BioLiP

>protein
GFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPR

The query sequence (length=33) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2m3o:W	43	33	1.0000	0.7674	1.0000	3.71e-20	2kpz:A, 2kq0:A, 2mpt:A, 4n7h:A
2	2laj:A	40	33	0.8485	0.7000	0.8485	1.08e-15
3	4lcd:A	419	31	0.6061	0.0477	0.6452	8.11e-10	4lcd:B
4	2jmf:A	43	33	0.6061	0.4651	0.6061	1.46e-09
5	5dws:C	40	33	0.6061	0.5000	0.6061	1.66e-09
6	5cq2:A	76	33	0.6061	0.2632	0.6061	4.63e-09	5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
7	5cq2:A	76	31	0.5455	0.2368	0.5806	2.84e-08	5dws:A, 5dws:E, 5dws:G, 5dzd:A, 5dzd:B, 2jo9:A, 4rof:A, 4rof:B
8	1i5h:W	50	33	0.6364	0.4200	0.6364	8.18e-09
9	2lb1:A	35	33	0.5758	0.5429	0.5758	1.10e-08	2ltx:A
10	2djy:A	42	33	0.5455	0.4286	0.5455	1.10e-08
11	2ez5:W	46	31	0.5758	0.4130	0.6129	2.14e-08
12	2kxq:A	90	33	0.5455	0.2000	0.5455	3.02e-08	2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
13	2kxq:A	90	31	0.3939	0.1444	0.4194	0.002	2laz:A, 2lb0:A, 2ltz:A
14	6jjz:B	96	31	0.5455	0.1875	0.5806	3.71e-08	6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
15	6jjz:B	96	30	0.3333	0.1146	0.3667	0.56	6jjz:A, 6kkg:A, 6kkg:B
16	2n8t:A	39	30	0.4848	0.4103	0.5333	5.92e-08
17	6jjy:A	128	31	0.5758	0.1484	0.6129	1.06e-06	6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
18	6jjy:A	128	31	0.4545	0.1172	0.4839	6.14e-06	6j68:A, 6j68:B, 6j69:A, 6jjw:A, 6jjx:B, 6jjx:A
19	7lp2:E	37	30	0.4545	0.4054	0.5000	1.69e-06	2lb2:A, 7lp2:A, 7lp2:C, 2lty:A
20	2ltv:A	36	33	0.4848	0.4444	0.4848	1.97e-06	2law:A
21	1jmq:A	46	31	0.4545	0.3261	0.4839	2.06e-06	1k5r:A, 1k9q:A, 1k9r:A, 2lax:A, 2lay:A, 2ltw:A
22	1eg4:A	260	27	0.3636	0.0462	0.4444	4.18e-05
23	7lp3:A	37	30	0.3939	0.3514	0.4333	5.56e-04	7lp3:C
24	8sg2:A	163	31	0.3939	0.0798	0.4194	0.008	6dun:A, 6dun:B, 7efj:A, 7efx:A, 7ekv:A, 7f0m:A, 7f0m:C, 7f0m:B, 7f0m:D, 1f8a:B, 4gwv:A, 3i6c:A, 3i6c:B, 1i8g:B, 1i8h:B, 3ikd:A, 3ikd:B, 3ikg:A, 3ikg:B, 9inr:A, 9inr:B, 2itk:A, 3jyj:A, 3jyj:B, 3kab:A, 3kac:A, 3kac:B, 3kad:A, 3kaf:A, 3kag:A, 3kah:A, 3kai:A, 3kce:A, 2lb3:A, 2n1o:A, 1nmw:A, 3ntp:A, 6o33:A, 6o34:A, 3odk:A, 3oob:A, 1pin:A, 2q5a:A, 3tc5:A, 3tcz:A, 3tdb:A, 4tns:A, 4tyo:A, 4tyo:B, 5uy9:A, 6vaj:A, 3wh0:A, 2xp3:A, 2xp4:A, 2xp5:A, 2xp6:A, 2xp7:A, 2xp8:A, 2xp9:A, 2xpa:A, 2xpb:A
