Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GELIHMVTLDKTGKKSFGICIVRGEVKDSPNTKTTGIFIKGIVPDSPAHLCGRLKVGDRILSLNGKDVRNSTEQAVIDLI
KEADFKIELEIQTFD

The query sequence (length=95) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1ihj:B 95 95 1.0000 1.0000 1.0000 2.37e-65 1ihj:A
2 7p73:A 420 80 0.2947 0.0667 0.3500 4.29e-09 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
3 3jxt:A 96 72 0.2947 0.2917 0.3889 4.69e-09 3jxt:B
4 6xa7:B 96 88 0.2842 0.2812 0.3068 4.74e-09 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
5 7d6f:A 87 85 0.3158 0.3448 0.3529 5.56e-09
6 5heb:A 119 68 0.3263 0.2605 0.4559 1.00e-08 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
7 4e34:A 87 88 0.3053 0.3333 0.3295 2.66e-08 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
8 2r4h:C 98 86 0.2421 0.2347 0.2674 7.02e-07
9 2ka9:A 189 86 0.3263 0.1640 0.3605 7.65e-07 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
10 2ka9:A 189 52 0.1895 0.0952 0.3462 0.026 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
11 4wyu:A 201 91 0.2947 0.1393 0.3077 9.95e-07 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
12 4wyu:A 201 78 0.2316 0.1095 0.2821 0.004 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
13 2m0z:A 97 65 0.2421 0.2371 0.3538 1.55e-06 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
14 6x23:A 89 71 0.2632 0.2809 0.3521 4.95e-06
15 2exg:A 101 88 0.2526 0.2376 0.2727 1.56e-05 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
16 8cn1:H 101 87 0.3053 0.2871 0.3333 1.61e-05 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
17 2i0i:A 81 71 0.2737 0.3210 0.3662 2.32e-05 2i0i:B, 2i0i:C
18 1zub:A 109 84 0.2632 0.2294 0.2976 2.56e-05
19 8c1t:A 90 81 0.2421 0.2556 0.2840 2.97e-05 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
20 2koh:A 111 81 0.2211 0.1892 0.2593 4.11e-05 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
21 3vqg:A 85 86 0.2421 0.2706 0.2674 4.32e-05
22 2qt5:A 194 90 0.3158 0.1546 0.3333 7.51e-05 2qt5:B
23 2qt5:A 194 40 0.1263 0.0619 0.3000 9.0 2qt5:B
24 2m0u:A 117 48 0.2000 0.1624 0.3958 9.67e-05
25 2egn:A 83 86 0.2842 0.3253 0.3140 1.16e-04
26 8bq8:C 93 68 0.2421 0.2473 0.3382 1.36e-04 8bq8:A, 8bq8:B
27 4xh7:A 110 45 0.1579 0.1364 0.3333 1.82e-04
28 7qct:A 90 90 0.2421 0.2556 0.2556 1.91e-04 7qct:B
29 8b82:A 108 90 0.2316 0.2037 0.2444 2.50e-04 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
30 5zys:A 90 68 0.2316 0.2444 0.3235 4.23e-04
31 4xhv:A 94 92 0.2211 0.2234 0.2283 5.95e-04
32 5ez0:D 95 48 0.1684 0.1684 0.3333 7.95e-04 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
33 6hks:B 94 78 0.2632 0.2660 0.3205 0.001 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
34 7qqn:C 414 85 0.2421 0.0556 0.2706 0.001 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
35 8bv7:A 95 51 0.1895 0.1895 0.3529 0.002 8buw:A, 8buw:B
36 6ar4:B 87 84 0.2421 0.2644 0.2738 0.002 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
37 7p70:A 407 76 0.2632 0.0614 0.3289 0.002 7pc4:A, 7qql:A
38 2kpl:A 129 92 0.2632 0.1938 0.2717 0.002
39 2pdz:A 86 86 0.2737 0.3023 0.3023 0.003
40 5n7d:A 423 81 0.2737 0.0615 0.3210 0.003 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
41 2ejy:A 85 88 0.2316 0.2588 0.2500 0.003
