Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
GAMGSRDTMFTKIFVGGLPYHTSDKTLHEYFEQFGDIEEAVVITDRNTQKSRGYGFVTMKDRASAERACKDPNPIIDGRK
ANVNLAYLGAKPRTNVQ

The query sequence (length=97) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2mgz:B 105 95 0.9691 0.8952 0.9895 1.50e-68 4ch1:A, 4cio:A, 2ru3:A
2 6jvx:A 87 87 0.7732 0.8621 0.8621 4.08e-53 6jvy:A
3 2rs2:A 84 77 0.2887 0.3333 0.3636 4.21e-16
4 5x3z:A 96 75 0.2887 0.2917 0.3733 1.64e-13
5 5en1:A 184 70 0.2887 0.1522 0.4000 2.61e-13 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
6 5en1:A 184 75 0.2990 0.1576 0.3867 3.63e-12 8hni:A, 8hni:B, 8hni:G, 8hni:I, 8hni:H, 8hni:E, 8hni:K, 8hni:C, 8hni:D, 8hni:J, 8hni:F, 8hni:L, 5ho4:A, 7wm3:A, 7wm3:B, 7wm3:C, 7wm3:D, 5wwe:A, 5wwf:A, 5wwf:C, 5wwg:A
7 2mb0:B 95 76 0.3196 0.3263 0.4079 2.97e-13
8 9gpj:A 184 68 0.2887 0.1522 0.4118 5.40e-13 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
9 9gpj:A 184 75 0.2990 0.1576 0.3867 7.42e-12 6dcl:A, 6dcl:B, 9f4d:A, 9f4e:A, 9f4f:A, 9f4g:A, 9f4h:A, 9f4j:A, 9f4k:A, 9f4l:A, 9f4m:A, 9f4n:A, 9f4o:A, 9f4p:A, 9f4q:A, 9f4r:A, 9f4s:A, 9f4t:A, 9f4u:A, 9f4v:A, 9f4w:A, 9f4x:A, 9f4y:A, 9f4z:A, 9f50:A, 9f51:A, 9f52:A, 9f53:A, 9f54:A, 9f55:A, 9f5c:A, 9f5d:A, 9f5e:A, 9f5f:A, 9f5g:A, 9f5k:A, 9f7f:A, 9f7h:A, 5mpg:A, 5mpl:A, 1pgz:A, 1po6:A, 8rzv:A, 1u1k:A, 1u1l:A, 1u1m:A, 1u1n:A, 1u1o:A, 1u1p:A, 1u1q:A, 1u1r:A, 2up1:A, 4yoe:A
10 6n7p:A 186 62 0.2680 0.1398 0.4194 6.45e-13 6n7r:A, 6n7x:A, 7oqc:B, 7oqe:B, 8w2o:A, 5zwn:Q
11 6g90:B 193 62 0.2680 0.1347 0.4194 9.21e-13
12 2fy1:A 108 62 0.2887 0.2593 0.4516 1.46e-11
13 2leb:A 101 87 0.3093 0.2970 0.3448 4.04e-11 2lec:A
14 2cjk:A 167 82 0.3093 0.1796 0.3659 5.48e-11 2km8:C
15 2cjk:A 167 68 0.2371 0.1377 0.3382 2.56e-09 2km8:C
16 6m75:A 167 68 0.2680 0.1557 0.3824 1.11e-09
17 6m75:A 167 56 0.1443 0.0838 0.2500 0.12
18 7q33:A 93 62 0.2268 0.2366 0.3548 1.12e-09 6pai:D, 6q0r:D, 6q0v:D, 6q0w:D, 6sj7:C, 6ud7:C, 6ue5:C
19 1wtb:A 79 75 0.2680 0.3291 0.3467 3.18e-09 1x0f:A
20 8any:A6 74 71 0.2371 0.3108 0.3239 7.52e-09
21 7zew:A 117 75 0.2990 0.2479 0.3867 8.68e-09 7zex:A
