, 9ey4:A, 4jfi:A, 4jfj:A, 4jfk:A, 4jfl:A, 4jfm:A, 3o5f:A, 3o5r:A, 5obk:A, 8pc2:G, 8pc2:H, 8pj8:A, 8pja:A, 7r0l:A, 8r5k:A, 6saf:A, 4tw6:A, 4tw7:A, 4tx0:A, 6tx4:A, 6tx5:A, 6tx6:A, 6tx7:A, 6tx9:A, 6txx:A, 4w9o:A, 4w9o:E, 4w9p:A, 4w9p:E, 4w9q:A
15 5njx:A 413 51 0.2000 0.0363 0.2941 0.028 7a6w:AAA, 7a6w:BBB, 7a6x:AAA, 7aot:A, 7aou:A, 7apq:A, 7aps:A, 7aps:B, 7apt:A, 7apw:A, 7awf:A, 7awx:A, 7awx:B, 7b9y:A, 7b9z:A, 7ba0:A, 8ba6:A, 8baj:A, 5bxj:A, 8cca:A, 8ccb:A, 8ccc:A, 8ccd:A, 8cce:A, 8ccf:A, 8ccg:A, 8cch:A, 8chn:A, 8chp:A, 8chq:A, 8chr:A, 5dit:A, 5diu:A, 5div:A, 4drh:A, 4drh:D, 4dri:A, 4drk:A, 4drk:B, 4drm:A, 4drn:A, 4dro:A, 4drp:A, 4drq:A, 7ett:A, 7etu:A, 7etv:A, 9eu6:A, 9eu7:A, 9eu7:B, 9eu8:A, 9eu8:B, 9eu9:A, 9eu9:B, 9eua:A, 9eua:B, 9eub:A, 9eub:B, 9euc:A, 9euc:B, 9eud:A, 9eud:B, 9eue:A, 9eue:B, 9ey3:A, 9ey4:A, 4jfi:A, 4jfj:A, 4jfk:A, 4jfl:A, 4jfm:A, 3o5f:A, 3o5r:A, 5obk:A, 8pc2:G, 8pc2:H, 8pj8:A, 8pja:A, 7r0l:A, 8r5k:A, 6saf:A, 4tw6:A, 4tw7:A, 4tx0:A, 6tx4:A, 6tx5:A, 6tx6:A, 6tx7:A, 6tx9:A, 6txx:A, 4w9o:A, 4w9o:E, 4w9p:A, 4w9p:E, 4w9q:A
16 4nnr:A 102 75 0.5067 0.3725 0.5067 1.88e-20 4nnr:B
17 5hw8:B 122 83 0.5333 0.3279 0.4819 2.49e-19 5hw8:A, 5hw8:C, 5hw8:D, 5hw8:E, 5hw8:F, 5hw8:G, 5hw8:H, 6tz6:C, 6tz6:F
18 3pa7:A 124 74 0.4400 0.2661 0.4459 2.76e-19 3ihz:A, 3ihz:B, 4itz:A, 4itz:B, 4j4o:A, 4mgv:A
19 7f2j:A 117 75 0.5067 0.3248 0.5067 3.91e-19 7f2j:B, 6j2m:A
20 8bk4:A 163 75 0.4933 0.2270 0.4933 8.30e-17 8p3d:A, 8p42:A, 8p42:D
21 5d75:A 120 65 0.4133 0.2583 0.4769 1.30e-16 5gpg:A, 3kz7:A, 1pbk:A
22 4qt3:A 125 74 0.4400 0.2640 0.4459 2.39e-16 4j4n:A, 4j4n:B, 4j4n:C, 4qt2:A, 2vn1:A, 2vn1:B
23 1q6i:A 210 74 0.5067 0.1810 0.5135 6.60e-15 1q6i:B
24 4msp:A 189 76 0.4133 0.1640 0.4079 1.29e-13 4msp:B
25 5mgx:G 266 68 0.3333 0.0940 0.3676 2.48e-07 5mgx:F, 5mgx:E, 5mgx:H
26 4odq:A 106 61 0.3067 0.2170 0.3770 3.86e-07 4odp:A, 4odr:A, 4odr:B, 7oxg:A, 7oxg:B
