Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
EVLEEIHPQDLLALWDELKGEHRYVVLTLLPKAKAAEVLSHLSPEEQAEYLKTLPPWRLREILEELSLDDLADALQAVRK
EDPAYFQRLKDLLDPRTRAEVEALARYEEDEAGGLMTPEYVAVREGMTVEEVLRFLRRAAPDAETIYYIYVVDEKGRLKG
VLSLRDLIVADPRTRVAEIMNPKVVYVRTDTDQEEVARLMADYDFTVLPVVDEEGRLVGIVTVDDVLDVLEAEATEDIHK
LGAVDVPDLVYSEAGPVALWLARVRWLVILILTGMVTSSILQGFESVLEAVTALAFYVPVLLGTGGNTGNQSATLIIRAL
ATRDLDLRDWRRVFLKEMGVGLLLGLTLSFLLVGKVYWDGHPLLLPVVGVSLVLIVFFANLVGAMLPFLLRRLGVDPALV
SNPLVATLSDVTGLLIYLSVARLLLEA

The query sequence (length=427) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 2yvx:A 442 426 0.9977 0.9638 1.0000 0.0 8h5e:A, 4u9n:B, 4wib:B, 5x9g:A, 5x9g:B, 5x9g:C, 5x9g:D, 5x9h:A, 5x9h:B, 2yvx:B, 2yvx:C, 2yvx:D, 2yvy:A, 2zy9:A, 2zy9:B
2 8gpv:A 255 231 0.2248 0.3765 0.4156 3.06e-40
3 8gps:A 228 231 0.1827 0.3421 0.3377 8.46e-35
4 2oux:A 257 204 0.1756 0.2918 0.3676 4.79e-33 2oux:B
5 5g5x:A 119 117 0.0960 0.3445 0.3504 1.86e-10
6 5g5x:A 119 116 0.0843 0.3025 0.3103 0.33
7 3kpc:A 124 83 0.0679 0.2339 0.3494 1.13e-08 3kpb:A, 3kpb:C, 3kpb:D, 3kpd:A, 3kpd:B, 3kpd:C, 3kpd:D
8 3kpc:A 124 59 0.0445 0.1532 0.3220 3.72e-04 3kpb:A, 3kpb:C, 3kpb:D, 3kpd:A, 3kpd:B, 3kpd:C, 3kpd:D
9 7oj1:B 425 165 0.1007 0.1012 0.2606 1.54e-06
10 2qh1:B 185 165 0.1007 0.2324 0.2606 2.11e-06 1pvm:A, 1pvm:B, 2qh1:A
11 4gqy:A 147 52 0.0515 0.1497 0.4231 1.32e-05 4gqy:B, 4gqy:C, 4gqy:D
12 4gqy:A 147 59 0.0468 0.1361 0.3390 3.8 4gqy:B, 4gqy:C, 4gqy:D
13 2yzq:A 224 84 0.0773 0.1473 0.3929 2.01e-05
14 2yzq:A 224 83 0.0562 0.1071 0.2892 0.001
15 2yzq:A 224 86 0.0656 0.1250 0.3256 6.4
16 1zfj:A 476 77 0.0562 0.0504 0.3117 1.19e-04
17 5mcp:C 446 73 0.0539 0.0516 0.3151 4.85e-04 5mcp:A, 5mcp:B, 5mcp:D, 6rpu:A
18 4z87:A 498 73 0.0539 0.0462 0.3151 5.06e-04 5tc3:A, 5tc3:B, 4z87:B, 4z87:C, 4z87:D