22 5mqf:o 223 92 0.3402 0.1480 0.3587 1.01e-08 6id1:y, 7w59:y, 7w5a:y, 7w5b:y
23 2n82:B 104 76 0.2887 0.2692 0.3684 1.84e-08 2err:A, 7vrl:B
24 7dvq:Y 140 73 0.2680 0.1857 0.3562 3.53e-08 8i0p:Y, 8i0r:Y
25 8h6e:4R 106 81 0.2784 0.2547 0.3333 4.32e-08 8h6j:4R, 8qp8:R, 8qp9:R, 8qpk:R, 6qw6:R, 6qx9:R, 8qxd:R, 8r08:R, 8r0a:R
26 1fnx:H 174 61 0.2371 0.1322 0.3770 5.13e-08 1fxl:A, 1g2e:A
27 1fnx:H 174 63 0.2165 0.1207 0.3333 1.58e-05 1fxl:A, 1g2e:A
28 5ith:A 80 75 0.2680 0.3250 0.3467 7.78e-08 5o3j:A
29 5x8p:v 190 75 0.2784 0.1421 0.3600 1.61e-07 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
30 5x8p:v 190 76 0.2371 0.1211 0.3026 1.01e-05 5mmj:v, 5mmm:v, 5x8r:v
31 4bs2:A 174 75 0.2474 0.1379 0.3200 1.81e-07 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
32 4bs2:A 174 84 0.2371 0.1322 0.2738 4.60e-04 4iuf:A, 4y00:A, 4y00:B, 4y00:C, 4y00:D, 4y0f:A, 4y0f:B
33 2mgz:A 94 76 0.2680 0.2766 0.3421 1.99e-07
34 7ohx:o 112 80 0.2784 0.2411 0.3375 2.30e-07
35 6c0f:o 133 80 0.2784 0.2030 0.3375 2.75e-07 7btb:o, 6cb1:o, 8e5t:o, 6elz:o, 6em1:o, 6em3:o, 6em4:o, 6em5:o, 3jct:o, 6m62:o, 7nac:o, 7ohp:o, 7ohq:o, 7ohr:o, 7ohs:o, 7ohv:o, 7ohw:o, 7r6q:o, 7r7a:o, 7u0h:o, 7uoo:o, 7uqb:o, 7uqz:o, 7v08:o, 8v83:o, 8v84:o, 8v87:o, 6ylx:o, 6yly:o, 5z3g:E
36 4lmz:A 176 59 0.2474 0.1364 0.4068 1.50e-06 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
37 4lmz:A 176 59 0.2062 0.1136 0.3390 0.002 3nmr:A, 3nna:A, 3nnc:A, 3nnh:A, 3nnh:C, 3nnh:B, 3nnh:D
38 4f02:A 175 64 0.2371 0.1314 0.3594 1.78e-06 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
39 4f02:A 175 72 0.2371 0.1314 0.3194 6.57e-04 1cvj:A, 1cvj:B, 1cvj:C, 1cvj:D, 1cvj:E, 1cvj:F, 1cvj:G, 1cvj:H, 4f02:D
40 6gd2:A 84 73 0.2680 0.3095 0.3562 1.93e-06 6g2k:A, 6g2k:B, 6gc5:A, 6gc5:B, 6gc5:C, 6gc5:D, 6gd2:B, 6gd3:B, 6gd3:C
41 8i0v:4 161 79 0.2990 0.1801 0.3671 2.87e-06
42 8i0v:4 161 62 0.1856 0.1118 0.2903 0.010
43 2xs2:A 87 58 0.1856 0.2069 0.3103 2.89e-06 2xs5:A, 2xs5:B, 2xs7:A
44 4ed5:B 169 61 0.2062 0.1183 0.3279 3.50e-06 4ed5:A
45 4ed5:B 169 100 0.2990 0.1716 0.2900 1.59e-05 4ed5:A
46 2rqc:A 115 68 0.2268 0.1913 0.3235 4.76e-06