27 8bjd:A 208 75 0.3200 0.1154 0.3200 1.49e-06 8bje:A, 8bk5:A, 2vcd:A
28 1qz2:A 285 68 0.2533 0.0667 0.2794 0.001 1qz2:B
29 6az1:O 137 41 0.1867 0.1022 0.3415 0.17 8a3w:SO, 8a98:SO, 8ova:AH, 8ove:AH, 8ovj:SO, 8rxh:SO, 8rxx:SO, 5t2a:AH
30 7ase:v 135 41 0.1867 0.1037 0.3415 0.21 5opt:V, 4v8m:AH
31 6zj3:SO 135 41 0.1867 0.1037 0.3415 0.32
32 4wnb:A 169 46 0.2133 0.0947 0.3478 0.43 4w78:G
33 2ood:A 463 45 0.1867 0.0302 0.3111 0.53
34 8ifd:3L 140 41 0.1867 0.1000 0.3415 0.82 7a01:a5, 7a09:i, 5a2q:O, 5aj0:BO, 9bdl:AS14, 9bdn:AS14, 9bdp:AS14, 8bhf:P3, 9bkd:P, 9bln:P, 8btk:An, 7cpu:SO, 7cpv:SO, 4d5l:O, 4d61:O, 6d90:PP, 6d9j:PP, 9f1b:An, 9f1c:An, 9f1d:An, 6fec:j, 5flx:O, 6g18:O, 6g4s:O, 6g4w:O, 6g51:O, 6g53:O, 6g5h:O, 6g5i:O, 8g5y:SO, 8g5z:SO, 8g60:SO, 8g61:SO, 8g6j:SO, 8glp:SO, 6gz3:BO, 6gz4:BO, 6gz5:BO, 6hcf:P1, 6hcj:P2, 6hcm:P1, 6hcq:P2, 8ife:3L, 6ip5:3L, 6ip6:3L, 6ip8:3L, 8ip8:na, 8ip9:na, 8ipa:na, 8ipb:na, 3j7p:SO, 3j7r:SO, 3jag:OO, 3jah:OO, 3jai:OO, 3jaj:SO, 3jan:SO, 8jdj:AA, 8jdk:AA, 8jdl:AA, 8jdm:AA, 7jqb:X, 7jqc:X, 5k0y:j, 8k2c:SO, 7k5i:O, 4kzx:O, 4kzy:O, 4kzz:O, 5lks:SO, 7ls1:O3, 7ls2:O3, 5lzs:OO, 5lzt:OO, 5lzu:OO, 5lzv:OO, 5lzw:OO, 5lzx:OO, 5lzy:OO, 5lzz:OO, 7mdz:OO, 7mq8:NG, 7mq9:NG, 7mqa:NG, 6mtb:OO, 6mtc:OO, 6mtd:OO, 6mte:OO, 7nwg:P2, 7nwh:OO, 7nwi:OO, 7o7y:An, 7o7z:An, 7o80:An, 7o81:An, 5oa3:O, 6ole:SO, 6olf:SO, 6olg:BO, 6oli:SO, 6olz:BO, 7olc:SO, 7old:SO, 6om0:SO, 6om7:SO, 8oo0:SO, 5oql:t, 7oya:O2, 7oyb:O2, 7oyc:O2, 7oyd:OO, 8oz0:T, 8p03:Q, 8p09:Q, 8p2k:An, 6p4g:P, 6p4h:P, 6p5i:P, 6p5j:P, 6p5k:P, 6p5n:P, 8pj1:P, 8pj2:P, 8pj3:P, 8pj4:P, 8pj5:P, 8pj6:P, 8ppk:O, 8ppl:AO, 8q7z:An, 8q87:An, 7qgg:SO, 7qix:S, 7qiz:IA, 8qoi:SO, 7qp6:P, 7qp7:P, 7qvp:SO, 7qvp:RO, 6qzp:SO, 7r4x:O, 6r5q:MM, 6r6g:MM, 6r6p:MM, 6r7q:MM, 7r81:P2, 6rxt:Ci, 6rxu:Ci, 6rxv:Ci, 6rxx:Ci, 6rxy:Ci, 6rxz:Ci, 8scb:OO, 6sgc:P1, 7syg:P, 7syh:P, 7syi:P, 7syj:P, 7syk:P, 7syl:P, 7sym:P, 7syn:P, 7syo:P, 7syp:P, 7syq:P, 7syr:P, 7sys:P, 