BioLiP

>protein
GAMGQKAQQKNGYQEIRVEVMGGYTPELIVLKKSVPARIVFDRKDPSPCLDQIVFPDFGVHANLPMGEEYVVEITPEQAG
EFSFACGMNMMHGKMIVE

The query sequence (length=98) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4f2e:A	98	98	1.0000	1.0000	1.0000	4.46e-70
2	4f2f:A	100	92	0.3776	0.3700	0.4022	2.64e-20
3	1iby:A	112	71	0.2245	0.1964	0.3099	6.70e-04	1iby:B, 1iby:C, 1iby:D, 1ibz:A, 1ibz:B, 1ibz:C, 1ibz:D, 1ic0:A, 1ic0:B, 1ic0:C, 1ic0:D, 1ic0:E, 1ic0:F
4	4i3h:A	1037	81	0.2245	0.0212	0.2716	0.024	3foe:D, 3foe:C, 3fof:C, 3fof:D, 4i3h:B, 4juo:A, 4juo:C, 3k9f:A, 3k9f:C, 3k9f:D, 3k9f:B, 4koe:A, 4koe:C, 4koe:D, 4koe:B, 4kpe:A, 4kpe:C, 4kpe:D, 4kpe:B, 4kpf:A, 4kpf:C, 4kpf:D, 4kpf:B, 3ksa:A, 3ksa:C, 3ksa:D, 3ksa:B, 3ksb:A, 3ksb:B, 3ksb:C, 3ksb:D, 3ltn:A, 3ltn:C, 3ltn:D, 3ltn:B, 3rad:A, 3rad:C, 3rad:D, 3rad:B, 3rae:A, 3rae:C, 3rae:D, 3rae:B, 3raf:A, 3raf:C, 3raf:D, 3raf:B, 4z3o:B, 4z3o:A, 4z4q:A, 4z4q:B, 4z53:A, 4z53:B
5	8c41:A	720	81	0.2245	0.0306	0.2716	0.029	8c41:B
6	3fof:A	435	65	0.1939	0.0437	0.2923	0.31	3foe:A, 3foe:B, 3fof:B
7	8cnt:A	620	46	0.1327	0.0210	0.2826	0.98
8	6j86:A	396	21	0.0918	0.0227	0.4286	2.0	6j85:A, 6j85:B, 6j86:B, 6j87:A, 6j87:B, 6j88:A, 6j88:B
9	6hzn:A	743	22	0.1122	0.0148	0.5000	5.0
10	3gnw:B	568	44	0.1633	0.0282	0.3636	5.2	2awz:A, 2awz:B, 2ax0:A, 2ax0:B, 2ax1:A, 2ax1:B, 2brk:A, 2brl:A, 3br9:A, 3br9:B, 3bsa:A, 3bsa:B, 3bsc:A, 3bsc:B, 3cde:A, 3cde:B, 3ciz:B, 3cj0:A, 3cj0:B, 3cj2:A, 3cj2:B, 3cj3:A, 3cj3:B, 3cj4:A, 3cj4:B, 3cj5:A, 3cj5:B, 3co9:A, 3co9:B, 3cso:A, 3cso:B, 3cvk:A, 3cvk:B, 3cwj:A, 3cwj:B, 5czb:A, 5czb:B, 3d28:A, 3d28:B, 2d3u:A, 2d3u:B, 2d3z:A, 2d3z:B, 2d41:A, 2d41:B, 3d5m:A, 3d5m:B, 4dru:A, 2dxs:A, 2dxs:B, 3e51:A, 3e51:B, 4eaw:A, 4eaw:B, 4eo6:A, 4eo6:B, 4eo8:A, 4eo8:B, 3fqk:A, 3fqk:B, 3fql:A, 3frz:A, 2fvc:A, 2fvc:B, 3g86:A, 3g86:B, 2gc8:A, 2gc8:B, 2giq:A, 2giq:B, 2gir:A, 2gir:B, 4gmc:B, 3gnv:A, 3gnv:B, 3gnw:A, 3gol:A, 