Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum Lab Only
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
EDVYCICKRPDYGELMVGCDGCDDWFHFTCLHIPEQFKDLVFSFYCPYCQAGITGKGSLPKTLWKRKCRISDCYKPCLQD
SKYCSEEHGR

The query sequence (length=90) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6j2p:A 98 92 1.0000 0.9184 0.9783 3.65e-62 6j2p:B, 6j2p:D, 6j2p:C
2 9c0o:A 63 50 0.2111 0.3016 0.3800 1.00e-09
3 1x4i:A 70 62 0.3000 0.3857 0.4355 2.48e-08 7zmx:A, 7zmx:B
4 8f8y:B 433 61 0.2556 0.0531 0.3770 6.75e-08 8f8y:A, 8f8z:A, 8f8z:B, 3kqi:A, 7m10:A, 3pu3:A, 3pu3:B, 3pu8:B, 3pu8:A, 3pua:A, 3pus:A, 3pus:B
5 3kv6:D 448 89 0.3222 0.0647 0.3258 1.75e-07 3kv5:D, 3kv5:A, 3kv6:A, 3kv9:A, 3kva:A, 3u78:A
6 2f6j:A 168 50 0.2222 0.1190 0.4000 1.80e-07 8ag2:A, 6aze:A, 7dmy:A, 7dn4:A, 7dn4:B, 7dn4:C, 7dn4:D, 7dn4:E, 7dn4:F, 7f5c:A, 7f5d:A, 7f5e:A, 2f6j:B, 2f6j:C, 2f6n:A, 2f6n:B, 8f6g:A, 2fsa:A, 2fsa:B, 2fsa:C, 2fuu:A, 5h6y:A, 7k6r:A, 7k6s:A, 7kdw:A, 7kdw:B, 7kdz:A, 7lp0:A, 7lp0:B, 7lpk:A, 7lpk:B, 7lrk:A, 7lrk:B, 7lro:A, 7lro:B, 6lu5:A, 6lu6:A, 7m2e:A, 8ou2:A, 8ou2:B, 3qzs:A, 3qzs:B, 3qzt:A, 3qzv:A, 5r4g:A, 5r4h:A, 5r4i:A, 5r4j:A, 5r4k:A, 5r4l:A, 5r4m:A, 5r4n:A, 2ri7:A, 7rwn:A, 7rwo:A, 7rwp:A, 7rwq:A, 7vd4:A
7 2k16:A 75 51 0.2333 0.2800 0.4118 2.66e-07 5c13:A, 5c13:C, 5c13:E, 5c13:G, 2k17:A, 5wxg:A, 5wxh:C, 5wxh:A, 5xmy:A, 5xmy:C
8 1wep:A 79 50 0.2111 0.2405 0.3800 5.54e-07
9 3kv4:A 432 50 0.2111 0.0440 0.3800 9.07e-07 4do0:A, 3k3n:A, 3k3o:A, 2wwu:A
10 1wem:A 76 51 0.2111 0.2500 0.3725 2.46e-06 4l7x:A, 2m3h:A
11 5wlf:A 60 53 0.1889 0.2833 0.3208 6.32e-06 5wle:A
12 5znp:B 186 48 0.2111 0.1022 0.3958 1.14e-05 5znp:A, 5znr:A, 5znr:B
13 2mum:A 50 51 0.2333 0.4200 0.4118 2.62e-05
14 2qic:A 51 54 0.2333 0.4118 0.3889 2.70e-05
15 1wes:A 71 54 0.2333 0.2958 0.3889 3.56e-05 2g6q:A
16 1weu:A 91 53 0.2222 0.2198 0.3774 1.25e-04 3c6w:A, 3c6w:C, 2k1j:A, 2m1r:A, 2pnx:A, 2pnx:C, 2vnf:A, 2vnf:C, 1wen:A
17 5z8l:A 204 50 0.2000 0.0882 0.3600 4.29e-04 5z8n:A, 5z8n:B, 5z8n:C
18 2miq:A 94 44 0.2111 0.2021 0.4318 0.001
19 5oqd:C 192 60 0.2333 0.1094 0.3500 0.002 5oqd:B, 5oqd:A, 5oqd:D, 5oqd:E, 5oqd:F
20 6wxk:B 51 48 0.1667 0.2941 0.3125 0.004 6wxk:A, 6wxk:C, 6wxk:D, 6wxk:E
