Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
GDAAAGEKAFAPCKACHNFEKNGVGPTLKGVVGAKAGEGADGYAFSDALKKSGLTWDQADLKQWLADPKKKVPGTKMVFP
GISDPKKVDDIIAYLKTK

The query sequence (length=98) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1qn2:A 99 98 1.0000 0.9899 1.0000 6.53e-67 1qn2:B, 1qn2:C
2 1co6:A 107 98 0.4796 0.4393 0.4796 1.01e-29 1cry:A, 1io3:A
3 1cyc:A 103 101 0.4592 0.4369 0.4455 2.45e-25 1cyc:B, 3cyt:O, 3cyt:I, 5cyt:R, 1i54:A, 1i54:B, 1i55:A, 1i55:B, 1lfm:A, 1lfm:B
4 1akk:A 104 100 0.4592 0.4327 0.4500 1.19e-24 2b4z:A, 5c0z:A, 5c0z:D, 5c0z:B, 5c0z:C, 5c9m:A, 5c9m:D, 5c9m:B, 5c9m:C, 1crc:A, 1crc:B, 5df5:A, 5df5:B, 5df5:C, 5df5:D, 8dvx:A, 8dvx:D, 8dvx:B, 8dvx:C, 8dzl:A, 8dzl:B, 8dzl:C, 8dzl:D, 6ff5:A, 1fi7:A, 1fi9:A, 2frc:A, 1giw:A, 2giw:A, 1hrc:A, 1i5t:A, 5iy5:1, 5iy5:2, 3j2t:H, 3j2t:I, 3j2t:J, 3j2t:K, 3j2t:L, 3j2t:M, 3j2t:N, 3jbt:B, 3jbt:D, 3jbt:F, 3jbt:H, 3jbt:J, 3jbt:L, 3jbt:N, 5juy:H, 5juy:I, 5juy:J, 5juy:K, 5juy:L, 5juy:M, 5juy:N, 6k9i:A, 6k9j:A, 1lc1:A, 1lc2:A, 7ljx:A, 7ljx:B, 1m60:A, 6n1o:A, 6n1o:B, 6n1o:C, 6n1o:D, 2n3b:A, 3nbs:A, 3nbs:B, 3nbs:C, 3nbs:D, 3nbt:A, 3nbt:E, 3nbt:B, 3nbt:C, 3nbt:D, 3nbt:F, 4nfg:B, 3o1y:A, 3o1y:B, 3o1y:C, 3o20:A, 3o20:B, 3o20:C, 1ocd:A, 2pcb:B, 4rsz:A, 4rsz:B, 4rsz:C, 4rsz:D, 4rsz:E, 4rsz:F, 6suv:AaA, 6suv:BaB, 6suv:CaC, 6suv:DaD, 6suv:EaE, 6suv:FaF, 6suv:GaG, 6suv:HaH, 1u75:B, 3wc8:A, 1wej:F, 3wui:A, 5wve:B, 5wve:D, 5wve:F, 5wve:H, 5wve:J, 5wve:L, 5wve:N, 2ybb:Y, 5zkv:A
5 2aiu:A 104 100 0.4592 0.4327 0.4500 7.87e-24
6 5dfs:A 104 100 0.4286 0.4038 0.4200 1.10e-22 5dfs:B, 6duj:A, 6duj:C, 6ecj:A, 6ecj:B, 6ecj:C, 6ecj:D, 6ecj:E, 6ecj:F, 6ecj:G, 6ecj:H, 5exq:A, 5exq:B, 1j3s:A, 2n3y:A, 2n9i:A, 2n9j:A, 3nwv:A, 3nwv:B, 3nwv:C, 3nwv:D, 5o10:A, 5o10:B, 5ty3:A, 5ty3:B, 6xnk:A, 6xnk:C, 6xnk:E, 6xnk:G, 3zcf:A, 3zcf:B, 3zcf:C, 3zcf:D, 3zoo:A, 3zoo:B, 3zoo:C, 3zoo:D
7 2yk3:A 110 101 0.4796 0.4273 0.4653 2.34e-22 2yk3:B, 2yk3:C
8 3m97:X 118 96 0.4592 0.3814 0.4688 4.47e-22 1c7m:A, 1i6d:A, 1i6e:A, 1ql3:A, 1ql3:B, 1ql3:C, 1ql3:D, 1ql4:A, 1ql4:B, 1ql4:C, 1ql4:D
9 1ccr:A 111 100 0.4286 0.3784 0.4200 1.22e-21
