BioLiP

>protein
GEIQWVKPNKETGRLNINGPTRTKLEPSVFHDVFEGNKEPAVLHSKDPRLEVDFEQALFSKYVGNTLYEPDEYIKEAALH
YANQLKQLDIDTSQMSMEEACYGTENLEAIDLHTSAGYPYSALGIKKRDILDSTTRDVSKMKFYMDKYGLDLPYSTYVKD
ELRSIDKIKKGKSRLIEASSLNDSVYLRMTFGHLYETFHANPGTVTGSAVGCNPDTFWSKLPILLPGSLFAFDYSGYDAS
LSPVWFRALELVLREIGYSEEAVSLVEGINHTHHVYRNKTYCVLGGMPSGCSGTSIFNSMINNIIIRALLIKTFKGIDLD
ELNMVAYGDDVLASYPFPIDCLELARTGKEYGLTMTPADKSPCFNEVNWDNATFLKRGFLPDEQFPFLIHPTMPMKEIHE
SIRWTKDARNTQDHVRSLCLLAWHNGKQEYEKFVSAIRSVPVGKALAIPNYENLRRNWLELF

The query sequence (length=462) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6lse:A	464	462	0.9978	0.9935	0.9978	0.0	5f8g:A, 5f8h:A, 5f8i:A, 5f8j:A, 5f8l:A, 5f8m:A, 5f8n:A, 4ika:A, 6kwq:A, 6kwr:A, 6lsf:A, 6lsg:A, 6lsh:A, 3n6m:A, 3n6n:A, 7w9s:A, 5y6z:A, 5y6z:E
2	2ijd:1	644	462	0.6732	0.4829	0.6732	0.0	4dcd:A, 2ijd:2, 2ily:A, 2ilz:A, 2im0:A, 2im1:A, 2im2:A, 2im3:A, 4k4s:A, 4k4s:E, 4k4t:A, 4k4t:E, 4k4u:A, 4k4u:E, 4k4v:A, 4k4v:E, 4k4w:A, 4k4w:E, 3ol6:A, 3ol6:E, 3ol6:I, 3ol6:M, 3ol7:A, 3ol7:E, 3ol7:I, 3ol7:M, 3ol8:A, 3ol8:E, 3ol8:I, 3ol8:M, 3ol9:A, 3ol9:E, 3ol9:I, 3ol9:M, 3ola:A, 3ola:E, 3ola:I, 3ola:M, 3olb:A, 3olb:E, 3olb:I, 3olb:M, 1ra7:A
3	3cdu:A	468	462	0.6732	0.6645	0.6732	0.0	3cdw:A, 4k4x:A, 4k4x:E, 4k4x:I, 4k4x:M, 4k4y:A, 4k4y:E, 4k4y:I, 4k4y:M, 4k4z:A, 4k4z:E, 4k4z:I, 4k4z:M, 4y2a:A, 4y34:A
4	5xe0:A	457	454	0.6234	0.6302	0.6344	0.0	5zit:A
5	4k50:A	460	463	0.5455	0.5478	0.5443	0.0	4k50:I, 4k50:E, 4k50:M, 1tp7:A
6	1rdr:A	316	286	0.3874	0.5665	0.6259	3.90e-131
7	1rdr:A	316	85	0.0714	0.1044	0.3882	4.40e-09
8	4nyz:A	460	457	0.3095	0.3109	0.3129	4.73e-77
9	4wyw:A	479	458	0.3182	0.3069	0.3210	3.36e-65	8c1n:A, 8c1n:B, 8c2p:A, 2d7s:A, 2e9r:X, 2e9t:A, 2e9t:D, 2e9z:A, 2ec0:A, 2ec0:D, 2f8e:X, 6gvy:A, 4iqx:A, 5jxs:A, 3klv:A, 3kmq:A, 3kms:A, 3kna:A, 3koa:A, 5n95:A, 3nl0:A, 3nma:A, 1wne:A, 4wyl:A, 4wzm:A, 4wzq:A, 4x2b:A