21 3o70:A 55 40 0.1556 0.2545 0.3500 0.004 3o7a:A
22 5xfr:A 309 61 0.2444 0.0712 0.3607 0.004 5xfr:B
23 6fhq:A 58 50 0.2333 0.3621 0.4200 0.005 6fhq:B, 6fi1:A, 6fi1:B, 4qf3:A, 4qf3:B
24 3n9m:A 503 34 0.1667 0.0298 0.4412 0.011 3n9l:A, 3n9m:C, 3n9n:A, 3n9o:A, 3n9p:A, 3n9q:A, 3puq:A, 3puq:C, 3pur:A, 3pur:C
25 2jmi:A 60 41 0.1778 0.2667 0.3902 0.016 2jmj:A
26 5tab:A 53 50 0.1667 0.2830 0.3000 0.020
27 2e6r:A 92 72 0.2111 0.2065 0.2639 0.022
28 1wee:A 72 48 0.2111 0.2639 0.3958 0.043
29 5yc3:A 60 37 0.1333 0.2000 0.3243 0.063 5yc4:A
30 1we9:A 64 37 0.1333 0.1875 0.3243 0.081
31 2rsd:A 68 53 0.1778 0.2353 0.3019 0.10
32 5xfo:A 315 56 0.2111 0.0603 0.3393 0.11 8h43:A, 8h43:B, 8h43:C, 4hcz:A, 4hcz:B, 7lky:B, 7lky:H, 7lky:A, 7lky:C, 7lky:D, 7lky:E, 7lky:F, 7lky:G, 6wat:AA, 6wat:AC, 6wat:BA, 6wat:BC, 6wat:CA, 6wat:CC, 6wat:DA, 6wat:DC, 6wat:EC, 6wat:EA, 6wat:FA, 6wat:FC, 6wat:GA, 6wat:GC, 6wat:HA, 6wat:HC, 6wat:IA, 6wat:IC, 6wat:JA, 6wat:JC, 6wat:KA, 6wat:KC, 6wat:OC, 6wat:LA, 6wat:LC, 6wat:MA, 6wat:MC, 6wat:NA, 6wat:NC, 6wat:OA, 6wav:A, 6wav:C, 6wav:B, 6wav:D, 5xfn:A, 5xfp:B, 5xfp:A, 5xfp:E, 5xfq:A, 5xfq:B
33 5y20:A 52 36 0.1222 0.2115 0.3056 0.11
34 5tbn:A 57 36 0.1333 0.2105 0.3333 0.22
35 2ke1:A 66 34 0.1778 0.2424 0.4706 0.25 2kft:A, 1xwh:A
36 4q6f:A 56 46 0.1667 0.2679 0.3261 0.29 6fap:A, 6fap:B, 6fap:C, 6fap:D, 6fhu:A, 6fhu:B, 6fhu:D, 6fhu:C, 6fi0:A, 6fi0:B, 6fi0:C, 6fi0:D, 6fkp:A, 6fkp:D, 6fkp:C, 6fkp:B, 4q6f:B, 4q6f:C, 4q6f:D, 4qf2:A, 4qf2:B, 4qf2:C, 4qf2:D, 5t8r:D, 5t8r:A, 5t8r:B, 5t8r:C
37 7xga:A 126 65 0.2000 0.1429 0.2769 0.33 6vfo:A
38 1f62:A 51 48 0.1444 0.2549 0.2708 0.44
39 7tau:A 951 37 0.1333 0.0126 0.3243 0.63 7tau:C, 7tau:D, 7tau:E, 7tau:F, 7tau:H, 7tau:I, 7tau:G, 7tau:K, 7tau:L, 7tau:J, 5tx1:A, 5tx1:C, 5tx1:D, 5tx1:E, 5tx1:F, 5tx1:H, 5tx1:I, 5tx1:G, 5tx1:J, 5tx1:L
40 8agq:A 213 67 0.1889 0.0798 0.2537 0.75 5f07:A
41 7klo:A 59 45 0.1889 0.2881 0.3778 0.77 7klr:A
42 7w1m:H 322 36 0.1333 0.0373 0.3333 0.95 5k5h:A, 5k5i:A, 5k5j:A, 5k5l:E, 5k5l:G, 5k5l:F, 5kkq:A, 5kkq:D, 8ssq:A, 8ssq:D, 8ssr:A, 8ssr:D, 8sss:A, 8sss:D, 8sst:A, 8sst:D, 8ssu:A, 5t00:A, 5t00:D, 5t0u:A, 5t0u:D, 5und:A, 5und:B, 5yef:A, 5yef:B, 5yef:G, 5yef:J, 5yeg:A, 5yeg:B, 5yeh:A, 5yeh:B, 5yel:B, 5yel:A