10 2b0z:B 108 100 0.4184 0.3796 0.4100 1.30e-21 2b10:B, 2b10:D, 2b11:B, 2b11:D, 2b12:B, 7bbt:A, 7bbt:B, 7bbt:C, 7bbt:D, 2bcn:B, 1chh:A, 1chi:A, 1chj:A, 1cie:A, 1cif:A, 1cig:A, 1cih:A, 5cib:B, 5cib:D, 5cic:B, 5cic:D, 5cid:B, 5cid:D, 5cie:B, 5cie:D, 5cif:B, 5cif:D, 5cig:B, 5cig:D, 5cih:B, 5cih:D, 1crg:A, 1crh:A, 1cri:A, 1crj:A, 1csu:A, 1csv:A, 1csw:A, 1csx:A, 1cty:A, 1ctz:A, 3cx5:W, 6egy:A, 6egy:B, 6egz:A, 6egz:B, 1fhb:A, 2gb8:B, 6gd6:A, 6gd7:A, 6gd8:A, 6gd8:C, 6gd8:B, 6gd8:D, 6gd9:A, 6gda:A, 2hv4:A, 1irv:A, 1irw:A, 2jqr:A, 2jti:B, 5kke:A, 5klu:A, 5klu:B, 5kpf:A, 5kpf:B, 1kyo:W, 5lft:A, 2lir:A, 2lit:A, 1lms:A, 5lyc:A, 5lyc:B, 2mhm:A, 7mri:A, 7mri:C, 7mri:E, 4mu8:A, 4mu8:B, 4n0k:A, 4n0k:B, 2n18:B, 2n18:C, 5ncv:A, 5ncv:B, 1nmi:A, 2orl:A, 4p4q:B, 4p4q:D, 6p41:B, 6p41:D, 6p42:B, 6p42:D, 6p43:B, 2pcc:B, 2pcc:D, 7pr2:A, 7pr2:B, 7pr3:A, 7pr3:D, 7pr3:C, 7pr3:B, 7pr4:A, 4q5p:A, 4q5p:B, 4q5p:C, 4qao:A, 4qao:B, 4qao:C, 1rap:A, 1raq:A, 6rsi:A, 6rsj:A, 6rsk:A, 6rsk:B, 6rsl:A, 6rsl:B, 1s6v:B, 1s6v:D, 6s8y:A, 6suy:A, 6suy:B, 5t7h:A, 5t7h:D, 5t7h:B, 5t7h:C, 5t8w:A, 5t8w:B, 3tyi:A, 3tyi:B, 1u74:B, 1u74:D, 6y0j:A, 6y0j:B, 6y0j:C, 6y0j:D, 1ycc:A, 2ycc:A, 4ye1:A, 4ye1:B, 1yfc:A, 1yic:A
11 1hro:A 105 100 0.4796 0.4476 0.4700 5.63e-21 1hro:B
12 8ed4:I 105 102 0.4388 0.4095 0.4216 1.14e-20 8ed4:J, 8ed4:K, 8ed4:L
13 3cxh:W 112 99 0.3776 0.3304 0.3737 6.04e-20 1yea:A, 1yeb:A, 1ytc:A
14 4dy9:A 108 101 0.4592 0.4167 0.4455 9.28e-20 4ged:B
15 6c4w:A 109 87 0.3469 0.3119 0.3908 2.35e-19
16 2c2c:A 112 111 0.4592 0.4018 0.4054 1.22e-16 3c2c:A
17 6rgi:A 92 100 0.3673 0.3913 0.3600 2.08e-15
18 1fj0:A 114 113 0.4388 0.3772 0.3805 3.49e-15 1fj0:B, 1fj0:C, 1fj0:D, 1hh7:A, 1i8o:A, 1i8p:A, 1i8p:B, 1i8p:C, 1i8p:D
19 7tlx:1 102 98 0.3469 0.3333 0.3469 5.01e-15
20 1jdl:A 118 115 0.4082 0.3390 0.3478 2.84e-11
21 7u2v:A 114 100 0.3469 0.2982 0.3400 1.69e-10 7u2v:B
22 7txe:A 131 110 0.3878 0.2901 0.3455 2.61e-10 7txe:B
23 155c:A 134 116 0.4286 0.3134 0.3621 3.34e-10 1cot:A
24 2bh4:X 121 83 0.3367 0.2727 0.3976 5.95e-10 2bgv:X, 2bh5:X
25 1cxa:A 124 83 0.3061 0.2419 0.3614 2.13e-09 1cxc:A, 2cxb:A, 2cxb:B, 1l9b:C, 1l9j:C, 1l9j:D
