Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GDGPRRLHVSNIPFKYREPDLTAMFEKVGPVVDVEIIFNERGSKGFGFVTMQNPDDADRARAEFNGTTIEGRRVEVNLAT
QRVHNKKAKPLMSV

The query sequence (length=94) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2mgz:A 94 94 1.0000 1.0000 1.0000 3.19e-66
2 2n82:B 104 84 0.5851 0.5288 0.6548 8.02e-37 2err:A, 7vrl:B
3 2rra:A 99 81 0.3404 0.3232 0.3951 1.57e-13 2kxn:B
4 5x8p:v 190 80 0.3085 0.1526 0.3625 2.43e-11 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
5 5x8p:v 190 80 0.2128 0.1053 0.2500 0.002 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
6 7q33:A 93 90 0.3085 0.3118 0.3222 1.76e-10 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
7 2fy1:A 108 81 0.2872 0.2500 0.3333 6.72e-10
8 2mb0:B 95 83 0.2979 0.2947 0.3373 2.38e-09
9 6gd2:A 84 78 0.2872 0.3214 0.3462 2.55e-08 6g2k:A, 6g2k:B, 6gc5:A, 6gc5:B, 6gc5:C, 6gc5:D, 6gd2:B, 6gd3:B, 6gd3:C
10 6hpj:B 84 73 0.2553 0.2857 0.3288 1.57e-07
11 2mgz:B 105 76 0.2766 0.2476 0.3421 2.28e-07 4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
12 2rqc:A 115 81 0.2872 0.2348 0.3333 3.24e-07
13 5m8i:A 114 81 0.2660 0.2193 0.3086 1.08e-06
14 4pkd:B 240 80 0.2447 0.0958 0.2875 1.11e-06 1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
15 7dvq:Y 140 73 0.2021 0.1357 0.2603 2.90e-06 8i0p:Y, 8i0r:Y
16 6m75:A 167 68 0.2234 0.1257 0.3088 3.30e-06
17 6m75:A 167 68 0.1596 0.0898 0.2206 0.016
18 6jvx:A 87 76 0.2660 0.2874 0.3289 4.07e-06 6jvy:A
19 7uj1:B 270 76 0.2872 0.1000 0.3553 4.62e-06 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
20 2leb:A 101 75 0.2660 0.2475 0.3333 5.02e-06 2lec:A
21 6qx9:1K 201 85 0.2553 0.1194 0.2824 5.45e-06 7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
22 4f02:A 175 56 0.2021 0.1086 0.3393 6.20e-06 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
23 4f02:A 175 78 0.2447 0.1314 0.2949 4.16e-04 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
24 1fnx:H 174 80 0.2128 0.1149 0.2500 1.70e-05 1fxl:A, 1g2e:A
25 6r5k:H 394 77 0.2447 0.0584 0.2987 3.85e-05 6r5k:D, 6r5k:F
26 6r5k:H 394 77 0.2447 0.0584 0.2987 1.16e-04 6r5k:D, 6r5k:F
27 6r5k:H 394 78 0.2660 0.0635 0.3205 0.032 6r5k:D, 6r5k:F
28 5ifm:C 256 76 0.2447 0.0898 0.3026 4.46e-05 5ifm:A
29 2x1f:A 94 78 0.1809 0.1809 0.2179 4.60e-05 2km8:B, 2x1a:A
30 7ohx:o 112 72 0.2021 0.1696 0.2639 7.02e-05
31 7zew:A 117 92 0.2872 0.2308 0.2935 7.08e-05 7zex:A
32 5ith:A 80 62 0.2128 0.2500 0.3226 9.98e-05 5o3j:A
33 4qqb:A 169 75 0.2340 0.1302 0.2933 1.00e-04 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
34 6c0f:o 133 72 0.2021 0.1429 0.2639 1.18e-04 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
35 4ed5:B 169 79 0.2340 0.1302 0.2785 1.20e-04 4ed5:A
36 4ed5:B 169 62 0.1596 0.0888 0.2419 0.007 4ed5:A
37 2xs2:A 87 82 0.2447 0.2644 0.2805 1.71e-04 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
38 2mxy:A 105 77 0.2447 0.2190 0.2987 1.93e-04 2mz1:A
39 2i2y:A 150 74 0.2553 0.1600 0.3243 2.40e-04 9asq:H, 5bmg:A, 5bmg:B, 5bmg:H, 5bmg:D, 5bmg:E, 5bmg:F, 5bmg:G, 5bmh:A, 3v3x:C, 3v3x:D
40 5en1:A 184 92 0.2872 0.1467 0.2935 4.01e-04 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
41 5en1:A 184 80 0.2872 0.1467 0.3375 0.001 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
42 4a8x:A 88 74 0.1702 0.1818 0.2162 4.61e-04
43 9gpj:A 184 92 0.2660 0.1359 0.2717 5.04e-04 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
