Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GGRPLQCEICGFTCRQKASLNWHQRKHAET

The query sequence (length=30) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6h0g:C 30 30 1.0000 1.0000 1.0000 1.34e-17 6h0g:F
2 2d9h:A 78 30 0.9000 0.3462 0.9000 1.44e-14
3 2m9a:A 89 27 0.7667 0.2584 0.8519 4.46e-13
4 8tnq:C 35 24 0.4667 0.4000 0.5833 0.002 8tnp:C, 8tnr:C
5 2elq:A 36 27 0.3000 0.2500 0.3333 0.003 2rv2:A
6 6wmi:A 146 27 0.4667 0.0959 0.5185 0.003 6wmi:D
7 8dey:C 57 28 0.3333 0.1754 0.3571 0.004 8dey:F
8 8dey:C 57 26 0.3333 0.1754 0.3846 4.7 8dey:F
9 2yrh:A 44 28 0.4667 0.3182 0.5000 0.005
10 2ept:A 41 27 0.4333 0.3171 0.4815 0.013
11 8tho:A 100 29 0.3667 0.1100 0.3793 0.014 8dtn:F, 6ki6:A, 6ki6:B, 8tlo:A, 6u9q:A
12 7w1m:H 322 25 0.3000 0.0280 0.3600 0.014 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
13 7w1m:H 322 28 0.3667 0.0342 0.3929 0.016 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
14 7w1m:H 322 24 0.2667 0.0248 0.3333 1.1 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
15 2yta:A 41 27 0.4000 0.2927 0.4444 0.024
16 2epq:A 45 27 0.3000 0.2000 0.3333 0.024
17 2eml:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 0.039
18 2en6:A 46 26 0.4000 0.2609 0.4615 0.043
19 2dmd:A 96 25 0.3333 0.1042 0.4000 0.046
20 2dmd:A 96 29 0.3333 0.1042 0.3448 0.058
21 2dmd:A 96 24 0.3333 0.1042 0.4167 6.1
22 6ml4:A 143 27 0.4333 0.0909 0.4815 0.053 6ml2:A, 6ml3:A, 6ml5:A, 6ml6:A, 6ml7:A
23 1x5w:A 70 24 0.3000 0.1286 0.3750 0.058
24 2i13:B 144 28 0.4000 0.0833 0.4286 0.062
25 2i13:B 144 28 0.3667 0.0764 0.3929 0.56
26 2i13:B 144 28 0.4000 0.0833 0.4286 1.0
27 2i13:B 144 28 0.3333 0.0694 0.3571 1.2
28 2i13:A 151 28 0.4000 0.0795 0.4286 0.063
29 2i13:A 151 27 0.3667 0.0728 0.4074 0.15
30 2i13:A 151 28 0.4000 0.0795 0.4286 1.0
31 2i13:A 151 28 0.3333 0.0662 0.3571 1.2
32 2i13:A 151 26 0.3333 0.0662 0.3846 2.1
33 2ena:A 46 25 0.3000 0.1957 0.3600 0.068
34 2kmk:A 82 28 0.3667 0.1341 0.3929 0.073
35 2kmk:A 82 26 0.2667 0.0976 0.3077 6.3
36 2elz:A 46 25 0.3333 0.2174 0.4000 0.081
37 2ep0:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 0.092
38 2em3:A 46 25 0.3333 0.2174 0.4000 0.092
39 2yrj:A 46 25 0.4000 0.2609 0.4800 0.10
40 2rsj:A 92 26 0.3667 0.1196 0.4231 0.11 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
41 2rsj:A 92 22 0.3000 0.0978 0.4091 1.6 2els:A, 2rut:A, 2rv6:A
42 2epu:A 45 26 0.3667 0.2444 0.4231 0.12
43 2en1:A 46 26 0.3667 0.2391 0.4231 0.15 2yth:A
44 2enh:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 0.15
45 2lce:A 64 28 0.3667 0.1719 0.3929 0.15
46 6h0f:C 32 28 0.4000 0.3750 0.4286 0.17 6h0f:F, 6h0f:I, 6h0f:L
47 2ysp:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 0.17
48 1g2d:C 89 28 0.4000 0.1348 0.4286 0.18 1g2d:F, 1g2f:C, 1g2f:F