19 4fry:B 138 54 0.0492 0.1522 0.3889 7.03e-04 4fry:A
20 3tsb:A 490 165 0.0960 0.0837 0.2485 8.62e-04 3tsd:A, 3usb:A
21 6jig:A 480 87 0.0679 0.0604 0.3333 0.001 6lk4:A
22 3fhm:A 136 92 0.0609 0.1912 0.2826 0.001 3fhm:D, 3fhm:B, 3fhm:C
23 8qqp:A 464 82 0.0585 0.0539 0.3049 0.004 8q65:A, 8q65:E, 8qqp:B, 8qqp:C, 8qqp:D, 8qqp:E, 8qqp:F, 8qqp:G, 8qqp:H, 8qqq:A, 8qqq:B, 8qqq:C, 8qqq:D, 8qqq:E, 8qqq:F, 8qqq:G, 8qqq:H, 8qqr:A, 8qqr:B, 8qqr:C, 8qqr:D, 8qqr:E, 8qqr:F, 8qqr:G, 8qqr:H, 8qqt:A, 8qqt:B, 8qqt:C, 8qqt:D, 8qqt:E, 8qqt:F, 8qqt:G, 8qqt:H
24 8qqp:A 464 54 0.0445 0.0409 0.3519 0.43 8q65:A, 8q65:E, 8qqp:B, 8qqp:C, 8qqp:D, 8qqp:E, 8qqp:F, 8qqp:G, 8qqp:H, 8qqq:A, 8qqq:B, 8qqq:C, 8qqq:D, 8qqq:E, 8qqq:F, 8qqq:G, 8qqq:H, 8qqr:A, 8qqr:B, 8qqr:C, 8qqr:D, 8qqr:E, 8qqr:F, 8qqr:G, 8qqr:H, 8qqt:A, 8qqt:B, 8qqt:C, 8qqt:D, 8qqt:E, 8qqt:F, 8qqt:G, 8qqt:H
25 8qqp:A 464 48 0.0328 0.0302 0.2917 1.7 8q65:A, 8q65:E, 8qqp:B, 8qqp:C, 8qqp:D, 8qqp:E, 8qqp:F, 8qqp:G, 8qqp:H, 8qqq:A, 8qqq:B, 8qqq:C, 8qqq:D, 8qqq:E, 8qqq:F, 8qqq:G, 8qqq:H, 8qqr:A, 8qqr:B, 8qqr:C, 8qqr:D, 8qqr:E, 8qqr:F, 8qqr:G, 8qqr:H, 8qqt:A, 8qqt:B, 8qqt:C, 8qqt:D, 8qqt:E, 8qqt:F, 8qqt:G, 8qqt:H
26 4yi7:A 331 130 0.0820 0.1057 0.2692 0.005
27 3tsd:B 426 199 0.1054 0.1056 0.2261 0.005
28 3lfz:A 280 53 0.0492 0.0750 0.3962 0.006 3kh5:A
29 3lfz:A 280 69 0.0609 0.0929 0.3768 0.092 3kh5:A
30 5ks7:A 123 81 0.0632 0.2195 0.3333 0.006 5ks7:B
31 7pmz:B 430 82 0.0609 0.0605 0.3171 0.010 7pmz:A, 7pmz:C, 7pmz:D, 7pmz:E, 7pmz:F, 7pmz:G, 7pmz:H, 7pmz:I, 7pmz:J, 7pmz:K, 7pmz:L, 7pmz:M, 7pmz:N, 7pmz:O, 7pmz:P
32 7pmz:B 430 54 0.0398 0.0395 0.3148 1.1 7pmz:A, 7pmz:C, 7pmz:D, 7pmz:E, 7pmz:F, 7pmz:G, 7pmz:H, 7pmz:I, 7pmz:J, 7pmz:K, 7pmz:L, 7pmz:M, 7pmz:N, 7pmz:O, 7pmz:P
33 2rc3:C 128 82 0.0609 0.2031 0.3171 0.011 2rc3:A, 2rc3:D, 2rc3:B