43 6ryr:W 708 66 0.2667 0.0339 0.3636 1.2 2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
44 2lv9:A 80 68 0.2000 0.2250 0.2647 1.2 4l58:A
45 2mny:A 55 46 0.1778 0.2909 0.3478 1.4 2mnz:A
46 5c11:A 52 35 0.1444 0.2500 0.3714 1.5 3gl6:A, 2kgg:A, 2kgi:A
47 2ct1:A 77 36 0.1333 0.1558 0.3333 1.5
48 7s78:H 933 37 0.1222 0.0118 0.2973 2.5 6b1t:E, 6b1t:F, 6b1t:D, 6b1t:A, 6b1t:C, 6cgv:A, 6cgv:C, 7s78:D, 7s78:F, 7s78:E, 7s78:G, 7s78:J, 7s78:L
49 6z7n:A 788 37 0.1222 0.0140 0.2973 2.6
50 6z7n:K 840 37 0.1222 0.0131 0.2973 2.6
51 6z7n:B 847 37 0.1222 0.0130 0.2973 2.6
52 6z7n:C 860 37 0.1222 0.0128 0.2973 2.6 6z7n:L
53 6z7n:H 894 37 0.1222 0.0123 0.2973 2.6 6z7n:G, 6z7n:D, 6z7n:E, 6z7n:F
54 6yba:E 917 37 0.1222 0.0120 0.2973 2.6 6yba:F, 6yba:D, 6yba:A, 6yba:C, 6yba:G, 6yba:I, 6yba:B, 6z7n:I, 6z7n:J
55 5tdr:A 70 33 0.1222 0.1571 0.3333 3.3 5tdw:A
56 8i02:G 284 58 0.1778 0.0563 0.2759 3.6 8ifg:P
57 2nax:A 76 57 0.1778 0.2105 0.2807 4.0 5m9z:A
58 6lqf:A 175 52 0.1889 0.0971 0.3269 4.1 6lqe:A
59 7duf:A 62 44 0.1333 0.1935 0.2727 4.1 7duf:B
60 4gy5:A 215 32 0.1444 0.0605 0.4062 4.2 3ask:A, 3ask:B, 3ask:D, 3asl:A, 3db3:A, 7fb7:B, 4gy5:B, 6iiw:A, 2lgg:A, 2lgk:A, 2lgl:A, 4qqd:A, 4qqd:B, 3shb:A, 3sou:A, 3sou:B, 3sow:A, 3sow:B, 3sox:A, 3sox:B, 3t6r:B, 3t6r:A, 8wms:A, 5xpi:A, 5yy9:A, 5yy9:B, 3zvy:A, 3zvy:B, 3zvz:B
61 6mlc:C 85 40 0.1333 0.1412 0.3000 4.3 6mlc:A, 6mlc:B, 6mlc:D
62 2obe:A 915 37 0.1222 0.0120 0.2973 4.5 2obe:B, 2obe:C
63 7rd1:J 942 37 0.1222 0.0117 0.2973 4.6 7rd1:L, 7rd1:A, 7rd1:C, 7rd1:D, 7rd1:F, 7rd1:B, 7rd1:E, 7rd1:G, 7rd1:H, 7rd1:K, 7rd1:I
64 2ma5:A 61 35 0.1333 0.1967 0.3429 5.4
65 9atn:A 98 31 0.1111 0.1020 0.3226 6.4
66 7mju:A 184 30 0.1444 0.0707 0.4333 6.6 5dag:A, 5dah:B, 5dah:A
67 2m85:A 65 38 0.1556 0.2154 0.3684 7.0
68 3a9b:A 374 32 0.1000 0.0241 0.2812 7.2 3abx:A, 3vof:A
69 8i02:F 235 53 0.1556 0.0596 0.2642 8.2

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023)(download the PDF file).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • zhanglabzhanggroup.org | +65-6601-1241 | Computing 1, 13 Computing Drive, Singapore 117417