3gol:B, 1gx5:A, 1gx6:A, 3gyn:A, 3gyn:B, 3h2l:A, 3h2l:B, 3h59:A, 3h59:B, 3h5s:A, 3h5s:B, 3h5u:A, 3h5u:B, 3h98:A, 3h98:B, 2hai:A, 3hhk:A, 3hhk:B, 3hky:A, 3hky:B, 2hwh:A, 2hwh:B, 2hwi:A, 2hwi:B, 2i1r:A, 2i1r:B, 3igv:A, 3igv:B, 4ih5:A, 4ih5:B, 4ih6:A, 4ih6:B, 4ih7:A, 4ih7:B, 2ijn:A, 2ijn:B, 4iz0:A, 4j02:A, 4j02:B, 4j04:A, 4j04:B, 4j06:A, 4j06:B, 4j08:A, 4j0a:A, 2jc0:A, 2jc0:B, 2jc1:A, 2jc1:B, 4jjs:A, 4jjs:B, 4jju:A, 4jju:B, 4jtw:A, 4jtw:B, 4jty:A, 4jty:B, 4jtz:A, 4jtz:B, 4ju1:A, 4ju1:B, 4ju2:A, 4ju2:B, 4ju3:A, 4ju3:B, 4ju4:A, 4ju4:B, 4ju6:A, 4ju7:A, 4jvq:A, 4jvq:B, 4jy0:A, 4jy0:B, 4jy1:A, 4kai:A, 4kai:B, 4kb7:A, 4kb7:B, 4kbi:A, 4kbi:B, 4ke5:A, 4ke5:B, 3lkh:A, 3lkh:B, 3mf5:A, 3mf5:B, 4mia:A, 4mia:B, 4mib:A, 4mib:B, 4mk7:A, 4mk7:B, 4mk8:A, 4mk8:B, 4mk9:A, 4mk9:B, 4mka:A, 4mka:B, 4mkb:A, 4mkb:B, 6mvk:A, 6mvk:B, 6mvp:A, 6mvp:B, 6mvq:A, 6mvq:B, 3mww:B, 4mz4:A, 4mz4:B, 1nb6:A, 1nb6:B, 1nb7:A, 1nb7:B, 1nhu:A, 1nhu:B, 1nhv:A, 1nhv:B, 4nld:A, 2o5d:A, 2o5d:B, 4oow:A, 1os5:A, 3phe:A, 3phe:B, 3phe:C, 3phe:D, 5pzk:A, 5pzk:B, 5pzl:A, 5pzl:B, 5pzm:A, 5pzm:B, 5pzn:A, 5pzn:B, 5pzo:A, 5pzo:B, 5pzp:A, 5pzp:B, 3q0z:A, 3q0z:B, 2qe2:A, 2qe2:B, 2qe5:A, 3qgd:A, 3qgd:B, 3qge:A, 3qge:B, 3qgf:A, 3qgf:B, 3qgg:A, 3qgg:B, 4ry5:A, 4ry5:B, 3ska:A, 3ska:B, 3ske:A, 3ske:B, 3skh:A, 3skh:B, 4tlr:A, 4tn2:A, 5trh:A, 5trh:B, 5tri:A, 5tri:B, 5trj:A, 5trj:B, 5trk:A, 5trk:B, 5twn:A, 5twn:B, 4txs:C, 3tyq:A, 3tyq:B, 3tyv:A, 3tyv:B, 4ty8:A, 4ty8:B, 4ty9:A, 4tya:A, 4tya:B, 4tya:C, 4tya:D, 4tyb:A, 4tyb:B, 4tyb:C, 4tyb:D, 3u4o:A, 3u4o:B, 3u4r:A, 3u4r:B, 3udl:A, 3udl:B, 3udl:C, 3udl:D, 3uph:A, 3uph:B, 3upi:A, 3upi:B, 3vqs:A, 3vqs:B, 3vqs:C, 3vqs:D, 5w2e:A, 5w2e:B, 6w4g:A, 6w4g:B, 2wcx:A, 2who:A, 2who:B, 2wrm:A, 2xhv:A, 2xwy:A, 2yoj:A, 2yoj:B, 1yvf:A, 1z4u:A
11	4gri:B	485	30	0.1122	0.0227	0.3667	6.3	4gri:A
12	4uph:A	504	48	0.1531	0.0298	0.3125	8.6	4uph:B, 4uph:C, 4uph:D

[Back]