BioLiP

>protein
GAYDAQVKNDEQDVELADHEARIKQLRIDVDDHESRITANTKAITALNVRVTTAEGEIASLQTNVSALDGRVTTAENNIS
ALQADYVSKTATTSQSLASPLNVTTSYSVGGKKVLGARQTGWTAATGTANKGVFDADLTFAVSDTYTQSEIQAIANALIT
ERRRTKAMEDALRAHGLID

The query sequence (length=179) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3c9i:B	242	179	0.9944	0.7355	0.9944	5.04e-127	3c9i:C, 3c9i:A, 3c9i:E, 3c9i:F, 3c9i:D, 4zkp:A, 4zkp:B, 4zku:A, 4zku:B
2	4lin:A	289	235	0.9609	0.5952	0.7319	7.78e-110	4lin:D, 4lin:E, 4lin:G, 4lin:H, 4lin:I, 4lin:J, 4lin:L, 4zxq:A, 4zxq:B, 4zxq:C, 4zxq:D, 4zxq:E, 4zxq:F
3	5bu8:A	199	191	0.5754	0.5176	0.5393	3.42e-59	5bu5:A, 5bu5:B, 5bu5:D, 5bu5:E, 5bu5:F, 5bu8:B, 5bvz:A, 5bvz:B, 5bvz:C, 5bvz:D, 5bvz:E, 5bvz:F
4	4eei:B	423	62	0.0838	0.0355	0.2419	0.70	4eei:A, 5hw2:A, 5hw2:C
5	3vkg:A	2954	92	0.1285	0.0078	0.2500	0.82
6	5sct:A	173	55	0.0950	0.0983	0.3091	2.4	2cig:A, 8cop:A, 8cop:B, 8coq:A, 8coq:B, 8cow:A, 8cow:B, 8cox:A, 8cox:B, 8cq8:A, 8cq8:B, 8cq9:A, 8cq9:B, 8cqa:A, 8cqa:B, 6ddp:A, 6ddp:B, 6ddp:C, 6ddp:D, 6dds:A, 6dds:B, 6dds:C, 6dds:D, 6ddw:A, 1df7:A, 1dg5:A, 1dg7:A, 1dg8:A, 5ja3:A, 5ja3:B, 5ja3:C, 5ja3:D, 4kl9:A, 4klx:A, 4klx:B, 4km0:A, 4km0:B, 4km2:A, 4km2:B, 4kne:A, 4kne:B, 4m2x:A, 4m2x:C, 4m2x:E, 4m2x:G, 6nnc:A, 6nnc:B, 6nnd:A, 6nnd:B, 6nne:A, 6nne:B, 6nnh:A, 6nnh:B, 6nni:A, 6nni:B, 5scm:A, 5scn:A, 5sco:A, 5scp:A, 5scp:B, 5scq:A, 5scr:A, 5scs:A, 5scu:A, 5scv:A, 5scv:B, 5scw:A, 5scx:A, 5scy:A, 5scz:A, 5sd0:A, 5sd1:A, 5sd2:A, 5sd3:A, 5sd4:A, 5sd5:A, 5u26:A, 5u27:A, 5ujf:A, 6vs5:A, 6vs5:B, 6vs6:A, 6vs6:B, 6vs8:A, 6vs8:B, 6vs9:A, 6vs9:B, 6vsd:A, 6vsd:B, 6vse:A, 6vse:B, 6vsf:A, 6vsf:B, 6vsg:A, 6vsg:B, 6vv6:A, 6vv6:B, 6vv7:A, 6vv7:B, 6vv8:A, 6vv8:B, 6vv9:A, 6vv9:B, 6vvb:A
7	3vkh:B	2908	79	0.1061	0.0065	0.2405	3.9
8	1abe:A	305	31	0.0894	0.0525	0.5161	5.2	1abf:A, 5abp:A, 6abp:A, 7abp:A, 8abp:A, 9abp:A, 1apb:A, 1bap:A
9	3vkg:B	2853	90	0.1173	0.0074	0.2333	5.8
10	8jg7:E	409	98	0.1341	0.0587	0.2449	7.3	8jg7:A, 8jg7:C, 8jg7:D
11	1v98:A	92	22	0.0559	0.1087	0.4545	9.4	1v98:B

[Back]