34 4o9k:A 130 94 0.0656 0.2154 0.2979 0.032 4o9k:B
35 5npl:A 181 132 0.0867 0.2044 0.2803 0.051
36 8jpo:A 733 63 0.0492 0.0286 0.3333 0.13 8jpo:B, 8jpr:A, 8jpr:B
37 7pji:A 445 111 0.0820 0.0787 0.3153 0.21 4dqw:A, 4dqw:B, 6gk9:A, 6gk9:D, 7pji:B
38 7qem:B 428 111 0.0820 0.0818 0.3153 0.24 7qdx:A, 7qdx:B, 7qem:A, 7qem:D
39 5tr1:A 606 71 0.0468 0.0330 0.2817 0.37 5tr1:B
40 3ddj:A 279 87 0.0632 0.0968 0.3103 0.54
41 3ddj:A 279 48 0.0398 0.0609 0.3542 0.69
42 4qfs:C 267 55 0.0468 0.0749 0.3636 0.63
43 4obv:C 471 97 0.0679 0.0616 0.2990 0.67 4obu:E, 4obu:A, 4obu:U, 4obu:G, 4obu:H, 4obu:F, 4obu:B, 4obu:C, 4obv:D, 4obv:B, 4obv:A
44 2v8q:E 304 55 0.0468 0.0658 0.3636 0.86 6b1u:E, 6b1u:F, 6b2e:C, 8bik:C, 8bik:F, 6c9f:C, 6c9g:C, 6c9h:C, 6c9j:C, 4cfe:E, 4cfe:F, 4cff:E, 4cff:F, 4cfh:E, 6e4t:C, 6e4u:C, 6e4w:C, 4eag:C, 4eai:C, 4eaj:C, 4eak:C, 4eal:C, 5ezv:E, 5ezv:F, 5iso:E, 5iso:F, 7jhg:G, 7jhh:G, 7jij:G, 5kq5:C, 7m74:G, 7myj:E, 7myj:F, 4qfg:C, 4qfr:C, 4rer:G, 4rew:G, 5t5t:C, 5ufu:C, 2uv4:A, 2uv5:A, 2uv6:A, 2uv7:A, 2v92:E, 2v9j:E, 2y8l:E, 2y8q:E, 2ya3:E, 4zhx:E, 4zhx:F
45 7oj1:A 401 159 0.0913 0.0973 0.2453 1.4
46 2rif:A 131 25 0.0281 0.0916 0.4800 2.1 2rif:B, 2rif:C, 2rif:D
47 8s5h:A 507 128 0.0796 0.0671 0.2656 2.8 4coo:A, 4coo:B, 1jbq:A, 1jbq:B, 1jbq:C, 1jbq:D, 1jbq:E, 1jbq:F, 4l0d:A, 4l0d:B, 4l27:B, 4l27:D, 4l27:A, 4l27:C, 4l28:A, 4l28:B, 4l28:C, 4l28:D, 4l3v:B, 4l3v:A, 4l3v:C, 1m54:A, 1m54:B, 1m54:C, 1m54:D, 1m54:E, 1m54:F, 5mms:A, 5mms:F, 5mms:B, 5mms:C, 5mms:D, 5mms:E, 4pcu:A, 4pcu:B, 7qgt:A, 7qgt:B, 8s5h:B, 8s5h:C, 8s5h:D, 8s5h:E, 8s5h:F, 8s5h:G, 8s5h:H, 8s5i:A, 8s5i:B, 8s5i:C, 8s5i:D, 8s5i:E, 8s5i:F, 8s5j:A, 8s5j:B, 8s5j:C, 8s5j:D, 8s5j:E, 8s5j:F, 8s5j:G, 8s5j:H, 8s5j:I, 8s5j:J, 8s5k:A, 8s5k:B, 8s5k:C, 8s5k:D, 8s5k:E, 8s5k:F, 8s5k:G, 8s5k:H, 8s5l:A, 8s5l:B, 8s5l:C, 8s5l:D, 8s5m:A, 8s5m:B, 8s5m:C, 8s5m:D, 8s5m:E, 8s5m:F, 8s5m:G, 8s5m:H, 8s5m:I, 8s5m:J, 8stw:A, 8stw:B, 8stw:C, 8stw:D, 8stw:E, 8stw:F, 4uuu:A, 4uuu:B