49 2rsi:A 92 26 0.4000 0.1304 0.4615 0.20 2elt:A, 2ruu:A, 2rv7:A
50 4m9v:C 60 25 0.3667 0.1833 0.4400 0.21 4gzn:C, 4m9v:F
51 4m9v:C 60 27 0.3333 0.1667 0.3704 9.2 4gzn:C, 4m9v:F
52 1mey:F 84 28 0.3667 0.1310 0.3929 0.21 1mey:C
53 1mey:F 84 26 0.3333 0.1190 0.3846 0.79 1mey:C
54 1mey:F 84 27 0.3333 0.1190 0.3704 3.0 1mey:C
55 2n26:A 55 26 0.3333 0.1818 0.3846 0.22
56 7txc:E 84 25 0.3333 0.1190 0.4000 0.28
57 7txc:E 84 26 0.3000 0.1071 0.3462 0.50
58 7txc:E 84 28 0.3000 0.1071 0.3214 8.0
59 2ep1:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 0.29 2ep2:A
60 2em8:A 46 26 0.3000 0.1957 0.3462 0.30
61 2eow:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 0.34
62 2eos:A 42 26 0.3667 0.2619 0.4231 0.36
63 2ytg:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 0.39
64 2yt9:A 95 27 0.3000 0.0947 0.3333 0.40
65 2yt9:A 95 28 0.3667 0.1158 0.3929 9.8
66 2ma7:A 73 24 0.3000 0.1233 0.3750 0.41
67 2ma7:A 73 28 0.3667 0.1507 0.3929 1.3
68 2ytb:A 42 25 0.3667 0.2619 0.4400 0.43
69 2eq2:A 46 25 0.3667 0.2391 0.4400 0.44 2ytr:A
70 7y3m:C 70 30 0.3333 0.1429 0.3333 0.45 8u15:C, 8u15:F, 8u16:C, 8u16:F, 8u17:C, 8u17:F, 7y3m:B, 7y3m:A, 7y3m:F, 7y3m:J, 7y3m:I
71 2eoz:A 46 27 0.3333 0.2174 0.3704 0.45
72 2ene:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 0.57
73 2yts:A 46 26 0.3667 0.2391 0.4231 0.58
74 2em4:A 46 26 0.3667 0.2391 0.4231 0.58
75 2rsh:A 37 22 0.3000 0.2432 0.4091 0.62 2ruv:A
76 1bbo:A 57 28 0.3000 0.1579 0.3214 0.76 3znf:A, 4znf:A
77 2emi:A 46 25 0.3667 0.2391 0.4400 0.83 2ytp:A
78 2emc:A 46 26 0.3667 0.2391 0.4231 0.94
79 2yto:A 46 26 0.3000 0.1957 0.3462 0.97
80 2emm:A 46 26 0.4000 0.2609 0.4615 1.0
81 5v3g:D 170 28 0.4000 0.0706 0.4286 1.1 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
82 5v3g:D 170 28 0.4000 0.0706 0.4286 1.1 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
83 5v3g:D 170 28 0.4000 0.0706 0.4286 1.9 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
84 5v3g:D 170 28 0.4000 0.0706 0.4286 2.0 5egb:A, 5eh2:F, 5eh2:E, 5ei9:E, 5ei9:F, 5v3g:A
85 8wex:B 388 19 0.2333 0.0180 0.3684 1.1 8wex:A
86 2eol:A 42 27 0.3667 0.2619 0.4074 1.2
87 2emy:A 46 25 0.3667 0.2391 0.4400 1.3 2el5:A
88 1srk:A 35 30 0.3667 0.3143 0.3667 1.3
89 5wjq:D 281 28 0.3333 0.0356 0.3571 1.3 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
90 5wjq:D 281 28 0.3667 0.0391 0.3929 3.1 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
91 5wjq:D 281 28 0.3333 0.0356 0.3571 4.9 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
92 5wjq:D 281 27 0.3000 0.0320 0.3333 9.0 5v3j:E, 5v3j:F, 5v3m:C
93 7ysf:A 113 31 0.4333 0.1150 0.4194 1.3
94 7ysf:A 113 28 0.3333 0.0885 0.3571 2.8
95 7ysf:A 113 26 0.3333 0.0885 0.3846 6.5
