Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
ERKEDIIPLANHFLKKFSRKYAKEVEGFTKSAQELLLSYPWYGNVRELKNVIERAVLFSEGKFIDRGELSCLV

The query sequence (length=73) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 1ny5:B 385 73 1.0000 0.1896 1.0000 2.35e-46 4bs1:A, 4bs1:B, 4bt0:A, 4bt0:B, 4bt1:A, 4bt1:B, 4ly6:A, 4ly6:B, 4ly6:C, 4ly6:D, 4ly6:E, 4ly6:G, 4ly6:H, 4ly6:I, 4ly6:J, 4ly6:K, 4ly6:L, 4ly6:M, 4ly6:N, 4ly6:O, 4ly6:P, 4ly6:Q, 4ly6:R, 4ly6:S, 4ly6:T, 4ly6:U, 4ly6:V, 4ly6:W, 4ly6:X, 4lzz:A, 4lzz:B, 4lzz:C, 4lzz:D, 4lzz:E, 4lzz:F, 4lzz:G, 4lzz:H, 4lzz:I, 4lzz:J, 4lzz:K, 4lzz:L, 4lzz:M, 4lzz:N, 4lzz:O, 4lzz:P, 4lzz:Q, 4lzz:R, 4lzz:S, 4lzz:T, 4lzz:U, 4lzz:V, 4lzz:W, 4lzz:X, 3m0e:A, 3m0e:B, 3m0e:C, 3m0e:D, 3m0e:E, 3m0e:F, 3m0e:G, 1ny5:A, 1ny6:A, 1ny6:B, 1ny6:C, 1ny6:D, 1ny6:E, 1ny6:F, 1ny6:G, 1ny6:H, 1ny6:I, 1ny6:J, 1ny6:K, 1ny6:L, 1ny6:M, 1ny6:N, 1zy2:A
2 1ojl:E 285 69 0.4795 0.1228 0.5072 2.11e-18
3 4qht:C 248 64 0.4247 0.1250 0.4844 5.47e-15 6luf:A, 6luf:B, 6luf:C, 6luf:D, 6luf:E, 6luf:F, 6luf:G, 4qht:A, 4qht:B, 4qht:D, 4qht:E, 4qht:F, 4qht:G
4 3dzd:A 368 64 0.4384 0.0870 0.5000 2.15e-14 3dzd:B
5 6iy8:A 469 60 0.3836 0.0597 0.4667 5.25e-14 6iy8:B, 6iy8:C, 6iy8:D
6 7v2b:D 376 69 0.4110 0.0798 0.4348 1.12e-13 7v2b:A, 7v3w:A, 7v3w:D
7 7qv9:a 259 57 0.3699 0.1042 0.4737 1.81e-10 2c96:A, 2c98:A, 2c99:A, 2c9c:A, 4qnr:A, 4qos:A, 7qv9:b, 7qv9:c, 7qv9:f, 7qv9:e, 2vii:A
8 5ep3:A 253 59 0.3288 0.0949 0.4068 5.27e-07 5ep2:A, 5ep4:A
9 5m7o:A 448 60 0.2466 0.0402 0.3000 6.44e-06 4d6y:A, 4d6y:B, 5m7n:A, 5m7o:B, 5m7p:A, 5m7p:B
10 5m7n:B 428 60 0.2466 0.0421 0.3000 7.67e-06
11 8pb9:D 390 69 0.3288 0.0615 0.3478 2.81e-05 7ejw:C, 5exs:A, 5ext:A, 5exx:A, 6j7e:A, 6jdi:A, 6jdl:A
12 3fe1:B 387 27 0.1370 0.0258 0.3704 0.22 3fe1:A, 3fe1:C
13 2gk1:I 440 24 0.1781 0.0295 0.5417 0.30 2gk1:J, 2gk1:K, 2gk1:L
