Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GDQCASSPCQNGGSCKDQLQSYICFCLPAFEGRNCETHKDDQLICVNENGGCEQYCSDHTGTKRSCRCHEGYSLLADGVS
CTPTVEYPCGKIPILE

The query sequence (length=96) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6r2w:L 143 96 1.0000 0.6713 1.0000 3.78e-68 2a2q:L, 2aei:L, 2aer:L, 2b8o:L, 2c4f:L, 8cn9:D, 8cn9:I, 8cn9:S, 1dan:L, 1dva:L, 1dva:M, 2ec9:L, 3ela:L, 1fak:L, 1ff7:A, 1ffm:A, 2fir:L, 4ibl:L, 1j9c:L, 5l0s:B, 5par:A, 2puq:L, 1qfk:L, 3th2:L, 3th3:L, 3th4:L, 1w0y:L, 1w2k:L, 1wqv:L, 1wss:L, 1wtg:L, 1wun:L, 1wv7:L, 4ylq:L, 1z6j:L, 4z6a:L, 4zma:L, 2zp0:L, 2zwl:L, 2zzu:L
2 8eph:A 91 94 0.4688 0.4945 0.4787 1.69e-25 1edm:B, 1edm:C, 8eph:C
3 1xkb:A 91 93 0.4479 0.4725 0.4624 1.17e-21 3k9x:A
4 5ky2:B 40 39 0.3021 0.7250 0.7436 4.45e-16 5ky3:B
5 5vyg:B 43 36 0.2500 0.5581 0.6667 4.78e-11 5vyg:A, 5vyg:C
6 5l0t:B 40 35 0.2188 0.5250 0.6000 1.22e-09 5ky7:B, 5l0u:B, 5l0v:B
7 4xbm:B 401 89 0.3854 0.0923 0.4157 4.21e-09
8 4xbm:B 401 66 0.2500 0.0599 0.3636 0.10
9 4xbm:B 401 25 0.1354 0.0324 0.5200 0.20
10 3h5c:B 312 90 0.3438 0.1058 0.3667 4.68e-09
11 1p0s:L 99 54 0.2292 0.2222 0.4074 1.36e-07 2y80:B
12 4d0f:A 125 40 0.1771 0.1360 0.4250 3.10e-07 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
13 4d0f:A 125 36 0.1562 0.1200 0.4167 0.004 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
14 4d0f:A 125 96 0.3021 0.2320 0.3021 0.056 4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
15 4xlw:C 118 40 0.1771 0.1441 0.4250 1.24e-06 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
16 4xlw:C 118 38 0.1562 0.1271 0.3947 5.24e-04 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
17 4xlw:C 118 82 0.2708 0.2203 0.3171 0.031 5ky8:B, 5l0r:B, 4xl1:A, 4xl1:D, 4xlw:E, 4xlw:G
18 5fm9:A 154 87 0.3438 0.2143 0.3793 9.21e-06 5fma:A, 5fma:B
19 5fm9:A 154 39 0.2083 0.1299 0.5128 1.48e-05 5fma:A, 5fma:B
20 5fm9:A 154 34 0.1458 0.0909 0.4118 0.016 5fma:A, 5fma:B
21 7alj:A 115 40 0.1875 0.1565 0.4500 1.55e-05
22 7alj:A 115 37 0.1458 0.1217 0.3784 0.003
23 7alj:A 115 67 0.2500 0.2087 0.3582 0.12
24 5mwb:A 118 35 0.1562 0.1271 0.4286 1.61e-05
25 5mwb:A 118 36 0.1458 0.1186 0.3889 0.002
26 5mwb:A 118 39 0.1458 0.1186 0.3590 1.6