44 9gpj:A 184 81 0.2553 0.1304 0.2963 0.037 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
45 1fje:B 175 74 0.2021 0.1086 0.2568 5.46e-04 1rkj:A
46 5kw6:A 201 73 0.2021 0.0945 0.2603 6.79e-04 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
47 8i0v:4 161 75 0.2447 0.1429 0.3067 0.001
48 8i0v:4 161 40 0.1277 0.0745 0.3000 1.6
49 3lqv:B 115 88 0.2447 0.2000 0.2614 0.002 2f9j:B, 3lqv:A, 7q4o:F, 8qo9:B6, 8qxd:B6, 8qzs:B6, 8r08:B6, 8r09:B6, 8r0a:B6, 8r0b:B6, 8rm5:B6
50 8h6e:4R 106 67 0.1915 0.1698 0.2687 0.002 8h6j:4R, 8qp8:R, 8qp9:R, 8qpk:R, 6qw6:R, 6qx9:R, 8qxd:R, 8r08:R, 8r0a:R
51 2n7c:A 89 73 0.2021 0.2135 0.2603 0.003
52 5mqf:o 223 75 0.2447 0.1031 0.3067 0.004 6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
53 3smz:A 280 73 0.2021 0.0679 0.2603 0.005
54 8xxm:3G 84 62 0.2021 0.2262 0.3065 0.005 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
55 2adc:A 208 83 0.2447 0.1106 0.2771 0.007
56 2adc:A 208 26 0.1383 0.0625 0.5000 1.1
57 8ch6:V 285 64 0.1596 0.0526 0.2344 0.008 7qtt:V
58 8i0s:Y 320 64 0.1596 0.0469 0.2344 0.008 8i0t:Y, 8i0u:Y, 8i0v:Y
59 8by6:B 152 74 0.2021 0.1250 0.2568 0.010 7abg:A1, 6d0y:A, 1h2t:Z, 1h2u:X, 1h2u:Y, 1n52:B, 5oo6:B, 5oo6:E, 5oo6:H, 5oo6:K, 5oo6:N, 5oo6:Q, 5oo6:T, 5oo6:W, 5oob:D, 5oob:J, 5oob:B, 5oob:G, 8pmp:B, 8pnt:B, 8srr:B, 8suy:B
60 5x3z:A 96 92 0.2553 0.2500 0.2609 0.012
61 2cjk:A 167 79 0.2128 0.1198 0.2532 0.012 2km8:C
62 2cjk:A 167 74 0.1915 0.1078 0.2432 0.12 2km8:C
63 6xlv:A 203 99 0.2979 0.1379 0.2828 0.013 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
64 6xlv:A 203 86 0.1809 0.0837 0.1977 1.7 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
65 1rk8:A 87 75 0.1915 0.2069 0.2400 0.017
66 4uer:b 572 52 0.1915 0.0315 0.3462 0.024
67 6gsn:p 658 52 0.1915 0.0274 0.3462 0.028 8cah:p, 8cas:p, 6fyx:p, 6fyy:p, 6gsm:p, 6zce:p, 6zu9:p
68 7b9v:Y 88 60 0.1809 0.1932 0.2833 0.035 6bk8:r, 7dco:p, 6exn:Y, 6g90:Y, 5gmk:a, 6j6g:a, 6j6h:a, 6j6n:a, 6j6q:a, 5lj3:Y, 5lj5:Y, 5mq0:Y, 5nrl:Y, 7oqb:Y, 7oqe:Y, 5wsg:X, 5y88:p, 5ylz:p, 5zwm:p, 5zwo:p
69 2mkc:A 118 73 0.1915 0.1525 0.2466 0.29 2my3:A
70 4lmz:A 176 71 0.2340 0.1250 0.3099 0.30 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
71 4lmz:A 176 69 0.2234 0.1193 0.3043 0.31 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
72 7dco:X 128 73 0.1915 0.1406 0.2466 0.31 5gm6:V, 5zwm:X
73 6htk:A 384 52 0.1702 0.0417 0.3077 1.2 6htk:B, 6htm:A, 6htm:B, 6hto:A, 6hto:B, 4r33:A, 4r33:B, 4r34:A, 4r34:B
74 2rs2:A 84 71 0.1702 0.1905 0.2254 1.8
75 7svj:B 326 52 0.1702 0.0491 0.3077 2.8
76 5d75:A 120 38 0.1277 0.1000 0.3158 5.8 5gpg:A, 3kz7:A, 1pbk:A
77 6g90:A 99 49 0.1596 0.1515 0.3061 6.1
78 7lhd:M 419 36 0.1383 0.0310 0.3611 6.4
79 3w8w:B 461 24 0.0957 0.0195 0.3750 7.7 6foq:A, 6foq:B, 6foq:C, 6foq:D, 6fow:A, 6fow:B, 6fow:C, 6fow:D, 6fp3:A, 6fp3:B, 6fp3:C, 6fp3:D, 6fy8:A, 6fy9:A, 6fya:A, 6fya:B, 6fyb:A, 6fyb:B, 6fyb:C, 6fyb:D, 6fyc:A, 6fyc:B, 6fyd:A, 6fyd:B, 6fyd:C, 6fyd:D, 6fye:A, 6fye:B, 6fyf:A, 6fyf:B, 6fyf:C, 6fyf:D, 6fyg:A, 6fyg:B, 6fyg:C, 6fyg:D, 3w8w:A, 3w8x:A, 3w8x:B, 3w8z:A, 3w8z:B, 4xlo:A, 4xlo:B, 4xlo:C, 4xlo:D
80 2mki:A 203 89 0.2021 0.0936 0.2135 9.0
81 8fnk:13 127 37 0.1383 0.1024 0.3514 9.1 6e4p:C, 6e4p:I, 6e4p:B
82 5vug:A 268 39 0.1170 0.0410 0.2821 9.4

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417