14 3zuh:A 286 54 0.1918 0.0490 0.2593 0.33 3zuh:B, 3zuh:C, 3zuh:D, 3zuh:E, 3zuh:F
15 7kw7:C 511 47 0.1918 0.0274 0.2979 0.78
16 7abv:A 232 35 0.1644 0.0517 0.3429 1.3 3eto:A, 3eto:B, 3i08:A, 3i08:C, 3l95:X, 3l95:Y
17 4j8f:A 551 47 0.1918 0.0254 0.2979 1.5 5aqw:A, 5aqx:A, 5aqy:A, 5aqz:A, 5ar0:A, 3atu:A, 3atv:A, 3ay9:A, 5bn8:A, 5bn9:A, 5bpl:A, 5bpm:A, 3d2f:B, 3d2f:D, 2e88:A, 2e8a:A, 7f4x:A, 7f4z:A, 7f50:A, 7fgm:A, 6fhk:A, 6fhk:B, 6g3r:A, 6g3s:A, 3gdq:A, 1hjo:A, 4io8:A, 3jxu:A, 7kw7:D, 5mkr:A, 5mks:A, 7q4r:A, 1s3x:A, 1xqs:C, 1xqs:D, 6zyi:A
18 6mjp:A 240 24 0.1507 0.0458 0.4583 2.5
19 3c7n:B 540 47 0.1781 0.0241 0.2766 3.1 5aqf:A, 5aqf:C, 5aqg:A, 5aqg:C, 5aqg:E, 5aqh:A, 5aqi:A, 5aqi:C, 5aqj:A, 5aqj:C, 5aqj:E, 5aqk:A, 5aqn:A, 5aqn:C, 5aqn:E, 5aqo:A, 5aqo:C, 5aqo:E, 5aqp:A, 5aqp:C, 5aqp:E, 5aqq:A, 5aqq:C, 5aqq:E, 5aqr:A, 5aqr:C, 5aqr:E, 5aqs:A, 5aqs:C, 5aqt:A, 5aqu:A, 5aqv:A, 1atr:A, 1ats:A, 6b1i:A, 6b1i:B, 6b1m:B, 6b1m:A, 6b1n:A, 6b1n:B, 1ba0:A, 1ba1:A, 1bup:A, 2bup:A, 4fl9:A, 5fpd:A, 5fpd:B, 5fpe:A, 5fpe:B, 5fpm:A, 5fpm:B, 5fpn:A, 5fpn:B, 3fzf:A, 3fzh:A, 3fzk:A, 3fzl:A, 3fzm:A, 4h5n:A, 4h5n:B, 4h5r:A, 4h5r:B, 4h5t:A, 4h5v:A, 4h5w:A, 4h5w:B, 6h54:A, 1hpm:A, 3hsc:A, 3i33:A, 1kax:A, 1kay:A, 1kaz:A, 3ldq:A, 3m3z:A, 1nga:A, 1ngb:A, 1ngc:A, 1ngd:A, 1nge:A, 1ngf:A, 1ngg:A, 1ngh:A, 1ngi:A, 1ngj:A, 7o6r:A, 7odb:A, 7odd:A, 7odi:A, 7plk:A, 1qqm:A, 1qqn:A, 1qqo:A, 2qwl:A, 2qwl:B, 2qwm:A, 2qwm:B, 2qwn:A, 2qwo:A, 2qwp:A, 2qwq:A, 2qwr:A, 2v7z:A, 2v7z:B, 6zyj:A, 6zyj:B
20 6mbn:A 241 24 0.1644 0.0498 0.5000 4.3 6b89:A, 6b89:B, 6b8b:A, 6mbn:B, 6mgf:A, 6mhz:A, 6mhz:B, 6mi8:A, 6mi8:B, 6mit:B, 6mit:E, 4p31:A, 4p31:B, 4p32:A, 4p32:B, 4p33:A, 4p33:B, 4qc2:A, 4qc2:B, 6s8g:A, 6s8g:B, 6s8n:B
21 2zkt:B 381 23 0.1507 0.0289 0.4783 5.1
22 7qb6:A 164 40 0.1918 0.0854 0.3500 8.9 4gy9:A, 4jhg:A, 4jhh:A, 4jhi:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417