47 5kw6:A 201 64 0.2165 0.1045 0.3281 5.35e-06 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
48 5kw6:A 201 71 0.1856 0.0896 0.2535 1.49e-04 5kvy:A, 5kvy:B, 5kw1:A, 5kw1:B, 5kw6:B, 7q8a:B, 7q8a:A, 2qfj:A, 2qfj:B, 7z3x:A, 7z3x:B
49 6xlv:A 203 81 0.2680 0.1281 0.3210 5.41e-06 5ev1:A, 5ev2:A, 5ev3:A, 5ev4:A, 2g4b:A, 2hzc:A, 7s3a:A, 7s3b:A, 7s3c:A, 4tu7:A, 4tu7:B, 4tu8:A, 4tu8:B, 4tu9:A, 4tu9:B, 3vaf:A, 3vaf:B, 3vag:A, 3vag:B, 3vah:B, 3vah:A, 3vai:A, 3vai:B, 3vaj:A, 3vaj:B, 3vak:A, 3vak:B, 3val:I, 3val:A, 3val:D, 3val:B, 3vam:A, 3vam:B, 5w0g:A, 6xlw:A, 6xlx:A, 2yh1:A
50 8by6:B 152 61 0.1959 0.1250 0.3115 7.10e-06 7abg:A1, 6d0y:A, 1h2t:Z, 1h2u:X, 1h2u:Y, 1n52:B, 5oo6:B, 5oo6:E, 5oo6:H, 5oo6:K, 5oo6:N, 5oo6:Q, 5oo6:T, 5oo6:W, 5oob:D, 5oob:J, 5oob:B, 5oob:G, 8pmp:B, 8pnt:B, 8srr:B, 8suy:B
51 5m8i:A 114 68 0.2165 0.1842 0.3088 1.66e-05
52 8y6o:W 167 76 0.2371 0.1377 0.3026 1.68e-05
53 7csz:A 175 70 0.2371 0.1314 0.3286 2.93e-05
54 7csz:A 175 65 0.2165 0.1200 0.3231 2.25e-04
55 6r5k:H 394 64 0.2268 0.0558 0.3438 3.07e-05 6r5k:D, 6r5k:F
56 6r5k:H 394 75 0.2577 0.0635 0.3333 0.002 6r5k:D, 6r5k:F
57 6r5k:H 394 64 0.1959 0.0482 0.2969 0.009 6r5k:D, 6r5k:F
58 6r5k:H 394 65 0.1959 0.0482 0.2923 0.015 6r5k:D, 6r5k:F
59 2yka:A 124 76 0.2577 0.2016 0.3289 3.18e-05
60 8ch6:V 285 75 0.2577 0.0877 0.3333 5.09e-05 7qtt:V
61 8i0s:Y 320 75 0.2577 0.0781 0.3333 5.46e-05 8i0t:Y, 8i0u:Y, 8i0v:Y
62 4pkd:B 240 77 0.2268 0.0917 0.2857 1.51e-04 1aud:A, 7b0y:c, 3bo2:A, 3bo3:A, 3bo4:A, 4c4w:A, 4c4w:E, 3cul:A, 3cul:B, 3cun:A, 3cun:B, 7d7v:C, 5ddo:G, 5ddo:C, 5ddp:D, 5ddp:C, 5ddq:D, 5ddq:C, 5ddr:D, 5ddr:C, 7dlz:A, 7dlz:B, 1drz:A, 7dwh:A, 7dwh:B, 1dz5:A, 1dz5:B, 3egz:A, 5fj4:A, 5fj4:E, 3g8s:A, 3g8s:B, 3g8s:C, 3g8s:D, 3g8t:A, 3g8t:B, 3g8t:C, 3g8t:D, 3g96:A, 3g96:B, 3g96:C, 3g96:D, 3g9c:A, 3g9c:B, 3g9c:C, 3g9c:D, 8gxb:C, 8gxb:D, 8gxb:F, 8gxc:C, 8gxc:D, 8gxc:F, 3hhn:B, 3hhn:D, 3iin:A, 3irw:P, 3iwn:C, 3iwn:D, 8jy0:A, 8jy0:C, 8jy0:E, 3k0j:A, 3k0j:B, 3l3c:A, 3l3c:B, 3l3c:C, 3l3c:D, 6las:E, 6las:D, 6las:C, 6lau:E, 6lau:D, 6lau:C, 6lax:D, 6lax:E, 6lax:C, 6laz:D, 6laz:E, 6laz:C, 