26 1c2n:A 116 80 0.3061 0.2586 0.3750 5.21e-08 1c2r:A, 1c2r:B, 1vyd:A, 1vyd:B
27 3cp5:A 116 95 0.2449 0.2069 0.2526 0.003 6cuk:A, 6cun:A
28 1cch:A 82 38 0.1939 0.2317 0.5000 0.022 1fi3:A, 2i8f:A
29 2yev:B 319 98 0.2959 0.0909 0.2959 0.045 2yev:E
30 1cor:A 82 27 0.1224 0.1463 0.4444 0.17 6kq1:A, 6kq1:B
31 6kls:C 236 44 0.1633 0.0678 0.3636 0.20 6kls:F, 6klv:C, 6klv:F
32 1kib:A 89 98 0.3163 0.3483 0.3163 0.24 1f1f:A, 1kib:B, 1kib:C, 1kib:D, 1kib:E, 1kib:F, 1kib:G, 1kib:H
33 2d0s:A 79 41 0.1735 0.2152 0.4146 0.46
34 3x15:A 87 26 0.1122 0.1264 0.4231 0.90 3x15:G, 3x15:D, 3x15:J, 2zxy:A
35 1etp:A 190 33 0.1327 0.0684 0.3939 1.1 1etp:B, 1m6z:A, 1m6z:B, 1m6z:C, 1m6z:D, 1m70:A, 1m70:B, 1m70:C, 1m70:D
36 1a56:A 81 19 0.1020 0.1235 0.5263 1.2 1a8c:A, 4jcg:A, 3zow:A, 3zow:B, 3zow:C, 3zow:D, 3zow:E, 3zow:F, 3zow:G, 3zow:H, 3zow:I, 3zow:J, 3zow:K, 3zow:L, 3zow:M, 3zow:N, 3zow:O, 3zow:P, 3zow:Q, 3zow:R, 3zox:A, 3zox:B, 3zox:C, 3zox:D, 3zoy:A, 3zoy:B, 3zoy:C, 3zoy:D
37 6e0w:A 602 44 0.1633 0.0266 0.3636 1.3 6e0w:B
38 5xec:C 80 38 0.1224 0.1500 0.3158 2.3 5xed:C
39 5htk:A 425 45 0.1429 0.0329 0.3111 2.4 5hr5:A, 5htk:B
40 1egy:A 403 16 0.0918 0.0223 0.5625 4.4 1eup:A, 1jin:A, 1jio:A, 1jip:A, 1oxa:A, 1z8o:A, 1z8p:A, 1z8q:A
41 4o1w:A 79 35 0.1429 0.1772 0.4000 4.7 4o1w:D, 4o1w:B, 4o1w:C, 4o1w:E, 4o1w:F
42 7x11:A 564 36 0.1735 0.0301 0.4722 4.7 7x11:B, 7x11:C, 7x11:D, 7x12:A, 7x12:B, 7x12:C, 7x12:D
43 5z25:A 96 26 0.1020 0.1042 0.3846 4.7
44 2axn:A 451 45 0.1327 0.0288 0.2889 4.7 5ajv:B, 5ajw:A, 5ajx:A, 5ajy:A, 5ajz:A, 5ak0:A, 4d4j:A, 4d4k:A, 4d4l:A, 4d4m:A, 2dwo:A, 2dwp:A, 6etj:A, 6hvh:A, 6hvi:A, 6hvj:A, 2i1v:B, 6ibx:A, 6iby:A, 6ibz:A, 6ic0:A, 4ma4:A, 3qpu:A, 3qpv:A, 3qpw:A
45 7lj2:A 507 52 0.1531 0.0296 0.2885 6.0 7lha:A, 7lha:B, 7lj2:B
46 351c:A 82 26 0.1122 0.1341 0.4231 6.1 451c:A, 1dvv:A, 2exv:A, 2exv:C, 2pac:A, 3x39:A, 3x39:B
47 5fg3:A 598 24 0.1122 0.0184 0.4583 6.3 5yt0:A
48 7py4:B 327 67 0.2041 0.0612 0.2985 9.6 6k7g:C, 6k7h:C, 6k7i:C, 6k7j:C, 6k7k:C, 6k7l:C, 6k7m:C, 6k7n:C, 6lkn:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218