Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
EVEALEKKVEALEWKVQKLEKKVEALEHGWDGR

The query sequence (length=33) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5uxt:A 33 33 1.0000 1.0000 1.0000 6.48e-16 5uxt:C
2 6egl:A 36 26 0.5758 0.5278 0.7308 2.58e-05 6egm:A, 6egn:C, 6egn:B, 6ego:A, 6egp:A, 5kb0:A, 5kb1:A, 5kb2:A, 6mcd:A, 7n2y:A, 7n2z:A
3 7p3h:A 36 28 0.4545 0.4167 0.5357 7.52e-04
4 4g1e:A 964 23 0.3636 0.0124 0.5217 0.012 5ffg:A, 5ffo:A, 5ffo:E, 4g1m:A, 3ije:A, 1jv2:A, 1l5g:A, 1m1x:A, 6mk0:A, 4mmx:A, 4mmy:A, 4mmz:A, 6msl:A, 6msu:A, 6naj:A, 5nem:A, 5ner:A, 5net:A, 4o02:A, 6om1:A, 6om1:C, 6om1:E, 6om1:G, 6om2:A, 6om2:C, 8tcf:A, 8tcg:A, 1u8c:A, 6uja:A, 6ujb:A, 6ujc:A, 4um8:C, 4um8:A, 4um9:A, 4um9:C, 8vs6:A, 8vsd:A, 7y1t:A
5 4g1e:A 964 22 0.3030 0.0104 0.4545 7.0 5ffg:A, 5ffo:A, 5ffo:E, 4g1m:A, 3ije:A, 1jv2:A, 1l5g:A, 1m1x:A, 6mk0:A, 4mmx:A, 4mmy:A, 4mmz:A, 6msl:A, 6msu:A, 6naj:A, 5nem:A, 5ner:A, 5net:A, 4o02:A, 6om1:A, 6om1:C, 6om1:E, 6om1:G, 6om2:A, 6om2:C, 8tcf:A, 8tcg:A, 1u8c:A, 6uja:A, 6ujb:A, 6ujc:A, 4um8:C, 4um8:A, 4um9:A, 4um9:C, 8vs6:A, 8vsd:A, 7y1t:A
6 8r3q:D 676 18 0.3030 0.0148 0.5556 0.15 8r3q:B, 8r3q:A, 8r3q:C
7 3w8v:A 32 25 0.4848 0.5000 0.6400 0.77 3w8v:B, 3w92:A, 3w92:B, 3w92:C, 3w93:A, 3w93:B, 3w93:C
8 3w8v:A 32 22 0.3939 0.4062 0.5909 6.6 3w8v:B, 3w92:A, 3w92:B, 3w92:C, 3w93:A, 3w93:B, 3w93:C
9 3acs:A 822 14 0.2424 0.0097 0.5714 1.2 3acs:B, 3act:A, 3act:B, 3afj:A, 3afj:B, 2cqs:A, 2cqs:B, 2cqt:A, 2cqt:B, 3qfy:A, 3qfy:B, 3qfz:A, 3qfz:B, 3qg0:A, 3qg0:B
10 2lxy:A 67 26 0.4545 0.2239 0.5769 1.3 8vsw:A
11 2lxy:A 67 18 0.3636 0.1791 0.6667 8.9 8vsw:A
12 9fff:B 950 24 0.2424 0.0084 0.3333 1.7 9ffb:B
13 6xzd:BP1 712 27 0.2727 0.0126 0.3333 1.9 6xzp:BP1, 6xzq:B, 6xzr:BP1, 6y0c:B
14 4etp:B 287 21 0.3333 0.0383 0.5238 1.9
15 4etp:B 287 24 0.3333 0.0383 0.4583 2.9
16 5xla:A 490 20 0.3030 0.0204 0.5000 2.0 3eyk:B, 5xl3:B, 5xl3:A, 5xl4:A, 5xl4:B, 5xl6:A, 5xl7:A, 5xl7:B, 5xl9:A, 5xla:B, 5xlc:A, 5xlc:B, 5xld:A, 5xld:B
17 1ca9:A 191 18 0.2727 0.0471 0.5000 2.3 1ca9:E, 1ca9:B, 1czy:A, 1czy:C, 1czz:A, 1czz:B, 1d00:A, 1d00:B, 1d00:F, 1d00:C, 1d00:D, 1d00:E, 1d00:G, 1d00:H, 1d01:D, 1d01:E, 1d01:F, 1d0a:A, 1d0a:B, 1d0a:C, 1d0a:D, 1d0a:E, 1d0a:F, 1d0j:A, 1d0j:C, 1d0j:D, 1d0j:E, 1d0j:F, 1qsc:A, 1qsc:B, 1qsc:C, 8t5q:A, 8t5q:B, 8t5q:D
18 7msw:A 635 26 0.3030 0.0157 0.3846 2.6 7exm:A, 7exm:B, 7exm:C, 7exm:D, 7msx:A
19 1g6u:A 48 26 0.3636 0.2500 0.4615 2.8 1g6u:B
20 4pnd:A 30 24 0.2424 0.2667 0.3333 3.6 4pnd:C
21 7q1s:E 30 17 0.2727 0.3000 0.5294 7.1 7q1s:M, 7q1s:A
22 1fcd:A 401 13 0.1818 0.0150 0.4615 7.5 1fcd:B
23 8gs1:B 332 28 0.2424 0.0241 0.2857 7.6 7wux:C, 7wux:D
24 6wzt:A 494 20 0.2727 0.0182 0.4500 8.2 6aos:A, 6aot:A, 6aou:A, 6aov:A, 6bkr:A, 6bks:A, 6bkt:A, 6cex:D, 6cex:B, 3eym:B, 3eym:D, 3eym:F, 8faw:A, 1hgg:B, 1hgg:D, 1hgg:F, 1hgh:B, 1hgh:D, 1hgh:F, 1htm:B, 1htm:D, 1htm:F, 6nsa:A, 6nsb:A, 6nsf:A, 6nsg:A, 5t6n:B, 5t6n:D, 5t6n:F, 8tj6:B, 8tj9:A, 8tja:A, 8tjb:A, 4uny:D, 4uo0:D, 8uwa:B, 4wea:A, 2yp3:A, 2yp4:A, 2yp5:A, 2yp8:A, 2yp9:A
25 6uaw:A 260 30 0.2121 0.0269 0.2333 8.7
26 6bbe:A 155 20 0.2727 0.0581 0.4500 9.2 6bbd:A, 4dn8:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417