27 5uk5:A 194 38 0.1667 0.0825 0.4211 1.72e-05 2rqz:A, 2rr2:A
28 5uk5:A 194 39 0.1458 0.0722 0.3590 0.053 2rqz:A, 2rr2:A
29 5uk5:A 194 73 0.2396 0.1186 0.3151 0.10 2rqz:A, 2rr2:A
30 5uk5:A 194 74 0.2500 0.1237 0.3243 0.20 2rqz:A, 2rr2:A
31 4d90:A 127 35 0.1667 0.1260 0.4571 6.47e-04 4d90:B
32 4d90:A 127 55 0.1771 0.1339 0.3091 0.25 4d90:B
33 4d90:A 127 34 0.1458 0.1102 0.4118 8.9 4d90:B
34 2vwn:L 44 48 0.1979 0.4318 0.3958 0.001 2vwo:L
35 4rs0:A 557 39 0.1667 0.0287 0.4103 0.010 6bl3:A, 6bl3:B, 6bl3:C, 6bl3:D, 6bl4:A, 6bl4:B, 6bl4:C, 6bl4:D, 4cox:A, 4cox:B, 4cox:C, 4cox:D, 5cox:A, 5cox:B, 5cox:C, 5cox:D, 6cox:A, 6cox:B, 1cvu:B, 1cvu:A, 1cx2:A, 1cx2:B, 1cx2:C, 1cx2:D, 1ddx:A, 1ddx:B, 1ddx:C, 1ddx:D, 4e1g:A, 4e1g:B, 8et0:A, 8et0:B, 5fdq:A, 5fdq:B, 4fm5:A, 4fm5:B, 4fm5:C, 4fm5:D, 3hs5:A, 3hs5:B, 3hs6:A, 3hs6:B, 3hs7:A, 3hs7:B, 5jvy:A, 5jvy:B, 5jvz:A, 5jvz:B, 5jw1:A, 5jw1:B, 3krk:A, 3krk:B, 3ln0:A, 3ln0:B, 3ln0:C, 3ln0:D, 3ln1:A, 3ln1:B, 3ln1:C, 3ln1:D, 4m10:A, 4m10:B, 4m10:C, 4m10:D, 4m11:A, 4m11:B, 4m11:C, 4m11:D, 3mdl:A, 3mdl:B, 3mqe:A, 3mqe:B, 3mqe:C, 3mqe:D, 3nt1:A, 3nt1:B, 3ntb:A, 3ntb:B, 3ntb:C, 3ntb:D, 3ntg:A, 3ntg:B, 3ntg:C, 3ntg:D, 6ofy:A, 6ofy:B, 3olt:A, 3olt:B, 3olu:A, 3olu:B, 4otj:A, 4otj:B, 4otj:C, 4otj:D, 4oty:A, 4oty:B, 3pgh:A, 3pgh:B, 3pgh:C, 3pgh:D, 4ph9:A, 4ph9:B, 1pxx:A, 1pxx:B, 1pxx:C, 1pxx:D, 3q7d:A, 3q7d:B, 3qh0:A, 3qh0:B, 3qmo:A, 3qmo:B, 3rr3:A, 3rr3:B, 3rr3:C, 3rr3:D, 4rrw:A, 4rrw:B, 4rrw:C, 4rrw:D, 4rrx:A, 4rrx:B, 4rrz:A, 4rrz:B, 4rrz:C, 4rrz:D, 4rut:A, 4rut:B, 4rut:C, 4rut:D, 3tzi:A, 3tzi:B, 6v3r:A, 6v3r:B, 6v3r:C, 6v3r:D, 5w58:A, 4z0l:A, 4z0l:B, 4z0l:C, 4z0l:D
36 3poy:A 1005 34 0.1562 0.0149 0.4412 0.019 3asi:A, 3b3q:E, 3b3q:F, 3biw:E, 3biw:F, 3biw:G, 3bod:A, 2h0b:A, 2h0b:B, 2h0b:C, 2h0b:D, 2r16:A, 2r1d:H, 2r1d:B, 2r1d:D, 2r1d:I, 3vkf:C, 3vkf:D, 2wqz:C, 2wqz:D, 2xb6:C, 2xb6:D, 5z8y:B, 5z8y:D, 5z8y:F, 5z8y:H
37 8em4:A 3818 60 0.2083 0.0052 0.3333 0.028 8em4:B
38 8em4:A 3818 48 0.1771 0.0045 0.3542 0.35 8em4:B
39 8em4:A 3818 68 0.2188 0.0055 0.3088 1.1 8em4:B
40 8em4:A 3818 36 0.1458 0.0037 0.3889 7.2 8em4:B
41 8em7:A 4378 60 0.2083 0.0046 0.3333 0.029 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
42 8em7:A 4378 48 0.1771 0.0039 0.3542 0.37 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