7syt:P, 7syu:P, 7syv:P, 7syw:P, 7syx:P, 5t2c:AO, 8t4s:O, 7toq:AS14, 7tor:AS14, 7tql:P, 7ucj:OO, 7uck:OO, 4ug0:SO, 4ujc:CO, 4ujd:CO, 4uje:BO, 4v3p:SK, 4v5z:Ak, 4v6w:AO, 4v6x:AO, 4v7e:BO, 5vyc:O1, 5vyc:O2, 5vyc:O3, 5vyc:O4, 5vyc:O5, 5vyc:O6, 6w2s:P, 6w2t:P, 7wts:O, 7wtt:O, 7wtu:O, 7wtv:O, 7wtw:O, 7wtx:O, 7wtz:O, 7wu0:O, 6xa1:SO, 7xnx:SO, 7xny:SO, 8xsx:SO, 8xsy:SO, 8xsz:SO, 6xu6:AO, 6xu7:AO, 6xu8:AO, 8xxl:SO, 8xxm:SO, 8xxn:SO, 6y0g:SO, 8y0w:SO, 8y0x:SO, 6y2l:SO, 6y57:SO, 6yal:Q, 6yam:Q, 6yan:Q, 6ybw:P, 8yoo:SO, 8yop:SO, 7z3n:SO, 7z3o:SO, 6z6l:SO, 6z6m:SO, 6z6n:SO, 7zjw:SZ, 7zjx:SZ, 6zlw:P, 6zm7:SO, 6zme:SO, 6zmi:SO, 6zmo:SO, 6zmt:P, 6zmw:P, 6zn5:P, 6zoj:O, 6zok:O, 6zon:i, 6zp4:i, 6zuo:O, 6zv6:O, 6zvh:O, 6zvj:i, 6zvk:a5, 6zxd:O, 6zxe:O, 6zxf:O, 6zxg:O, 6zxh:O
35 6jmb:A 374 47 0.1867 0.0374 0.2979 1.1
36 7ebp:A 526 74 0.2000 0.0285 0.2027 1.7 7ebp:B, 7ebq:A
37 8auv:S 132 41 0.1867 0.1061 0.3415 2.0 8b2l:S1, 8jiw:BO, 8r6f:O
38 3j7a:P 127 41 0.1867 0.1102 0.3415 2.3 3jbn:P, 3jbo:P, 3jbp:P, 6okk:P, 8tpu:SP
39 9bh5:AO 135 41 0.1733 0.0963 0.3171 3.4 9cai:AO
40 6fyx:O 129 41 0.1733 0.1008 0.3171 3.5 7a1g:Z, 7ajt:DO, 7aju:DO, 7b7d:Z, 8bn3:C4, 8bqd:Z, 8bqx:Z, 8c00:Z, 8c01:Z, 8c3a:Q, 8c3a:DB, 8cah:Z, 8cas:Z, 8cbj:O, 8ccs:q, 8cdl:q, 8cdr:q, 8ceh:q, 8cf5:q, 8cg8:q, 8cgn:q, 8civ:q, 8cku:q, 8cmj:q, 8cq7:Q, 8cq7:DB, 8cqw:Q, 8cqw:DB, 8cre:Q, 8cre:DB, 7d4i:SP, 7d5s:SP, 7d5t:SP, 7d63:SP, 5dat:C4, 5dat:c4, 5dc3:C4, 5dc3:c4, 5dge:C4, 5dge:c4, 5dgf:C4, 5dgf:c4, 5dgv:C4, 5dgv:c4, 6eml:Z, 8eub:BO, 8evp:BO, 8evq:BO, 8evr:BO, 8evs:BO, 8evt:BO, 8ewb:BO, 8ewc:BO, 6fai:O, 5fci:C4, 5fci:c4, 5fcj:C4, 5fcj:c4, 6fyy:O, 6gq1:AE, 6gqb:AE, 6gqv:AE, 6gsm:O, 6gsn:O, 6hhq:P, 6hhq:c4, 5i4l:C4, 5i4l:c4, 6i7o:Z, 6i7o:Zb, 8i7j:O, 5it7:O, 5it9:O, 3j6x:14, 3j6y:14, 3j77:14, 3j78:14, 3j80:O, 3j81:O, 3jam:O, 3jap:O, 5jpq:w, 5juo:LB, 5jup:LB, 5jus:LB, 5jut:LB, 5juu:LB, 8k2d:SO, 8k82:SO, 6ke6:SP, 5ll6:Z, 6lqp:SP, 