10	1khw:B	497	377	0.2100	0.1952	0.2573	1.37e-12	1khw:A
11	3qid:A	492	398	0.2121	0.1992	0.2462	2.34e-11	3nai:A, 3nai:B, 3nai:C, 4nru:A, 4nru:B, 4nru:C, 4nru:D, 4nru:E, 4nru:F, 4o4r:A, 4o4r:B, 4o4r:C, 3qid:B, 3qid:C, 3sfg:A, 3sfg:B, 3sfg:C, 3sfu:A, 3sfu:B, 3sfu:C, 3upf:A, 3upf:B, 3upf:C, 3ur0:B, 3ur0:C
12	1sh3:B	503	383	0.2208	0.2028	0.2663	7.94e-10	3bsn:A, 3bso:A, 3h5x:A, 3h5y:A, 4lq3:A, 4lq9:A, 4nrt:A, 4qpx:A, 1sh3:A, 5tsn:A
13	4z6k:A	345	111	0.0693	0.0928	0.2883	0.50	4z6k:B, 4z6k:C, 4z6k:D
14	3s2e:A	340	54	0.0433	0.0588	0.3704	0.52	3s1l:A, 3s1l:B, 3s1l:C, 3s1l:D, 3s2e:B, 3s2e:C, 3s2e:D, 3s2e:E, 3s2e:F, 3s2e:G, 3s2e:H, 3s2f:A, 3s2f:B, 3s2f:C, 3s2f:D, 3s2f:E, 3s2f:F, 3s2f:G, 3s2f:H, 3s2g:A, 3s2g:B, 3s2g:C, 3s2g:D, 3s2g:E, 3s2g:F, 3s2g:G, 3s2g:H, 3s2i:A, 3s2i:B, 3s2i:C, 3s2i:D, 3s2i:E, 3s2i:F, 3s2i:G, 3s2i:H
15	1vjt:A	471	37	0.0368	0.0361	0.4595	2.1	7br4:A, 7brf:A, 7ctl:A, 7ctm:A, 6kcx:A, 3u95:A, 3u95:B, 3u95:C, 3u95:D, 3u95:E, 3u95:F
16	8s1p:V	249	57	0.0325	0.0602	0.2632	2.5	8s1u:V
17	1t1e:A	534	33	0.0346	0.0300	0.4848	2.6	1gt9:1, 1gt9:2, 1gtg:1, 1gtj:1, 1gtj:2, 1gtl:1, 1gtl:2, 4ne7:A, 1sio:A, 1sio:B, 1sio:C, 1siu:A, 1sn7:A, 1t1g:A, 1t1i:A, 1zvj:A, 1zvk:A, 1zvk:B
18	5awv:B	498	88	0.0563	0.0522	0.2955	3.5	5awv:C, 5awv:A, 5awv:D, 2wdw:A, 2wdw:B
19	1e5q:A	449	61	0.0411	0.0423	0.3115	3.9	1e5q:B, 1e5q:C, 1e5q:D, 1e5q:E, 1e5q:F, 1e5q:G, 1e5q:H
20	3env:A	217	47	0.0325	0.0691	0.3191	5.7	3enw:A, 3enw:B
21	7wss:A	533	54	0.0368	0.0319	0.3148	5.8	8jt1:A, 8jt1:B, 7wss:B, 7xeb:A, 7xeb:B
22	7z8g:A	3047	62	0.0433	0.0066	0.3226	5.9	8fdu:A, 7z8l:f
23	7z8f:e	4579	62	0.0433	0.0044	0.3226	6.8	5owo:A, 8pr2:f, 8ptk:m, 8ptk:n, 7z8f:f, 7z8f:m, 7z8f:n, 7z8h:A
24	8ptk:f	4502	62	0.0433	0.0044	0.3226	7.0	8ptk:e
25	8b9w:A	329	38	0.0346	0.0486	0.4211	7.9	8b9w:B
26	7ycx:K	590	73	0.0411	0.0322	0.2603	9.0	7cun:K, 8r22:C, 8r23:C, 8r2d:C, 8rc4:k, 8uib:K

[Back]