Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
EFKDVFIEKQKGEILGVVIVESGWGSILPTVIIANMMHGGPAEKSGKLNIGDQIMSINGTSLVGLPLSTCQSIIKGLKNQ
SRVKLNIVR

The query sequence (length=89) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 1u38:A 89 89 1.0000 1.0000 1.0000 1.43e-59
2 7d6f:A 87 75 0.2697 0.2759 0.3200 6.83e-09
3 1n7f:A 86 62 0.2921 0.3023 0.4194 3.85e-08 1n7f:B
4 1b8q:A 127 57 0.2247 0.1575 0.3509 2.21e-07
5 6nid:B 88 51 0.1910 0.1932 0.3333 5.72e-06 6nid:A, 6nid:C
6 2r4h:C 98 59 0.2360 0.2143 0.3559 6.76e-06
7 2exg:A 101 89 0.3034 0.2673 0.3034 9.11e-06 2ain:A, 7qcr:B, 7qcr:A
8 7qct:A 90 89 0.3258 0.3222 0.3258 1.58e-05 7qct:B
9 4wsi:A 372 62 0.2697 0.0645 0.3871 1.77e-05 7m4r:A, 7ntj:B, 7ntj:A, 7ntk:A, 7ntk:D, 7ntk:B, 7ntk:F, 7qcs:A, 7qcs:B, 4uu5:A, 4wsi:B
10 2ejy:A 85 49 0.1798 0.1882 0.3265 3.68e-05
11 8bv7:A 95 59 0.2135 0.2000 0.3220 5.07e-05 8buw:A, 8buw:B
12 3r0h:D 199 86 0.2921 0.1307 0.3023 5.12e-05 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
13 8xud:D 651 75 0.2809 0.0384 0.3333 1.09e-04 6iqq:C, 6iqq:D, 5wql:D, 5wql:C, 8xud:C
14 3vqg:A 85 62 0.2472 0.2588 0.3548 1.57e-04
15 5heb:A 119 32 0.1798 0.1345 0.5000 1.87e-04 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
16 2qt5:A 194 45 0.1798 0.0825 0.3556 2.53e-04 2qt5:B
17 2qt5:A 194 43 0.1573 0.0722 0.3256 0.026 2qt5:B
18 6gbe:A 119 61 0.2584 0.1933 0.3770 2.90e-04
19 2koh:A 111 34 0.1461 0.1171 0.3824 4.01e-04 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
20 3jxt:A 96 45 0.1685 0.1562 0.3333 4.79e-04 3jxt:B
21 7pc3:A 405 52 0.2022 0.0444 0.3462 0.001 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
22 5oak:A 90 76 0.2360 0.2333 0.2763 0.001 5oak:C
23 4e34:A 87 61 0.2247 0.2299 0.3279 0.002 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
24 2ka9:A 189 54 0.2022 0.0952 0.3333 0.002 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
25 2ka9:A 189 62 0.1910 0.0899 0.2742 0.28 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
26 4xhv:A 94 89 0.3146 0.2979 0.3146 0.002
27 6kz1:A 97 81 0.2584 0.2371 0.2840 0.003 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
28 4c2c:A 433 59 0.2697 0.0554 0.4068 0.003 4c2d:A, 4c2d:B, 4c2d:C, 4c2f:A, 4c2g:A
29 6xa7:B 96 29 0.1236 0.1146 0.3793 0.004 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
30 2i0i:A 81 32 0.1573 0.1728 0.4375 0.005 2i0i:B, 2i0i:C
31 8hcj:D 433 61 0.2472 0.0508 0.3607 0.006 8hcj:E, 8hcj:H, 8hcj:A, 8hcj:B, 8hcj:G, 8hcj:C, 8hcj:F
32 5n7d:A 423 57 0.1910 0.0402 0.2982 0.021 2i04:A, 2i04:B, 5n7d:B, 5n7f:A, 5n7f:B, 5n7g:A, 7p71:A, 7p71:B, 6twq:B, 6twq:A, 6twu:B, 6twu:A, 6twx:B, 6twx:A, 6twy:B, 6twy:A
33 1rzx:A 98 46 0.1461 0.1327 0.2826 0.025 5i7z:A, 1x8s:A
34 5zys:A 90 59 0.1573 0.1556 0.2373 0.027
35 6ar4:B 87 82 0.2247 0.2299 0.2439 0.028 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
36 7pc5:A 405 89 0.2697 0.0593 0.2697 0.035
37 2kpl:A 129 57 0.1910 0.1318 0.2982 0.035
38 2m0z:A 97 44 0.1685 0.1546 0.3409 0.036 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
39 4wyu:A 201 71 0.2360 0.1045 0.2958 0.042 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