48 6gmh:B 1132 104 0.0656 0.0247 0.2692 2.8 8a3y:B, 6gml:B, 8p4a:B, 8p4b:B, 8p4c:B, 8p4d:B, 8p4e:B, 7pks:B, 8rbx:B, 8s51:B, 8s5n:B, 6ted:B, 7unc:B, 7und:B, 7ycx:2
49 5iy6:B 1165 104 0.0656 0.0240 0.2692 3.1 8a40:B, 7b0y:B, 8b3d:B, 8b3f:B, 8bvw:B, 8byq:B, 8bz1:B, 7edx:p, 7eg7:p, 7eg8:p, 7eg9:p, 7ega:p, 7egb:p, 7egc:p, 7ena:PB, 7enc:PB, 6exv:B, 5flm:B, 8gxq:PB, 8gxs:PB, 5iy7:B, 5iy8:B, 5iy9:B, 5iya:B, 5iyb:B, 5iyc:B, 5iyd:B, 7lbm:B, 7nvr:B, 7nvs:B, 7nvt:B, 7nvu:B, 7nvy:B, 7nvz:B, 7nw0:B, 8oeu:B, 8oev:B, 8oew:B, 8of0:B, 5oik:B, 7okx:B, 7oky:B, 7ol0:B, 7oo3:B, 7oob:B, 7oop:B, 7opc:B, 7opd:B, 8p4f:B, 8s52:B, 8s54:B, 8s55:B, 8uha:B, 8uhd:B, 8uhg:B, 8ui0:B, 8uis:B, 8w8e:B, 8w8f:B, 8wak:p, 8wal:p, 8wan:p, 8wao:p, 8wap:p, 8waq:p, 8war:p, 8was:p, 8wat:p, 8wau:p, 8wav:p, 8waw:p, 8wax:p, 8way:p, 8waz:p, 8wb0:p, 7zwd:B, 7zx7:B, 7zx8:B
50 4yd1:A 334 112 0.0679 0.0868 0.2589 3.4 6aec:A, 6aeh:A, 6ak5:A, 6ak6:A, 6ak8:A, 6ak9:A, 6akh:A, 7co6:A, 7co8:A, 7co9:A, 7coa:A, 7cob:A, 7coc:A, 7cod:A, 6ipd:A, 6ipe:A, 6ipf:A, 6ipg:A, 6iph:A, 6ipi:A, 6ipj:A, 6ipk:A, 6ipl:A, 6ipm:A, 6ipn:A, 7kss:A, 7kst:A, 7ksu:A, 7ksv:A, 7ksw:A, 7ksx:A, 7ksy:A, 7ksz:A, 7kt0:A, 7kt1:A, 7kt2:A, 7kt3:A, 7kt4:A, 7kt5:A, 7kt6:A, 7kt7:A, 7kt8:A, 7kt9:A, 7kta:A, 7ktb:A, 7ktc:A, 7ktd:A, 7kte:A, 7ktf:A, 7ktg:A, 7kth:A, 7kti:A, 7ktj:A, 7ktk:A, 7ktl:A, 7ktm:A, 7ktn:A, 4lzg:A, 4m04:A, 4m0a:A, 6p1m:A, 6p1n:A, 6p1o:A, 6p1p:A, 6p1q:A, 6p1r:A, 6p1s:A, 6p1t:A, 6p1u:A, 6p1v:A, 6p1w:A, 5twp:A, 5twq:A, 5twr:A, 5tws:A, 5txx:A, 5txz:A, 5tyb:A, 5tyc:A, 5tyd:A, 5tye:A, 5tyf:A, 5tyg:A, 5tyu:A, 5tyv:A, 5tyw:A, 5tyx:A, 