25	2nc3:A	33	30	0.3636	0.3636	0.4000	0.008	2nc4:A, 2nc5:A, 2nc6:A
26	8pxx:A	99	26	0.3030	0.1010	0.3846	0.032	2dyf:A
27	8pxx:A	99	27	0.2121	0.0707	0.2593	1.0	2dyf:A
28	7olc:SE	261	30	0.3030	0.0383	0.3333	2.7	7old:SE, 8oo0:SE, 5oql:m, 7r81:F2, 6rxu:Cb, 6rxv:Cb, 6rxx:Cb, 6rxz:Cb, 7z3n:SE, 7z3o:SE
29	8tl6:B	353	12	0.1818	0.0170	0.5000	2.8
30	2jup:W	37	27	0.2121	0.1892	0.2593	3.8	2rly:W, 2rm0:W
31	7jmr:A	224	35	0.4848	0.0714	0.4571	4.3	7jmv:A
32	4gr5:C	457	20	0.2424	0.0175	0.4000	5.3	4gr5:A, 4gr5:B, 4gr5:D
33	4v6w:AE	261	30	0.2727	0.0345	0.3000	6.0	6xu6:AE, 6xu7:AE, 6xu8:AE
34	3gr3:A	226	20	0.2727	0.0398	0.4500	6.4	3gr3:B
35	6xyw:Bw	337	32	0.3333	0.0326	0.3438	7.0
36	4o5t:B	326	16	0.2424	0.0245	0.5000	7.2	4o5t:A, 7zp7:A, 7zp7:B
37	3cwb:E	196	23	0.2424	0.0408	0.3478	7.6	3cwb:R, 3h1h:E, 3h1h:R, 3h1i:R, 3h1i:E, 3h1j:R, 3h1j:E, 3h1k:E, 3h1k:R, 3h1l:E, 3h1l:R, 3l70:E, 3l70:R, 3l71:E, 3l71:R, 3l72:E, 3l72:R, 3l73:E, 3l73:R, 3l74:E, 3l74:R, 3l75:E, 3l75:R, 3tgu:E, 3tgu:R, 4u3f:E, 4u3f:R
38	3o4p:A	314	16	0.2424	0.0255	0.5000	8.9	3byc:A, 1e1a:A, 2gvu:A, 2gvv:A, 2gvw:A, 2gvx:A, 3hlh:A, 3hlh:B, 3hlh:C, 3hlh:D, 3hli:A, 3hli:B, 3hli:C, 3hli:D, 2iao:A, 2iap:A, 2iaq:A, 2iar:A, 2ias:A, 2iat:A, 2iau:A, 2iav:A, 2iaw:A, 2iax:A, 3kgg:A, 3li3:A, 3li4:A, 3li5:A, 1pjx:A
39	2a06:E	196	23	0.2424	0.0408	0.3478	9.0	2a06:R, 1bcc:E, 2bcc:E, 3bcc:E, 1be3:E, 1bgy:Q, 4d6t:R, 4d6u:R, 7dkf:Q1, 2fyu:E, 5gpn:E, 5gpn:Q, 5gup:2, 5gup:4, 6haw:E, 8iog:C, 8iog:c, 5j4z:AE, 5j4z:AP, 5j7y:AE, 5j7y:AP, 5j8k:AE, 5j8k:AP, 5klv:E, 1l0l:E, 1l0n:E, 5luf:q, 6nhg:E, 5nmi:E, 1ntk:E, 1ntm:E, 1ntz:E, 1nu1:E, 7o37:E, 7o37:P, 7o3c:E, 7o3c:P, 7o3h:E, 7o3h:P, 5okd:E, 8p65:E, 8p65:R, 1pp9:R, 1pp9:E, 1ppj:R, 1ppj:E, 8pw5:E, 8pw5:P, 8pw6:E, 8pw6:P, 8pw7:E, 8pw7:P, 6q9e:f1, 6q9e:f2, 6qbx:f1, 6qbx:f2, 6qc2:f1, 6qc2:f2, 6qc3:f1, 6qc3:f2, 6qc4:f1, 6qc4:f2, 7r3v:E, 1rie:A, 1sqb:E, 1sqp:E, 1sqq:E, 1sqv:E, 1sqx:E, 7tay:E, 7tz6:E, 7tz6:R, 8ugd:3E, 8ugd:3R, 8uge:3E, 8uge:3R, 8ugf:3E, 8ugf:3R, 8ugg:3E, 8ugg:3R, 8ugh:3E, 8ugh:3R, 8ugi:3E, 8ugi:3R, 8ugj:3E, 8ugj:3R, 8ugk:3E, 8ugk:3R, 8ugn:3E, 8ugn:3R, 8ugr:3E, 8ugr:3R, 8ugr:6E, 8ugr:6R, 5xte:C, 5xte:P, 5xth:AC, 5xth:AP, 5xti:AC, 5xti:AP, 6xvf:E, 2ybb:e, 2ybb:E, 6zfs:E, 6zft:E, 6zfu:E

[Back]