Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
FSMKIGIIGAMEEEVTLLRDKIENRQTISLGGCEIYTGQLNGTEVALLKSGIGKVAAALGATLLLEHCKPDVIINTGSAG
GLAPTLKVGDIVVSDEARYHDADVTAFGYEYGQLPGCPAGFKADDKLIAAAEACIAELNLNAVRGLIVSGDAFINGSVGL
AKIRHNFPQAIAVEMEATAIAHVCHNFNVPFVVVRAISDVADQQSHLSFDEFLAVAAKQSSLMVESLVQKLAHG

The query sequence (length=234) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4f2p:B 239 232 0.9487 0.9289 0.9569 9.77e-157 3df9:A, 3df9:B, 4f1w:A, 4f1w:B, 4f2p:A, 4f2w:A, 4f2w:B, 4f3c:A, 4f3c:B, 4f3k:A, 4f3k:B, 1jys:A, 1jys:B, 1nc1:A, 1nc1:B, 1nc3:A, 1nc3:B, 3o4v:A, 3o4v:B, 4wkc:A, 1y6q:A, 1y6q:B, 1y6r:A, 1y6r:B, 4yml:A, 1z5n:A, 1z5n:B, 1z5o:A, 1z5o:B
2 4g89:A 233 233 0.8974 0.9013 0.9013 1.62e-155 4g89:B
3 4wkb:A 237 230 0.5940 0.5865 0.6043 2.22e-96 3dp9:A, 3dp9:C, 4wkb:B, 4x24:A, 4x24:B
4 5ue1:A 233 231 0.5855 0.5880 0.5931 1.29e-92 5ue1:B
5 6po4:A 233 232 0.5556 0.5579 0.5603 2.04e-89 6po4:B, 6po4:C, 6po4:D, 6po4:E, 6po4:F
6 3bl6:A 230 230 0.5342 0.5435 0.5435 4.32e-84
7 6if8:B 228 229 0.5128 0.5263 0.5240 5.58e-80 6if8:A, 6if8:C, 6if8:D, 6k2q:A, 6k2q:B, 6k2q:C, 6k2q:D
8 4qez:B 231 228 0.5214 0.5281 0.5351 2.49e-79 4qez:A, 4qez:C
9 5dk6:A 242 232 0.4957 0.4793 0.5000 9.13e-72
10 3eei:A 231 228 0.4829 0.4892 0.4956 4.14e-68 3eei:B
11 1zos:A 230 229 0.4060 0.4130 0.4148 5.74e-63 3mms:A, 1zos:B, 1zos:C, 1zos:D, 1zos:E, 1zos:F
12 4l0m:A 237 234 0.3846 0.3797 0.3846 2.81e-53
13 4g41:B 236 230 0.4103 0.4068 0.4174 7.53e-51
14 4jwt:A 245 230 0.3590 0.3429 0.3652 3.33e-47
15 4jos:B 230 228 0.3547 0.3609 0.3640 5.75e-46 4jos:A
16 6ayo:A 229 229 0.3632 0.3712 0.3712 1.51e-42 6ayo:B, 6ayq:A, 6ayq:B, 6ayr:A, 6ayr:B, 6ayr:C, 6ayr:D, 6ays:A, 6ays:B, 6ays:C, 6ays:G, 6ays:D, 6ays:H, 6ays:E, 6ays:F, 6ayt:A, 6ayt:B, 6ayt:C, 6ayt:D