5tyy:A, 5tyz:A, 6vez:A, 6vf0:A, 6vf1:A, 6vf2:A, 6vf3:A, 6vf4:A, 6vf5:A, 6vf6:A, 6vf7:A, 6vf8:A, 6vf9:A, 6vfa:A, 6vfb:A, 6vfc:A, 5vz7:A, 5vz8:A, 5vz9:A, 5vza:A, 5vzb:A, 5vzc:A, 5vzd:A, 5vze:A, 5vzf:A, 5vzg:A, 5vzh:A, 5vzi:A, 6wic:A, 6wid:A, 6wie:A, 4ycx:A, 4yd2:A, 5zlc:A
51 3lhh:A 125 24 0.0304 0.1040 0.5417 4.4
52 3lhh:A 125 22 0.0258 0.0880 0.5000 9.4
53 6zza:A 150 92 0.0422 0.1200 0.1957 5.0
54 6zza:A 150 43 0.0281 0.0800 0.2791 7.7
55 8js5:B 253 104 0.0585 0.0988 0.2404 6.4 2cmn:A, 1dp6:A, 1dp8:A, 1dp9:A, 1drm:A, 8js5:A, 8js5:C, 8js5:D, 8js5:E, 8js5:F, 8js5:G, 8js5:H, 8js5:I, 8js5:J, 8js6:A, 8js6:B, 8js6:C, 8js6:D, 8js6:E, 8js6:F, 8js6:G, 8js6:H, 8js6:I, 8js6:J, 8js7:A, 8js7:B, 8js7:C, 8js7:D, 8js7:E, 8js7:F, 8js7:G, 8js7:H, 8js7:I, 8js7:J, 1lsv:A, 1lsw:A, 1lsx:A, 1lt0:A, 2owh:A, 2owj:A, 2vv6:A, 2vv6:D, 2vv6:B, 2vv6:C, 2vv7:A, 2vv7:B, 2vv7:C, 2vv7:D, 2vv8:A, 2vv8:D, 2vv8:B, 2vv8:C, 1xj2:A, 1xj3:A, 1xj4:A, 1xj4:B, 1xj6:A, 1xj6:B, 1y28:A
56 4fxs:A 467 42 0.0398 0.0364 0.4048 7.4
57 3org:A 534 64 0.0351 0.0281 0.2344 7.6 3org:B, 3org:C, 3org:D
58 8d6j:A 810 37 0.0351 0.0185 0.4054 8.1 9bez:A, 9bez:B, 9bez:C, 9bf0:A, 9bf0:B, 9bf0:C, 9bf2:A, 9bf2:B, 9bf2:C, 7c6b:A, 7c6b:B, 7c6b:C, 7d7u:A, 7d7u:B, 7d7u:C, 8d71:A, 4f3t:A, 5js1:A, 5js2:A, 5ki6:A, 7ki3:A, 7ki3:D, 3luc:A, 3luc:B, 3luc:C, 3lud:A, 3lud:B, 3lud:C, 3lug:A, 3lug:B, 3lug:C, 3luh:A, 3luh:B, 3luh:C, 3luj:A, 3luj:B, 3luj:C, 3luk:A, 3luk:B, 3luk:C, 6mdz:A, 6mdz:B, 6mfn:A, 6mfr:A, 6mfr:B, 6n4o:A, 6nit:A, 6nit:B, 4ola:A, 4olb:A, 3qx8:A, 3qx8:B, 3qx8:C, 3qx9:A, 3qx9:B, 3qx9:C, 6ra4:A, 6ra4:B, 5t7b:A, 4w5n:A, 4w5o:A, 4w5q:A, 4w5r:A, 4w5t:A, 4z4c:A, 4z4d:A, 4z4e:A, 4z4f:A, 4z4g:A, 4z4h:A, 4z4i:A
59 6cbd:A 787 37 0.0351 0.0191 0.4054 8.6 5wea:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218