BioLiP

>protein
FFSDVPKIGTTSVCGRRRDMEDAVSIHPSFLQRNSENHHFYGVFDGHGCSHVAEKCRERLHDIVKKEVEVMASDEWTETM
VKSFQKMDKEVSQCRCELQSPQCDAVGSTAVVSVVTPEKIIVSNCGDSRAVLCRNGVAIPLSVDHKPDRPDELIRIQQAG
GRVIYWDGARVLGVLAMSRAIGDNYLKPYVIPDPEVTVTDRTDEDECLILASDGLWDVVPNETACGVARMCLRNACSDAA
LLLTKLALARQSSDNVSVVVVDLRKRR

The query sequence (length=267) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4n0g:A	267	267	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	4n0g:B
2	3nmn:D	276	281	0.5655	0.5471	0.5374	1.56e-94	3kdj:B, 3nmn:B
3	3ujk:A	298	299	0.5805	0.5201	0.5184	1.52e-92	3nmv:B, 3ujl:B
4	8aya:B	298	295	0.5169	0.4631	0.4678	2.05e-85	4ds8:B, 5jo2:B, 3kb3:B, 4lg5:B, 4lgb:B, 5mn0:B, 7mwn:B, 3nmt:B, 5or2:B, 5or6:B, 3qn1:B, 5vs5:B, 4wvo:B, 3zvu:B
5	3rt0:A	328	316	0.5281	0.4299	0.4462	1.90e-83	7avw:B, 8ay3:B, 8ay6:B, 8ay7:B, 8ay8:B, 8ay9:B, 5jo1:B, 4la7:B, 4lga:B, 3rt0:B, 3ujg:B, 5vr7:B, 5vro:B, 5vsq:B, 5vsr:B, 5vt7:B, 6zuc:B
6	4oic:B	305	301	0.5318	0.4656	0.4718	1.27e-81
7	5zcl:A	312	294	0.5056	0.4327	0.4592	4.60e-74	5gwo:A, 5gwo:B, 5gwp:A, 5gwp:B, 5zcg:A, 5zcg:B, 5zch:A, 5zch:B, 5zcl:B, 5zcu:A, 5zcu:B
8	2p8e:B	281	268	0.3633	0.3452	0.3619	1.18e-37	2p8e:A
9	1a6q:A	363	280	0.3633	0.2672	0.3464	3.39e-33	6b67:A, 6b67:B, 6b67:C, 3fxj:A, 3fxk:A, 3fxl:A, 3fxm:A, 3fxo:A, 4ra2:A, 4raf:A, 4rag:A
10	2i0o:A	287	230	0.3184	0.2962	0.3696	6.30e-32
11	6ak7:A	257	261	0.3071	0.3191	0.3142	3.27e-29	4da1:A, 2iq1:A
12	4yzg:A	294	300	0.3109	0.2823	0.2767	3.62e-24	4yzg:B, 4yzh:A
13	2i44:A	317	306	0.3221	0.2713	0.2810	1.08e-18	2i44:B, 2i44:C
14	7kpr:A	403	280	0.2659	0.1762	0.2536	1.02e-16	7kpr:B, 7l4i:A, 7l4i:B, 7l4j:A, 7l4j:B, 7n0z:A, 7n0z:B
15	8t2j:A	339	303	0.3034	0.2389	0.2673	2.38e-14
16	4jnd:A	408	262	0.2659	0.1740	0.2710	1.61e-13
17	6v0t:A	402	252	0.2360	0.1567	0.2500	1.70e-10	3mq3:A, 2pnq:A, 2pnq:B
18	2pom:A	355	302	0.2884	0.2169	0.2550	1.18e-09
19	6ihr:A	257	268	0.2285	0.2374	0.2276	3.69e-05	5f1m:A, 6ihl:A, 6ihs:A, 6iht:A, 6ihw:A
20	6ihv:A	221	268	0.2172	0.2624	0.2164	3.19e-04	6ihu:A
21	2pk0:A	247	272	0.2397	0.2591	0.2353	5.67e-04	2pk0:B, 2pk0:C, 2pk0:D
22	1txo:B	236	163	0.1573	0.1780	0.2577	0.005	2cm1:A, 1txo:A
23	2jfr:A	234	232	0.2360	0.2692	0.2716	0.31	2jfs:A, 2jft:A, 2v06:A
24	7b39:A	240	36	0.0524	0.0583	0.3889	3.6	7bns:A2, 7bnu:A2, 7bo6:A, 8ck5:A, 8ckc:A, 3dr1:A, 5e7v:A, 9eyr:A, 9ez1:A, 9ez2:A, 9fbf:A, 4fhh:A, 4fhi:A, 6fo7:A, 6fo8:1, 6fo9:A, 6fob:A, 6fod:A, 4g1d:A, 4g1y:A, 4g1z:A, 4g20:A, 4g21:A, 4g2h:A, 2hbh:A, 2hc4:A, 2hcd:A, 4ia1:A, 4ia2:A, 4ia3:A, 4ia7:A, 5lga:A, 5mx7:A1, 5nky:A, 5nma:A, 5nmb:A2, 3o1d:A, 3o1e:A, 5ow7:A, 5ow9:A, 5owd:A, 7oxu:A, 7oxz:A, 7oy4:A, 8p9w:A, 8p9x:A, 8pwd:A, 8pwe:A, 8pwf:A, 8pwm:A, 8pz6:A, 8pz7:A, 8pz8:A, 8pz9:A, 8pzb:A, 4q0a:C, 4ruj:A, 4ruo:X, 4rup:A, 6t2m:A, 6xzh:A, 6xzi:A, 6xzj:A, 6xzk:A, 6xzv:A, 7zfg:A, 7zfx:A
25	6o7c:A	506	46	0.0637	0.0336	0.3696	5.6	6o6j:A
26	5bp7:A	249	56	0.0787	0.0843	0.3750	6.7	5bp7:B, 5bp7:C
27	5a31:B	84	25	0.0375	0.1190	0.4000	7.0	5g04:B, 5g05:B, 9gaw:C, 5jg6:A, 5jg6:D, 2mt5:A, 7qe7:C, 4r2y:A, 4r2y:B, 4r2y:C, 4r2y:D, 8s4g:C, 6tm5:B, 6tnt:B, 4ui9:B
28	4i2o:A	198	55	0.0487	0.0657	0.2364	7.1	4i2o:B
29	4v98:AN	216	44	0.0524	0.0648	0.3182	8.9	4v98:AF, 4v98:AV, 4v98:Ad, 4v98:Al, 4v98:At, 4v98:A2, 4v98:BF, 4v98:BN, 4v98:BV, 4v98:Bd, 4v98:Bl, 4v98:Bt, 4v98:B2, 4v98:CF, 4v98:CN, 4v98:CV, 4v98:Cd, 4v98:Cl, 4v98:Ct
30	3h3e:A	256	59	0.0712	0.0742	0.3220	9.2
31	2q6f:B	295	29	0.0487	0.0441	0.4483	9.6	2q6f:A
32	6b51:A	246	51	0.0487	0.0528	0.2549	9.9	6b52:A, 6b53:A, 6b53:B, 6b54:A, 5tiv:A, 5tiw:A, 5tiw:B, 5tix:A, 5tix:B, 5tiy:A, 6uuy:A, 6uuy:B

[Back]