96 3iuf:A 32 21 0.2333 0.2188 0.3333 1.4
97 2epr:A 48 24 0.3333 0.2083 0.4167 1.4
98 8e3e:F 121 28 0.3333 0.0826 0.3571 1.5 8e3d:A, 8e3d:B, 8e3d:F, 8e3e:A, 8e3e:B, 7eyi:G, 7eyi:H, 8h9h:G, 7n5s:A, 7n5t:A, 7n5u:A, 7n5v:A, 7n5v:F, 7n5v:B, 7n5w:A
99 2eoq:A 46 26 0.3000 0.1957 0.3462 1.5
100 2emh:A 46 26 0.3000 0.1957 0.3462 1.6
101 2en3:A 46 28 0.3667 0.2391 0.3929 1.8
102 2em6:A 46 24 0.3000 0.1957 0.3750 2.1
103 2eoe:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 2.1 2ytk:A
104 2en7:A 44 26 0.3333 0.2273 0.3846 2.2
105 2eor:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 2.3
106 2emk:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 2.4
107 2em2:A 46 25 0.3333 0.2174 0.4000 2.7
108 8a4i:L 56 28 0.3333 0.1786 0.3571 2.7 8a4i:I, 8a4i:K, 8a4i:J, 8cuc:F, 8cuc:G, 7y3i:B, 7y3i:A, 7y3k:A, 7y3k:B
109 2emw:A 44 27 0.3667 0.2500 0.4074 3.0
110 2ysv:A 42 27 0.3333 0.2381 0.3704 3.2
111 1f2i:G 66 28 0.3333 0.1515 0.3571 3.2 1f2i:H, 1f2i:I, 1f2i:J, 1f2i:K, 1f2i:L
112 7lfd:L 214 21 0.2667 0.0374 0.3810 3.2
113 2ely:A 46 25 0.2667 0.1739 0.3200 3.4
114 2en4:A 46 26 0.3000 0.1957 0.3462 3.5
115 2emv:A 44 26 0.3000 0.2045 0.3462 3.6
116 2emx:A 44 29 0.3667 0.2500 0.3793 3.7
117 2ebt:A 100 27 0.2667 0.0800 0.2963 3.8
118 2eon:A 46 26 0.2667 0.1739 0.3077 3.8
119 1x6e:A 72 28 0.3667 0.1528 0.3929 3.9
120 7nf9:A 67 25 0.2667 0.1194 0.3200 4.0
121 2emj:A 46 25 0.3000 0.1957 0.3600 4.6
122 7y3l:A 57 27 0.3333 0.1754 0.3704 4.8
123 2eq3:A 46 25 0.3000 0.1957 0.3600 4.8
124 2em5:A 46 23 0.3667 0.2391 0.4783 4.9
125 2eme:A 46 25 0.3333 0.2174 0.4000 5.0
126 2epv:A 44 26 0.3333 0.2273 0.3846 5.0
127 2cot:A 77 28 0.3333 0.1299 0.3571 5.4
128 2ytd:A 46 26 0.3000 0.1957 0.3462 5.5
129 2eoh:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 5.7
130 6e93:A 112 27 0.3333 0.0893 0.3704 5.8 6e94:A
131 2ytf:A 46 26 0.3000 0.1957 0.3462 5.8 2eof:A
132 2epz:A 46 26 0.3000 0.1957 0.3462 5.8
133 2enc:A 46 26 0.3000 0.1957 0.3462 6.4
134 2eq1:A 46 25 0.3000 0.1957 0.3600 6.6
135 1p47:A 87 28 0.3333 0.1149 0.3571 6.7 1a1f:A, 1a1g:A, 1a1h:A, 1a1i:A, 1a1j:A, 1a1k:A, 1a1l:A, 1aay:A, 1jk1:A, 1jk2:A, 1p47:B, 4r2a:A, 4r2c:A, 4r2d:A, 4x9j:A, 1zaa:C
136 8ffz:A 314 30 0.3333 0.0318 0.3333 7.4
137 5yj3:C 70 24 0.3333 0.1429 0.4167 7.6 5yj3:D
138 2em9:A 46 26 0.3333 0.2174 0.3846 7.7
139 2epc:A 42 27 0.3333 0.2381 0.3704 7.8
140 8b6h:EN 145 13 0.2333 0.0483 0.5385 7.8 8b6h:En, 8bqs:EN, 8bqs:En
141 2en2:A 42 25 0.3333 0.2381 0.4000 8.2
142 6dd5:A 652 17 0.2667 0.0123 0.4706 8.4 6dd5:B, 3rum:A, 3vfj:A
143 2ytq:A 46 26 0.3000 0.1957 0.3462 8.9 2eog:A
144 2emf:A 46 24 0.2667 0.1739 0.3333 8.9
145 2yu5:A 44 25 0.3000 0.2045 0.3600 9.8

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417