1m5k:C, 1m5k:F, 1m5o:C, 1m5o:F, 1m5p:C, 1m5p:F, 1m5v:C, 1m5v:F, 3mum:P, 3mur:P, 3mut:P, 3muv:P, 3mxh:P, 2nz4:A, 2nz4:B, 2nz4:C, 2nz4:D, 2oih:A, 2oj3:A, 3p49:B, 4pr6:A, 4prf:A, 7qr3:A, 7qr3:B, 7qr4:A, 6qx9:1A, 3r1h:A, 3r1h:D, 3r1l:A, 3r1l:D, 1sj3:P, 1sj4:P, 1sjf:A, 6sqn:A, 6sqn:B, 6sqn:C, 6sqq:AAA, 6sqq:BBB, 6sqq:CCC, 1u6b:A, 3ucu:P, 3ucz:P, 3ud3:P, 3ud4:P, 1urn:A, 1urn:B, 1urn:C, 1vbx:A, 1vby:A, 1vbz:A, 1vc0:A, 1vc5:A, 1vc6:A, 7vpx:M, 4w90:B, 4w92:B, 1zzn:A
63 8xxm:3G 84 57 0.1959 0.2262 0.3333 2.10e-04 5k0y:O, 8pj1:o, 8pj2:o, 8pj3:o, 8pj4:o, 8pj5:o, 8pj6:o
64 4qqb:A 169 65 0.2165 0.1243 0.3231 2.63e-04 1b7f:A, 1b7f:B, 4qqb:B
65 7uj1:B 270 75 0.2680 0.0963 0.3467 2.86e-04 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
66 7uj1:B 270 85 0.2577 0.0926 0.2941 5.71e-04 7pu5:B, 7pu5:D, 7pu5:H, 7pu5:J, 7pu5:L, 7sp0:B, 7uj1:A
67 7zap:A 97 52 0.1546 0.1546 0.2885 3.05e-04
68 6qx9:1K 201 77 0.2268 0.1095 0.2857 3.19e-04 7b0y:b, 4pjo:K, 4pjo:k, 4pjo:N, 4pjo:n, 8r08:1K, 7vpx:O
69 5ifm:C 256 80 0.2268 0.0859 0.2750 3.71e-04 5ifm:A
70 5ifm:C 256 55 0.2165 0.0820 0.3818 7.72e-04 5ifm:A
71 3smz:A 280 59 0.1856 0.0643 0.3051 4.47e-04
72 2x1f:A 94 61 0.1443 0.1489 0.2295 6.47e-04 2km8:B, 2x1a:A
73 2mkc:A 118 98 0.2371 0.1949 0.2347 0.002 2my3:A
74 8pv1:CI 152 58 0.1753 0.1118 0.2931 0.002 8i9p:CI, 8i9r:CI, 8i9t:CI, 8i9v:CI, 8i9w:CI, 8i9x:CI, 8i9y:CI, 8i9z:CI, 8ia0:CI, 8pv3:CI, 8pv4:CI, 8pv7:CI, 8pvk:CI
75 8ch6:U 295 79 0.2371 0.0780 0.2911 0.002 7a5p:P, 8c6j:M, 6ff4:P, 6ff7:P, 9fmd:O, 8i0p:O, 8i0r:O, 8i0s:O, 8i0t:O, 8i0u:O, 8i0v:O, 8i0w:O, 6icz:O, 6id0:O, 6id1:O, 5mqf:P, 6qdv:M, 7qtt:U, 8ro2:O, 7w59:O, 7w5a:O, 7w5b:O, 5xjc:O, 5yzg:O, 5z56:O, 5z57:O, 6zym:P
76 2n7c:A 89 78 0.2062 0.2247 0.2564 0.003
77 8esq:o 137 45 0.1546 0.1095 0.3333 0.003 8esr:o, 8etg:o, 8eth:o, 8eti:o, 8eup:o, 8euy:o, 8ev3:o
78 3d2w:A 72 74 0.1856 0.2500 0.2432 0.008
79 7abi:P 237 77 0.2268 0.0928 0.2857 0.008 7aav:P, 7abg:P
80 6xh2:A 93 46 0.1753 0.1828 0.3696 0.020 6cmn:A, 3k0j:D, 3k0j:C, 6xh0:A, 6xh1:A, 6xh3:A
81 6f4h:C 96 45 0.1753 0.1771 0.3778 0.021 6f4g:B, 6f4g:E, 6f4h:A, 6f4h:E