17 4yo8:B 242 233 0.3462 0.3347 0.3476 7.74e-35 4bmx:B, 4bmz:A, 4bmz:B, 5ccd:A, 5cce:A, 6dyu:A, 6dyu:B, 6dyv:A, 6dyv:B, 6dyw:A, 6dyw:B, 6dyy:A, 6dyy:B, 6dyy:C, 6dyy:D, 4ffs:A, 5jpc:A, 5k1z:A, 5kb3:A, 3nm5:A, 3nm5:B, 3nm6:B, 4ojt:A, 4oy3:A, 4p54:A, 4wkn:A, 4wko:A, 4wkp:A, 4wkp:B, 4wkp:C, 4wkp:D, 4ynb:A, 4yo8:A
18 5b7g:A 249 244 0.2949 0.2771 0.2828 1.14e-17 5b7g:B, 5b7n:A, 5b7n:B, 5b7p:A, 5b7p:B
19 3bsf:A 244 190 0.2265 0.2172 0.2789 5.91e-08 3bsf:B
20 2qtt:A 248 174 0.2051 0.1935 0.2759 1.28e-07 2h8g:A, 2h8g:B, 3lgs:A, 3lgs:B, 3lgs:C, 3lgs:D, 2qtg:A, 2qtg:B, 2qtt:B
21 4pr3:A 205 171 0.2094 0.2390 0.2865 8.69e-07 4pr3:B
22 1jdv:C 235 160 0.1966 0.1957 0.2875 2.52e-06 1jds:A, 1jds:B, 1jds:C, 1jds:D, 1jds:E, 1jds:F, 1jdt:A, 1jdt:B, 1jdt:C, 1jdv:A, 1jdv:B, 1jdv:D, 1jdv:E, 1jdv:F, 1jdz:A, 1jdz:B, 1jdz:C, 1je0:A, 1je0:B, 1je0:C, 1je1:A, 1je1:B, 1je1:C, 1je1:D, 1je1:E, 1je1:F, 1jp7:A, 1jp7:B, 1jp7:C, 1jpv:A, 1jpv:B, 1jpv:C
23 3uaw:A 233 188 0.1752 0.1760 0.2181 7.26e-06 2ac7:A, 2ac7:B, 3uav:A, 3uax:A, 3uay:A, 3uaz:A
24 2isc:D 238 169 0.1966 0.1933 0.2722 1.22e-05 2i4t:A, 2i4t:B, 2i4t:C, 2isc:A, 2isc:B, 2isc:C, 2isc:E, 2isc:F, 1z34:A, 1z35:A, 1z36:A, 1z37:A, 1z38:A, 1z39:A
25 3qpb:C 254 59 0.1026 0.0945 0.4068 3.25e-05 3qpb:A, 3qpb:B, 3qpb:D, 3qpb:E, 3qpb:F, 3qpb:G, 3qpb:H, 3qpb:I, 3qpb:J, 3qpb:K, 3qpb:L, 3qpb:M, 3qpb:N, 3qpb:O, 3qpb:P, 3qpb:Q, 3qpb:R
26 3u40:D 241 191 0.2350 0.2282 0.2880 6.05e-05 3u40:A, 3u40:B, 3u40:C, 3u40:E, 3u40:F
27 3of3:A 240 197 0.1795 0.1750 0.2132 5.15e-04 3of3:B, 3of3:C, 3of3:D, 3of3:E, 3of3:F, 3of3:G, 3of3:H, 3of3:I, 3of3:J, 3of3:K, 3of3:L, 1vhw:A, 1vhw:D, 1vhw:B, 1vhw:F, 1vhw:C, 1vhw:E
28 1odi:A 234 151 0.1880 0.1880 0.2914 0.001 1odi:B, 1odi:C, 1odi:D, 1odi:E, 1odi:F, 1odj:A, 1odj:B, 1odj:C, 1odj:D, 1odj:E, 1odj:F, 1odl:A, 1odl:F, 1odl:B, 1odl:C, 1odl:D, 1odl:E