6lqq:SP, 6lqr:SP, 6lqs:SP, 6lqt:SP, 6lqu:SP, 5lyb:C4, 5lyb:c4, 5m1j:O2, 5mc6:Z, 5mei:c4, 5mei:P, 7mpi:BO, 7mpj:BO, 7n8b:BO, 5ndg:C4, 5ndg:c4, 5ndv:C4, 5ndv:c4, 5ndw:C4, 5ndw:c4, 7nrc:SZ, 7nrd:SZ, 5obm:C4, 5obm:c4, 8oeq:Q, 8oeq:DB, 5on6:c4, 5on6:P, 7osa:uS11, 7osm:uS11, 7pzy:P, 7q08:P, 7q0f:P, 7q0p:P, 7q0r:P, 8q5i:P, 6q8y:Z, 6rbd:O, 7rr5:SO, 8rw1:O, 6s47:BP, 8s8d:O, 8s8e:O, 8s8f:O, 8s8g:O, 8s8h:O, 8s8i:O, 8s8j:O, 6snt:O, 7suk:NG, 6sv4:Z, 6sv4:Zb, 6sv4:Zc, 6t4q:SO, 6t7i:SO, 6t7t:SO, 6t83:Ob, 6t83:p, 5tbw:P, 5tbw:c4, 6tb3:Z, 5tga:C4, 5tga:c4, 5tgm:C4, 5tgm:c4, 6tnu:Z, 4u3m:C4, 4u3m:c4, 4u3n:C4, 4u3n:c4, 4u3u:C4, 4u3u:c4, 4u4n:C4, 4u4n:c4, 4u4o:C4, 4u4o:c4, 4u4q:C4, 4u4q:c4, 4u4r:C4, 4u4r:c4, 4u4u:C4, 4u4u:c4, 4u4y:C4, 4u4y:c4, 4u4z:C4, 4u4z:c4, 4u50:C4, 4u50:c4, 4u51:C4, 4u51:c4, 4u52:C4, 4u52:c4, 4u53:C4, 4u53:c4, 4u55:C4, 4u55:c4, 4u56:C4, 4u56:c4, 4u6f:C4, 4u6f:c4, 4uer:K, 6uz7:O, 4v4b:AK, 4v6i:AK, 4v7h:AK, 4v7r:AH, 4v7r:CH, 4v88:AO, 4v88:CO, 4v8y:AO, 4v8z:AO, 4v92:BO, 5wlc:NG, 6woo:OO, 7wtl:SO, 7wtm:SO, 7wtn:SO, 7wto:SO, 7wtp:SO, 7wtq:SO, 7wtr:SO, 5wyj:SP, 5wyk:SP, 6xiq:AE, 6xir:AE, 8y0u:SO, 6y7c:O, 6z6j:SO, 6z6k:SO, 6zce:P, 7zpq:AO, 6zqa:DO, 6zqb:DO, 6zqc:DO, 6zqd:DO, 6zqe:DO, 6zqf:DO, 6zqg:DO, 7zrs:AO, 6zu9:Z, 7zuw:AO, 7zux:DO, 6zvi:w, 7zw0:sZ
41 5g2v:A 494 24 0.1333 0.0202 0.4167 4.5
42 6jr9:A 269 42 0.2000 0.0558 0.3571 6.2 5c7y:A, 5c7y:B, 5c81:A, 5c81:B, 5c8x:A, 5c8x:B, 5c8z:A, 5c8z:B, 5ie4:A, 5ie4:B, 5ie5:A, 5ie5:B, 5ie6:A, 5ie6:B, 5ie7:A, 5ie7:B, 6jqz:A, 6jqz:B, 6jr2:A, 6jr2:B, 6jr5:A, 6jr5:B, 6jr9:B, 6jra:A, 6jra:B, 6jrb:A, 6jrb:B, 6jrc:A, 6jrc:B, 6jrd:A, 6jrd:B, 3wzm:A, 3wzm:B, 3wzm:C
43 7wnh:D 316 27 0.1067 0.0253 0.2963 6.8 8cyo:A, 6dda:B, 6dda:A, 6dda:C, 6l6l:A, 6l6l:B, 6l6q:A, 6l6q:B, 7wnh:A, 7wnh:C, 7wnh:B, 5y41:A, 5y41:B, 5yd6:A, 5yd6:B, 5yd6:C, 5yd6:D
44 7p24:AAA 494 68 0.1333 0.0202 0.1471 9.8

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417