42 6gbe:A 119 51 0.1684 0.1345 0.3137 0.004
43 8blu:B 195 48 0.1684 0.0821 0.3333 0.004 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
44 1rzx:A 98 48 0.1895 0.1837 0.3750 0.005 5i7z:A, 1x8s:A
45 5wou:A 95 57 0.2000 0.2000 0.3333 0.006
46 2joa:A 105 55 0.2211 0.2000 0.3818 0.006
47 6kz1:A 97 58 0.2105 0.2062 0.3448 0.006 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
48 2os6:A 89 56 0.1895 0.2022 0.3214 0.007
49 3tsz:A 341 46 0.2211 0.0616 0.4565 0.007 3shw:A
50 7pc3:A 405 74 0.2421 0.0568 0.3108 0.016 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
51 7qqm:A 413 57 0.2000 0.0460 0.3333 0.022
52 1r18:A 223 84 0.2421 0.1031 0.2738 0.022
53 8bp4:A 93 77 0.2000 0.2043 0.2468 0.023 8bp4:C, 8bp4:B
54 2m0v:A 128 46 0.1789 0.1328 0.3696 0.026
55 2l4t:A 124 55 0.1895 0.1452 0.3273 0.040 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
56 4wsi:A 372 82 0.2632 0.0672 0.3049 0.042 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
57 7pcb:A 415 53 0.1684 0.0386 0.3019 0.045 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
58 7x2e:A 163 69 0.2105 0.1227 0.2899 0.046 2kbs:A
59 5oak:A 90 59 0.2000 0.2111 0.3220 0.050 5oak:C
60 1u38:A 89 58 0.1895 0.2022 0.3103 0.061
61 3cyy:B 81 56 0.1895 0.2222 0.3214 0.073 3cyy:A
62 3ch8:A 190 56 0.1895 0.0947 0.3214 0.087 2qbw:A
63 1n7t:A 103 54 0.1789 0.1650 0.3148 0.10 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
64 1n7f:A 86 90 0.2526 0.2791 0.2667 0.15 1n7f:B
65 6q0m:B 94 54 0.1895 0.1915 0.3333 0.17
66 4ewh:A 275 37 0.1684 0.0582 0.4324 0.22 3eqp:B, 3eqp:A, 3eqr:A, 3eqr:B, 4ewh:B, 8fe9:A, 8hmt:A, 8hmt:B, 8hmt:C, 8hmt:D, 4id7:A, 7kp6:A, 7kp6:B, 1u4d:A, 1u4d:B, 1u54:A, 1u54:B, 6vqm:A, 6vqm:B
67 3cs0:A 392 33 0.1579 0.0383 0.4545 0.40 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
68 2kaw:A 90 76 0.2211 0.2333 0.2763 0.49 6lcb:A, 2mx6:A
69 6nid:B 88 43 0.1579 0.1705 0.3488 0.56 6nid:A, 6nid:C
70 5f67:A 98 50 0.1895 0.1837 0.3600 0.58 5f67:B
71 7w6z:A 414 27 0.1368 0.0314 0.4815 0.61 7w6y:A
72 6ezi:A 86 54 0.1895 0.2093 0.3333 1.4 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
73 7xs0:A 376 38 0.1684 0.0426 0.4211 1.4
74 3r0h:D 199 59 0.1895 0.0905 0.3051 1.9 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
75 8kic:A 300 38 0.1579 0.0500 0.3947 1.9 8kic:C, 8kic:B, 3stj:A, 3stj:B, 3stj:C, 3stj:D, 3stj:E, 3stj:F, 3stj:G, 3stj:H, 3stj:I, 3stj:J, 3stj:K, 3stj:L, 8w69:A, 8w69:C, 8w69:B
76 8c3a:J 185 38 0.1474 0.0757 0.3684 2.8 8c3a:CU, 8cq7:J, 8cq7:CU, 8cqw:J, 8cqw:CU, 8cre:J, 8cre:CU, 8oeq:J, 8oeq:CU, 7pzy:I, 7q08:I, 7q0f:I, 7q0p:I, 7q0r:I, 8q5i:I
77 1l6o:A 95 80 0.2105 0.2105 0.2500 3.5 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
78 6ii7:A 355 25 0.1158 0.0310 0.4400 5.1
79 1dli:A 402 43 0.1474 0.0348 0.3256 5.6 1dlj:A
80 5gmj:B 224 71 0.2105 0.0893 0.2817 5.6 5gmi:A, 5gmi:B, 5gmj:A, 5h3j:A
81 6zbq:A 89 76 0.2000 0.2135 0.2500 6.0 6zc4:A
82 1e59:A 239 61 0.1579 0.0628 0.2459 6.0
83 6yx0:B 112 84 0.2000 0.1696 0.2262 7.7 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
84 8j9c:A 605 75 0.2105 0.0331 0.2667 7.8 8j9c:B, 8j9c:C, 8j9c:D, 8j9d:A, 8j9d:B, 8j9d:C, 8j9d:D
85 6jly:C 338 43 0.1474 0.0414 0.3256 8.6 6jly:D, 6jlz:C, 6jlz:D

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417