29 3occ:F 238 221 0.2137 0.2101 0.2262 0.001 1a69:A, 1a69:B, 1a69:C, 5i3c:A, 5i3c:B, 5i3c:C, 5iu6:A, 5iu6:B, 5iu6:C, 1k9s:A, 1k9s:D, 1k9s:B, 1k9s:E, 1k9s:C, 1k9s:F, 3occ:A, 3occ:B, 3occ:C, 3occ:D, 3occ:E, 3ooe:A, 3ooe:B, 3ooe:C, 3ooe:D, 3ooe:E, 3ooe:F, 3opv:A, 3opv:B, 3opv:C, 3opv:D, 3opv:E, 3opv:F, 3opv:G, 3opv:H, 3opv:I, 3opv:J, 3opv:K, 3opv:L, 1oty:A, 1oty:B, 1oty:C, 1ou4:A, 1ou4:B, 1ou4:C, 1oum:A, 1oum:B, 1oum:C, 1ov6:A, 1ov6:B, 1ov6:C, 1ovg:A, 1ovg:B, 1ovg:C, 1pk7:A, 1pk7:B, 1pk7:C, 1pk9:A, 1pk9:B, 1pk9:C, 1pke:A, 1pke:B, 1pke:C, 1pr0:A, 1pr0:B, 1pr0:C, 1pr1:A, 1pr1:B, 1pr1:C, 1pr2:A, 1pr2:B, 1pr2:C, 1pr4:A, 1pr4:B, 1pr4:C, 1pr5:A, 1pr5:B, 1pr5:C, 1pr6:A, 1pr6:B, 1pr6:C, 1pw7:A, 1pw7:B, 1pw7:C, 4ts3:A, 4ts3:D, 4ts3:B, 4ts3:C, 4ts3:E, 4ts3:F, 4ts9:A, 4ts9:C, 4ts9:B, 4tta:A, 4tta:B, 4tta:C, 4tta:F, 4tta:D, 4tta:E, 4tti:A, 4tti:B, 4tti:C, 4tti:F, 4tti:D, 4tti:E, 4ttj:A, 4ttj:D, 4ttj:B, 3ut6:A, 3ut6:B, 3ut6:C, 6xz2:B, 6xz2:C
30 6f4w:A 233 197 0.1709 0.1717 0.2030 0.004 6f4w:D, 6f4w:B, 6f4w:E, 6f4w:C, 6f4w:F, 6f4x:A, 6f4x:D, 6f4x:B, 6f4x:E, 6f4x:C, 6f4x:F, 5lu0:A, 5lu0:B, 5lu0:C, 5lu0:E, 5mx4:C, 5mx6:A, 5mx6:B, 5mx6:C, 5mx6:D, 5mx6:F, 5mx8:A, 7ooy:B, 7ooz:B, 7op9:A, 7op9:B, 7op9:C, 7op9:D, 7op9:E, 7op9:F, 7op9:G, 7op9:H, 7op9:I, 7op9:J, 7op9:K, 7op9:L, 7opa:C, 7opa:H
31 1t8y:F 461 167 0.1667 0.0846 0.2335 0.025 1t8s:A, 1t8s:B, 1t8s:C, 1t8s:D, 1t8s:E, 1t8s:F, 1t8y:C, 1t8y:B, 1t8y:E, 1t8y:A
32 4dae:A 232 145 0.1368 0.1379 0.2207 0.031 4d8v:A, 4d8v:B, 4d9h:A, 4d9h:B, 4da0:A, 4da6:A, 4da7:A, 4da8:A, 4dab:A, 4dan:A, 4dan:B, 4dao:A, 4dao:B, 4dar:A