82 2xb2:D 89 61 0.1649 0.1798 0.2623 0.022 2xb2:Z
83 4a8x:A 88 85 0.2474 0.2727 0.2824 0.027
84 7qde:B 169 61 0.1649 0.0947 0.2623 0.029 7qdd:B
85 8fkp:SH 150 68 0.1753 0.1133 0.2500 0.035 8fkq:SH, 8fkr:SH, 8fks:SH, 8fkt:SH, 8fku:SH, 8fkv:SH, 8fkw:SH, 8fkx:SH, 8fky:SH, 8fkz:SH, 8fl2:SH, 8fl6:SH, 8fla:SH, 8fld:SH, 8ine:t, 8inf:t, 8ipx:t, 8ipy:t, 8ir3:t
86 7dco:X 128 86 0.1959 0.1484 0.2209 0.069 5gm6:V, 5zwm:X
87 6hpj:B 84 68 0.2062 0.2381 0.2941 0.084
88 8ro0:O 342 44 0.1443 0.0409 0.3182 0.10 8ro1:O
89 3lqv:B 115 57 0.1546 0.1304 0.2632 0.10 2f9j:B, 3lqv:A, 7q4o:F, 8qo9:B6, 8qxd:B6, 8qzs:B6, 8r08:B6, 8r09:B6, 8r0a:B6, 8r0b:B6, 8rm5:B6
90 2mki:A 203 59 0.1856 0.0887 0.3051 0.12
91 6snj:A 131 65 0.2165 0.1603 0.3231 0.13 6gbm:B
92 7s7b:C 79 74 0.2062 0.2532 0.2703 0.14 7s7b:G, 7s7c:C
93 8idf:A 459 71 0.1856 0.0392 0.2535 0.15
94 5o1y:A 163 61 0.1443 0.0859 0.2295 0.15 5o1z:A, 5o20:A
95 7dco:4 174 61 0.1546 0.0862 0.2459 0.22 6g90:R, 5gm6:e, 5nrl:R, 7oqb:R, 7oqe:R, 5zwm:4
96 1fje:B 175 80 0.2474 0.1371 0.3000 0.27 1rkj:A
97 8ro1:p 76 46 0.1443 0.1842 0.3043 0.29
98 5det:B 94 56 0.1649 0.1702 0.2857 0.32 5det:A
99 5wbu:D 317 48 0.1753 0.0536 0.3542 0.59 5wbu:C, 5wby:D, 5wby:C
100 6i5r:A 428 30 0.1237 0.0280 0.4000 0.91 6i5v:A, 6i5w:A
101 6fec:u 76 47 0.1031 0.1316 0.2128 1.1
102 1rk8:A 87 77 0.1959 0.2184 0.2468 1.5
103 8h2h:D 599 52 0.1443 0.0234 0.2692 1.7
104 2adb:A 127 57 0.1546 0.1181 0.2632 1.8 3zzy:A, 3zzy:B, 3zzz:A, 3zzz:B
105 7q4l:A 227 68 0.1649 0.0705 0.2353 1.9
106 5lr8:A 844 35 0.1134 0.0130 0.3143 2.6 5lr8:B, 5lra:A, 5lra:B, 5lrb:B, 5lrb:A
107 5lbh:A 143 23 0.0928 0.0629 0.3913 3.0 5lbh:J, 5lbh:B, 5lbh:C, 5lbh:D, 5lbh:G, 5lbh:E, 5lbh:F, 5lbh:L, 5lbh:H, 5lbh:I, 5lbh:K
108 8ita:A 429 103 0.2784 0.0629 0.2621 4.6 8inp:A
109 2mkk:A 213 28 0.0928 0.0423 0.3214 4.8
110 4aiq:A 660 84 0.2680 0.0394 0.3095 5.6
111 3d45:A 383 39 0.1134 0.0287 0.2821 6.5 2a1r:A, 2a1r:B
112 3hyu:B 146 24 0.1031 0.0685 0.4167 7.0 3a0g:B
113 8pbz:A 1003 16 0.0928 0.0090 0.5625 7.1 8pbz:D, 8pc0:A, 6r41:A, 6r43:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417