40 4wyu:A 201 36 0.1573 0.0697 0.3889 1.0 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
41 2l4t:A 124 29 0.1573 0.1129 0.4828 0.052 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
42 1ihj:B 95 58 0.2022 0.1895 0.3103 0.057 1ihj:A
43 8bq8:C 93 45 0.1461 0.1398 0.2889 0.081 8bq8:A, 8bq8:B
44 4xh7:A 110 46 0.1798 0.1455 0.3478 0.087
45 6q0m:B 94 59 0.2247 0.2128 0.3390 0.11
46 6bxg:A 98 59 0.2472 0.2245 0.3729 0.11
47 8c1t:A 90 61 0.1910 0.1889 0.2787 0.13 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
48 7p70:A 407 60 0.2135 0.0467 0.3167 0.19 7pc4:A, 7qql:A
49 8b82:A 108 46 0.1348 0.1111 0.2609 0.24 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
50 5ez0:D 95 44 0.1798 0.1684 0.3636 0.35 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
51 7p73:A 420 35 0.1348 0.0286 0.3429 0.45 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
52 1n7t:A 103 59 0.2135 0.1845 0.3220 0.58 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
53 3ch8:A 190 59 0.2135 0.1000 0.3220 0.59 2qbw:A
54 2pdz:A 86 43 0.1461 0.1512 0.3023 0.62
55 7weg:B 96 75 0.2135 0.1979 0.2533 0.89 7weg:A
56 7w6z:A 414 22 0.1348 0.0290 0.5455 1.1 7w6y:A
57 5wou:A 95 33 0.1236 0.1158 0.3333 1.3
58 2egn:A 83 54 0.1910 0.2048 0.3148 1.3
59 8tua:A 1329 51 0.2022 0.0135 0.3529 2.3 5d3x:A, 5d3x:B, 5d3y:A, 5d3y:B, 5fi0:A, 5fi0:C, 5fi0:E, 5fi0:G
60 7qqn:C 414 32 0.1461 0.0314 0.4062 2.4 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
61 7x2e:A 163 51 0.1573 0.0859 0.2745 2.7 2kbs:A
62 1zub:A 109 59 0.1798 0.1468 0.2712 2.7
63 8cn1:H 101 29 0.1011 0.0891 0.3103 4.2 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
64 2kaw:A 90 81 0.1910 0.1889 0.2099 4.5 6lcb:A, 2mx6:A
65 6zbq:A 89 54 0.1685 0.1685 0.2778 4.7 6zc4:A
66 1l6o:A 95 58 0.2022 0.1895 0.3103 4.8 2f0a:B, 2f0a:D, 1l6o:B, 1l6o:C, 6zbq:B, 6zbz:A, 6zbz:B, 6zbz:C, 6zbz:D, 6zc3:A, 6zc3:B, 6zc4:B, 6zc6:A, 6zc7:A, 6zc7:B, 6zc8:A, 6zc8:B
67 4neu:A 286 43 0.1461 0.0455 0.3023 5.0 6c3e:A, 6c3e:B, 6c4d:A, 6c4d:B, 6c4d:C, 6c4d:D, 7fcz:A, 7fcz:B, 7fd0:A, 7fd0:B, 6hho:A, 6hho:B, 5hx6:A, 5hx6:B, 8i2n:A, 8i2n:B, 4ith:A, 4ith:B, 4iti:A, 4iti:B, 4itj:A, 4itj:B, 4neu:B, 6nw2:A, 6nw2:B, 6nyh:A, 6nyh:B, 6ocq:A, 6ocq:B, 6r5f:A, 6r5f:B, 6r5f:C, 6r5f:D, 6rln:A, 6rln:B, 5tx5:A, 5tx5:B, 7xmk:A, 7xmk:B, 7ydx:A, 7ydx:B
68 1sgf:G 232 16 0.1124 0.0431 0.6250 5.7 1sgf:Z
69 5xxm:A 749 39 0.1461 0.0174 0.3333 6.0 5xxl:A, 5xxl:B, 5xxm:B, 5xxn:A, 5xxn:B, 5xxo:B, 5xxo:A
70 8w2h:A 761 47 0.1573 0.0184 0.2979 6.2 7lw1:A, 7lw1:D, 7lw1:E, 7lw1:F, 8w2g:A, 8w2g:B, 8w2g:D, 8w2g:C, 8w2h:B, 8w2h:C, 8w2h:D, 8w2j:E, 8w2j:F, 8w2j:G, 8w2j:H, 8w2j:A, 8w2j:B, 8w2j:C, 8w2j:D
71 8j5k:M 41 40 0.1461 0.3171 0.3250 6.3 8j5k:m
72 6rxx:UV 1061 38 0.1348 0.0113 0.3158 7.6
73 5jzx:A 364 37 0.1348 0.0330 0.3243 8.6 5jzx:C, 5jzx:D, 5jzx:F
74 5jzx:B 327 37 0.1348 0.0367 0.3243 8.7 5jzx:E
75 7psl:A 600 62 0.1798 0.0267 0.2581 8.8 4myh:B, 7psl:B, 7psm:A, 7psm:B, 7psn:A, 7psn:B
76 8bp4:A 93 45 0.1348 0.1290 0.2667 10.0 8bp4:C, 8bp4:B

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417