33 5efo:B 253 122 0.1239 0.1146 0.2377 0.034 5c80:A, 5c80:B, 5c80:C, 5c80:D, 5c80:E, 5c80:F, 5efo:A, 5efo:C, 5efo:D, 5efo:E, 5efo:F, 5epu:A, 5epu:B, 5epu:C, 5epu:D, 5epu:E, 5epu:F, 4k6o:A, 4k6o:B, 4k6o:C, 4k6o:D, 4k6o:E, 4k6o:F, 5lhv:A, 5lhv:B, 5lhv:C, 5lhv:D, 5lhv:E, 5lhv:F, 5lok:A, 5lok:B, 5lok:C, 5lok:D, 5lok:E, 5lok:F, 5m2t:A, 5m2t:B, 5m2t:C, 5m2t:D, 5m2t:E, 5m2t:F, 5miw:A, 5miw:B, 5miw:C, 5miw:D, 5miw:E, 5miw:F, 4oeh:A, 4oeh:B, 4oeh:E, 4oeh:F, 4ogl:A, 4ogl:B, 4ogl:C, 4ogl:D, 4ogl:E, 4ogl:F, 3pns:B, 3pns:C, 3pns:D, 3pns:E, 3pns:F, 3pns:G, 3pns:H, 3pns:I, 3pns:J, 3pns:K, 3pns:L, 6rca:A, 6rca:B, 6rca:C, 6rca:D, 6rca:E, 6rca:F, 4u2k:B, 4u2k:D, 4u2k:F
34 2vq1:B 213 26 0.0427 0.0469 0.3846 1.3 2vq1:F
35 1kv9:A 664 101 0.1068 0.0377 0.2475 2.7
36 3d1v:A 288 23 0.0470 0.0382 0.4783 3.4 2a0w:A, 2a0x:A, 2a0y:A, 3bgs:A, 4ear:A, 4ear:B, 4ear:C, 4eb8:A, 4eb8:B, 4eb8:C, 5etj:A, 5etj:B, 5etj:C, 5etj:D, 5etj:E, 5etj:F, 3gb9:A, 3gb9:B, 3gb9:C, 3ggs:A, 3ggs:B, 3ggs:C, 4gka:A, 4gka:B, 4gka:C, 4gka:D, 4gka:E, 4gka:F, 3iny:A, 3k8o:E, 3k8o:Q, 3k8o:S, 3k8o:T, 3k8o:U, 3k8o:Y, 3k8q:A, 2oc4:A, 2oc9:A, 2on6:A, 1pf7:E, 3phb:E, 3phb:Q, 3phb:S, 3phb:T, 3phb:U, 3phb:Y, 1pwy:E, 2q7o:E, 1rct:E, 1rfg:E, 1rr6:A, 1rsz:A, 1rt9:A, 5ugf:A, 5ugf:B, 5ugf:C, 5ugf:D, 5ugf:E, 5ugf:F, 1v2h:E, 1v3q:E, 1v41:E, 1v45:E, 1yry:E, 7zsl:A, 7zsl:B, 7zsl:C, 7zsl:D, 7zsl:E, 7zsl:F, 7zsm:A, 7zsn:A, 7zso:A, 7zso:B, 7zso:C, 7zsp:A
37 4j56:A 504 120 0.1496 0.0694 0.2917 4.6 4b1b:A, 4b1b:B, 4j56:B, 4j56:C, 4j56:D, 4j57:A, 4j57:B
38 8gja:F 342 39 0.0513 0.0351 0.3077 7.3 8gja:B, 8gja:D
39 2wjy:A 773 75 0.0940 0.0285 0.2933 7.6 2gjk:A, 2gk6:A, 2gk6:B, 2gk7:A, 8rxb:E, 8rxb:A, 8rxb:D, 8rxb:I, 8rxb:L, 8rxb:P, 2wjv:A, 2wjv:B, 2xzo:A
40 6m7y:A 952 81 0.0940 0.0231 0.2716 7.7 6m7y:B
41 6tg9:B 493 63 0.0897 0.0426 0.3333 7.8 6tg9:F, 6tga:B, 6tga:F
42 4umv:A 605 42 0.0769 0.0298 0.4286 8.2 4umw:A
43 6gaw:BC 571 85 0.1068 0.0438 0.2941 8.3 6gaz:BC, 6gb2:BC, 7po2:7, 8qrn:7, 6rw5:7

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218