43 8em7:A 4378 68 0.2188 0.0048 0.3088 0.95 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
44 8em7:A 4378 36 0.1458 0.0032 0.3889 6.7 8em7:B, 8jut:A, 8jut:B, 8juu:B, 8juu:A, 8jx8:B, 8jx8:A, 8jx9:B, 8jxa:A, 8jxb:A, 8jxd:A, 8jxe:A, 8jxe:B, 8jxf:B, 8jxg:A, 8jxh:A, 8jxi:B
45 5f1a:A 553 36 0.1667 0.0289 0.4444 0.037 5f19:A, 5f19:B, 5f1a:B, 5ikq:A, 5ikq:B, 5ikr:A, 5ikr:B, 5ikt:A, 5ikt:B, 5ikv:A, 5ikv:B, 5kir:A, 5kir:B
46 6l6r:A 610 37 0.1458 0.0230 0.3784 0.051 6l6r:B, 7nam:A, 3sob:B, 3soq:A, 3sov:A
47 1g1q:A 160 38 0.1458 0.0875 0.3684 0.100 1g1q:B, 1g1q:C, 1g1q:D, 1g1r:A, 1g1r:B, 1g1r:D, 1g1r:C, 1g1s:B, 1g1s:A
48 8dvm:A 612 38 0.1667 0.0261 0.4211 0.13 4a0p:A, 8dvl:A, 8dvn:A
49 8dvm:A 612 41 0.1562 0.0245 0.3659 1.1 4a0p:A, 8dvl:A, 8dvn:A
50 4c16:A 280 33 0.1250 0.0429 0.3636 0.47 4c16:B, 4csy:A, 4csy:B, 1esl:A, 6eyi:A, 6eyj:A, 6eyj:B, 6eyk:A, 1g1t:A
51 4bxw:B 287 47 0.1771 0.0592 0.3617 0.51 4bxw:A
52 8gs8:A 614 69 0.1875 0.0293 0.2609 1.9 3abv:A, 3ae1:A, 3ae2:A, 3ae3:A, 3ae4:A, 3ae5:A, 3ae6:A, 3ae7:A, 3ae8:A, 3ae9:A, 3aea:A, 3aeb:A, 3aec:A, 3aed:A, 3aee:A, 3aef:A, 3aeg:A, 8dyd:A, 8dye:A, 2fbw:A, 2fbw:N, 2h88:A, 2h88:N, 2h89:A, 6myo:A, 6myp:A, 6myq:A, 6myr:A, 6mys:A, 6myt:A, 6myu:A, 3sfd:A, 3sfe:A, 6vax:A, 6vax:C, 2wqy:A, 2wqy:N, 1yq3:A, 1yq4:A, 4ytp:A, 4yxd:A, 1zoy:A, 1zp0:A
53 2w2m:E 49 32 0.1250 0.2449 0.3750 3.2 2w2n:E, 2w2o:E, 2w2p:E, 2w2q:E
54 2w86:A 147 25 0.1458 0.0952 0.5600 3.3
55 5to3:B 367 62 0.2396 0.0627 0.3710 3.4 1dx5:I, 1dx5:J, 1dx5:K, 1dx5:L, 3gis:X, 3gis:Y, 3gis:Z
56 3sqi:A 388 44 0.1562 0.0387 0.3409 6.1 3t79:A, 3t79:D
57 1n7d:A 639 51 0.1562 0.0235 0.2941 6.7 1ajj:A, 3bps:E, 1d2j:A, 1f8z:A, 2fcw:B, 3gcw:E, 3gcx:E, 1hj7:A, 1hz8:A, 1i0u:A, 2kri:B, 2lgp:A, 3m0c:C, 3p5b:L, 3p5c:L, 1xfe:A
58 7vh6:A 768 41 0.1667 0.0208 0.3902 6.8 7vh6:B, 7vh6:C, 7vh6:D, 7vh6:E, 7vh6:F
59 8jxc:A 1337 48 0.1562 0.0112 0.3125 8.6 2i1p:A, 8jxb:B, 8jxh:B, 8jxi:A
60 3v64:C 338 27 0.1146 0.0325 0.4074 8.9 3v64:D
61 4adg:C 432 79 0.2188 0.0486 0.2658 9.0 4adg:A, 4adg:B, 4adj:A, 4adj:B, 4adj:C, 4b3v:A, 4b3v:B, 4b3v:C
62 6pog:B 236 33 0.1354 0.0551 0.3939 9.1

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417